MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	AT	5	10	123	132	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
2	NC_009496	AT	3	6	215	220	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
3	NC_009496	TA	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
4	NC_009496	TA	3	6	1123	1128	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
5	NC_009496	AT	3	6	1178	1183	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
6	NC_009496	TA	3	6	1591	1596	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
7	NC_009496	TA	3	6	1626	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
8	NC_009496	TA	3	6	1749	1754	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
9	NC_009496	TC	3	6	2289	2294	0 %	50 %	0 %	50 %	148381587
10	NC_009496	TA	3	6	2563	2568	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
11	NC_009496	AT	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
12	NC_009496	TA	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	148381587
13	NC_009496	TC	3	6	3031	3036	0 %	50 %	0 %	50 %	148381587
14	NC_009496	AT	3	6	3719	3724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009496	TA	3	6	4245	4250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009496	AT	3	6	4278	4283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009496	AT	5	10	4293	4302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009496	TA	4	8	4326	4333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009496	TA	3	6	4518	4523	50 %	50 %	0 %	0 %	148381589
20	NC_009496	AT	3	6	4925	4930	50 %	50 %	0 %	0 %	148381590
21	NC_009496	AG	3	6	5029	5034	50 %	0 %	50 %	0 %	148381590
22	NC_009496	TA	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	148381590
23	NC_009496	AC	4	8	5179	5186	50 %	0 %	0 %	50 %	148381590
24	NC_009496	AT	3	6	5249	5254	50 %	50 %	0 %	0 %	148381590
25	NC_009496	AT	3	6	5427	5432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009496	TA	3	6	5560	5565	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
27	NC_009496	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
28	NC_009496	TA	3	6	6002	6007	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
29	NC_009496	TA	4	8	6012	6019	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
30	NC_009496	TG	3	6	6035	6040	0 %	50 %	50 %	0 %	148381591
31	NC_009496	TA	3	6	6097	6102	50 %	50 %	0 %	0 %	148381591
32	NC_009496	TA	3	6	6126	6131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009496	TA	3	6	6384	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	148381592
34	NC_009496	TA	3	6	6406	6411	50 %	50 %	0 %	0 %	148381592
35	NC_009496	AT	3	6	6593	6598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009496	AT	3	6	7288	7293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009496	AT	4	8	7805	7812	50 %	50 %	0 %	0 %	148381596
38	NC_009496	AT	3	6	7835	7840	50 %	50 %	0 %	0 %	148381596
39	NC_009496	TA	3	6	8870	8875	50 %	50 %	0 %	0 %	148381597
40	NC_009496	AG	3	6	9224	9229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009496	TA	3	6	9318	9323	50 %	50 %	0 %	0 %	148381598
42	NC_009496	TA	3	6	9441	9446	50 %	50 %	0 %	0 %	148381598
43	NC_009496	TA	3	6	9484	9489	50 %	50 %	0 %	0 %	148381598
44	NC_009496	AT	3	6	9890	9895	50 %	50 %	0 %	0 %	148381599
45	NC_009496	AT	3	6	10545	10550	50 %	50 %	0 %	0 %	148381600
46	NC_009496	AT	3	6	11156	11161	50 %	50 %	0 %	0 %	148381600
47	NC_009496	TA	3	6	11335	11340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009496	TA	4	8	11398	11405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009496	GT	3	6	11921	11926	0 %	50 %	50 %	0 %	148381602
50	NC_009496	AT	3	6	11943	11948	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
51	NC_009496	AT	3	6	11964	11969	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
52	NC_009496	AT	3	6	12102	12107	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
53	NC_009496	TA	3	6	12328	12333	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
54	NC_009496	AT	3	6	12761	12766	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
55	NC_009496	AT	3	6	12917	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
56	NC_009496	TA	3	6	12946	12951	50 %	50 %	0 %	0 %	148381602
57	NC_009496	AT	3	6	13481	13486	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
58	NC_009496	TA	4	8	13772	13779	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
59	NC_009496	AT	3	6	14107	14112	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
60	NC_009496	AT	3	6	14203	14208	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
61	NC_009496	TA	3	6	14218	14223	50 %	50 %	0 %	0 %	148381603
62	NC_009496	TA	3	6	14354	14359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009496	AT	3	6	14527	14532	50 %	50 %	0 %	0 %	148381604
64	NC_009496	TA	3	6	15594	15599	50 %	50 %	0 %	0 %	148381604
65	NC_009496	TA	4	8	16094	16101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009496	TA	3	6	16118	16123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.