MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae PG2 chromosome

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009497	AATTGA	2	12	20533	20544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009497	GAAAAA	2	12	54217	54228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009497	ATTAAA	2	12	68174	68185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009497	CAAAAA	2	12	79359	79370	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009497	TAATAT	2	12	104902	104913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009497	AAATAT	2	12	128400	128411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009497	AAGCAA	2	12	153352	153363	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009497	TTTGCA	2	12	153372	153383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009497	AAAATA	2	12	164387	164398	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009497	TAAAAT	2	12	164421	164432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009497	ATATAA	2	12	164435	164446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009497	AAAATT	2	12	167178	167189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009497	TTTAAG	2	12	173424	173435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009497	CAGAAA	2	12	201351	201362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009497	AATGTT	2	12	206963	206974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009497	ATTTAT	2	12	207038	207049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009497	AATGCA	2	12	223649	223660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009497	AAGATA	2	12	235000	235011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009497	TATTTT	2	12	248711	248722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009497	ATTTTT	2	12	279638	279649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009497	TTAAAT	2	12	313829	313840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009497	ATTTAA	2	12	320909	320920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009497	TAAAAT	2	12	324173	324184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009497	ATTTTT	2	12	331511	331522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009497	TTTTAG	2	12	336431	336442	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009497	CACTTT	2	12	338799	338810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009497	AAGAAC	2	12	380653	380664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009497	TTTTTA	2	12	395602	395613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009497	TTTTCA	2	12	399428	399439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009497	TTTTCT	2	12	399479	399490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009497	TATAAA	2	12	410953	410964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009497	AATTAA	2	12	412473	412484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009497	TAAAAT	2	12	421513	421524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009497	TTTTAT	2	12	425191	425202	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009497	AGTCAG	2	12	425325	425336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009497	CTATTA	2	12	458271	458282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009497	AGCTAT	2	12	460021	460032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009497	CAACTT	2	12	460288	460299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009497	TAAAAT	2	12	471772	471783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009497	ATTTTT	2	12	490204	490215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009497	GTTTAT	2	12	491492	491503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009497	TTTTAT	2	12	492570	492581	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009497	TGAATG	2	12	503631	503642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009497	CACTTA	2	12	505007	505018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009497	ATTAAA	2	12	517263	517274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009497	TAAATT	2	12	517330	517341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009497	TTATAA	2	12	518188	518199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009497	ATTTTT	2	12	535366	535377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009497	ATTAAT	2	12	578461	578472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009497	TATTTC	2	12	594215	594226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009497	TAATAT	2	12	597232	597243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009497	TAAAAA	2	12	603158	603169	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009497	CTCCAG	2	12	612167	612178	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009497	CTCCAG	2	12	617169	617180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009497	ATTTTA	2	12	623958	623969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009497	ATTATA	2	12	642879	642890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009497	TTTAAA	2	12	649030	649041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009497	TTTTAT	2	12	654896	654907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009497	AATATC	2	12	704975	704986	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009497	AAATAT	2	12	707271	707282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009497	TATGCA	2	12	729305	729316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009497	TTTTTA	2	12	743962	743973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009497	AAAACC	2	12	801643	801654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009497	TAAAAG	2	12	801715	801726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009497	ATTTTG	2	12	804099	804110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009497	AGTTAC	2	12	824944	824955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_009497	GTTTTT	2	12	825855	825866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009497	TCAAAA	2	12	830857	830868	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009497	AATTTT	2	12	845675	845686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.