MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 chromosome

Total Repeats: 5341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009511	CGGCG	2	10	2354	2363	0 %	0 %	60 %	40 %	148552932
2	NC_009511	TCGGC	2	10	2387	2396	0 %	20 %	40 %	40 %	148552932
3	NC_009511	CGCGG	2	10	4264	4273	0 %	0 %	60 %	40 %	148552933
4	NC_009511	AGCGC	2	10	4587	4596	20 %	0 %	40 %	40 %	148552934
5	NC_009511	ATCGA	2	10	4700	4709	40 %	20 %	20 %	20 %	148552934
6	NC_009511	CGGCG	2	10	5331	5340	0 %	0 %	60 %	40 %	148552934
7	NC_009511	AGCGC	2	10	5700	5709	20 %	0 %	40 %	40 %	148552934
8	NC_009511	GGTCG	2	10	7446	7455	0 %	20 %	60 %	20 %	148552936
9	NC_009511	CGTCG	2	10	7979	7988	0 %	20 %	40 %	40 %	148552937
10	NC_009511	AGGGC	2	10	9945	9954	20 %	0 %	60 %	20 %	148552939
11	NC_009511	GCGCG	2	10	10804	10813	0 %	0 %	60 %	40 %	148552940
12	NC_009511	CGCGG	2	10	11584	11593	0 %	0 %	60 %	40 %	148552940
13	NC_009511	GGCGG	2	10	12108	12117	0 %	0 %	80 %	20 %	148552941
14	NC_009511	CGGCG	2	10	12557	12566	0 %	0 %	60 %	40 %	148552941
15	NC_009511	CTGGT	2	10	13248	13257	0 %	40 %	40 %	20 %	148552941
16	NC_009511	GCTCG	2	10	13527	13536	0 %	20 %	40 %	40 %	148552942
17	NC_009511	CTCGC	2	10	13600	13609	0 %	20 %	20 %	60 %	148552942
18	NC_009511	GGCGC	2	10	14152	14161	0 %	0 %	60 %	40 %	148552942
19	NC_009511	CGGAC	2	10	14293	14302	20 %	0 %	40 %	40 %	148552942
20	NC_009511	CGCGC	2	10	14815	14824	0 %	0 %	40 %	60 %	148552943
21	NC_009511	CTGGC	2	10	16530	16539	0 %	20 %	40 %	40 %	148552945
22	NC_009511	AATCG	2	10	17190	17199	40 %	20 %	20 %	20 %	148552946
23	NC_009511	CGGCC	2	10	18943	18952	0 %	0 %	40 %	60 %	148552948
24	NC_009511	CGCGG	2	10	19220	19229	0 %	0 %	60 %	40 %	148552948
25	NC_009511	CGATC	2	10	21558	21567	20 %	20 %	20 %	40 %	148552952
26	NC_009511	CGGCG	2	10	21592	21601	0 %	0 %	60 %	40 %	148552952
27	NC_009511	TCGCG	2	10	21905	21914	0 %	20 %	40 %	40 %	148552952
28	NC_009511	AGCGG	2	10	24383	24392	20 %	0 %	60 %	20 %	148552955
29	NC_009511	GGCGA	2	10	27322	27331	20 %	0 %	60 %	20 %	148552957
30	NC_009511	TCCGC	2	10	28119	28128	0 %	20 %	20 %	60 %	148552958
31	NC_009511	AGGTC	2	10	28224	28233	20 %	20 %	40 %	20 %	148552958
32	NC_009511	GCGCG	2	10	29403	29412	0 %	0 %	60 %	40 %	148552958
33	NC_009511	CGACG	2	10	29987	29996	20 %	0 %	40 %	40 %	148552959
34	NC_009511	GGGCG	2	10	32702	32711	0 %	0 %	80 %	20 %	148552963
35	NC_009511	GCGCA	2	10	33621	33630	20 %	0 %	40 %	40 %	148552964
36	NC_009511	CTCGA	2	10	33705	33714	20 %	20 %	20 %	40 %	148552964
37	NC_009511	CCGGC	2	10	34019	34028	0 %	0 %	40 %	60 %	148552964
38	NC_009511	TGCGC	2	10	34274	34283	0 %	20 %	40 %	40 %	148552964
39	NC_009511	GTCGC	2	10	35084	35093	0 %	20 %	40 %	40 %	148552965
40	NC_009511	GAGCT	2	10	35348	35357	20 %	20 %	40 %	20 %	148552966
41	NC_009511	CGGCG	2	10	37087	37096	0 %	0 %	60 %	40 %	148552966
42	NC_009511	GCGAG	2	10	38408	38417	20 %	0 %	60 %	20 %	148552968
43	NC_009511	GGGGC	2	10	38722	38731	0 %	0 %	80 %	20 %	148552968
44	NC_009511	CGGCG	2	10	40613	40622	0 %	0 %	60 %	40 %	148552969
45	NC_009511	GATCG	2	10	41598	41607	20 %	20 %	40 %	20 %	148552969
46	NC_009511	GGCGA	2	10	42256	42265	20 %	0 %	60 %	20 %	148552970
47	NC_009511	GGCGC	2	10	42695	42704	0 %	0 %	60 %	40 %	148552971
48	NC_009511	GCGAG	2	10	42935	42944	20 %	0 %	60 %	20 %	148552971
49	NC_009511	CGCGA	2	10	44628	44637	20 %	0 %	40 %	40 %	148552972
50	NC_009511	GAGCA	2	10	45549	45558	40 %	0 %	40 %	20 %	148552972
51	NC_009511	CGGGG	2	10	46072	46081	0 %	0 %	80 %	20 %	148552973
52	NC_009511	TTCGA	2	10	46791	46800	20 %	40 %	20 %	20 %	148552974
53	NC_009511	CGGCG	2	10	51644	51653	0 %	0 %	60 %	40 %	148552981
54	NC_009511	CCGCG	2	10	51983	51992	0 %	0 %	40 %	60 %	148552981
55	NC_009511	GGCGA	2	10	54807	54816	20 %	0 %	60 %	20 %	148552984
56	NC_009511	GCGCC	2	10	56646	56655	0 %	0 %	40 %	60 %	148552987
57	NC_009511	GCGCC	2	10	56975	56984	0 %	0 %	40 %	60 %	148552987
58	NC_009511	GCGCG	2	10	60153	60162	0 %	0 %	60 %	40 %	148552990
59	NC_009511	CGGGG	2	10	60964	60973	0 %	0 %	80 %	20 %	148552991
60	NC_009511	CGGCG	2	10	61554	61563	0 %	0 %	60 %	40 %	148552992
61	NC_009511	CGGCT	2	10	61639	61648	0 %	20 %	40 %	40 %	148552992
62	NC_009511	GCAGC	2	10	64634	64643	20 %	0 %	40 %	40 %	148552994
63	NC_009511	CCGGT	2	10	64651	64660	0 %	20 %	40 %	40 %	148552994
64	NC_009511	CCGCG	2	10	65873	65882	0 %	0 %	40 %	60 %	148552996
65	NC_009511	CTCGC	2	10	67034	67043	0 %	20 %	20 %	60 %	148552997
66	NC_009511	CGATC	2	10	71362	71371	20 %	20 %	20 %	40 %	148553003
67	NC_009511	GCCGC	2	10	71794	71803	0 %	0 %	40 %	60 %	148553004
68	NC_009511	CGGCG	2	10	72188	72197	0 %	0 %	60 %	40 %	148553004
69	NC_009511	CGGCG	2	10	72305	72314	0 %	0 %	60 %	40 %	148553004
70	NC_009511	GTCGC	2	10	72486	72495	0 %	20 %	40 %	40 %	148553004
71	NC_009511	GGCCA	2	10	72497	72506	20 %	0 %	40 %	40 %	148553004
72	NC_009511	CGATC	2	10	73246	73255	20 %	20 %	20 %	40 %	148553006
73	NC_009511	CAGAA	2	10	73980	73989	60 %	0 %	20 %	20 %	148553007
74	NC_009511	CGGCG	2	10	77756	77765	0 %	0 %	60 %	40 %	148553009
75	NC_009511	CCGCG	2	10	80864	80873	0 %	0 %	40 %	60 %	148553011
76	NC_009511	GGGCA	2	10	82667	82676	20 %	0 %	60 %	20 %	148553014
77	NC_009511	TCGGC	2	10	83739	83748	0 %	20 %	40 %	40 %	148553015
78	NC_009511	CATCG	2	10	84241	84250	20 %	20 %	20 %	40 %	148553015
79	NC_009511	GCCGC	2	10	85298	85307	0 %	0 %	40 %	60 %	148553017
80	NC_009511	CCTCG	2	10	86767	86776	0 %	20 %	20 %	60 %	148553018
81	NC_009511	CCGAG	2	10	87557	87566	20 %	0 %	40 %	40 %	148553019
82	NC_009511	CAGGC	2	10	88214	88223	20 %	0 %	40 %	40 %	148553020
83	NC_009511	CGGCG	2	10	89157	89166	0 %	0 %	60 %	40 %	148553022
84	NC_009511	CGCCC	2	10	89278	89287	0 %	0 %	20 %	80 %	148553022
85	NC_009511	CGGCC	2	10	90682	90691	0 %	0 %	40 %	60 %	148553023
86	NC_009511	CCGCG	2	10	91059	91068	0 %	0 %	40 %	60 %	148553024
87	NC_009511	AGCGC	2	10	91272	91281	20 %	0 %	40 %	40 %	148553024
88	NC_009511	CCGGC	2	10	92193	92202	0 %	0 %	40 %	60 %	148553026
89	NC_009511	GATCG	2	10	93141	93150	20 %	20 %	40 %	20 %	148553026
90	NC_009511	GATCG	2	10	93946	93955	20 %	20 %	40 %	20 %	148553028
91	NC_009511	CGCGG	2	10	94051	94060	0 %	0 %	60 %	40 %	148553028
92	NC_009511	ACCAG	2	10	95898	95907	40 %	0 %	20 %	40 %	148553029
93	NC_009511	GCGCC	2	10	96105	96114	0 %	0 %	40 %	60 %	148553029
94	NC_009511	AAGGC	2	10	96704	96713	40 %	0 %	40 %	20 %	148553030
95	NC_009511	TGCGC	2	10	97808	97817	0 %	20 %	40 %	40 %	148553031
96	NC_009511	TGGGG	2	10	97850	97859	0 %	20 %	80 %	0 %	148553031
97	NC_009511	CGGCT	2	10	99270	99279	0 %	20 %	40 %	40 %	148553032
98	NC_009511	GGCCG	2	10	99714	99723	0 %	0 %	60 %	40 %	148553033
99	NC_009511	CCGGC	2	10	100212	100221	0 %	0 %	40 %	60 %	148553033
100	NC_009511	GCGCC	2	10	102011	102020	0 %	0 %	40 %	60 %	148553034
101	NC_009511	GGGCA	2	10	103091	103100	20 %	0 %	60 %	20 %	148553035
102	NC_009511	CGGCC	2	10	104401	104410	0 %	0 %	40 %	60 %	148553035
103	NC_009511	GCCTC	2	10	106698	106707	0 %	20 %	20 %	60 %	148553036
104	NC_009511	CGGCG	2	10	107730	107739	0 %	0 %	60 %	40 %	148553037
105	NC_009511	CGCGG	2	10	109034	109043	0 %	0 %	60 %	40 %	148553039
106	NC_009511	CGGGG	2	10	111014	111023	0 %	0 %	80 %	20 %	148553042
107	NC_009511	AGCTC	2	10	111792	111801	20 %	20 %	20 %	40 %	148553043
108	NC_009511	GGCCA	2	10	113935	113944	20 %	0 %	40 %	40 %	148553046
109	NC_009511	CGCGG	2	10	116152	116161	0 %	0 %	60 %	40 %	148553049
110	NC_009511	CCGAC	2	10	116223	116232	20 %	0 %	20 %	60 %	148553049
111	NC_009511	GCGCC	2	10	116889	116898	0 %	0 %	40 %	60 %	148553050
112	NC_009511	CGACG	2	10	119011	119020	20 %	0 %	40 %	40 %	148553052
113	NC_009511	CATCG	2	10	120499	120508	20 %	20 %	20 %	40 %	148553052
114	NC_009511	GCGCG	2	10	121104	121113	0 %	0 %	60 %	40 %	148553053
115	NC_009511	CGGCG	2	10	121871	121880	0 %	0 %	60 %	40 %	148553054
116	NC_009511	CGGGC	2	10	124631	124640	0 %	0 %	60 %	40 %	148553056
117	NC_009511	AGCAG	2	10	126353	126362	40 %	0 %	40 %	20 %	148553058
118	NC_009511	GCAAG	2	10	126422	126431	40 %	0 %	40 %	20 %	148553058
119	NC_009511	CGGCG	2	10	131180	131189	0 %	0 %	60 %	40 %	148553063
120	NC_009511	TGGCC	2	10	132962	132971	0 %	20 %	40 %	40 %	148553065
121	NC_009511	GCGTC	2	10	133316	133325	0 %	20 %	40 %	40 %	148553065
122	NC_009511	GCCGC	2	10	134624	134633	0 %	0 %	40 %	60 %	148553066
123	NC_009511	CGCTG	2	10	134647	134656	0 %	20 %	40 %	40 %	148553066
124	NC_009511	CGCGC	2	10	136232	136241	0 %	0 %	40 %	60 %	148553067
125	NC_009511	CGGCG	2	10	137866	137875	0 %	0 %	60 %	40 %	148553068
126	NC_009511	GCCGC	2	10	138127	138136	0 %	0 %	40 %	60 %	148553069
127	NC_009511	GCGTC	2	10	138228	138237	0 %	20 %	40 %	40 %	148553069
128	NC_009511	GGCCG	2	10	138274	138283	0 %	0 %	60 %	40 %	148553069
129	NC_009511	TCGCG	2	10	139470	139479	0 %	20 %	40 %	40 %	148553069
130	NC_009511	GGGCG	2	10	140521	140530	0 %	0 %	80 %	20 %	148553070
131	NC_009511	GCGCC	2	10	142616	142625	0 %	0 %	40 %	60 %	148553073
132	NC_009511	GCCCG	2	10	143241	143250	0 %	0 %	40 %	60 %	148553073
133	NC_009511	GGCCG	2	10	144132	144141	0 %	0 %	60 %	40 %	148553076
134	NC_009511	AGGGC	2	10	144271	144280	20 %	0 %	60 %	20 %	148553076
135	NC_009511	CTCCG	2	10	144725	144734	0 %	20 %	20 %	60 %	148553076
136	NC_009511	AGCCC	2	10	145288	145297	20 %	0 %	20 %	60 %	148553076
137	NC_009511	CCATG	2	10	145540	145549	20 %	20 %	20 %	40 %	148553076
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250	NC_009511	CTGGC	2	10	260880	260889	0 %	20 %	40 %	40 %	148553179
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260	NC_009511	CGGCG	2	10	268215	268224	0 %	0 %	60 %	40 %	148553187
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262	NC_009511	CGAGG	2	10	269474	269483	20 %	0 %	60 %	20 %	148553188
263	NC_009511	GGACG	2	10	269683	269692	20 %	0 %	60 %	20 %	148553188
264	NC_009511	ATCGA	2	10	269754	269763	40 %	20 %	20 %	20 %	148553188
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