MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphingomonas wittichii RW1 plasmid pSWIT02

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009508	GA	3	6	6856	6861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009508	TG	3	6	10535	10540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009508	AT	4	8	15654	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009508	AT	5	10	15760	15769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009508	GC	4	8	16001	16008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009508	AC	3	6	21176	21181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009508	CG	3	6	22381	22386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009508	CG	3	6	28103	28108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009508	GC	3	6	28488	28493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009508	GC	3	6	31574	31579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009508	CG	3	6	31672	31677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009508	CT	3	6	32455	32460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009508	CG	3	6	43771	43776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009508	TC	3	6	44616	44621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009508	GC	4	8	44689	44696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009508	GC	3	6	44714	44719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009508	GC	3	6	44818	44823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009508	GA	3	6	44916	44921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009508	AG	3	6	44979	44984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009508	CG	3	6	45122	45127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009508	GC	4	8	49278	49285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009508	AT	3	6	50116	50121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009508	CG	3	6	57092	57097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009508	GC	3	6	57267	57272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009508	CG	3	6	59945	59950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009508	GC	3	6	69204	69209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009508	GC	3	6	70860	70865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009508	AT	3	6	70928	70933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009508	GC	3	6	74458	74463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009508	GC	3	6	74827	74832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009508	CG	4	8	75684	75691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009508	GC	3	6	75704	75709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009508	AT	3	6	77223	77228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009508	GC	3	6	77715	77720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009508	GC	3	6	77743	77748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009508	GC	3	6	80379	80384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009508	GT	3	6	80658	80663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009508	GC	3	6	80734	80739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009508	CG	3	6	82079	82084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009508	GT	3	6	84531	84536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009508	GC	3	6	84574	84579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009508	GC	3	6	93709	93714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009508	GC	3	6	93771	93776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009508	GC	4	8	93806	93813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009508	GA	3	6	99875	99880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009508	TG	3	6	100248	100253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009508	TC	4	8	100440	100447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009508	GT	3	6	100820	100825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009508	CT	3	6	104790	104795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009508	CG	3	6	115234	115239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009508	TA	4	8	115245	115252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009508	CG	5	10	122128	122137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009508	GC	3	6	122388	122393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009508	CT	3	6	128522	128527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009508	AG	3	6	128652	128657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009508	CG	3	6	131021	131026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009508	CG	3	6	131106	131111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009508	GC	3	6	131491	131496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009508	GT	3	6	133098	133103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009508	TG	3	6	137735	137740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009508	GC	4	8	140025	140032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009508	CT	3	6	145866	145871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009508	AG	3	6	147732	147737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009508	GA	3	6	149237	149242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009508	TC	3	6	161241	161246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009508	CA	3	6	163084	163089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009508	CG	3	6	172935	172940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009508	AT	3	6	173847	173852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009508	AG	3	6	173930	173935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009508	CG	3	6	184783	184788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009508	CG	3	6	187925	187930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009508	GC	3	6	189303	189308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009508	GC	3	6	199137	199142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009508	TC	3	6	199202	199207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009508	GA	3	6	199442	199447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009508	AT	3	6	199454	199459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009508	TC	3	6	201429	201434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009508	GC	3	6	210389	210394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009508	GT	3	6	210548	210553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009508	TC	3	6	210851	210856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009508	CG	3	6	213986	213991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009508	AG	3	6	220646	220651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009508	AG	3	6	220700	220705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009508	CT	3	6	220877	220882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009508	CA	3	6	222560	222565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.