MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 chromosome

Total Repeats: 2004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009495	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148378012
2	NC_009495	AAAAAT	2	12	1340	1351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378012
3	NC_009495	GATAAT	2	12	2159	2170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378013
4	NC_009495	AAGTTA	2	12	2841	2852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378014
5	NC_009495	CAAATA	2	12	3074	3085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148378015
6	NC_009495	ATAAAG	2	12	3170	3181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378015
7	NC_009495	GAAGTA	2	12	4802	4813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148378017
8	NC_009495	TTGATA	2	12	5853	5864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378017
9	NC_009495	GATTAG	2	12	6499	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378018
10	NC_009495	TTTAAA	2	12	7364	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	148378018
11	NC_009495	CAAGCT	2	12	7590	7601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148378018
12	NC_009495	GATATA	2	12	7809	7820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378018
13	NC_009495	ATAGAT	2	12	17723	17734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378022
14	NC_009495	ACAAAT	2	12	18632	18643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148378022
15	NC_009495	AATAAA	2	12	19605	19616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378023
16	NC_009495	GCAAAA	2	12	23461	23472	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148378026
17	NC_009495	TATAAT	2	12	29340	29351	50 %	50 %	0 %	0 %	148378030
18	NC_009495	ATTTAG	2	12	31123	31134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378032
19	NC_009495	ATATAG	2	12	32439	32450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378033
20	NC_009495	AGAAGC	2	12	32857	32868	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148378033
21	NC_009495	AGATGA	2	12	39991	40002	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148378039
22	NC_009495	CTATAG	2	12	40172	40183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148378040
23	NC_009495	AGAAAA	2	12	41995	42006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378043
24	NC_009495	ATGTTT	2	12	47049	47060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148378048
25	NC_009495	ATTTAA	2	12	85106	85117	50 %	50 %	0 %	0 %	148378058
26	NC_009495	ATTATA	2	12	88223	88234	50 %	50 %	0 %	0 %	148378061
27	NC_009495	AATATG	2	12	88243	88254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378061
28	NC_009495	AATTAT	2	12	90265	90276	50 %	50 %	0 %	0 %	148378064
29	NC_009495	GAAAAA	2	12	90806	90817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378065
30	NC_009495	TGTAGA	2	12	91641	91652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378066
31	NC_009495	AAAATA	2	12	93258	93269	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378069
32	NC_009495	GTTTTA	2	12	93491	93502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148378069
33	NC_009495	AGAAAA	2	12	93526	93537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378069
34	NC_009495	GTAAGA	2	12	94930	94941	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148378070
35	NC_009495	ATTTAA	2	12	104632	104643	50 %	50 %	0 %	0 %	148378082
36	NC_009495	ATAAAT	2	12	108581	108592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378084
37	NC_009495	AGTTAA	2	12	110445	110456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378086
38	NC_009495	AGAACA	2	12	113317	113328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148378089
39	NC_009495	AATATA	2	12	115691	115702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378091
40	NC_009495	AGGACA	2	12	116439	116450	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148378092
41	NC_009495	GTAGAT	2	12	116707	116718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378092
42	NC_009495	TACTGA	2	12	119364	119375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148378095
43	NC_009495	AATAAA	2	12	122544	122555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378100
44	NC_009495	GATATA	2	12	122632	122643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378100
45	NC_009495	TAAAGA	2	12	123880	123891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378101
46	NC_009495	TTAAAT	2	12	127651	127662	50 %	50 %	0 %	0 %	148378105
47	NC_009495	TCAAAA	2	12	130167	130178	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148378106
48	NC_009495	TTTGCT	2	12	131193	131204	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148378106
49	NC_009495	GAAAAA	2	12	133328	133339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378108
50	NC_009495	AGGAAA	2	12	133590	133601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378108
51	NC_009495	AATGTA	2	12	134400	134411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378108
52	NC_009495	TGGATA	2	12	137451	137462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378109
53	NC_009495	CATGAA	2	12	138624	138635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148378110
54	NC_009495	ATAAAT	2	12	138738	138749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378110
55	NC_009495	ATAAGA	2	12	144336	144347	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378114
56	NC_009495	ATATAA	2	12	147020	147031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378118
57	NC_009495	ATTTTT	2	12	149941	149952	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148378120
58	NC_009495	GTAAGT	2	12	150175	150186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378120
59	NC_009495	TTGAAA	2	12	150373	150384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378121
60	NC_009495	TGATTT	2	12	150839	150850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148378121
61	NC_009495	AAAGAA	2	12	154968	154979	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378125
62	NC_009495	AATATA	2	12	156047	156058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378126
63	NC_009495	ATTAGT	2	12	158912	158923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378127
64	NC_009495	TTAAAG	2	12	163808	163819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378132
65	NC_009495	TACCTA	2	12	164895	164906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378133
66	NC_009495	GTAGAA	2	12	167882	167893	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148378135
67	NC_009495	AAAAGA	2	12	168441	168452	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378136
68	NC_009495	ATAAAT	2	12	168682	168693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378136
69	NC_009495	ATAGAA	2	12	169101	169112	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378137
70	NC_009495	AGATTT	2	12	169693	169704	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378138
71	NC_009495	AAAGAA	2	12	169880	169891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378138
72	NC_009495	ATGAAT	2	12	171630	171641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378139
73	NC_009495	GTGGTA	2	12	175860	175871	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148378144
74	NC_009495	ATATAA	2	12	177066	177077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378145
75	NC_009495	AGGTAT	2	12	180720	180731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378150
76	NC_009495	AGTTAT	2	12	182967	182978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378153
77	NC_009495	TACAAC	2	12	184060	184071	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148378154
78	NC_009495	AAAAAT	2	12	185602	185613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378155
79	NC_009495	ATGGTA	2	12	189610	189621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378161
80	NC_009495	AACATA	2	12	189678	189689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148378161
81	NC_009495	AATTAA	2	12	192060	192071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378163
82	NC_009495	TAATTT	2	12	192776	192787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378164
83	NC_009495	AATAAA	2	12	193754	193765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378165
84	NC_009495	ATAAAA	2	12	193827	193838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148378165
85	NC_009495	TAAAGT	2	12	196720	196731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378167
86	NC_009495	AATGGT	2	12	200919	200930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378172
87	NC_009495	TTAAAA	2	12	202280	202291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378173
88	NC_009495	TAAATA	2	12	203040	203051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378173
89	NC_009495	AAAGAT	2	12	203657	203668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378173
90	NC_009495	TGTAAT	2	12	208417	208428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378177
91	NC_009495	AAAGAA	2	12	209348	209359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378177
92	NC_009495	GTAGAA	2	12	209585	209596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148378177
93	NC_009495	GAAATA	2	12	210692	210703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378178
94	NC_009495	AATTAA	2	12	211534	211545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378179
95	NC_009495	GAAAAA	2	12	213370	213381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378180
96	NC_009495	CTATAT	2	12	213995	214006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148378180
97	NC_009495	GGGTAA	2	12	217485	217496	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148378182
98	NC_009495	ATATAG	2	12	217975	217986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378183
99	NC_009495	TAAGAT	2	12	218507	218518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378184
100	NC_009495	CAGATA	2	12	219583	219594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148378186
101	NC_009495	GATAAA	2	12	220563	220574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378186
102	NC_009495	TAAAAG	2	12	220981	220992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378186
103	NC_009495	CTATAT	2	12	222134	222145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148378187
104	NC_009495	TATAAA	2	12	223143	223154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378188
105	NC_009495	TTTATA	2	12	229484	229495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378194
106	NC_009495	ATAGAT	2	12	230555	230566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148378195
107	NC_009495	TCATAA	2	12	232041	232052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148378196
108	NC_009495	TTTATA	2	12	234026	234037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378199
109	NC_009495	AAATGA	2	12	234133	234144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378199
110	NC_009495	CTTATT	2	12	238801	238812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148378205
111	NC_009495	ATTTAG	2	12	246134	246145	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148378210
112	NC_009495	TTTAGG	2	12	248295	248306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148378213
113	NC_009495	TATGTT	2	12	252170	252181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148378216
114	NC_009495	AGATAA	2	12	253370	253381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148378217
115	NC_009495	TCAATA	2	12	254640	254651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148378218
116	NC_009495	ATTTTT	2	12	257008	257019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148378220
117	NC_009495	CTGTAG	2	12	257194	257205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148378220
118	NC_009495	GAAAAA	2	12	258400	258411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148378222
119	NC_009495	AGGAAT	2	12	259921	259932	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148378223
120	NC_009495	ATATTA	2	12	260165	260176	50 %	50 %	0 %	0 %	148378223
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352	NC_009495	AGCTGA	2	12	732429	732440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148378632
353	NC_009495	ATCATA	2	12	732514	732525	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148378632
354	NC_009495	AGCATC	2	12	735356	735367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148378639
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