MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 plasmid pFN3

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009506	AGTA	2	8	171	178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009506	TAAT	2	8	447	454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009506	TATT	2	8	670	677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009506	AATA	2	8	709	716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009506	ATTT	2	8	924	931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009506	AAAT	2	8	1198	1205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009506	AATG	2	8	1764	1771	50 %	25 %	25 %	0 %	148557804
8	NC_009506	TAAA	2	8	1796	1803	75 %	25 %	0 %	0 %	148557804
9	NC_009506	AGAA	2	8	2499	2506	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
10	NC_009506	AAGA	2	8	2574	2581	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
11	NC_009506	AGAA	2	8	2706	2713	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
12	NC_009506	TATT	2	8	2714	2721	25 %	75 %	0 %	0 %	148557804
13	NC_009506	AAAG	2	8	2820	2827	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
14	NC_009506	ATAA	2	8	3488	3495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009506	TAAT	2	8	3839	3846	50 %	50 %	0 %	0 %	148557806
16	NC_009506	TATT	2	8	4278	4285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009506	AATA	2	8	4320	4327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009506	AAAT	2	8	4479	4486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009506	AAAG	2	8	5079	5086	75 %	0 %	25 %	0 %	148557807
20	NC_009506	GACA	2	8	5273	5280	50 %	0 %	25 %	25 %	148557807
21	NC_009506	AAGA	2	8	5636	5643	75 %	0 %	25 %	0 %	148557807
22	NC_009506	TAAA	2	8	6265	6272	75 %	25 %	0 %	0 %	148557807
23	NC_009506	AAAG	2	8	6393	6400	75 %	0 %	25 %	0 %	148557807
24	NC_009506	AATA	2	8	6635	6642	75 %	25 %	0 %	0 %	148557807
25	NC_009506	TCTT	2	8	6863	6870	0 %	75 %	0 %	25 %	148557808
26	NC_009506	TTAG	2	8	6989	6996	25 %	50 %	25 %	0 %	148557808
27	NC_009506	GACA	2	8	7354	7361	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009506	TTTG	2	8	8034	8041	0 %	75 %	25 %	0 %	148557810
29	NC_009506	ACAT	2	8	8207	8214	50 %	25 %	0 %	25 %	148557810
30	NC_009506	AAAG	2	8	8392	8399	75 %	0 %	25 %	0 %	148557810
31	NC_009506	AAGA	2	8	8657	8664	75 %	0 %	25 %	0 %	148557810
32	NC_009506	AGAA	2	8	8852	8859	75 %	0 %	25 %	0 %	148557810
33	NC_009506	AGAA	2	8	9263	9270	75 %	0 %	25 %	0 %	148557810
34	NC_009506	AAAG	2	8	10077	10084	75 %	0 %	25 %	0 %	148557810
35	NC_009506	GTAA	2	8	10295	10302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009506	AAGA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	148557812
37	NC_009506	GTAG	2	8	10896	10903	25 %	25 %	50 %	0 %	148557812
38	NC_009506	AAGT	2	8	11041	11048	50 %	25 %	25 %	0 %	148557812
39	NC_009506	AACT	2	8	11060	11067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009506	CAAA	2	8	11131	11138	75 %	0 %	0 %	25 %	148557813
41	NC_009506	AAGA	2	8	11139	11146	75 %	0 %	25 %	0 %	148557813
42	NC_009506	TAGT	2	8	11369	11376	25 %	50 %	25 %	0 %	148557813
43	NC_009506	ACTA	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	148557813

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.