MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 chromosome

Total Repeats: 4395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009495	AATAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	148378015
2	NC_009495	TAAAT	2	10	3603	3612	60 %	40 %	0 %	0 %	148378015
3	NC_009495	TAAAA	2	10	4083	4092	80 %	20 %	0 %	0 %	148378015
4	NC_009495	ACTTT	2	10	5927	5936	20 %	60 %	0 %	20 %	148378017
5	NC_009495	AAGAT	2	10	6315	6324	60 %	20 %	20 %	0 %	148378017
6	NC_009495	TAAAA	2	10	6968	6977	80 %	20 %	0 %	0 %	148378018
7	NC_009495	GGTAA	2	10	9510	9519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009495	TCGTG	2	10	10301	10310	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009495	TAAGT	2	10	12038	12047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009495	AAATT	2	10	14622	14631	60 %	40 %	0 %	0 %	148378019
11	NC_009495	AATAA	2	10	15360	15369	80 %	20 %	0 %	0 %	148378020
12	NC_009495	ATATA	2	10	15738	15747	60 %	40 %	0 %	0 %	148378021
13	NC_009495	TTTTA	2	10	16300	16309	20 %	80 %	0 %	0 %	148378021
14	NC_009495	AATAA	2	10	16649	16658	80 %	20 %	0 %	0 %	148378022
15	NC_009495	TTATT	2	10	17092	17101	20 %	80 %	0 %	0 %	148378022
16	NC_009495	TATAA	2	10	17738	17747	60 %	40 %	0 %	0 %	148378022
17	NC_009495	CAAAG	2	10	18527	18536	60 %	0 %	20 %	20 %	148378022
18	NC_009495	TAATG	2	10	18712	18721	40 %	40 %	20 %	0 %	148378022
19	NC_009495	TAAAA	2	10	19260	19269	80 %	20 %	0 %	0 %	148378022
20	NC_009495	GAAAT	2	10	19549	19558	60 %	20 %	20 %	0 %	148378023
21	NC_009495	ATATT	2	10	19988	19997	40 %	60 %	0 %	0 %	148378023
22	NC_009495	TAATA	2	10	20048	20057	60 %	40 %	0 %	0 %	148378023
23	NC_009495	ATAGT	2	10	21106	21115	40 %	40 %	20 %	0 %	148378024
24	NC_009495	AATTT	2	10	21596	21605	40 %	60 %	0 %	0 %	148378024
25	NC_009495	ATTAT	2	10	22273	22282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009495	CTAAA	2	10	22526	22535	60 %	20 %	0 %	20 %	148378026
27	NC_009495	TGAAA	2	10	22569	22578	60 %	20 %	20 %	0 %	148378026
28	NC_009495	TCAAT	2	10	23184	23193	40 %	40 %	0 %	20 %	148378026
29	NC_009495	TTTAA	2	10	23657	23666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009495	ATTAA	2	10	23677	23686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009495	TATTT	2	10	23749	23758	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009495	TTTTA	2	10	26410	26419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009495	AATTA	2	10	26491	26500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009495	ATATT	2	10	26552	26561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009495	TTAAT	2	10	26965	26974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009495	AATAA	2	10	27855	27864	80 %	20 %	0 %	0 %	148378028
37	NC_009495	TATGT	2	10	28684	28693	20 %	60 %	20 %	0 %	148378029
38	NC_009495	TTATT	2	10	28802	28811	20 %	80 %	0 %	0 %	148378030
39	NC_009495	GGATT	2	10	29005	29014	20 %	40 %	40 %	0 %	148378030
40	NC_009495	ATTAT	2	10	29795	29804	40 %	60 %	0 %	0 %	148378031
41	NC_009495	ATTTT	2	10	30305	30314	20 %	80 %	0 %	0 %	148378031
42	NC_009495	TAATT	2	10	32480	32489	40 %	60 %	0 %	0 %	148378033
43	NC_009495	ATTTT	2	10	33309	33318	20 %	80 %	0 %	0 %	148378034
44	NC_009495	TAAAT	2	10	33647	33656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009495	ATATA	2	10	33935	33944	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009495	AATAA	2	10	35492	35501	80 %	20 %	0 %	0 %	148378035
47	NC_009495	AAAAT	2	10	37101	37110	80 %	20 %	0 %	0 %	148378037
48	NC_009495	CAATA	2	10	37192	37201	60 %	20 %	0 %	20 %	148378037
49	NC_009495	ATATT	2	10	37532	37541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009495	AATAA	2	10	37590	37599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009495	GATTT	2	10	38609	38618	20 %	60 %	20 %	0 %	148378038
52	NC_009495	TAATA	2	10	41142	41151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009495	GAATA	2	10	41229	41238	60 %	20 %	20 %	0 %	148378042
54	NC_009495	TTATT	2	10	41245	41254	20 %	80 %	0 %	0 %	148378042
55	NC_009495	ATAAA	2	10	41624	41633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009495	GATTT	2	10	41979	41988	20 %	60 %	20 %	0 %	148378043
57	NC_009495	ACACC	2	10	42188	42197	40 %	0 %	0 %	60 %	148378043
58	NC_009495	AAAAG	2	10	42238	42247	80 %	0 %	20 %	0 %	148378043
59	NC_009495	ATAGA	2	10	43901	43910	60 %	20 %	20 %	0 %	148378046
60	NC_009495	GCAAT	2	10	44558	44567	40 %	20 %	20 %	20 %	148378046
61	NC_009495	AAAGA	2	10	44575	44584	80 %	0 %	20 %	0 %	148378046
62	NC_009495	AGTAT	2	10	45584	45593	40 %	40 %	20 %	0 %	148378047
63	NC_009495	TTAAT	2	10	46621	46630	40 %	60 %	0 %	0 %	148378048
64	NC_009495	ATTGT	2	10	47804	47813	20 %	60 %	20 %	0 %	148378049
65	NC_009495	ATAGA	2	10	47909	47918	60 %	20 %	20 %	0 %	148378049
66	NC_009495	GGTAA	2	10	48696	48705	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009495	TCGTG	2	10	49487	49496	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009495	TAAGT	2	10	51225	51234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009495	AAAAT	2	10	53076	53085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009495	AATAA	2	10	53750	53759	80 %	20 %	0 %	0 %	148378050
71	NC_009495	GAATA	2	10	54101	54110	60 %	20 %	20 %	0 %	148378050
72	NC_009495	GGTAA	2	10	55324	55333	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009495	TCGTG	2	10	56115	56124	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009495	TAAGT	2	10	58006	58015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009495	AAAAT	2	10	59857	59866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009495	TTATA	2	10	60436	60445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009495	GGTAA	2	10	63422	63431	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009495	TCGTG	2	10	64213	64222	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009495	TAAGT	2	10	65951	65960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009495	AAAAT	2	10	67802	67811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009495	TGATT	2	10	68192	68201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009495	TAAAT	2	10	68436	68445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009495	AAGAA	2	10	68935	68944	80 %	0 %	20 %	0 %	148378053
84	NC_009495	TTATA	2	10	69586	69595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009495	GGTAA	2	10	70481	70490	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009495	TCGTG	2	10	71272	71281	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009495	TAAGT	2	10	73009	73018	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009495	AAAAT	2	10	74860	74869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009495	GAAGA	2	10	75369	75378	60 %	0 %	40 %	0 %	148378054
90	NC_009495	AAATA	2	10	75987	75996	80 %	20 %	0 %	0 %	148378054
91	NC_009495	ATTAT	2	10	76110	76119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009495	TCGTG	2	10	77553	77562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009495	TAAGT	2	10	79291	79300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009495	AAAAT	2	10	81142	81151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009495	ATTTT	2	10	81627	81636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009495	TTGAA	2	10	82548	82557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009495	CAATC	2	10	82699	82708	40 %	20 %	0 %	40 %	148378056
98	NC_009495	TTATT	2	10	84976	84985	20 %	80 %	0 %	0 %	148378058
99	NC_009495	ATTTT	2	10	84993	85002	20 %	80 %	0 %	0 %	148378058
100	NC_009495	ATTTT	2	10	85346	85355	20 %	80 %	0 %	0 %	148378058
101	NC_009495	AAAAT	2	10	85380	85389	80 %	20 %	0 %	0 %	148378058
102	NC_009495	TTTCC	2	10	86061	86070	0 %	60 %	0 %	40 %	148378059
103	NC_009495	ATTTT	2	10	86076	86085	20 %	80 %	0 %	0 %	148378059
104	NC_009495	GAATA	2	10	86635	86644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009495	TATAA	2	10	88213	88222	60 %	40 %	0 %	0 %	148378061
106	NC_009495	AATAT	2	10	89247	89256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009495	TAAAT	2	10	90063	90072	60 %	40 %	0 %	0 %	148378064
108	NC_009495	TAAAT	2	10	90856	90865	60 %	40 %	0 %	0 %	148378065
109	NC_009495	TAGAA	2	10	90985	90994	60 %	20 %	20 %	0 %	148378065
110	NC_009495	GATAG	2	10	92593	92602	40 %	20 %	40 %	0 %	148378068
111	NC_009495	AGGAT	2	10	93294	93303	40 %	20 %	40 %	0 %	148378069
112	NC_009495	AATGG	2	10	93541	93550	40 %	20 %	40 %	0 %	148378069
113	NC_009495	AAATT	2	10	93726	93735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009495	AAAGA	2	10	94282	94291	80 %	0 %	20 %	0 %	148378070
115	NC_009495	ATTTA	2	10	95377	95386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009495	CAATA	2	10	95637	95646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_009495	TTTAA	2	10	96043	96052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009495	AAGTT	2	10	96937	96946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009495	TAAAT	2	10	98398	98407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009495	TATAA	2	10	99493	99502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009495	ATTTT	2	10	100563	100572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009495	ATTTA	2	10	100765	100774	40 %	60 %	0 %	0 %	148378077
123	NC_009495	TAATA	2	10	101035	101044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009495	TAATA	2	10	102220	102229	60 %	40 %	0 %	0 %	148378079
125	NC_009495	ATATT	2	10	104404	104413	40 %	60 %	0 %	0 %	148378081
126	NC_009495	AGAAA	2	10	106904	106913	80 %	0 %	20 %	0 %	148378083
127	NC_009495	AAAAC	2	10	106949	106958	80 %	0 %	0 %	20 %	148378083
128	NC_009495	AAATT	2	10	107919	107928	60 %	40 %	0 %	0 %	148378084
129	NC_009495	AAATG	2	10	108187	108196	60 %	20 %	20 %	0 %	148378084
130	NC_009495	GAAGT	2	10	109200	109209	40 %	20 %	40 %	0 %	148378085
131	NC_009495	AGATA	2	10	109822	109831	60 %	20 %	20 %	0 %	148378085
132	NC_009495	GAAAA	2	10	110765	110774	80 %	0 %	20 %	0 %	148378086
133	NC_009495	ACATT	2	10	113776	113785	40 %	40 %	0 %	20 %	148378089
134	NC_009495	AAAAT	2	10	116264	116273	80 %	20 %	0 %	0 %	148378092
135	NC_009495	ATTTA	2	10	117241	117250	40 %	60 %	0 %	0 %	148378093
136	NC_009495	GTTAT	2	10	119852	119861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009495	GAAAT	2	10	120552	120561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009495	ATTTT	2	10	121593	121602	20 %	80 %	0 %	0 %	148378099
139	NC_009495	ATACA	2	10	122110	122119	60 %	20 %	0 %	20 %	148378100
140	NC_009495	AATAT	2	10	122414	122423	60 %	40 %	0 %	0 %	148378100
141	NC_009495	TAAAA	2	10	122706	122715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009495	AAGAA	2	10	123679	123688	80 %	0 %	20 %	0 %	148378101
143	NC_009495	TAATA	2	10	123967	123976	60 %	40 %	0 %	0 %	148378101
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