MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 3316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009508	CAG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
2	NC_009508	ACC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550846
3	NC_009508	GCA	2	6	213	218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
4	NC_009508	GCT	2	6	353	358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550846
5	NC_009508	GCA	2	6	434	439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
6	NC_009508	CAT	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550846
7	NC_009508	TCG	2	6	522	527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550846
8	NC_009508	GCG	2	6	608	613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550846
9	NC_009508	CCG	2	6	636	641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550846
10	NC_009508	CGC	2	6	867	872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550846
11	NC_009508	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550846
12	NC_009508	CAG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550846
13	NC_009508	AAC	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550846
14	NC_009508	CAT	2	6	1062	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550846
15	NC_009508	GTC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550846
16	NC_009508	GAT	2	6	1281	1286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
17	NC_009508	GCC	2	6	1317	1322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550847
18	NC_009508	TGA	3	9	1358	1366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
19	NC_009508	ACA	2	6	1372	1377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550847
20	NC_009508	CGA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550847
21	NC_009508	CGC	2	6	1592	1597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550847
22	NC_009508	TGA	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
23	NC_009508	CCA	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550847
24	NC_009508	GTA	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550847
25	NC_009508	GCC	2	6	1846	1851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550847
26	NC_009508	TTC	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550847
27	NC_009508	AGT	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550848
28	NC_009508	TCG	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550848
29	NC_009508	ACG	2	6	1935	1940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550848
30	NC_009508	CCG	2	6	2092	2097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550848
31	NC_009508	TCA	3	9	2163	2171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550848
32	NC_009508	CCG	2	6	2247	2252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550848
33	NC_009508	TGC	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550848
34	NC_009508	ATC	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550848
35	NC_009508	TTG	2	6	2421	2426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550848
36	NC_009508	CCA	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550848
37	NC_009508	ATG	2	6	2514	2519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550848
38	NC_009508	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550849
39	NC_009508	ACA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550849
40	NC_009508	CAT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550849
41	NC_009508	TCC	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550849
42	NC_009508	TAA	2	6	2978	2983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550849
43	NC_009508	TCG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550849
44	NC_009508	CGA	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550849
45	NC_009508	GGC	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550849
46	NC_009508	GGT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550849
47	NC_009508	GGT	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550849
48	NC_009508	CCA	2	6	3192	3197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550849
49	NC_009508	ACA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550849
50	NC_009508	CGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550849
51	NC_009508	GCA	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550849
52	NC_009508	TCT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009508	GTC	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550850
54	NC_009508	TGC	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550850
55	NC_009508	GGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550850
56	NC_009508	ACG	2	6	3791	3796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550850
57	NC_009508	CAA	2	6	3969	3974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550850
58	NC_009508	CTT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550850
59	NC_009508	TGG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550850
60	NC_009508	CCG	3	9	4286	4294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550850
61	NC_009508	CAG	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550850
62	NC_009508	GCC	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550850
63	NC_009508	CGT	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550851
64	NC_009508	ATG	2	6	4699	4704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550851
65	NC_009508	CCG	3	9	4781	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550851
66	NC_009508	AGC	2	6	4831	4836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550851
67	NC_009508	CGT	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550851
68	NC_009508	CCG	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550851
69	NC_009508	CAT	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550851
70	NC_009508	GCG	2	6	5236	5241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550851
71	NC_009508	GAT	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550851
72	NC_009508	CCA	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550851
73	NC_009508	GAA	2	6	5646	5651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550851
74	NC_009508	GGC	2	6	5870	5875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550851
75	NC_009508	GAA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550851
76	NC_009508	CGG	2	6	6091	6096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550851
77	NC_009508	CCA	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550851
78	NC_009508	CTT	2	6	6246	6251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550851
79	NC_009508	GCA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550851
80	NC_009508	ATT	2	6	6402	6407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009508	TAA	2	6	6484	6489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009508	GGA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009508	TTG	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550852
84	NC_009508	TCG	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550852
85	NC_009508	AAG	2	6	6622	6627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550852
86	NC_009508	AGG	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550852
87	NC_009508	CCG	2	6	6710	6715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550852
88	NC_009508	TAT	2	6	6744	6749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550852
89	NC_009508	TAT	2	6	6841	6846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009508	AGG	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009508	TAC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550853
92	NC_009508	GCC	2	6	7058	7063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
93	NC_009508	TCA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550853
94	NC_009508	CTG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550853
95	NC_009508	CAC	2	6	7228	7233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550853
96	NC_009508	TCG	2	6	7510	7515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550853
97	NC_009508	TTC	2	6	7647	7652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550853
98	NC_009508	TCC	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550853
99	NC_009508	CAG	2	6	7861	7866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
100	NC_009508	AGG	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550853
101	NC_009508	CGG	2	6	7934	7939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550853
102	NC_009508	AAT	2	6	7964	7969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148550853
103	NC_009508	GCA	2	6	8088	8093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
104	NC_009508	GTC	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550853
105	NC_009508	CCG	2	6	8190	8195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
106	NC_009508	CAG	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
107	NC_009508	CGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
108	NC_009508	CGA	2	6	8327	8332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
109	NC_009508	CGA	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
110	NC_009508	CCA	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550853
111	NC_009508	AGG	2	6	8467	8472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550853
112	NC_009508	CGC	2	6	8558	8563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
113	NC_009508	GCA	2	6	8568	8573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
114	NC_009508	ATC	2	6	8726	8731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550853
115	NC_009508	GTC	2	6	8732	8737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550853
116	NC_009508	CAT	2	6	8797	8802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550853
117	NC_009508	CCG	2	6	8922	8927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
118	NC_009508	AAG	2	6	8991	8996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550853
119	NC_009508	CGC	2	6	9196	9201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550853
120	NC_009508	GAC	2	6	9260	9265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550853
121	NC_009508	ATT	2	6	9390	9395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550853
122	NC_009508	TCC	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_009508	CTT	2	6	9407	9412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009508	CGC	2	6	9430	9435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009508	AAC	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009508	CGA	2	6	9887	9892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550854
127	NC_009508	GCG	2	6	9932	9937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550854
128	NC_009508	CGC	2	6	9944	9949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550854
129	NC_009508	CGA	2	6	9995	10000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550854
130	NC_009508	GCG	2	6	10008	10013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550854
131	NC_009508	GTG	2	6	10030	10035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550854
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257	NC_009508	CTT	2	6	18960	18965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550864
258	NC_009508	GGT	2	6	18996	19001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550864
259	NC_009508	CTG	2	6	19110	19115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550864
260	NC_009508	GTC	2	6	19221	19226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550864
261	NC_009508	ATC	2	6	19414	19419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550864
262	NC_009508	GGT	2	6	19455	19460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550864
263	NC_009508	CGA	2	6	19472	19477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550864
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273	NC_009508	ATC	2	6	19987	19992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550864
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275	NC_009508	GAT	2	6	20093	20098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550864
276	NC_009508	CGG	2	6	20100	20105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550864
277	NC_009508	CAT	2	6	20166	20171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550864
278	NC_009508	ATC	2	6	20175	20180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_009508	CAA	2	6	20239	20244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_009508	GCC	2	6	20292	20297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550865
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283	NC_009508	CGA	2	6	20402	20407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550865
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285	NC_009508	TGC	2	6	20518	20523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550865
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287	NC_009508	GCG	2	6	20614	20619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550865
288	NC_009508	CTG	2	6	20685	20690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550865
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295	NC_009508	ACC	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_009508	CGC	2	6	21065	21070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_009508	TTG	2	6	34475	34480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550878

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