MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	TCT	2	6	284	289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
2	NC_009496	AAT	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
3	NC_009496	ATA	2	6	419	424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
4	NC_009496	TAT	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
5	NC_009496	TTA	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
6	NC_009496	TCC	2	6	466	471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148381587
7	NC_009496	AAC	2	6	475	480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148381587
8	NC_009496	CAT	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
9	NC_009496	TTA	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
10	NC_009496	ATC	2	6	544	549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
11	NC_009496	TAT	2	6	721	726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
12	NC_009496	TAT	2	6	744	749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
13	NC_009496	AAG	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
14	NC_009496	GTT	2	6	911	916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148381587
15	NC_009496	AAT	2	6	982	987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
16	NC_009496	ATA	2	6	1192	1197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
17	NC_009496	TTA	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
18	NC_009496	AGG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381587
19	NC_009496	CAT	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
20	NC_009496	CTT	2	6	1433	1438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
21	NC_009496	AAG	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
22	NC_009496	ATC	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
23	NC_009496	CTT	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
24	NC_009496	TGA	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381587
25	NC_009496	TAA	2	6	1974	1979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
26	NC_009496	GCA	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148381587
27	NC_009496	GAA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
28	NC_009496	ATT	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
29	NC_009496	ATT	3	9	2117	2125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
30	NC_009496	AGT	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381587
31	NC_009496	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
32	NC_009496	CTA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
33	NC_009496	CTT	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
34	NC_009496	CTT	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381587
35	NC_009496	TAT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
36	NC_009496	GTA	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381587
37	NC_009496	ATA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
38	NC_009496	CAT	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381587
39	NC_009496	AAT	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
40	NC_009496	TAA	2	6	3233	3238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381587
41	NC_009496	AAG	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381587
42	NC_009496	TTA	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
43	NC_009496	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
44	NC_009496	ATT	2	6	3508	3513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381587
45	NC_009496	TCC	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009496	ATT	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009496	AAG	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009496	TAT	2	6	3684	3689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009496	AAG	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381588
50	NC_009496	ATC	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381588
51	NC_009496	ATA	2	6	3940	3945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381588
52	NC_009496	ATT	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381588
53	NC_009496	TCA	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009496	AAT	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009496	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009496	ACA	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009496	TAA	2	6	4194	4199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009496	ATA	3	9	4248	4256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009496	ATT	2	6	4335	4340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009496	ACA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148381589
61	NC_009496	ACA	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009496	ATG	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009496	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009496	TAT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009496	AAG	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381590
66	NC_009496	TAA	2	6	5012	5017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381590
67	NC_009496	ATA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381590
68	NC_009496	ATG	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381590
69	NC_009496	ATA	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381590
70	NC_009496	TGC	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009496	ATA	2	6	5402	5407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009496	TAT	2	6	5445	5450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009496	TAT	2	6	5456	5461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009496	ATA	2	6	5471	5476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
75	NC_009496	TAT	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381591
76	NC_009496	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381591
77	NC_009496	TAA	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
78	NC_009496	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
79	NC_009496	ATA	2	6	5720	5725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
80	NC_009496	TAT	2	6	5732	5737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381591
81	NC_009496	TAA	2	6	5835	5840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
82	NC_009496	ATA	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
83	NC_009496	ATA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381591
84	NC_009496	AAC	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148381591
85	NC_009496	TAT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009496	TAT	2	6	6270	6275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009496	TTG	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148381592
88	NC_009496	ATT	2	6	6500	6505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381592
89	NC_009496	AAG	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381592
90	NC_009496	TTA	2	6	6583	6588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009496	GGT	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009496	TAA	2	6	6711	6716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381593
93	NC_009496	TAG	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009496	TTA	2	6	6897	6902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009496	GAG	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381594
96	NC_009496	AGA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381594
97	NC_009496	AAG	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381595
98	NC_009496	AAG	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009496	TGA	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009496	TAT	2	6	7463	7468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009496	ATA	2	6	7475	7480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009496	AAT	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009496	TTA	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009496	AGG	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009496	ATA	2	6	7728	7733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381596
106	NC_009496	GGA	2	6	7799	7804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381596
107	NC_009496	AGA	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381596
108	NC_009496	AGA	2	6	7853	7858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381596
109	NC_009496	ATA	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381596
110	NC_009496	TAG	4	12	8074	8085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148381596
111	NC_009496	TAA	2	6	8126	8131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381596
112	NC_009496	GAG	2	6	8202	8207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381596
113	NC_009496	TTA	2	6	8226	8231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381596
114	NC_009496	ATT	2	6	8264	8269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381597
115	NC_009496	AGA	2	6	8296	8301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381597
116	NC_009496	GAA	2	6	8345	8350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381597
117	NC_009496	TAA	2	6	8374	8379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381597
118	NC_009496	TAA	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381597
119	NC_009496	TAA	2	6	8505	8510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381597
120	NC_009496	TGT	2	6	8548	8553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148381597
121	NC_009496	ATA	2	6	8700	8705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381597
122	NC_009496	AGA	2	6	8806	8811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381597
123	NC_009496	GGA	2	6	8827	8832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381597
124	NC_009496	AGG	2	6	8952	8957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148381597
125	NC_009496	ACA	2	6	9177	9182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009496	TAT	2	6	9405	9410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381598
127	NC_009496	AAT	2	6	9422	9427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381598
128	NC_009496	TAT	2	6	9466	9471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148381598
129	NC_009496	ATA	3	9	9477	9485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381598
130	NC_009496	CAT	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148381599
131	NC_009496	AAT	2	6	9849	9854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381599
132	NC_009496	TAA	2	6	9878	9883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381599
133	NC_009496	TAA	2	6	9917	9922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148381599
134	NC_009496	ATA	2	6	9953	9958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009496	AAG	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148381600
136	NC_009496	TTC	2	6	10102	10107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148381600
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237	NC_009496	TTA	2	6	16200	16205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.