MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 1837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	TTTTA	3	15	107	121	20 %	80 %	0 %	0 %	148642061
2	NC_009515	CAGCT	2	10	924	933	20 %	20 %	20 %	40 %	148642061
3	NC_009515	TGTTT	2	10	1122	1131	0 %	80 %	20 %	0 %	148642061
4	NC_009515	CTGTA	2	10	1176	1185	20 %	40 %	20 %	20 %	148642061
5	NC_009515	AATTT	2	10	1729	1738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009515	AACCT	2	10	2139	2148	40 %	20 %	0 %	40 %	148642062
7	NC_009515	AGCAA	2	10	2464	2473	60 %	0 %	20 %	20 %	148642062
8	NC_009515	ATGAT	2	10	2737	2746	40 %	40 %	20 %	0 %	148642062
9	NC_009515	ATTTT	2	10	3835	3844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009515	TTTAA	2	10	7871	7880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009515	GTTTA	2	10	8653	8662	20 %	60 %	20 %	0 %	148642071
12	NC_009515	ATTTA	2	10	8692	8701	40 %	60 %	0 %	0 %	148642071
13	NC_009515	ATTAT	2	10	10156	10165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009515	AAATA	2	10	11642	11651	80 %	20 %	0 %	0 %	148642075
15	NC_009515	ATTAT	2	10	13019	13028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009515	CATTA	2	10	13824	13833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009515	TGTTT	2	10	15957	15966	0 %	80 %	20 %	0 %	148642083
18	NC_009515	ATTTT	2	10	15968	15977	20 %	80 %	0 %	0 %	148642083
19	NC_009515	TAAAT	2	10	16620	16629	60 %	40 %	0 %	0 %	148642084
20	NC_009515	TTATT	2	10	16760	16769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009515	AATAG	2	10	17516	17525	60 %	20 %	20 %	0 %	148642085
22	NC_009515	CATTA	2	10	17624	17633	40 %	40 %	0 %	20 %	148642085
23	NC_009515	AAATT	2	10	18835	18844	60 %	40 %	0 %	0 %	148642086
24	NC_009515	GTTTT	2	10	19142	19151	0 %	80 %	20 %	0 %	148642086
25	NC_009515	ATTTT	2	10	19406	19415	20 %	80 %	0 %	0 %	148642086
26	NC_009515	GCAAT	2	10	19577	19586	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009515	GAAAT	2	10	20851	20860	60 %	20 %	20 %	0 %	148642087
28	NC_009515	TATAA	2	10	21339	21348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009515	AATAA	2	10	21468	21477	80 %	20 %	0 %	0 %	148642088
30	NC_009515	ATTTT	2	10	21496	21505	20 %	80 %	0 %	0 %	148642088
31	NC_009515	AAAAC	2	10	21637	21646	80 %	0 %	0 %	20 %	148642088
32	NC_009515	ATTTT	2	10	22049	22058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009515	AATTG	2	10	23078	23087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009515	TATTT	2	10	24839	24848	20 %	80 %	0 %	0 %	148642091
35	NC_009515	TCAAA	2	10	26419	26428	60 %	20 %	0 %	20 %	148642094
36	NC_009515	CAATA	2	10	26446	26455	60 %	20 %	0 %	20 %	148642094
37	NC_009515	TAAAT	2	10	27660	27669	60 %	40 %	0 %	0 %	148642096
38	NC_009515	ATTTA	2	10	29526	29535	40 %	60 %	0 %	0 %	148642098
39	NC_009515	TATCA	2	10	31271	31280	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_009515	AAAAC	2	10	31445	31454	80 %	0 %	0 %	20 %	148642103
41	NC_009515	ATAAA	2	10	31881	31890	80 %	20 %	0 %	0 %	148642103
42	NC_009515	GTTCT	2	10	32684	32693	0 %	60 %	20 %	20 %	148642104
43	NC_009515	ATATT	2	10	33366	33375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009515	ATTTG	2	10	34177	34186	20 %	60 %	20 %	0 %	148642105
45	NC_009515	AATAT	2	10	34315	34324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009515	TTTAA	2	10	35841	35850	40 %	60 %	0 %	0 %	148642107
47	NC_009515	AATCC	2	10	36535	36544	40 %	20 %	0 %	40 %	148642108
48	NC_009515	CTTAA	2	10	37636	37645	40 %	40 %	0 %	20 %	148642110
49	NC_009515	AATTC	2	10	37796	37805	40 %	40 %	0 %	20 %	148642110
50	NC_009515	ATGTT	2	10	38262	38271	20 %	60 %	20 %	0 %	148642111
51	NC_009515	ACAGT	2	10	39260	39269	40 %	20 %	20 %	20 %	148642111
52	NC_009515	AATCA	2	10	41797	41806	60 %	20 %	0 %	20 %	148642112
53	NC_009515	ACTTA	2	10	42319	42328	40 %	40 %	0 %	20 %	148642112
54	NC_009515	ATTGT	2	10	43556	43565	20 %	60 %	20 %	0 %	148642112
55	NC_009515	ATTTG	2	10	43837	43846	20 %	60 %	20 %	0 %	148642112
56	NC_009515	CCATT	2	10	46170	46179	20 %	40 %	0 %	40 %	148642112
57	NC_009515	TAATG	2	10	46537	46546	40 %	40 %	20 %	0 %	148642112
58	NC_009515	TATTT	2	10	49040	49049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009515	AATTG	2	10	49066	49075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009515	ATTAT	2	10	49229	49238	40 %	60 %	0 %	0 %	148642113
61	NC_009515	AAAGG	2	10	50285	50294	60 %	0 %	40 %	0 %	148642113
62	NC_009515	ATTTT	2	10	51607	51616	20 %	80 %	0 %	0 %	148642115
63	NC_009515	TTTTA	2	10	54685	54694	20 %	80 %	0 %	0 %	148642118
64	NC_009515	TTAAG	2	10	56049	56058	40 %	40 %	20 %	0 %	148642118
65	NC_009515	ATTTA	2	10	57658	57667	40 %	60 %	0 %	0 %	148642118
66	NC_009515	TATTT	2	10	58144	58153	20 %	80 %	0 %	0 %	148642118
67	NC_009515	AAAAG	2	10	59624	59633	80 %	0 %	20 %	0 %	148642120
68	NC_009515	GTATT	2	10	60512	60521	20 %	60 %	20 %	0 %	148642121
69	NC_009515	AAATC	2	10	62190	62199	60 %	20 %	0 %	20 %	148642122
70	NC_009515	CTTTT	2	10	64869	64878	0 %	80 %	0 %	20 %	148642126
71	NC_009515	AAAAT	2	10	65918	65927	80 %	20 %	0 %	0 %	148642127
72	NC_009515	AAAAT	2	10	66345	66354	80 %	20 %	0 %	0 %	148642127
73	NC_009515	AATGA	2	10	68146	68155	60 %	20 %	20 %	0 %	148642130
74	NC_009515	AATTA	2	10	69204	69213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009515	TTGAT	2	10	69772	69781	20 %	60 %	20 %	0 %	148642131
76	NC_009515	CTTAA	2	10	70625	70634	40 %	40 %	0 %	20 %	148642131
77	NC_009515	TCATG	2	10	70968	70977	20 %	40 %	20 %	20 %	148642131
78	NC_009515	ATTTT	2	10	72119	72128	20 %	80 %	0 %	0 %	148642132
79	NC_009515	ATCTT	2	10	72758	72767	20 %	60 %	0 %	20 %	148642132
80	NC_009515	AAATA	2	10	73132	73141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009515	AATAC	2	10	73937	73946	60 %	20 %	0 %	20 %	148642133
82	NC_009515	ATATC	2	10	74267	74276	40 %	40 %	0 %	20 %	148642133
83	NC_009515	ATATC	2	10	75529	75538	40 %	40 %	0 %	20 %	148642135
84	NC_009515	ATCCA	2	10	76672	76681	40 %	20 %	0 %	40 %	148642137
85	NC_009515	ATATC	2	10	77025	77034	40 %	40 %	0 %	20 %	148642138
86	NC_009515	GTTAA	2	10	77127	77136	40 %	40 %	20 %	0 %	148642138
87	NC_009515	TAAAC	2	10	77271	77280	60 %	20 %	0 %	20 %	148642138
88	NC_009515	TTTAA	2	10	85992	86001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009515	GATTT	2	10	86477	86486	20 %	60 %	20 %	0 %	148642147
90	NC_009515	AAGAA	2	10	87415	87424	80 %	0 %	20 %	0 %	148642148
91	NC_009515	CAAAA	2	10	89082	89091	80 %	0 %	0 %	20 %	148642150
92	NC_009515	GAAAT	2	10	90789	90798	60 %	20 %	20 %	0 %	148642152
93	NC_009515	TCTGT	2	10	93284	93293	0 %	60 %	20 %	20 %	148642154
94	NC_009515	AAAAG	2	10	93700	93709	80 %	0 %	20 %	0 %	148642155
95	NC_009515	AAAAG	2	10	95021	95030	80 %	0 %	20 %	0 %	148642157
96	NC_009515	CAATT	2	10	95912	95921	40 %	40 %	0 %	20 %	148642158
97	NC_009515	TTAAA	2	10	97021	97030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009515	AAGAA	2	10	97240	97249	80 %	0 %	20 %	0 %	148642161
99	NC_009515	ACCAG	2	10	98265	98274	40 %	0 %	20 %	40 %	148642162
100	NC_009515	AATAT	2	10	99410	99419	60 %	40 %	0 %	0 %	148642164
101	NC_009515	AATTA	2	10	100595	100604	60 %	40 %	0 %	0 %	148642165
102	NC_009515	ATTTT	2	10	100704	100713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009515	ATATA	2	10	100820	100829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009515	CCAAA	2	10	101582	101591	60 %	0 %	0 %	40 %	148642166
105	NC_009515	ATTTT	2	10	103882	103891	20 %	80 %	0 %	0 %	148642170
106	NC_009515	AAATA	2	10	104797	104806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009515	TTTTG	2	10	105676	105685	0 %	80 %	20 %	0 %	148642172
108	NC_009515	ATAAG	2	10	106814	106823	60 %	20 %	20 %	0 %	148642172
109	NC_009515	ATATC	2	10	106976	106985	40 %	40 %	0 %	20 %	148642172
110	NC_009515	TAAAT	2	10	107454	107463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009515	TACAG	2	10	110128	110137	40 %	20 %	20 %	20 %	148642174
112	NC_009515	TCAAA	2	10	110751	110760	60 %	20 %	0 %	20 %	148642174
113	NC_009515	AATGA	2	10	111900	111909	60 %	20 %	20 %	0 %	148642175
114	NC_009515	TCATT	2	10	112238	112247	20 %	60 %	0 %	20 %	148642176
115	NC_009515	GTAAA	2	10	112633	112642	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009515	ATACA	2	10	113106	113115	60 %	20 %	0 %	20 %	148642177
117	NC_009515	AATTG	2	10	113647	113656	40 %	40 %	20 %	0 %	148642177
118	NC_009515	AACCA	2	10	114412	114421	60 %	0 %	0 %	40 %	148642178
119	NC_009515	TATTT	2	10	116418	116427	20 %	80 %	0 %	0 %	148642180
120	NC_009515	ATTTC	2	10	117340	117349	20 %	60 %	0 %	20 %	148642180
121	NC_009515	TTTTG	2	10	119314	119323	0 %	80 %	20 %	0 %	148642181
122	NC_009515	ATTTT	2	10	120543	120552	20 %	80 %	0 %	0 %	148642182
123	NC_009515	CTATT	2	10	122496	122505	20 %	60 %	0 %	20 %	148642184
124	NC_009515	AATAA	2	10	123019	123028	80 %	20 %	0 %	0 %	148642184
125	NC_009515	ATATT	2	10	123294	123303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009515	AAATC	2	10	123792	123801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009515	AGGGA	2	10	124119	124128	40 %	0 %	60 %	0 %	148642186
128	NC_009515	ATCAA	2	10	124442	124451	60 %	20 %	0 %	20 %	148642187
129	NC_009515	ATTCC	2	10	124741	124750	20 %	40 %	0 %	40 %	148642187
130	NC_009515	ATATT	2	10	124838	124847	40 %	60 %	0 %	0 %	148642187
131	NC_009515	ATAAA	2	10	125158	125167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009515	TAACT	2	10	125489	125498	40 %	40 %	0 %	20 %	148642188
133	NC_009515	ATTTA	2	10	128911	128920	40 %	60 %	0 %	0 %	148642194
134	NC_009515	ATTAC	2	10	129434	129443	40 %	40 %	0 %	20 %	148642194
135	NC_009515	TAAGA	2	10	129724	129733	60 %	20 %	20 %	0 %	148642195
136	NC_009515	TTCTA	2	10	130505	130514	20 %	60 %	0 %	20 %	148642195
137	NC_009515	ACAAA	2	10	130592	130601	80 %	0 %	0 %	20 %	148642195
138	NC_009515	TAATA	2	10	130747	130756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009515	AAAGA	2	10	131710	131719	80 %	0 %	20 %	0 %	148642196
140	NC_009515	TCAAT	2	10	131894	131903	40 %	40 %	0 %	20 %	148642197
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143	NC_009515	TCTTT	2	10	133520	133529	0 %	80 %	0 %	20 %	148642198
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149	NC_009515	TCCTA	2	10	141039	141048	20 %	40 %	0 %	40 %	148642207
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262	NC_009515	AAATA	2	10	255616	255625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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