MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 5903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009511	ATTTG	2	10	199	208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009511	CGGCG	2	10	2354	2363	0 %	0 %	60 %	40 %	148552932
3	NC_009511	TCGGC	2	10	2387	2396	0 %	20 %	40 %	40 %	148552932
4	NC_009511	CGCGG	2	10	4264	4273	0 %	0 %	60 %	40 %	148552933
5	NC_009511	AGCGC	2	10	4587	4596	20 %	0 %	40 %	40 %	148552934
6	NC_009511	ATCGA	2	10	4700	4709	40 %	20 %	20 %	20 %	148552934
7	NC_009511	CGGCG	2	10	5331	5340	0 %	0 %	60 %	40 %	148552934
8	NC_009511	AGCGC	2	10	5700	5709	20 %	0 %	40 %	40 %	148552934
9	NC_009511	GGTCG	2	10	7446	7455	0 %	20 %	60 %	20 %	148552936
10	NC_009511	CGTCG	2	10	7979	7988	0 %	20 %	40 %	40 %	148552937
11	NC_009511	CCGGC	2	10	8550	8559	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009511	AGGGC	2	10	9945	9954	20 %	0 %	60 %	20 %	148552939
13	NC_009511	CATCG	2	10	10580	10589	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009511	GCGCG	2	10	10804	10813	0 %	0 %	60 %	40 %	148552940
15	NC_009511	CGCGG	2	10	11584	11593	0 %	0 %	60 %	40 %	148552940
16	NC_009511	GGCGG	2	10	12108	12117	0 %	0 %	80 %	20 %	148552941
17	NC_009511	CGGCG	2	10	12557	12566	0 %	0 %	60 %	40 %	148552941
18	NC_009511	CTGGT	2	10	13248	13257	0 %	40 %	40 %	20 %	148552941
19	NC_009511	GCTCG	2	10	13527	13536	0 %	20 %	40 %	40 %	148552942
20	NC_009511	CTCGC	2	10	13600	13609	0 %	20 %	20 %	60 %	148552942
21	NC_009511	GGCGC	2	10	14152	14161	0 %	0 %	60 %	40 %	148552942
22	NC_009511	CGGAC	2	10	14293	14302	20 %	0 %	40 %	40 %	148552942
23	NC_009511	CGCGC	2	10	14815	14824	0 %	0 %	40 %	60 %	148552943
24	NC_009511	CTGGC	2	10	16530	16539	0 %	20 %	40 %	40 %	148552945
25	NC_009511	AATCG	2	10	17190	17199	40 %	20 %	20 %	20 %	148552946
26	NC_009511	CGGCC	2	10	18943	18952	0 %	0 %	40 %	60 %	148552948
27	NC_009511	CGCGG	2	10	19220	19229	0 %	0 %	60 %	40 %	148552948
28	NC_009511	CGATC	2	10	21558	21567	20 %	20 %	20 %	40 %	148552952
29	NC_009511	CGGCG	2	10	21592	21601	0 %	0 %	60 %	40 %	148552952
30	NC_009511	TCGCG	2	10	21905	21914	0 %	20 %	40 %	40 %	148552952
31	NC_009511	AGCGG	2	10	24383	24392	20 %	0 %	60 %	20 %	148552955
32	NC_009511	GGCGA	2	10	27322	27331	20 %	0 %	60 %	20 %	148552957
33	NC_009511	TCCGC	2	10	28119	28128	0 %	20 %	20 %	60 %	148552958
34	NC_009511	AGGTC	2	10	28224	28233	20 %	20 %	40 %	20 %	148552958
35	NC_009511	GCGCG	2	10	29403	29412	0 %	0 %	60 %	40 %	148552958
36	NC_009511	CGACG	2	10	29987	29996	20 %	0 %	40 %	40 %	148552959
37	NC_009511	CGATC	2	10	30539	30548	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009511	ATCGG	2	10	30551	30560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009511	GGGCG	2	10	32702	32711	0 %	0 %	80 %	20 %	148552963
40	NC_009511	GCGCA	2	10	33621	33630	20 %	0 %	40 %	40 %	148552964
41	NC_009511	CTCGA	2	10	33705	33714	20 %	20 %	20 %	40 %	148552964
42	NC_009511	CCGGC	2	10	34019	34028	0 %	0 %	40 %	60 %	148552964
43	NC_009511	TGCGC	2	10	34274	34283	0 %	20 %	40 %	40 %	148552964
44	NC_009511	GTCGC	2	10	35084	35093	0 %	20 %	40 %	40 %	148552965
45	NC_009511	GAGCT	2	10	35348	35357	20 %	20 %	40 %	20 %	148552966
46	NC_009511	CGGCG	2	10	37087	37096	0 %	0 %	60 %	40 %	148552966
47	NC_009511	GCGAG	2	10	38408	38417	20 %	0 %	60 %	20 %	148552968
48	NC_009511	GGGGC	2	10	38722	38731	0 %	0 %	80 %	20 %	148552968
49	NC_009511	CGGCG	2	10	40613	40622	0 %	0 %	60 %	40 %	148552969
50	NC_009511	GATCG	2	10	41598	41607	20 %	20 %	40 %	20 %	148552969
51	NC_009511	GGCGA	2	10	42256	42265	20 %	0 %	60 %	20 %	148552970
52	NC_009511	GGCGC	2	10	42695	42704	0 %	0 %	60 %	40 %	148552971
53	NC_009511	GCGAG	2	10	42935	42944	20 %	0 %	60 %	20 %	148552971
54	NC_009511	CGCGA	2	10	44628	44637	20 %	0 %	40 %	40 %	148552972
55	NC_009511	GAGCA	2	10	45549	45558	40 %	0 %	40 %	20 %	148552972
56	NC_009511	CGGGG	2	10	46072	46081	0 %	0 %	80 %	20 %	148552973
57	NC_009511	TTCGA	2	10	46791	46800	20 %	40 %	20 %	20 %	148552974
58	NC_009511	GTCCG	2	10	47084	47093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009511	CGGCG	2	10	51644	51653	0 %	0 %	60 %	40 %	148552981
60	NC_009511	CCGCG	2	10	51983	51992	0 %	0 %	40 %	60 %	148552981
61	NC_009511	GGCGA	2	10	54807	54816	20 %	0 %	60 %	20 %	148552984
62	NC_009511	GCGCC	2	10	56646	56655	0 %	0 %	40 %	60 %	148552987
63	NC_009511	GCGCC	2	10	56975	56984	0 %	0 %	40 %	60 %	148552987
64	NC_009511	GCGCG	2	10	60153	60162	0 %	0 %	60 %	40 %	148552990
65	NC_009511	CGGGG	2	10	60964	60973	0 %	0 %	80 %	20 %	148552991
66	NC_009511	CGGCG	2	10	61554	61563	0 %	0 %	60 %	40 %	148552992
67	NC_009511	CGGCT	2	10	61639	61648	0 %	20 %	40 %	40 %	148552992
68	NC_009511	GCAGC	2	10	64634	64643	20 %	0 %	40 %	40 %	148552994
69	NC_009511	CCGGT	2	10	64651	64660	0 %	20 %	40 %	40 %	148552994
70	NC_009511	CCCGT	2	10	65550	65559	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_009511	CCGCG	2	10	65873	65882	0 %	0 %	40 %	60 %	148552996
72	NC_009511	CTCGC	2	10	67034	67043	0 %	20 %	20 %	60 %	148552997
73	NC_009511	CGATC	2	10	71362	71371	20 %	20 %	20 %	40 %	148553003
74	NC_009511	GCCGC	2	10	71794	71803	0 %	0 %	40 %	60 %	148553004
75	NC_009511	CGGCG	2	10	72188	72197	0 %	0 %	60 %	40 %	148553004
76	NC_009511	CGGCG	2	10	72305	72314	0 %	0 %	60 %	40 %	148553004
77	NC_009511	GTCGC	2	10	72486	72495	0 %	20 %	40 %	40 %	148553004
78	NC_009511	GGCCA	2	10	72497	72506	20 %	0 %	40 %	40 %	148553004
79	NC_009511	CGATC	2	10	73246	73255	20 %	20 %	20 %	40 %	148553006
80	NC_009511	CAGAA	2	10	73980	73989	60 %	0 %	20 %	20 %	148553007
81	NC_009511	CGGCG	2	10	77756	77765	0 %	0 %	60 %	40 %	148553009
82	NC_009511	CCGCG	2	10	80864	80873	0 %	0 %	40 %	60 %	148553011
83	NC_009511	GCGAT	2	10	82266	82275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009511	GGGCA	2	10	82667	82676	20 %	0 %	60 %	20 %	148553014
85	NC_009511	TCGGC	2	10	83739	83748	0 %	20 %	40 %	40 %	148553015
86	NC_009511	CATCG	2	10	84241	84250	20 %	20 %	20 %	40 %	148553015
87	NC_009511	GCCGC	2	10	85298	85307	0 %	0 %	40 %	60 %	148553017
88	NC_009511	CCTCG	2	10	86767	86776	0 %	20 %	20 %	60 %	148553018
89	NC_009511	CCGAG	2	10	87557	87566	20 %	0 %	40 %	40 %	148553019
90	NC_009511	CAGGC	2	10	88214	88223	20 %	0 %	40 %	40 %	148553020
91	NC_009511	CGGCG	2	10	89157	89166	0 %	0 %	60 %	40 %	148553022
92	NC_009511	CGCCC	2	10	89278	89287	0 %	0 %	20 %	80 %	148553022
93	NC_009511	CGGCC	2	10	90682	90691	0 %	0 %	40 %	60 %	148553023
94	NC_009511	CCGCG	2	10	91059	91068	0 %	0 %	40 %	60 %	148553024
95	NC_009511	AGCGC	2	10	91272	91281	20 %	0 %	40 %	40 %	148553024
96	NC_009511	CCGGC	2	10	92193	92202	0 %	0 %	40 %	60 %	148553026
97	NC_009511	GATCG	2	10	93141	93150	20 %	20 %	40 %	20 %	148553026
98	NC_009511	GATCG	2	10	93946	93955	20 %	20 %	40 %	20 %	148553028
99	NC_009511	CGCGG	2	10	94051	94060	0 %	0 %	60 %	40 %	148553028
100	NC_009511	ACCAG	2	10	95898	95907	40 %	0 %	20 %	40 %	148553029
101	NC_009511	GCGCC	2	10	96105	96114	0 %	0 %	40 %	60 %	148553029
102	NC_009511	AAGGC	2	10	96704	96713	40 %	0 %	40 %	20 %	148553030
103	NC_009511	GGTCG	2	10	97469	97478	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009511	TGCGC	2	10	97808	97817	0 %	20 %	40 %	40 %	148553031
105	NC_009511	TGGGG	2	10	97850	97859	0 %	20 %	80 %	0 %	148553031
106	NC_009511	CGGCT	2	10	99270	99279	0 %	20 %	40 %	40 %	148553032
107	NC_009511	GGCCG	2	10	99714	99723	0 %	0 %	60 %	40 %	148553033
108	NC_009511	CCGGC	2	10	100212	100221	0 %	0 %	40 %	60 %	148553033
109	NC_009511	GCGCC	2	10	102011	102020	0 %	0 %	40 %	60 %	148553034
110	NC_009511	GGGCA	2	10	103091	103100	20 %	0 %	60 %	20 %	148553035
111	NC_009511	CGGCC	2	10	104401	104410	0 %	0 %	40 %	60 %	148553035
112	NC_009511	GCCTC	2	10	106698	106707	0 %	20 %	20 %	60 %	148553036
113	NC_009511	CGGCG	2	10	107730	107739	0 %	0 %	60 %	40 %	148553037
114	NC_009511	CGCGG	2	10	109034	109043	0 %	0 %	60 %	40 %	148553039
115	NC_009511	GTCCT	2	10	109774	109783	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009511	CGGGG	2	10	111014	111023	0 %	0 %	80 %	20 %	148553042
117	NC_009511	AGCTC	2	10	111792	111801	20 %	20 %	20 %	40 %	148553043
118	NC_009511	GGCCA	2	10	113935	113944	20 %	0 %	40 %	40 %	148553046
119	NC_009511	CGCGG	2	10	116152	116161	0 %	0 %	60 %	40 %	148553049
120	NC_009511	CCGAC	2	10	116223	116232	20 %	0 %	20 %	60 %	148553049
121	NC_009511	GCGCC	2	10	116889	116898	0 %	0 %	40 %	60 %	148553050
122	NC_009511	CGACG	2	10	119011	119020	20 %	0 %	40 %	40 %	148553052
123	NC_009511	CATCG	2	10	120499	120508	20 %	20 %	20 %	40 %	148553052
124	NC_009511	GCGCG	2	10	121104	121113	0 %	0 %	60 %	40 %	148553053
125	NC_009511	CGGCG	2	10	121871	121880	0 %	0 %	60 %	40 %	148553054
126	NC_009511	GGGCC	2	10	124162	124171	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_009511	CGGGC	2	10	124631	124640	0 %	0 %	60 %	40 %	148553056
128	NC_009511	AGCAG	2	10	126353	126362	40 %	0 %	40 %	20 %	148553058
129	NC_009511	GCAAG	2	10	126422	126431	40 %	0 %	40 %	20 %	148553058
130	NC_009511	TCAGC	2	10	127044	127053	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009511	GCCCG	2	10	127338	127347	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_009511	GCCGA	2	10	127401	127410	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_009511	CGGCG	2	10	131180	131189	0 %	0 %	60 %	40 %	148553063
134	NC_009511	TTGGG	2	10	131866	131875	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009511	TGGCC	2	10	132962	132971	0 %	20 %	40 %	40 %	148553065
136	NC_009511	GCGTC	2	10	133316	133325	0 %	20 %	40 %	40 %	148553065
137	NC_009511	GCCGC	2	10	134624	134633	0 %	0 %	40 %	60 %	148553066
138	NC_009511	CGCTG	2	10	134647	134656	0 %	20 %	40 %	40 %	148553066
139	NC_009511	CGCGC	2	10	136232	136241	0 %	0 %	40 %	60 %	148553067
140	NC_009511	CGGCG	2	10	137866	137875	0 %	0 %	60 %	40 %	148553068
141	NC_009511	GCCGC	2	10	138127	138136	0 %	0 %	40 %	60 %	148553069
142	NC_009511	GCGTC	2	10	138228	138237	0 %	20 %	40 %	40 %	148553069
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146	NC_009511	GCGCC	2	10	142616	142625	0 %	0 %	40 %	60 %	148553073
147	NC_009511	GCCCG	2	10	143241	143250	0 %	0 %	40 %	60 %	148553073
148	NC_009511	GGCCG	2	10	144132	144141	0 %	0 %	60 %	40 %	148553076
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150	NC_009511	CTCCG	2	10	144725	144734	0 %	20 %	20 %	60 %	148553076
151	NC_009511	AGCCC	2	10	145288	145297	20 %	0 %	20 %	60 %	148553076
152	NC_009511	CCATG	2	10	145540	145549	20 %	20 %	20 %	40 %	148553076
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155	NC_009511	CATCG	2	10	152105	152114	20 %	20 %	20 %	40 %	148553085
156	NC_009511	GCGCC	2	10	152488	152497	0 %	0 %	40 %	60 %	148553086
157	NC_009511	CGTCG	2	10	152941	152950	0 %	20 %	40 %	40 %	148553086
158	NC_009511	CGGCC	2	10	153460	153469	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
159	NC_009511	CTGCC	2	10	153734	153743	0 %	20 %	20 %	60 %	148553087
160	NC_009511	GCGCG	2	10	154142	154151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
161	NC_009511	GCTGC	2	10	154729	154738	0 %	20 %	40 %	40 %	148553088
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169	NC_009511	GCCGC	2	10	159175	159184	0 %	0 %	40 %	60 %	148553093
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172	NC_009511	CCGAT	2	10	160946	160955	20 %	20 %	20 %	40 %	148553095
173	NC_009511	GCCGC	2	10	162206	162215	0 %	0 %	40 %	60 %	148553097
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178	NC_009511	CGATA	2	10	164969	164978	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_009511	TCAGG	2	10	165609	165618	20 %	20 %	40 %	20 %	148553102
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184	NC_009511	GCGCC	2	10	170596	170605	0 %	0 %	40 %	60 %	148553105
185	NC_009511	CGCGC	2	10	170846	170855	0 %	0 %	40 %	60 %	148553105
186	NC_009511	AGCGC	2	10	170941	170950	20 %	0 %	40 %	40 %	148553105
187	NC_009511	CGAAG	2	10	171621	171630	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_009511	CCGCG	2	10	174232	174241	0 %	0 %	40 %	60 %	148553110
197	NC_009511	ATGGG	2	10	174907	174916	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009511	CGGGA	2	10	175709	175718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
199	NC_009511	CGGCG	2	10	175897	175906	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
200	NC_009511	GGCTC	2	10	176017	176026	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
201	NC_009511	GCGCG	2	10	177103	177112	0 %	0 %	60 %	40 %	148553113
202	NC_009511	AGGCG	2	10	178627	178636	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
203	NC_009511	CGAAG	2	10	181041	181050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
204	NC_009511	TGCCC	2	10	184019	184028	0 %	20 %	20 %	60 %	148553119
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216	NC_009511	GGCAT	2	10	202545	202554	20 %	20 %	40 %	20 %	148553127
217	NC_009511	GAAGC	2	10	204598	204607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
218	NC_009511	GGCCG	2	10	205055	205064	0 %	0 %	60 %	40 %	148553129
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221	NC_009511	ATCCG	2	10	206876	206885	20 %	20 %	20 %	40 %	148553132
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224	NC_009511	CTCCC	2	10	208382	208391	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
225	NC_009511	AGGGG	2	10	208512	208521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_009511	ATCGA	2	10	211895	211904	40 %	20 %	20 %	20 %	148553140
230	NC_009511	CGATC	2	10	211915	211924	20 %	20 %	20 %	40 %	148553140
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233	NC_009511	GCGGG	2	10	216302	216311	0 %	0 %	80 %	20 %	148553145
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236	NC_009511	CGTGG	2	10	220236	220245	0 %	20 %	60 %	20 %	148553149
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240	NC_009511	TGCGC	2	10	221788	221797	0 %	20 %	40 %	40 %	148553150
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242	NC_009511	GTCGC	2	10	225054	225063	0 %	20 %	40 %	40 %	148553150
243	NC_009511	CGCGC	2	10	225302	225311	0 %	0 %	40 %	60 %	148553150
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246	NC_009511	CGGTG	2	10	226518	226527	0 %	20 %	60 %	20 %	148553151
247	NC_009511	GTCGC	2	10	227183	227192	0 %	20 %	40 %	40 %	148553152
248	NC_009511	CGCGC	2	10	229388	229397	0 %	0 %	40 %	60 %	148553153
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250	NC_009511	TCGGC	2	10	232077	232086	0 %	20 %	40 %	40 %	148553154
251	NC_009511	GGCGA	2	10	233553	233562	20 %	0 %	60 %	20 %	148553155
252	NC_009511	GCCCG	2	10	233766	233775	0 %	0 %	40 %	60 %	148553155
253	NC_009511	TCCAT	2	10	235170	235179	20 %	40 %	0 %	40 %	148553156
254	NC_009511	CAGCT	2	10	236238	236247	20 %	20 %	20 %	40 %	148553157
255	NC_009511	TCGCC	2	10	237224	237233	0 %	20 %	20 %	60 %	148553158
256	NC_009511	CCGAT	2	10	237656	237665	20 %	20 %	20 %	40 %	148553158
257	NC_009511	CCTTG	2	10	238986	238995	0 %	40 %	20 %	40 %	148553159
258	NC_009511	CGCGA	2	10	240436	240445	20 %	0 %	40 %	40 %	148553160
259	NC_009511	GCGCT	2	10	241259	241268	0 %	20 %	40 %	40 %	148553161
260	NC_009511	GCGCG	2	10	243198	243207	0 %	0 %	60 %	40 %	148553164
261	NC_009511	GCGCT	2	10	244912	244921	0 %	20 %	40 %	40 %	148553165
262	NC_009511	TCGCC	2	10	245979	245988	0 %	20 %	20 %	60 %	148553165
263	NC_009511	CGCGG	2	10	247956	247965	0 %	0 %	60 %	40 %	148553168
264	NC_009511	AGCCG	2	10	249454	249463	20 %	0 %	40 %	40 %	148553171
265	NC_009511	CGGCG	2	10	250039	250048	0 %	0 %	60 %	40 %	148553171
266	NC_009511	GCCGG	2	10	252030	252039	0 %	0 %	60 %	40 %	148553173
267	NC_009511	GGCGC	2	10	252232	252241	0 %	0 %	60 %	40 %	148553173
268	NC_009511	GCGCC	2	10	252603	252612	0 %	0 %	40 %	60 %	148553173
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