MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	TATAA	2	10	1458	1467	60 %	40 %	0 %	0 %	148543244
2	NC_009513	GTTAA	2	10	2746	2755	40 %	40 %	20 %	0 %	148543245
3	NC_009513	TGTTT	2	10	3061	3070	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009513	AAGAT	2	10	3437	3446	60 %	20 %	20 %	0 %	148543246
5	NC_009513	AGCAA	2	10	5956	5965	60 %	0 %	20 %	20 %	148543248
6	NC_009513	AATCA	2	10	8006	8015	60 %	20 %	0 %	20 %	148543249
7	NC_009513	AGTAA	2	10	9625	9634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009513	TGATA	2	10	10647	10656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009513	AGATG	2	10	13787	13796	40 %	20 %	40 %	0 %	148543255
10	NC_009513	GACAA	2	10	14314	14323	60 %	0 %	20 %	20 %	148543255
11	NC_009513	AAAAT	2	10	17500	17509	80 %	20 %	0 %	0 %	148543259
12	NC_009513	AAAAT	2	10	17549	17558	80 %	20 %	0 %	0 %	148543259
13	NC_009513	AAACC	2	10	20029	20038	60 %	0 %	0 %	40 %	148543261
14	NC_009513	AGCAG	2	10	21925	21934	40 %	0 %	40 %	20 %	148543263
15	NC_009513	TTCAT	2	10	23655	23664	20 %	60 %	0 %	20 %	148543264
16	NC_009513	CACGA	2	10	23701	23710	40 %	0 %	20 %	40 %	148543264
17	NC_009513	TAATT	2	10	23834	23843	40 %	60 %	0 %	0 %	148543264
18	NC_009513	GGATC	2	10	24167	24176	20 %	20 %	40 %	20 %	148543264
19	NC_009513	ATATT	2	10	25091	25100	40 %	60 %	0 %	0 %	148543265
20	NC_009513	ATGGA	2	10	25989	25998	40 %	20 %	40 %	0 %	148543266
21	NC_009513	ACAAT	2	10	29644	29653	60 %	20 %	0 %	20 %	148543269
22	NC_009513	AAAAG	2	10	30461	30470	80 %	0 %	20 %	0 %	148543270
23	NC_009513	TACCT	2	10	30818	30827	20 %	40 %	0 %	40 %	148543270
24	NC_009513	GATTT	2	10	30999	31008	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009513	TTAGT	2	10	31668	31677	20 %	60 %	20 %	0 %	148543272
26	NC_009513	ACCTA	2	10	36107	36116	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009513	AAATT	2	10	36194	36203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009513	AAAAG	2	10	37312	37321	80 %	0 %	20 %	0 %	148543277
29	NC_009513	AATAT	2	10	38092	38101	60 %	40 %	0 %	0 %	148543278
30	NC_009513	ATGGG	2	10	38365	38374	20 %	20 %	60 %	0 %	148543278
31	NC_009513	GTTTT	2	10	39272	39281	0 %	80 %	20 %	0 %	148543279
32	NC_009513	CGTGA	2	10	40091	40100	20 %	20 %	40 %	20 %	148543280
33	NC_009513	TTCTC	2	10	40511	40520	0 %	60 %	0 %	40 %	148543280
34	NC_009513	TCAAC	2	10	41531	41540	40 %	20 %	0 %	40 %	148543281
35	NC_009513	TAGTT	2	10	41735	41744	20 %	60 %	20 %	0 %	148543282
36	NC_009513	ACAAA	2	10	42579	42588	80 %	0 %	0 %	20 %	148543283
37	NC_009513	GTTGG	2	10	46302	46311	0 %	40 %	60 %	0 %	148543287
38	NC_009513	ATTTA	2	10	47243	47252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009513	ATTTA	2	10	47255	47264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009513	CAAGA	2	10	47522	47531	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009513	AAAAT	2	10	47658	47667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009513	AAGGT	2	10	48945	48954	40 %	20 %	40 %	0 %	148543288
43	NC_009513	CAAGC	2	10	51390	51399	40 %	0 %	20 %	40 %	148543289
44	NC_009513	TTAAC	2	10	52512	52521	40 %	40 %	0 %	20 %	148543289
45	NC_009513	AAGAT	2	10	55345	55354	60 %	20 %	20 %	0 %	148543291
46	NC_009513	TTGCA	2	10	55402	55411	20 %	40 %	20 %	20 %	148543291
47	NC_009513	TTAAA	2	10	55765	55774	60 %	40 %	0 %	0 %	148543291
48	NC_009513	CAGCT	2	10	56475	56484	20 %	20 %	20 %	40 %	148543292
49	NC_009513	TATTC	2	10	56880	56889	20 %	60 %	0 %	20 %	148543292
50	NC_009513	GACAA	2	10	58332	58341	60 %	0 %	20 %	20 %	148543292
51	NC_009513	AATTG	2	10	59973	59982	40 %	40 %	20 %	0 %	148543293
52	NC_009513	AAGCA	2	10	60930	60939	60 %	0 %	20 %	20 %	148543293
53	NC_009513	AATTT	2	10	64802	64811	40 %	60 %	0 %	0 %	148543294
54	NC_009513	TGGGG	2	10	66052	66061	0 %	20 %	80 %	0 %	148543295
55	NC_009513	GTTTT	2	10	67756	67765	0 %	80 %	20 %	0 %	148543296
56	NC_009513	AGCAA	2	10	68265	68274	60 %	0 %	20 %	20 %	148543297
57	NC_009513	GAAAA	2	10	70975	70984	80 %	0 %	20 %	0 %	148543299
58	NC_009513	AGTCA	2	10	71082	71091	40 %	20 %	20 %	20 %	148543299
59	NC_009513	CTGGA	2	10	72338	72347	20 %	20 %	40 %	20 %	148543300
60	NC_009513	TATTT	2	10	72640	72649	20 %	80 %	0 %	0 %	148543300
61	NC_009513	AGCAG	2	10	73412	73421	40 %	0 %	40 %	20 %	148543301
62	NC_009513	AATTA	2	10	74358	74367	60 %	40 %	0 %	0 %	148543302
63	NC_009513	ATTTT	2	10	75342	75351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009513	ATGCA	2	10	75655	75664	40 %	20 %	20 %	20 %	148543303
65	NC_009513	TGCGT	2	10	76646	76655	0 %	40 %	40 %	20 %	148543303
66	NC_009513	ATTAT	2	10	81265	81274	40 %	60 %	0 %	0 %	148543307
67	NC_009513	TTAAC	2	10	81962	81971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009513	TATCT	2	10	87722	87731	20 %	60 %	0 %	20 %	148543314
69	NC_009513	ATATA	2	10	89634	89643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009513	ATCAT	2	10	89644	89653	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_009513	AAAAG	2	10	89692	89701	80 %	0 %	20 %	0 %	148543316
72	NC_009513	CAAAG	2	10	90851	90860	60 %	0 %	20 %	20 %	148543317
73	NC_009513	TCAAT	2	10	91053	91062	40 %	40 %	0 %	20 %	148543318
74	NC_009513	GAAAT	2	10	94656	94665	60 %	20 %	20 %	0 %	148543322
75	NC_009513	TGAAT	2	10	96293	96302	40 %	40 %	20 %	0 %	148543323
76	NC_009513	CATAC	2	10	97417	97426	40 %	20 %	0 %	40 %	148543324
77	NC_009513	CAGAC	2	10	98293	98302	40 %	0 %	20 %	40 %	148543324
78	NC_009513	ATTTT	2	10	99132	99141	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009513	TTTTA	2	10	99270	99279	20 %	80 %	0 %	0 %	148543325
80	NC_009513	CAATG	2	10	100564	100573	40 %	20 %	20 %	20 %	148543325
81	NC_009513	ATTTC	2	10	102897	102906	20 %	60 %	0 %	20 %	148543327
82	NC_009513	AACTC	2	10	103904	103913	40 %	20 %	0 %	40 %	148543327
83	NC_009513	ATTGC	2	10	106110	106119	20 %	40 %	20 %	20 %	148543328
84	NC_009513	ATCTT	2	10	106272	106281	20 %	60 %	0 %	20 %	148543328
85	NC_009513	TAAAA	2	10	107018	107027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009513	AACGA	2	10	111887	111896	60 %	0 %	20 %	20 %	148543332
87	NC_009513	AATTT	2	10	114171	114180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009513	CTTAC	2	10	117146	117155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009513	AGTTT	2	10	121161	121170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009513	GAAAA	2	10	123642	123651	80 %	0 %	20 %	0 %	148543337
91	NC_009513	TACTA	2	10	123671	123680	40 %	40 %	0 %	20 %	148543337
92	NC_009513	TTATT	2	10	126214	126223	20 %	80 %	0 %	0 %	148543339
93	NC_009513	ATTAT	2	10	126868	126877	40 %	60 %	0 %	0 %	148543339
94	NC_009513	TCTTT	2	10	127198	127207	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_009513	TTGGA	2	10	129962	129971	20 %	40 %	40 %	0 %	148543341
96	NC_009513	GATAA	2	10	132136	132145	60 %	20 %	20 %	0 %	148543343
97	NC_009513	ATAAG	2	10	132204	132213	60 %	20 %	20 %	0 %	148543343
98	NC_009513	ATTTT	2	10	133564	133573	20 %	80 %	0 %	0 %	148543345
99	NC_009513	TGCAA	2	10	136685	136694	40 %	20 %	20 %	20 %	148543349
100	NC_009513	CTTTT	2	10	137130	137139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009513	AAAGG	2	10	139984	139993	60 %	0 %	40 %	0 %	148543352
102	NC_009513	GAATT	2	10	140333	140342	40 %	40 %	20 %	0 %	148543352
103	NC_009513	TGGGA	2	10	140708	140717	20 %	20 %	60 %	0 %	148543353
104	NC_009513	ATGAT	2	10	141187	141196	40 %	40 %	20 %	0 %	148543353
105	NC_009513	ATGGA	2	10	143857	143866	40 %	20 %	40 %	0 %	148543356
106	NC_009513	AGCCT	2	10	144372	144381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_009513	GCGGT	2	10	144808	144817	0 %	20 %	60 %	20 %	148543357
108	NC_009513	GATTG	2	10	145770	145779	20 %	40 %	40 %	0 %	148543358
109	NC_009513	AATTA	2	10	146955	146964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009513	TTTTA	2	10	147012	147021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009513	ACCAG	2	10	150371	150380	40 %	0 %	20 %	40 %	148543363
112	NC_009513	TGGAA	2	10	151515	151524	40 %	20 %	40 %	0 %	148543365
113	NC_009513	ATCCC	2	10	153391	153400	20 %	20 %	0 %	60 %	148543367
114	NC_009513	TAAAG	2	10	154052	154061	60 %	20 %	20 %	0 %	148543368
115	NC_009513	TTTTC	2	10	154069	154078	0 %	80 %	0 %	20 %	148543368
116	NC_009513	ATGTA	2	10	154103	154112	40 %	40 %	20 %	0 %	148543368
117	NC_009513	AGTAA	2	10	154395	154404	60 %	20 %	20 %	0 %	148543368
118	NC_009513	AATTT	2	10	155085	155094	40 %	60 %	0 %	0 %	148543369
119	NC_009513	TATTG	2	10	155882	155891	20 %	60 %	20 %	0 %	148543369
120	NC_009513	ATTTT	2	10	156030	156039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009513	ACTTT	2	10	157689	157698	20 %	60 %	0 %	20 %	148543370
122	NC_009513	GGTCA	2	10	159910	159919	20 %	20 %	40 %	20 %	148543372
123	NC_009513	TTTAT	2	10	160554	160563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009513	AAATG	2	10	160762	160771	60 %	20 %	20 %	0 %	148543373
125	NC_009513	TTTAC	2	10	161411	161420	20 %	60 %	0 %	20 %	148543374
126	NC_009513	TGATT	2	10	163426	163435	20 %	60 %	20 %	0 %	148543375
127	NC_009513	TTCCG	2	10	163470	163479	0 %	40 %	20 %	40 %	148543375
128	NC_009513	GGCAA	2	10	163851	163860	40 %	0 %	40 %	20 %	148543376
129	NC_009513	AAAGA	2	10	165513	165522	80 %	0 %	20 %	0 %	148543379
130	NC_009513	AGCAC	2	10	170243	170252	40 %	0 %	20 %	40 %	148543382
131	NC_009513	CAAAT	2	10	172004	172013	60 %	20 %	0 %	20 %	148543383
132	NC_009513	GGCGA	2	10	172107	172116	20 %	0 %	60 %	20 %	148543383
133	NC_009513	GGTTG	2	10	173741	173750	0 %	40 %	60 %	0 %	148543385
134	NC_009513	AAGAT	2	10	174854	174863	60 %	20 %	20 %	0 %	148543386
135	NC_009513	CCATT	2	10	176580	176589	20 %	40 %	0 %	40 %	148543387
136	NC_009513	GGTAA	2	10	178007	178016	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009513	GTCTG	2	10	178490	178499	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_009513	TCGTG	2	10	178824	178833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009513	AACAA	2	10	179405	179414	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009513	GAGAT	2	10	182296	182305	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009513	TCTTT	2	10	182651	182660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009513	ATTGT	2	10	183975	183984	20 %	60 %	20 %	0 %	148543390
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145	NC_009513	CTTTA	2	10	188231	188240	20 %	60 %	0 %	20 %	148543393
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153	NC_009513	TCTAA	2	10	200460	200469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_009513	GTTAA	2	10	200771	200780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009513	AACTT	2	10	201723	201732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009513	GAAAA	2	10	202882	202891	80 %	0 %	20 %	0 %	148543407
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161	NC_009513	TAAGT	2	10	212668	212677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_009513	TTAGT	2	10	229110	229119	20 %	60 %	20 %	0 %	148543432
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174	NC_009513	TTTCC	2	10	231477	231486	0 %	60 %	0 %	40 %	148543435
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210	NC_009513	ATTAA	2	10	292630	292639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_009513	AAAGA	2	10	293487	293496	80 %	0 %	20 %	0 %	148543494
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227	NC_009513	TCGTG	2	10	313489	313498	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_009513	TTCTA	2	10	321962	321971	20 %	60 %	0 %	20 %	148543514
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255	NC_009513	CAATA	2	10	361648	361657	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_009513	AATTC	2	10	362947	362956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_009513	ATTTA	2	10	363504	363513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009513	ATTAT	2	10	363547	363556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_009513	GATGG	2	10	363624	363633	20 %	20 %	60 %	0 %	148543555
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262	NC_009513	AGTCC	2	10	366014	366023	20 %	20 %	20 %	40 %	148543558
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265	NC_009513	CTGTT	2	10	369283	369292	0 %	60 %	20 %	20 %	148543559
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268	NC_009513	TATTT	2	10	380141	380150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009513	AATGA	2	10	381178	381187	60 %	20 %	20 %	0 %	148543573
270	NC_009513	ACTTT	2	10	385004	385013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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