MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma agalactiae PG2 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009497	TATTT	2	10	2886	2895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009497	TAGTT	2	10	12749	12758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009497	TTTAG	2	10	23213	23222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009497	TAATT	2	10	32886	32895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009497	AACAA	2	10	51096	51105	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009497	TATAA	2	10	51392	51401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009497	AAAAT	2	10	54186	54195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009497	TATAA	2	10	56317	56326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009497	ATTTT	2	10	65579	65588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009497	TAATA	2	10	74904	74913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009497	AAGAA	2	10	107441	107450	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009497	GTTTT	2	10	110268	110277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009497	TATAA	2	10	122172	122181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009497	TTAGT	2	10	127469	127478	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009497	TAATA	2	10	129053	129062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009497	TAGTT	2	10	153186	153195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009497	ATTGC	2	10	171136	171145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009497	AATTA	2	10	172211	172220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009497	TTTAT	2	10	174800	174809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009497	ATAAA	2	10	182654	182663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009497	ATTTA	2	10	188600	188609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009497	AAATT	2	10	188743	188752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009497	TAACT	2	10	201316	201325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009497	GCTAA	2	10	211927	211936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009497	ATTAA	2	10	219078	219087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009497	TAAAA	2	10	219117	219126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009497	ATATT	2	10	222088	222097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009497	ATATT	2	10	223624	223633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009497	ATTTT	2	10	234457	234466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009497	TAGTT	2	10	242379	242388	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009497	TAATA	2	10	242421	242430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009497	TAGTT	2	10	250309	250318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009497	AATTT	2	10	266392	266401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009497	TTTTA	2	10	266773	266782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009497	TTTAA	2	10	274173	274182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009497	AAAAT	2	10	279462	279471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009497	TAATA	2	10	280869	280878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009497	ATTTA	2	10	282105	282114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009497	ATAAA	2	10	284427	284436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009497	AATTT	2	10	285008	285017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009497	ATTTT	2	10	299784	299793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009497	AAATA	2	10	300751	300760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009497	AATTA	2	10	318263	318272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009497	ATTTA	2	10	320928	320937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009497	AATAA	2	10	324342	324351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009497	TTATA	2	10	327945	327954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009497	ATTTT	2	10	329377	329386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009497	AGTTA	2	10	338847	338856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009497	GCTTT	2	10	353505	353514	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009497	ATTAA	2	10	363814	363823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009497	ACAAA	2	10	367541	367550	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009497	TAATT	2	10	367720	367729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009497	AAAAT	2	10	382103	382112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009497	TAATT	2	10	388155	388164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009497	TAAAA	2	10	388457	388466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009497	CTTTT	2	10	391534	391543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009497	ATTTT	2	10	395177	395186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009497	GAATT	2	10	397760	397769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009497	TTTTA	2	10	402833	402842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009497	ACTTC	2	10	410941	410950	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009497	ATTTA	2	10	412374	412383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009497	CTTAA	2	10	414219	414228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009497	TAAAA	2	10	414243	414252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009497	TTGCA	2	10	414285	414294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009497	ATATT	2	10	434096	434105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009497	TAAAA	2	10	437486	437495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009497	TAAAA	2	10	438702	438711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009497	TGTTT	2	10	442718	442727	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009497	TAAAT	2	10	443460	443469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009497	AAAAT	2	10	453396	453405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009497	AATTT	2	10	455051	455060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009497	TAATT	2	10	458106	458115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009497	ACTTA	2	10	466124	466133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009497	CTTTT	2	10	469241	469250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009497	TTTAT	2	10	481731	481740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009497	CTTGT	2	10	481768	481777	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009497	ATTTC	2	10	492802	492811	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009497	AAATC	2	10	492929	492938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009497	AACTA	2	10	499748	499757	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009497	TTTTA	2	10	499800	499809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009497	ATTTT	2	10	504374	504383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009497	TCTAT	2	10	505172	505181	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009497	ATTAT	2	10	517252	517261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009497	TGTTT	2	10	518148	518157	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009497	ATTTA	2	10	532926	532935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009497	CATTT	2	10	533978	533987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009497	ATTTT	2	10	535576	535585	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009497	TAAAT	2	10	541280	541289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009497	AAAAC	2	10	559673	559682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009497	TTTAT	2	10	559697	559706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009497	ACTAT	2	10	561219	561228	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009497	ATTTT	2	10	561250	561259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009497	TTTTA	2	10	563100	563109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009497	AATAA	2	10	565440	565449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009497	TGCAC	2	10	567654	567663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_009497	AAATT	2	10	571127	571136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009497	ATTTT	2	10	572311	572320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009497	AAAAG	2	10	572885	572894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009497	TAATT	2	10	582003	582012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009497	AAACA	2	10	586158	586167	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009497	TTTTA	2	10	586222	586231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009497	TAAAA	2	10	601123	601132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009497	AAAAT	2	10	605898	605907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009497	TACTT	2	10	609303	609312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009497	TTTTC	2	10	614471	614480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009497	CGTAG	2	10	615171	615180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009497	CACGA	2	10	615461	615470	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009497	TTTTC	2	10	619473	619482	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009497	CGTAG	2	10	620173	620182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009497	CACGA	2	10	620463	620472	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_009497	CTAAT	2	10	633254	633263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_009497	ATTTT	2	10	634101	634110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009497	TTTTA	2	10	639791	639800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009497	AAAAC	2	10	672728	672737	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009497	TAATG	2	10	676247	676256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009497	TATGA	2	10	679216	679225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009497	AATTA	2	10	679310	679319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009497	TTTTG	2	10	707322	707331	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009497	AAAAG	2	10	720091	720100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009497	TTAAA	2	10	732659	732668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009497	CAATA	2	10	734495	734504	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009497	TGTAT	2	10	734578	734587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009497	AAAAT	2	10	742502	742511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009497	AAATT	2	10	742560	742569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009497	AATTG	2	10	767221	767230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009497	TAATT	2	10	767487	767496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009497	TGAAT	2	10	772027	772036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009497	TTAAA	2	10	772280	772289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009497	AAATA	2	10	789990	789999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009497	ATATT	2	10	810492	810501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009497	TAAAA	2	10	823222	823231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009497	TATTT	2	10	826110	826119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009497	ATTTT	2	10	828503	828512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009497	ATTTA	2	10	828524	828533	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009497	ACCAA	2	10	830944	830953	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_009497	TCAAA	2	10	835009	835018	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009497	ATTTT	2	10	841476	841485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009497	TAAAT	2	10	843617	843626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009497	CATTT	2	10	847040	847049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009497	TATAT	2	10	852691	852700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009497	AATTA	2	10	877292	877301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.