MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 1866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009513	CT	3	6	166	171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009513	AT	3	6	194	199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009513	AC	3	6	271	276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009513	TC	5	10	483	492	0 %	50 %	0 %	50 %	148543244
5	NC_009513	AT	3	6	1843	1848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009513	TA	3	6	1850	1855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009513	AC	3	6	4479	4484	50 %	0 %	0 %	50 %	148543247
8	NC_009513	TA	4	8	9147	9154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009513	AG	3	6	9635	9640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009513	GT	3	6	9917	9922	0 %	50 %	50 %	0 %	148543251
11	NC_009513	TA	3	6	10774	10779	50 %	50 %	0 %	0 %	148543253
12	NC_009513	AT	3	6	11031	11036	50 %	50 %	0 %	0 %	148543253
13	NC_009513	CT	3	6	13734	13739	0 %	50 %	0 %	50 %	148543255
14	NC_009513	AT	3	6	15013	15018	50 %	50 %	0 %	0 %	148543256
15	NC_009513	GA	3	6	16314	16319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009513	AT	3	6	17318	17323	50 %	50 %	0 %	0 %	148543259
17	NC_009513	AT	3	6	17407	17412	50 %	50 %	0 %	0 %	148543259
18	NC_009513	TC	3	6	17644	17649	0 %	50 %	0 %	50 %	148543259
19	NC_009513	AT	3	6	17675	17680	50 %	50 %	0 %	0 %	148543259
20	NC_009513	TA	3	6	17915	17920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009513	TA	3	6	17997	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009513	AT	3	6	20969	20974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009513	TG	4	8	22828	22835	0 %	50 %	50 %	0 %	148543263
24	NC_009513	GT	3	6	24103	24108	0 %	50 %	50 %	0 %	148543264
25	NC_009513	AC	3	6	24311	24316	50 %	0 %	0 %	50 %	148543264
26	NC_009513	TA	3	6	27806	27811	50 %	50 %	0 %	0 %	148543267
27	NC_009513	AG	3	6	33489	33494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009513	AT	3	6	33517	33522	50 %	50 %	0 %	0 %	148543274
29	NC_009513	GT	3	6	33879	33884	0 %	50 %	50 %	0 %	148543274
30	NC_009513	AT	3	6	34312	34317	50 %	50 %	0 %	0 %	148543274
31	NC_009513	GA	3	6	34409	34414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009513	TA	3	6	37874	37879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009513	TA	3	6	40260	40265	50 %	50 %	0 %	0 %	148543280
34	NC_009513	TA	4	8	41144	41151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009513	TA	3	6	41833	41838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009513	GT	3	6	42990	42995	0 %	50 %	50 %	0 %	148543283
37	NC_009513	TA	3	6	46863	46868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009513	AT	3	6	50221	50226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009513	TC	3	6	50701	50706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009513	AC	3	6	52334	52339	50 %	0 %	0 %	50 %	148543289
41	NC_009513	AG	3	6	53202	53207	50 %	0 %	50 %	0 %	148543289
42	NC_009513	AT	3	6	54329	54334	50 %	50 %	0 %	0 %	148543290
43	NC_009513	AT	3	6	56012	56017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009513	TA	3	6	56608	56613	50 %	50 %	0 %	0 %	148543292
45	NC_009513	CG	3	6	57781	57786	0 %	0 %	50 %	50 %	148543292
46	NC_009513	AT	3	6	58261	58266	50 %	50 %	0 %	0 %	148543292
47	NC_009513	CT	4	8	59276	59283	0 %	50 %	0 %	50 %	148543292
48	NC_009513	TA	3	6	60305	60310	50 %	50 %	0 %	0 %	148543293
49	NC_009513	TA	3	6	61118	61123	50 %	50 %	0 %	0 %	148543293
50	NC_009513	CT	3	6	65004	65009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009513	TG	3	6	66164	66169	0 %	50 %	50 %	0 %	148543295
52	NC_009513	TA	3	6	68486	68491	50 %	50 %	0 %	0 %	148543297
53	NC_009513	TC	3	6	70906	70911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009513	AT	3	6	72384	72389	50 %	50 %	0 %	0 %	148543300
55	NC_009513	GC	3	6	73593	73598	0 %	0 %	50 %	50 %	148543301
56	NC_009513	AT	3	6	73997	74002	50 %	50 %	0 %	0 %	148543301
57	NC_009513	AT	3	6	74120	74125	50 %	50 %	0 %	0 %	148543302
58	NC_009513	TA	3	6	75955	75960	50 %	50 %	0 %	0 %	148543303
59	NC_009513	TA	3	6	76934	76939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009513	TA	3	6	77003	77008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009513	GA	3	6	77125	77130	50 %	0 %	50 %	0 %	148543304
62	NC_009513	GC	3	6	77715	77720	0 %	0 %	50 %	50 %	148543305
63	NC_009513	TG	3	6	78576	78581	0 %	50 %	50 %	0 %	148543306
64	NC_009513	GC	3	6	78914	78919	0 %	0 %	50 %	50 %	148543306
65	NC_009513	CA	3	6	79087	79092	50 %	0 %	0 %	50 %	148543306
66	NC_009513	AT	3	6	79282	79287	50 %	50 %	0 %	0 %	148543306
67	NC_009513	TC	3	6	80545	80550	0 %	50 %	0 %	50 %	148543307
68	NC_009513	TA	3	6	82055	82060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009513	GT	4	8	82118	82125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009513	CG	3	6	83912	83917	0 %	0 %	50 %	50 %	148543310
71	NC_009513	TG	3	6	84409	84414	0 %	50 %	50 %	0 %	148543310
72	NC_009513	CA	3	6	84460	84465	50 %	0 %	0 %	50 %	148543310
73	NC_009513	AT	3	6	84558	84563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009513	CA	3	6	84826	84831	50 %	0 %	0 %	50 %	148543311
75	NC_009513	CA	3	6	85010	85015	50 %	0 %	0 %	50 %	148543311
76	NC_009513	TG	3	6	85145	85150	0 %	50 %	50 %	0 %	148543311
77	NC_009513	CA	3	6	89081	89086	50 %	0 %	0 %	50 %	148543315
78	NC_009513	AC	3	6	90707	90712	50 %	0 %	0 %	50 %	148543317
79	NC_009513	TA	3	6	92855	92860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009513	CG	3	6	93803	93808	0 %	0 %	50 %	50 %	148543321
81	NC_009513	CG	3	6	96134	96139	0 %	0 %	50 %	50 %	148543323
82	NC_009513	AT	3	6	97182	97187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009513	TA	3	6	98781	98786	50 %	50 %	0 %	0 %	148543324
84	NC_009513	GA	3	6	99116	99121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009513	GA	3	6	99262	99267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009513	AT	3	6	100385	100390	50 %	50 %	0 %	0 %	148543325
87	NC_009513	CG	3	6	101769	101774	0 %	0 %	50 %	50 %	148543326
88	NC_009513	TC	3	6	102376	102381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009513	TA	3	6	104055	104060	50 %	50 %	0 %	0 %	148543327
90	NC_009513	GC	3	6	104808	104813	0 %	0 %	50 %	50 %	148543327
91	NC_009513	GA	3	6	105387	105392	50 %	0 %	50 %	0 %	148543327
92	NC_009513	AT	4	8	106817	106824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009513	CA	3	6	107469	107474	50 %	0 %	0 %	50 %	148543329
94	NC_009513	CT	3	6	108842	108847	0 %	50 %	0 %	50 %	148543330
95	NC_009513	GA	3	6	109886	109891	50 %	0 %	50 %	0 %	148543331
96	NC_009513	GT	3	6	111670	111675	0 %	50 %	50 %	0 %	148543332
97	NC_009513	TC	3	6	112738	112743	0 %	50 %	0 %	50 %	148543333
98	NC_009513	CA	3	6	115950	115955	50 %	0 %	0 %	50 %	148543335
99	NC_009513	GA	3	6	118686	118691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009513	TA	3	6	120987	120992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009513	AT	3	6	122316	122321	50 %	50 %	0 %	0 %	148543336
102	NC_009513	CA	4	8	122818	122825	50 %	0 %	0 %	50 %	148543336
103	NC_009513	CA	3	6	122860	122865	50 %	0 %	0 %	50 %	148543336
104	NC_009513	AT	3	6	123038	123043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009513	AG	4	8	127231	127238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009513	AC	3	6	128367	128372	50 %	0 %	0 %	50 %	148543340
107	NC_009513	AT	3	6	128671	128676	50 %	50 %	0 %	0 %	148543340
108	NC_009513	AT	3	6	128695	128700	50 %	50 %	0 %	0 %	148543340
109	NC_009513	TA	3	6	130505	130510	50 %	50 %	0 %	0 %	148543342
110	NC_009513	AG	3	6	131685	131690	50 %	0 %	50 %	0 %	148543343
111	NC_009513	AG	3	6	136253	136258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009513	CA	3	6	137294	137299	50 %	0 %	0 %	50 %	148543350
113	NC_009513	AT	3	6	140600	140605	50 %	50 %	0 %	0 %	148543353
114	NC_009513	AT	3	6	141636	141641	50 %	50 %	0 %	0 %	148543354
115	NC_009513	TC	3	6	142058	142063	0 %	50 %	0 %	50 %	148543354
116	NC_009513	AG	3	6	142245	142250	50 %	0 %	50 %	0 %	148543354
117	NC_009513	TG	3	6	144335	144340	0 %	50 %	50 %	0 %	148543356
118	NC_009513	TG	3	6	144636	144641	0 %	50 %	50 %	0 %	148543357
119	NC_009513	AT	3	6	145974	145979	50 %	50 %	0 %	0 %	148543358
120	NC_009513	TA	3	6	146216	146221	50 %	50 %	0 %	0 %	148543358
121	NC_009513	AC	3	6	147851	147856	50 %	0 %	0 %	50 %	148543361
122	NC_009513	AG	4	8	148124	148131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009513	TA	3	6	149127	149132	50 %	50 %	0 %	0 %	148543362
124	NC_009513	AC	3	6	150210	150215	50 %	0 %	0 %	50 %	148543363
125	NC_009513	AT	3	6	155316	155321	50 %	50 %	0 %	0 %	148543369
126	NC_009513	CT	3	6	160514	160519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009513	GA	3	6	161899	161904	50 %	0 %	50 %	0 %	148543374
128	NC_009513	AG	3	6	162293	162298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009513	CA	3	6	162940	162945	50 %	0 %	0 %	50 %	148543375
130	NC_009513	AT	3	6	162973	162978	50 %	50 %	0 %	0 %	148543375
131	NC_009513	CT	3	6	163033	163038	0 %	50 %	0 %	50 %	148543375
132	NC_009513	TA	3	6	167107	167112	50 %	50 %	0 %	0 %	148543379
133	NC_009513	AT	3	6	167336	167341	50 %	50 %	0 %	0 %	148543379
134	NC_009513	CA	3	6	167478	167483	50 %	0 %	0 %	50 %	148543379
135	NC_009513	AT	3	6	168130	168135	50 %	50 %	0 %	0 %	148543380
136	NC_009513	TC	3	6	171322	171327	0 %	50 %	0 %	50 %	148543383
137	NC_009513	GC	3	6	172860	172865	0 %	0 %	50 %	50 %	148543384
138	NC_009513	TA	3	6	173125	173130	50 %	50 %	0 %	0 %	148543384
139	NC_009513	CT	3	6	174229	174234	0 %	50 %	0 %	50 %	148543385
140	NC_009513	GA	3	6	174520	174525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009513	AT	3	6	177447	177452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009513	AT	3	6	177530	177535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009513	TA	3	6	177713	177718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009513	GA	3	6	178050	178055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009513	AT	3	6	178457	178462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_009513	AC	3	6	179147	179152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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