MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 chromosome

Total Repeats: 507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009495	TCTATT	2	12	1561	1572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009495	AGATTT	2	12	24296	24307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009495	ATTTAG	2	12	25317	25328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009495	ATATAA	2	12	30440	30451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009495	AATATA	2	12	41186	41197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009495	AATATG	2	12	69274	69285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009495	TAAAAA	2	12	84684	84695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009495	AATAAA	2	12	95538	95549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009495	TTTCAA	2	12	100640	100651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009495	TATTAA	2	12	120483	120494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009495	ACATTA	2	12	165616	165627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009495	AAGGAA	2	12	168374	168385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009495	AAACTT	2	12	169432	169443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009495	TTTATT	2	12	171902	171913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009495	ATATTT	2	12	185071	185082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009495	TTTAAT	2	12	195845	195856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009495	AAAAAT	2	12	211160	211171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009495	AATATT	2	12	214863	214874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009495	ATTAAT	2	12	214915	214926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009495	ATTAAT	2	12	216032	216043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009495	ATTATA	2	12	222544	222555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009495	AATTAT	2	12	222566	222577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009495	TATTTT	2	12	223727	223738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009495	ATTTTA	2	12	237944	237955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009495	TTTAAT	2	12	255510	255521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009495	ATTTAA	2	12	265922	265933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009495	TAAGTT	2	12	276498	276509	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009495	ATTAAA	2	12	278303	278314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009495	CTTCAC	2	12	287347	287358	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009495	ATTTAA	2	12	287508	287519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009495	TTGTAA	2	12	294698	294709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009495	TTTATA	2	12	297141	297152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009495	AAAATA	2	12	305205	305216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009495	TAAATA	2	12	305235	305246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009495	TAATTT	2	12	325409	325420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009495	TTTTTA	2	12	325523	325534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009495	TAATTT	2	12	336531	336542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009495	TAAAAG	2	12	339379	339390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009495	AAAGTA	2	12	349342	349353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009495	TTTTAA	2	12	360509	360520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009495	TAAATA	2	12	360526	360537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009495	AAAATG	2	12	360768	360779	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009495	TTTAAT	2	12	372103	372114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009495	ATTAAA	2	12	380398	380409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009495	TAAATT	2	12	383357	383368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009495	GAGATC	2	12	385587	385598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009495	TGTGAG	2	12	392405	392416	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009495	TGTAAA	2	12	395418	395429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009495	TAATAT	2	12	399350	399361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009495	ATTTTA	2	12	402077	402088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009495	TATTTT	2	12	406105	406116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009495	TTAAAA	2	12	422251	422262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009495	AACTTA	2	12	452493	452504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009495	AATAGC	2	12	455836	455847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009495	ATATAA	2	12	463374	463385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009495	AAAAAT	2	12	463771	463782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009495	TTAATA	2	12	463988	463999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009495	ATTAAT	2	12	485026	485037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009495	ATTAAA	2	12	486376	486387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009495	ATTTTT	2	12	494147	494158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009495	TTCAAT	2	12	494261	494272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009495	AAAGCA	2	12	496695	496706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009495	ATATTA	2	12	507376	507387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009495	TTTAAT	2	12	512304	512315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009495	TTTTTA	2	12	515785	515796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009495	TAAAAT	2	12	524945	524956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009495	GTTAAT	2	12	535624	535635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009495	ATTAAA	2	12	537359	537370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009495	AAATAA	2	12	537392	537403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009495	TAAATA	2	12	540768	540779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009495	TTTAAT	2	12	548729	548740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009495	AATTAA	2	12	548804	548815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009495	TAATAT	2	12	551857	551868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009495	TATTAA	2	12	553326	553337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009495	TTTATT	2	12	557557	557568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009495	AAAATA	2	12	563691	563702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009495	TTATAT	2	12	567993	568004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009495	ATGGGG	2	12	569454	569465	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009495	TATAAA	2	12	570402	570413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009495	TTTATT	2	12	571590	571601	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009495	TATAAA	2	12	576381	576392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009495	AATTTT	2	12	585859	585870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009495	ATTAAA	2	12	585904	585915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009495	ATATTT	2	12	585963	585974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009495	AAAGTA	2	12	590645	590656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009495	TAAAAA	2	12	607987	607998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009495	TTTAAT	2	12	608003	608014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009495	TTAAAA	2	12	608123	608134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009495	TTTTAA	2	12	614694	614705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009495	TTTAAA	2	12	617589	617600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009495	TTTAAG	2	12	620784	620795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009495	TAAAAA	2	12	633431	633442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009495	GTATTA	2	12	639081	639092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009495	TACATA	2	12	642585	642596	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009495	TTTAAT	2	12	645022	645033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009495	TTAAAT	2	12	645092	645103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009495	AATATT	2	12	645150	645161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009495	ATTTTT	2	12	649307	649318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009495	TAATCT	2	12	652970	652981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009495	TTTAAT	2	12	657107	657118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009495	TATTGA	2	12	657509	657520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009495	ATGTAT	2	12	667767	667778	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009495	AAATTA	2	12	673197	673208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009495	ATTATA	2	12	674923	674934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009495	ATAAAA	2	12	675038	675049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009495	ATGGAA	2	12	699433	699444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009495	TTTTTA	2	12	707649	707660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009495	TTTAAT	2	12	707690	707701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009495	TTATAA	2	12	711770	711781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009495	TAAATA	2	12	715513	715524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009495	TAAAGT	2	12	720565	720576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009495	TTATTT	2	12	721257	721268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009495	TAAAAT	2	12	724089	724100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009495	AATATA	2	12	739481	739492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009495	TTTTAA	2	12	757307	757318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009495	TTAAAT	2	12	770852	770863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009495	AATATA	2	12	786843	786854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009495	AATTAG	2	12	796048	796059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009495	TTGAAA	2	12	812265	812276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009495	CCTCTA	2	12	836686	836697	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009495	AAAACA	2	12	846897	846908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009495	AATATA	2	12	848541	848552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009495	TATAAA	2	12	849569	849580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009495	TTTTAT	2	12	853841	853852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009495	ACAGCA	2	12	863644	863655	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009495	TATAAA	2	12	863716	863727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009495	ATATTT	2	12	863737	863748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009495	TTCATA	2	12	873735	873746	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009495	ATTAAT	2	12	881927	881938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009495	GAAAAA	2	12	882253	882264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009495	ATTAAA	2	12	891000	891011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009495	TAAAAT	2	12	919153	919164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009495	AAAATA	2	12	919186	919197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009495	ATTAAA	2	12	933007	933018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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