MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	ATAA	2	8	1375	1382	75 %	25 %	0 %	0 %	148381587
2	NC_009496	TTCT	2	8	1385	1392	0 %	75 %	0 %	25 %	148381587
3	NC_009496	AATT	2	8	2038	2045	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
4	NC_009496	CTAT	2	8	2318	2325	25 %	50 %	0 %	25 %	148381587
5	NC_009496	TCTA	2	8	2557	2564	25 %	50 %	0 %	25 %	148381587
6	NC_009496	TTTA	2	8	2887	2894	25 %	75 %	0 %	0 %	148381587
7	NC_009496	CTAG	2	8	2999	3006	25 %	25 %	25 %	25 %	148381587
8	NC_009496	AAGC	2	8	3164	3171	50 %	0 %	25 %	25 %	148381587
9	NC_009496	TTAA	2	8	3269	3276	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
10	NC_009496	CATA	2	8	3441	3448	50 %	25 %	0 %	25 %	148381587
11	NC_009496	TTAA	2	8	3615	3622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009496	AATT	2	8	4050	4057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009496	AATT	2	8	4110	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009496	TAAA	2	8	4211	4218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009496	ATAA	2	8	4449	4456	75 %	25 %	0 %	0 %	148381589
16	NC_009496	CATA	2	8	4574	4581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009496	ATGT	2	8	4777	4784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009496	TAAA	2	8	4835	4842	75 %	25 %	0 %	0 %	148381590
19	NC_009496	GAAT	2	8	4848	4855	50 %	25 %	25 %	0 %	148381590
20	NC_009496	AATA	2	8	4899	4906	75 %	25 %	0 %	0 %	148381590
21	NC_009496	TTTA	2	8	5333	5340	25 %	75 %	0 %	0 %	148381590
22	NC_009496	TATT	2	8	5365	5372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009496	TATG	2	8	5463	5470	25 %	50 %	25 %	0 %	148381591
24	NC_009496	AGAT	2	8	5640	5647	50 %	25 %	25 %	0 %	148381591
25	NC_009496	GTAA	2	8	5800	5807	50 %	25 %	25 %	0 %	148381591
26	NC_009496	ATAA	2	8	5866	5873	75 %	25 %	0 %	0 %	148381591
27	NC_009496	ATAA	2	8	5947	5954	75 %	25 %	0 %	0 %	148381591
28	NC_009496	ATTT	2	8	6020	6027	25 %	75 %	0 %	0 %	148381591
29	NC_009496	ATTT	2	8	6285	6292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009496	ATAA	2	8	6296	6303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009496	GGAA	2	8	6318	6325	50 %	0 %	50 %	0 %	148381592
32	NC_009496	TAAA	2	8	6563	6570	75 %	25 %	0 %	0 %	148381592
33	NC_009496	TATT	2	8	6729	6736	25 %	75 %	0 %	0 %	148381593
34	NC_009496	TGTA	2	8	6775	6782	25 %	50 %	25 %	0 %	148381593
35	NC_009496	CGAC	2	8	6951	6958	25 %	0 %	25 %	50 %	148381594
36	NC_009496	AATC	2	8	6960	6967	50 %	25 %	0 %	25 %	148381594
37	NC_009496	AAAT	2	8	8194	8201	75 %	25 %	0 %	0 %	148381596
38	NC_009496	ATTA	2	8	8305	8312	50 %	50 %	0 %	0 %	148381597
39	NC_009496	AAGT	2	8	8772	8779	50 %	25 %	25 %	0 %	148381597
40	NC_009496	AAAG	2	8	8990	8997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009496	ACGG	2	8	9510	9517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009496	ATCA	2	8	9969	9976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009496	ATAG	2	8	10552	10559	50 %	25 %	25 %	0 %	148381600
44	NC_009496	AAGT	2	8	10659	10666	50 %	25 %	25 %	0 %	148381600
45	NC_009496	AAAT	2	8	11184	11191	75 %	25 %	0 %	0 %	148381600
46	NC_009496	TATC	2	8	11365	11372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009496	AGAA	2	8	11471	11478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009496	ATTT	2	8	12035	12042	25 %	75 %	0 %	0 %	148381602
49	NC_009496	AAGA	2	8	12109	12116	75 %	0 %	25 %	0 %	148381602
50	NC_009496	GATT	2	8	12221	12228	25 %	50 %	25 %	0 %	148381602
51	NC_009496	ATTA	2	8	12307	12314	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
52	NC_009496	AAGA	2	8	12637	12644	75 %	0 %	25 %	0 %	148381602
53	NC_009496	TGAA	2	8	12794	12801	50 %	25 %	25 %	0 %	148381602
54	NC_009496	AATA	2	8	13499	13506	75 %	25 %	0 %	0 %	148381603
55	NC_009496	CAAT	2	8	13783	13790	50 %	25 %	0 %	25 %	148381603
56	NC_009496	TTAA	2	8	13928	13935	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
57	NC_009496	AGAA	2	8	14053	14060	75 %	0 %	25 %	0 %	148381603
58	NC_009496	TAAA	2	8	14320	14327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009496	TAGA	2	8	14337	14344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009496	AGGA	2	8	14393	14400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009496	TAAT	2	8	15021	15028	50 %	50 %	0 %	0 %	148381604
62	NC_009496	GAAG	2	8	15581	15588	50 %	0 %	50 %	0 %	148381604
63	NC_009496	AAAG	2	8	15959	15966	75 %	0 %	25 %	0 %	148381604
64	NC_009496	ATTA	2	8	15982	15989	50 %	50 %	0 %	0 %	148381604
65	NC_009496	ATAA	2	8	16022	16029	75 %	25 %	0 %	0 %	148381604
66	NC_009496	ATTT	2	8	16124	16131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.