MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 plasmid pFN3

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009506	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
2	NC_009506	GAT	3	9	1327	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
3	NC_009506	TTA	2	6	1358	1363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
4	NC_009506	TAC	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557804
5	NC_009506	ATA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
6	NC_009506	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
7	NC_009506	AGA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
8	NC_009506	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557804
9	NC_009506	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
10	NC_009506	AGA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
11	NC_009506	AGT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
12	NC_009506	TAA	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
13	NC_009506	AGA	3	9	2013	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
14	NC_009506	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
15	NC_009506	GAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
16	NC_009506	GAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
17	NC_009506	GAT	3	9	2242	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
18	NC_009506	AGA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
19	NC_009506	AGA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
20	NC_009506	TTC	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
21	NC_009506	GAA	3	9	2434	2442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
22	NC_009506	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
23	NC_009506	AAG	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
24	NC_009506	AGA	3	9	2736	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
25	NC_009506	GTT	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557804
26	NC_009506	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
27	NC_009506	CTT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
28	NC_009506	AGA	2	6	2886	2891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
29	NC_009506	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
30	NC_009506	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
31	NC_009506	CGA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148557804
32	NC_009506	TAT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
33	NC_009506	TGT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557805
34	NC_009506	TTC	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
35	NC_009506	TAT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
36	NC_009506	ATT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
37	NC_009506	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
38	NC_009506	CTT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
39	NC_009506	TAA	2	6	3785	3790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557806
40	NC_009506	ATG	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557807
41	NC_009506	CTT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557807
42	NC_009506	AAT	2	6	5309	5314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
43	NC_009506	AAT	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
44	NC_009506	GAA	2	6	5496	5501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
45	NC_009506	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
46	NC_009506	GAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
47	NC_009506	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
48	NC_009506	AGA	2	6	5617	5622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
49	NC_009506	TAA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
50	NC_009506	ATG	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557807
51	NC_009506	GAA	2	6	5697	5702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
52	NC_009506	AGA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
53	NC_009506	ATA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
54	NC_009506	AGA	3	9	5822	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
55	NC_009506	GAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
56	NC_009506	GAA	2	6	5943	5948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
57	NC_009506	TAA	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
58	NC_009506	AGA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
59	NC_009506	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
60	NC_009506	CAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557807
61	NC_009506	AGA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
62	NC_009506	AGA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
63	NC_009506	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
64	NC_009506	AGA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
65	NC_009506	GGA	2	6	6408	6413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148557807
66	NC_009506	AGA	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
67	NC_009506	ATA	2	6	6456	6461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
68	NC_009506	AGA	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
69	NC_009506	GAA	3	9	6489	6497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
70	NC_009506	GAA	3	9	6519	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
71	NC_009506	TAT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
72	NC_009506	GTT	2	6	6575	6580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557807
73	NC_009506	AGA	3	9	6680	6688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
74	NC_009506	AGA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
75	NC_009506	GAA	4	12	6729	6740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
76	NC_009506	TAT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
77	NC_009506	TGT	2	6	6857	6862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557808
78	NC_009506	TTC	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557808
79	NC_009506	TAT	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
80	NC_009506	ATT	2	6	7094	7099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
81	NC_009506	ATT	2	6	7108	7113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557808
82	NC_009506	GAA	2	6	7570	7575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557809
83	NC_009506	AAG	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557809
84	NC_009506	AGA	2	6	7695	7700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557809
85	NC_009506	ACA	2	6	7708	7713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557809
86	NC_009506	TAA	2	6	7737	7742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557809
87	NC_009506	TAA	2	6	7767	7772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557809
88	NC_009506	ATA	2	6	7807	7812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557809
89	NC_009506	TAG	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557809
90	NC_009506	ATT	2	6	7837	7842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557809
91	NC_009506	TAA	2	6	7883	7888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
92	NC_009506	ATT	2	6	7935	7940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557810
93	NC_009506	CAG	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148557810
94	NC_009506	ATA	2	6	7991	7996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
95	NC_009506	TAA	2	6	8021	8026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
96	NC_009506	ATC	2	6	8075	8080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557810
97	NC_009506	AGA	2	6	8133	8138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
98	NC_009506	ATA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
99	NC_009506	AAG	2	6	8291	8296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
100	NC_009506	AGA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
101	NC_009506	GAG	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148557810
102	NC_009506	ATT	2	6	8497	8502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557810
103	NC_009506	AGA	2	6	8514	8519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
104	NC_009506	AGA	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
105	NC_009506	CTA	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557810
106	NC_009506	GAA	3	9	8767	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
107	NC_009506	AGA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
108	NC_009506	TGA	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557810
109	NC_009506	GAA	2	6	8896	8901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
110	NC_009506	GAA	2	6	8941	8946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
111	NC_009506	GAA	3	9	9022	9030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
112	NC_009506	GAA	2	6	9061	9066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
113	NC_009506	ATA	2	6	9077	9082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
114	NC_009506	TAA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
115	NC_009506	TAT	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557810
116	NC_009506	ATG	3	9	9314	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557810
117	NC_009506	AAG	2	6	9330	9335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
118	NC_009506	AGA	4	12	9411	9422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
119	NC_009506	GAA	2	6	9481	9486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
120	NC_009506	CTG	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148557810
121	NC_009506	TAA	2	6	9558	9563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
122	NC_009506	TGA	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557810
123	NC_009506	AAT	2	6	9675	9680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
124	NC_009506	AAT	2	6	9754	9759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
125	NC_009506	ATA	2	6	9818	9823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557810
126	NC_009506	AGA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
127	NC_009506	GAA	3	9	10030	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557810
128	NC_009506	TCA	2	6	10229	10234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557811
129	NC_009506	TTA	2	6	10596	10601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557812
130	NC_009506	CAG	2	6	10652	10657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148557812
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132	NC_009506	TCT	2	6	10777	10782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557812
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.