MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009508	CGGGG	2	10	6383	6392	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009508	TGATC	2	10	20255	20264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009508	TGGGG	2	10	23355	23364	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009508	CCCCA	2	10	23369	23378	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_009508	CCGGG	2	10	28734	28743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_009508	ATGCG	2	10	29289	29298	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009508	TTCGG	2	10	32264	32273	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009508	ATCGA	2	10	43817	43826	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009508	GGCTC	2	10	57251	57260	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009508	GGGTT	2	10	59461	59470	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009508	GCCCT	2	10	59901	59910	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009508	AGGGG	2	10	64967	64976	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009508	GCTGG	2	10	72180	72189	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009508	GGCGC	2	10	75548	75557	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009508	TCGCT	2	10	77375	77384	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009508	CGCAT	2	10	78292	78301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009508	ACCGG	2	10	78340	78349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009508	GGTAG	2	10	78387	78396	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009508	GCCAG	2	10	84407	84416	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009508	AGAGA	2	10	100565	100574	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009508	ATTAT	2	10	115192	115201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009508	GCGGG	2	10	122154	122163	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009508	GAACG	2	10	128420	128429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009508	TTCAC	2	10	129680	129689	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009508	CTGCG	2	10	131928	131937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_009508	TCTCC	2	10	132092	132101	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009508	TGGCG	2	10	134694	134703	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009508	GCGCG	2	10	138378	138387	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009508	GCAAT	2	10	146812	146821	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009508	TTAAG	2	10	201250	201259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009508	TGCCT	2	10	202136	202145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009508	TCTCT	2	10	220781	220790	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.