MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 plasmid pBOT3502

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009496	T	6	6	193	198	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
2	NC_009496	T	6	6	255	260	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
3	NC_009496	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	148381587
4	NC_009496	T	6	6	579	584	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
5	NC_009496	T	6	6	688	693	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
6	NC_009496	T	6	6	965	970	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
7	NC_009496	T	6	6	1010	1015	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
8	NC_009496	T	6	6	1308	1313	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
9	NC_009496	T	6	6	1414	1419	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
10	NC_009496	T	8	8	1577	1584	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
11	NC_009496	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	148381587
12	NC_009496	T	7	7	1931	1937	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
13	NC_009496	T	7	7	2463	2469	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
14	NC_009496	T	6	6	2683	2688	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
15	NC_009496	T	6	6	2792	2797	0 %	100 %	0 %	0 %	148381587
16	NC_009496	T	6	6	3599	3604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009496	T	8	8	3767	3774	0 %	100 %	0 %	0 %	148381588
18	NC_009496	A	6	6	4222	4227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009496	A	6	6	4437	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	148381589
20	NC_009496	A	7	7	4596	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009496	T	6	6	4700	4705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009496	A	6	6	5674	5679	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
23	NC_009496	A	7	7	5844	5850	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
24	NC_009496	A	7	7	6057	6063	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
25	NC_009496	A	6	6	6109	6114	100 %	0 %	0 %	0 %	148381591
26	NC_009496	T	6	6	6204	6209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009496	A	6	6	6214	6219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009496	T	6	6	6290	6295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009496	T	7	7	6347	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	148381592
30	NC_009496	A	6	6	6365	6370	100 %	0 %	0 %	0 %	148381592
31	NC_009496	T	6	6	6522	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	148381592
32	NC_009496	T	6	6	6551	6556	0 %	100 %	0 %	0 %	148381592
33	NC_009496	A	7	7	6875	6881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009496	G	7	7	7226	7232	0 %	0 %	100 %	0 %	148381595
35	NC_009496	T	6	6	7645	7650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009496	A	6	6	8003	8008	100 %	0 %	0 %	0 %	148381596
37	NC_009496	A	6	6	8016	8021	100 %	0 %	0 %	0 %	148381596
38	NC_009496	A	6	6	8478	8483	100 %	0 %	0 %	0 %	148381597
39	NC_009496	A	6	6	9055	9060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009496	A	7	7	9346	9352	100 %	0 %	0 %	0 %	148381598
41	NC_009496	T	6	6	9471	9476	0 %	100 %	0 %	0 %	148381598
42	NC_009496	T	6	6	9495	9500	0 %	100 %	0 %	0 %	148381598
43	NC_009496	A	7	7	9628	9634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009496	T	6	6	9653	9658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009496	T	7	7	9663	9669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009496	T	6	6	9771	9776	0 %	100 %	0 %	0 %	148381599
47	NC_009496	A	9	9	9791	9799	100 %	0 %	0 %	0 %	148381599
48	NC_009496	A	6	6	9841	9846	100 %	0 %	0 %	0 %	148381599
49	NC_009496	T	6	6	10094	10099	0 %	100 %	0 %	0 %	148381600
50	NC_009496	A	9	9	10242	10250	100 %	0 %	0 %	0 %	148381600
51	NC_009496	A	7	7	10424	10430	100 %	0 %	0 %	0 %	148381600
52	NC_009496	T	6	6	10950	10955	0 %	100 %	0 %	0 %	148381600
53	NC_009496	A	7	7	11015	11021	100 %	0 %	0 %	0 %	148381600
54	NC_009496	T	6	6	11310	11315	0 %	100 %	0 %	0 %	148381600
55	NC_009496	A	6	6	11324	11329	100 %	0 %	0 %	0 %	148381600
56	NC_009496	A	8	8	11390	11397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009496	T	6	6	11457	11462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009496	T	6	6	11508	11513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009496	T	6	6	11855	11860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009496	A	6	6	12088	12093	100 %	0 %	0 %	0 %	148381602
61	NC_009496	A	7	7	12321	12327	100 %	0 %	0 %	0 %	148381602
62	NC_009496	A	6	6	12502	12507	100 %	0 %	0 %	0 %	148381602
63	NC_009496	T	7	7	12803	12809	0 %	100 %	0 %	0 %	148381602
64	NC_009496	A	6	6	12867	12872	100 %	0 %	0 %	0 %	148381602
65	NC_009496	G	6	6	13055	13060	0 %	0 %	100 %	0 %	148381602
66	NC_009496	A	6	6	13089	13094	100 %	0 %	0 %	0 %	148381603
67	NC_009496	A	7	7	13429	13435	100 %	0 %	0 %	0 %	148381603
68	NC_009496	A	7	7	13454	13460	100 %	0 %	0 %	0 %	148381603
69	NC_009496	T	6	6	13735	13740	0 %	100 %	0 %	0 %	148381603
70	NC_009496	T	6	6	14474	14479	0 %	100 %	0 %	0 %	148381604
71	NC_009496	T	6	6	14805	14810	0 %	100 %	0 %	0 %	148381604
72	NC_009496	T	8	8	14921	14928	0 %	100 %	0 %	0 %	148381604
73	NC_009496	A	6	6	14962	14967	100 %	0 %	0 %	0 %	148381604
74	NC_009496	A	8	8	14971	14978	100 %	0 %	0 %	0 %	148381604
75	NC_009496	A	8	8	15083	15090	100 %	0 %	0 %	0 %	148381604
76	NC_009496	T	6	6	15273	15278	0 %	100 %	0 %	0 %	148381604
77	NC_009496	A	7	7	15401	15407	100 %	0 %	0 %	0 %	148381604
78	NC_009496	A	7	7	15720	15726	100 %	0 %	0 %	0 %	148381604
79	NC_009496	A	6	6	16046	16051	100 %	0 %	0 %	0 %	148381604
80	NC_009496	A	6	6	16174	16179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.