MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 29286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	CTT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009515	TTC	2	6	65	70	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009515	TTC	2	6	77	82	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009515	TCA	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
5	NC_009515	ACA	2	6	217	222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
6	NC_009515	TCA	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
7	NC_009515	TTC	2	6	267	272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
8	NC_009515	ATT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
9	NC_009515	ATT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
10	NC_009515	ATT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
11	NC_009515	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
12	NC_009515	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
13	NC_009515	ATT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
14	NC_009515	ATT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
15	NC_009515	CAG	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642061
16	NC_009515	TAA	2	6	744	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642061
17	NC_009515	AAC	2	6	918	923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
18	NC_009515	TGC	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642061
19	NC_009515	TCC	3	9	1086	1094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642061
20	NC_009515	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
21	NC_009515	TGT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642061
22	NC_009515	TTA	2	6	1268	1273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
23	NC_009515	CTT	2	6	1325	1330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
24	NC_009515	CAC	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642061
25	NC_009515	ACA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642061
26	NC_009515	TAG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642061
27	NC_009515	ATC	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642061
28	NC_009515	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642061
29	NC_009515	TTC	2	6	1689	1694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642061
30	NC_009515	TAA	2	6	1740	1745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009515	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009515	AGC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009515	TAA	2	6	1959	1964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009515	GAA	2	6	2118	2123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
35	NC_009515	GAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
36	NC_009515	ACA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
37	NC_009515	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642062
38	NC_009515	AAG	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
39	NC_009515	TAA	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
40	NC_009515	TGA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
41	NC_009515	ACA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
42	NC_009515	GAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
43	NC_009515	AAG	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642062
44	NC_009515	TGA	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642062
45	NC_009515	AAC	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642062
46	NC_009515	TAA	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642062
47	NC_009515	TTA	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009515	TAA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009515	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009515	AAT	2	6	3626	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009515	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009515	ATC	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009515	AAT	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009515	TTA	2	6	3809	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009515	AAT	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009515	ATC	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
57	NC_009515	ATA	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642063
58	NC_009515	AGA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642063
59	NC_009515	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642063
60	NC_009515	CAG	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
61	NC_009515	TAG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642063
62	NC_009515	TTA	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
63	NC_009515	TAT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
64	NC_009515	TGT	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642063
65	NC_009515	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642063
66	NC_009515	GCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642063
67	NC_009515	ACC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642063
68	NC_009515	GCA	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642063
69	NC_009515	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009515	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009515	ATT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
72	NC_009515	ATT	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
73	NC_009515	ATA	2	6	4552	4557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642064
74	NC_009515	ATT	2	6	4616	4621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
75	NC_009515	TTA	2	6	4719	4724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
76	NC_009515	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642064
77	NC_009515	CTT	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642064
78	NC_009515	TAT	2	6	4977	4982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009515	TTA	2	6	5151	5156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642065
80	NC_009515	GTT	2	6	5387	5392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009515	AAT	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009515	AGC	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148642067
83	NC_009515	TCG	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642067
84	NC_009515	CTG	2	6	5896	5901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642067
85	NC_009515	TGA	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009515	TAA	2	6	6108	6113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009515	ATA	2	6	6124	6129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009515	ATA	2	6	6300	6305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
89	NC_009515	ACA	2	6	6404	6409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642068
90	NC_009515	AAT	2	6	6467	6472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
91	NC_009515	AAT	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
92	NC_009515	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642068
93	NC_009515	TCA	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642068
94	NC_009515	GAA	2	6	6641	6646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642068
95	NC_009515	TAT	2	6	6680	6685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642068
96	NC_009515	ATG	2	6	6690	6695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642068
97	NC_009515	AAC	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642068
98	NC_009515	AGA	2	6	6971	6976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642068
99	NC_009515	GTT	2	6	7112	7117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642068
100	NC_009515	TGA	3	9	7177	7185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642068
101	NC_009515	TAC	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642068
102	NC_009515	ATT	2	6	7411	7416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642069
103	NC_009515	TCA	3	9	7571	7579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
104	NC_009515	CAT	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
105	NC_009515	ATC	3	9	7690	7698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642069
106	NC_009515	TTC	2	6	7732	7737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642069
107	NC_009515	AAC	2	6	7758	7763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642069
108	NC_009515	ATA	2	6	7766	7771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642069
109	NC_009515	TAT	2	6	7824	7829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009515	ATA	2	6	7850	7855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009515	GGA	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009515	ATT	2	6	7988	7993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642070
113	NC_009515	TAC	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642070
114	NC_009515	ATG	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642070
115	NC_009515	ATA	2	6	8177	8182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642070
116	NC_009515	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642070
117	NC_009515	TGA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642070
118	NC_009515	AGA	2	6	8291	8296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642070
119	NC_009515	CAA	2	6	8307	8312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642070
120	NC_009515	TAG	2	6	8325	8330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642070
121	NC_009515	AAC	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642070
122	NC_009515	AAT	2	6	8498	8503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642070
123	NC_009515	ATT	3	9	8567	8575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642071
124	NC_009515	GTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642071
125	NC_009515	ATT	2	6	8677	8682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642071
126	NC_009515	TTC	2	6	8730	8735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642071
127	NC_009515	TCA	2	6	8792	8797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642071
128	NC_009515	CAT	2	6	8853	8858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642071
129	NC_009515	TGC	2	6	8911	8916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642071
130	NC_009515	GAA	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148642071
131	NC_009515	AAT	2	6	8944	8949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642071
132	NC_009515	TAA	2	6	9137	9142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009515	CAG	2	6	9194	9199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009515	ATT	2	6	9218	9223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009515	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009515	ATA	2	6	9264	9269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009515	ATA	2	6	9291	9296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009515	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
139	NC_009515	ATA	2	6	9354	9359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642072
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142	NC_009515	ATT	2	6	9796	9801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642072
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162	NC_009515	ATT	2	6	11063	11068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_009515	TAA	3	9	16798	16806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009515	ATT	2	6	16894	16899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_009515	AGG	2	6	16941	16946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009515	TAA	2	6	17032	17037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009515	TTG	2	6	17242	17247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642085
264	NC_009515	TCA	2	6	17259	17264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642085
265	NC_009515	TCT	2	6	17328	17333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642085
266	NC_009515	CTT	3	9	17350	17358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642085
267	NC_009515	TTA	2	6	17359	17364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642085
268	NC_009515	TCA	2	6	17394	17399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642085
269	NC_009515	TCC	2	6	17480	17485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642085
270	NC_009515	TTC	2	6	17506	17511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642085
271	NC_009515	TCA	2	6	17535	17540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642085
272	NC_009515	CTT	2	6	17587	17592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642085
273	NC_009515	CTG	2	6	17764	17769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642085
274	NC_009515	CTT	2	6	17851	17856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642085
275	NC_009515	TGA	2	6	17906	17911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642085
276	NC_009515	CTG	2	6	18186	18191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642085
277	NC_009515	TAC	2	6	18245	18250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642085
278	NC_009515	ATT	2	6	18254	18259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642085
279	NC_009515	CAT	2	6	18292	18297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642085
280	NC_009515	AAT	3	9	18315	18323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642085
281	NC_009515	ATT	2	6	18464	18469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642085
282	NC_009515	ATA	2	6	18667	18672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642085
283	NC_009515	ATT	2	6	18686	18691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148642085
284	NC_009515	TCA	2	6	18887	18892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642086
285	NC_009515	ATG	2	6	18907	18912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642086
286	NC_009515	TTC	2	6	19012	19017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642086
287	NC_009515	TTC	2	6	19045	19050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642086
288	NC_009515	TAC	2	6	19168	19173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642086
289	NC_009515	ACT	2	6	19196	19201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642086
290	NC_009515	TCA	4	12	19217	19228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642086
291	NC_009515	ATA	2	6	19454	19459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009515	TAA	2	6	19473	19478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009515	ATT	2	6	19520	19525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009515	TTC	2	6	19754	19759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148642087
295	NC_009515	CTG	2	6	19883	19888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148642087
296	NC_009515	ACC	2	6	19979	19984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148642087
297	NC_009515	TTG	2	6	20053	20058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642087
298	NC_009515	TTG	2	6	20065	20070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642087
299	NC_009515	TAA	2	6	20149	20154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642087
300	NC_009515	AAT	2	6	20355	20360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148642087
301	NC_009515	TTG	2	6	20377	20382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148642087
302	NC_009515	TCA	2	6	20427	20432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148642087
303	NC_009515	TCC	2	6	20504	20509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148642087
304	NC_009515	GTA	2	6	20658	20663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642087
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327	NC_009515	TAA	2	6	22140	22145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_009515	AAT	2	6	22282	22287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_009515	TGT	2	6	22288	22293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_009515	ATT	2	6	23071	23076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_009515	TAA	2	6	24870	24875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
377	NC_009515	TAT	2	6	24900	24905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_009515	AAC	2	6	25202	25207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_009515	ATA	2	6	25216	25221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_009515	ATG	2	6	25564	25569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148642093
389	NC_009515	AAC	2	6	25766	25771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148642093
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