MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 5598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	TTTA	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009513	TATT	2	8	802	809	25 %	75 %	0 %	0 %	148543244
3	NC_009513	CATT	2	8	1904	1911	25 %	50 %	0 %	25 %	148543245
4	NC_009513	TTGA	2	8	3286	3293	25 %	50 %	25 %	0 %	148543246
5	NC_009513	AGTA	2	8	3481	3488	50 %	25 %	25 %	0 %	148543246
6	NC_009513	GATT	2	8	4394	4401	25 %	50 %	25 %	0 %	148543247
7	NC_009513	TTAA	2	8	4557	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	148543247
8	NC_009513	TTTA	2	8	6070	6077	25 %	75 %	0 %	0 %	148543248
9	NC_009513	ATTA	2	8	6136	6143	50 %	50 %	0 %	0 %	148543248
10	NC_009513	GAAT	3	12	6768	6779	50 %	25 %	25 %	0 %	148543249
11	NC_009513	AATG	2	8	7207	7214	50 %	25 %	25 %	0 %	148543249
12	NC_009513	AAAG	2	8	7723	7730	75 %	0 %	25 %	0 %	148543249
13	NC_009513	TAAT	2	8	7791	7798	50 %	50 %	0 %	0 %	148543249
14	NC_009513	GGCA	2	8	7869	7876	25 %	0 %	50 %	25 %	148543249
15	NC_009513	GTTG	2	8	8866	8873	0 %	50 %	50 %	0 %	148543249
16	NC_009513	GTTA	2	8	8908	8915	25 %	50 %	25 %	0 %	148543249
17	NC_009513	TTAA	2	8	8990	8997	50 %	50 %	0 %	0 %	148543249
18	NC_009513	CAAC	2	8	9098	9105	50 %	0 %	0 %	50 %	148543249
19	NC_009513	TTAC	2	8	9340	9347	25 %	50 %	0 %	25 %	148543250
20	NC_009513	TTAA	2	8	9611	9618	50 %	50 %	0 %	0 %	148543250
21	NC_009513	CAAC	2	8	10017	10024	50 %	0 %	0 %	50 %	148543251
22	NC_009513	TAAA	2	8	10213	10220	75 %	25 %	0 %	0 %	148543251
23	NC_009513	TTTA	2	8	11201	11208	25 %	75 %	0 %	0 %	148543253
24	NC_009513	TGAT	2	8	11855	11862	25 %	50 %	25 %	0 %	148543253
25	NC_009513	ACCA	2	8	12170	12177	50 %	0 %	0 %	50 %	148543253
26	NC_009513	GAAA	2	8	12339	12346	75 %	0 %	25 %	0 %	148543253
27	NC_009513	AAAT	2	8	12392	12399	75 %	25 %	0 %	0 %	148543253
28	NC_009513	CAAG	2	8	12657	12664	50 %	0 %	25 %	25 %	148543253
29	NC_009513	CTAA	2	8	12679	12686	50 %	25 %	0 %	25 %	148543253
30	NC_009513	TTTA	2	8	14033	14040	25 %	75 %	0 %	0 %	148543255
31	NC_009513	TTGA	2	8	14181	14188	25 %	50 %	25 %	0 %	148543255
32	NC_009513	TGGC	2	8	15003	15010	0 %	25 %	50 %	25 %	148543256
33	NC_009513	ACAG	2	8	15282	15289	50 %	0 %	25 %	25 %	148543256
34	NC_009513	TATT	2	8	15572	15579	25 %	75 %	0 %	0 %	148543256
35	NC_009513	GAAA	2	8	16078	16085	75 %	0 %	25 %	0 %	148543257
36	NC_009513	TGGA	2	8	16087	16094	25 %	25 %	50 %	0 %	148543257
37	NC_009513	TCAA	2	8	16494	16501	50 %	25 %	0 %	25 %	148543258
38	NC_009513	CAAC	2	8	16647	16654	50 %	0 %	0 %	50 %	148543258
39	NC_009513	AATC	2	8	16688	16695	50 %	25 %	0 %	25 %	148543258
40	NC_009513	TAAA	2	8	17247	17254	75 %	25 %	0 %	0 %	148543258
41	NC_009513	TTTA	2	8	17278	17285	25 %	75 %	0 %	0 %	148543259
42	NC_009513	ATGA	2	8	18021	18028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009513	ATTT	2	8	18351	18358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009513	AAAT	2	8	18968	18975	75 %	25 %	0 %	0 %	148543261
45	NC_009513	TAAT	2	8	19105	19112	50 %	50 %	0 %	0 %	148543261
46	NC_009513	ATTA	2	8	19172	19179	50 %	50 %	0 %	0 %	148543261
47	NC_009513	ATTG	2	8	20096	20103	25 %	50 %	25 %	0 %	148543261
48	NC_009513	TAAA	2	8	20675	20682	75 %	25 %	0 %	0 %	148543261
49	NC_009513	TAAT	2	8	20988	20995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009513	AACA	2	8	21962	21969	75 %	0 %	0 %	25 %	148543263
51	NC_009513	AAAC	2	8	22385	22392	75 %	0 %	0 %	25 %	148543263
52	NC_009513	GGAT	2	8	23064	23071	25 %	25 %	50 %	0 %	148543263
53	NC_009513	AAGA	2	8	23210	23217	75 %	0 %	25 %	0 %	148543263
54	NC_009513	GCAA	2	8	23615	23622	50 %	0 %	25 %	25 %	148543264
55	NC_009513	CAAT	2	8	23748	23755	50 %	25 %	0 %	25 %	148543264
56	NC_009513	CAAA	2	8	23897	23904	75 %	0 %	0 %	25 %	148543264
57	NC_009513	TACT	2	8	24078	24085	25 %	50 %	0 %	25 %	148543264
58	NC_009513	GTGA	2	8	24525	24532	25 %	25 %	50 %	0 %	148543264
59	NC_009513	CAAC	2	8	24739	24746	50 %	0 %	0 %	50 %	148543264
60	NC_009513	GAAT	2	8	24895	24902	50 %	25 %	25 %	0 %	148543265
61	NC_009513	GAAA	2	8	25105	25112	75 %	0 %	25 %	0 %	148543265
62	NC_009513	ACTT	2	8	25431	25438	25 %	50 %	0 %	25 %	148543265
63	NC_009513	GATC	2	8	25901	25908	25 %	25 %	25 %	25 %	148543266
64	NC_009513	GGCA	2	8	26022	26029	25 %	0 %	50 %	25 %	148543266
65	NC_009513	TCGC	2	8	26447	26454	0 %	25 %	25 %	50 %	148543266
66	NC_009513	CAAG	2	8	26541	26548	50 %	0 %	25 %	25 %	148543266
67	NC_009513	GTCC	2	8	26895	26902	0 %	25 %	25 %	50 %	148543267
68	NC_009513	TTAT	2	8	27050	27057	25 %	75 %	0 %	0 %	148543267
69	NC_009513	ATTA	2	8	27435	27442	50 %	50 %	0 %	0 %	148543267
70	NC_009513	AATT	2	8	27465	27472	50 %	50 %	0 %	0 %	148543267
71	NC_009513	TTAA	2	8	27565	27572	50 %	50 %	0 %	0 %	148543267
72	NC_009513	TTAA	2	8	28116	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009513	TTAA	2	8	28662	28669	50 %	50 %	0 %	0 %	148543268
74	NC_009513	AGCA	2	8	29881	29888	50 %	0 %	25 %	25 %	148543269
75	NC_009513	TAAG	2	8	29954	29961	50 %	25 %	25 %	0 %	148543269
76	NC_009513	TAAC	2	8	30113	30120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009513	AAGG	2	8	30600	30607	50 %	0 %	50 %	0 %	148543270
78	NC_009513	ATAA	2	8	30901	30908	75 %	25 %	0 %	0 %	148543270
79	NC_009513	ATTG	2	8	31225	31232	25 %	50 %	25 %	0 %	148543271
80	NC_009513	GAGT	2	8	31546	31553	25 %	25 %	50 %	0 %	148543272
81	NC_009513	GATT	2	8	31630	31637	25 %	50 %	25 %	0 %	148543272
82	NC_009513	ATTG	2	8	32202	32209	25 %	50 %	25 %	0 %	148543273
83	NC_009513	TAAC	2	8	32438	32445	50 %	25 %	0 %	25 %	148543273
84	NC_009513	AATT	2	8	32768	32775	50 %	50 %	0 %	0 %	148543273
85	NC_009513	TAAA	2	8	33275	33282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009513	GCCA	2	8	33336	33343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009513	TTGG	2	8	33545	33552	0 %	50 %	50 %	0 %	148543274
88	NC_009513	ATTA	2	8	33564	33571	50 %	50 %	0 %	0 %	148543274
89	NC_009513	AACC	2	8	33662	33669	50 %	0 %	0 %	50 %	148543274
90	NC_009513	GTTA	2	8	33798	33805	25 %	50 %	25 %	0 %	148543274
91	NC_009513	CGGA	2	8	33920	33927	25 %	0 %	50 %	25 %	148543274
92	NC_009513	TAAT	2	8	34371	34378	50 %	50 %	0 %	0 %	148543274
93	NC_009513	CTGC	2	8	34659	34666	0 %	25 %	25 %	50 %	148543275
94	NC_009513	TTGC	2	8	34719	34726	0 %	50 %	25 %	25 %	148543275
95	NC_009513	TTAA	2	8	34757	34764	50 %	50 %	0 %	0 %	148543275
96	NC_009513	GTTA	2	8	35221	35228	25 %	50 %	25 %	0 %	148543275
97	NC_009513	GTTT	2	8	35485	35492	0 %	75 %	25 %	0 %	148543276
98	NC_009513	CTTG	2	8	35922	35929	0 %	50 %	25 %	25 %	148543276
99	NC_009513	GTTA	2	8	36235	36242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009513	TTTA	2	8	36362	36369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009513	AACA	2	8	36459	36466	75 %	0 %	0 %	25 %	148543277
102	NC_009513	ATTA	2	8	36610	36617	50 %	50 %	0 %	0 %	148543277
103	NC_009513	TATT	2	8	36804	36811	25 %	75 %	0 %	0 %	148543277
104	NC_009513	AACA	2	8	37724	37731	75 %	0 %	0 %	25 %	148543277
105	NC_009513	AATG	2	8	38318	38325	50 %	25 %	25 %	0 %	148543278
106	NC_009513	CAAT	2	8	38338	38345	50 %	25 %	0 %	25 %	148543278
107	NC_009513	CAAG	2	8	38445	38452	50 %	0 %	25 %	25 %	148543278
108	NC_009513	CAAG	2	8	38488	38495	50 %	0 %	25 %	25 %	148543278
109	NC_009513	ATCA	2	8	38542	38549	50 %	25 %	0 %	25 %	148543278
110	NC_009513	TGAT	2	8	41601	41608	25 %	50 %	25 %	0 %	148543282
111	NC_009513	AAGG	2	8	41645	41652	50 %	0 %	50 %	0 %	148543282
112	NC_009513	ATGA	2	8	41839	41846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009513	CTAT	2	8	41935	41942	25 %	50 %	0 %	25 %	148543283
114	NC_009513	CAGT	2	8	42302	42309	25 %	25 %	25 %	25 %	148543283
115	NC_009513	GGAT	2	8	43418	43425	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009513	GATT	2	8	43495	43502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009513	TTAA	2	8	43587	43594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009513	TGAT	2	8	43611	43618	25 %	50 %	25 %	0 %	148543284
119	NC_009513	TATG	2	8	43912	43919	25 %	50 %	25 %	0 %	148543284
120	NC_009513	AGAA	2	8	43937	43944	75 %	0 %	25 %	0 %	148543284
121	NC_009513	GGAT	2	8	43958	43965	25 %	25 %	50 %	0 %	148543284
122	NC_009513	TGGT	2	8	44301	44308	0 %	50 %	50 %	0 %	148543285
123	NC_009513	GCTT	2	8	45068	45075	0 %	50 %	25 %	25 %	148543286
124	NC_009513	TCAA	2	8	45554	45561	50 %	25 %	0 %	25 %	148543286
125	NC_009513	GTAA	2	8	46289	46296	50 %	25 %	25 %	0 %	148543287
126	NC_009513	GAGT	2	8	46789	46796	25 %	25 %	50 %	0 %	148543287
127	NC_009513	TTGA	2	8	47151	47158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009513	ATTA	2	8	47167	47174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009513	ATGA	2	8	47732	47739	50 %	25 %	25 %	0 %	148543288
130	NC_009513	GTTG	2	8	48232	48239	0 %	50 %	50 %	0 %	148543288
131	NC_009513	CAAG	2	8	48477	48484	50 %	0 %	25 %	25 %	148543288
132	NC_009513	AAGA	2	8	48740	48747	75 %	0 %	25 %	0 %	148543288
133	NC_009513	TTAA	2	8	49463	49470	50 %	50 %	0 %	0 %	148543288
134	NC_009513	TGCT	2	8	49575	49582	0 %	50 %	25 %	25 %	148543288
135	NC_009513	AAGA	2	8	49916	49923	75 %	0 %	25 %	0 %	148543288
136	NC_009513	ATAC	2	8	50536	50543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009513	AATG	2	8	50620	50627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009513	AAGT	2	8	50949	50956	50 %	25 %	25 %	0 %	148543289
139	NC_009513	TTAC	2	8	50967	50974	25 %	50 %	0 %	25 %	148543289
140	NC_009513	TACT	2	8	51718	51725	25 %	50 %	0 %	25 %	148543289
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142	NC_009513	ATTA	2	8	54164	54171	50 %	50 %	0 %	0 %	148543290
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