MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 chromosome

Total Repeats: 61639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009495	AAT	2	6	115	120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378012
2	NC_009495	ACT	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378012
3	NC_009495	GAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
4	NC_009495	AGA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
5	NC_009495	ATA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378012
6	NC_009495	ATG	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378012
7	NC_009495	CTA	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378012
8	NC_009495	GCA	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148378012
9	NC_009495	TGG	2	6	450	455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148378012
10	NC_009495	AGT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378012
11	NC_009495	TCT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148378012
12	NC_009495	GAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378012
13	NC_009495	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378012
14	NC_009495	AAT	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378012
15	NC_009495	AGA	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
16	NC_009495	TAA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378012
17	NC_009495	TAG	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378012
18	NC_009495	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378012
19	NC_009495	TAA	2	6	987	992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378012
20	NC_009495	ATT	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378012
21	NC_009495	AAG	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
22	NC_009495	TAT	2	6	1096	1101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378012
23	NC_009495	AGA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
24	NC_009495	AGA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
25	NC_009495	GAA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378012
26	NC_009495	TAC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378012
27	NC_009495	TAA	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378012
28	NC_009495	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009495	TTG	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009495	ATT	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009495	TTA	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009495	CAA	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009495	CTA	6	18	1530	1547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009495	TAT	2	6	1551	1556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009495	TAA	2	6	1590	1595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009495	AGG	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009495	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378013
38	NC_009495	TTA	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378013
39	NC_009495	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
40	NC_009495	AGA	2	6	1795	1800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
41	NC_009495	ATA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
42	NC_009495	AGA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
43	NC_009495	ATA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
44	NC_009495	TAT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378013
45	NC_009495	TAG	2	6	2112	2117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378013
46	NC_009495	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
47	NC_009495	GTT	2	6	2153	2158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148378013
48	NC_009495	AGA	3	9	2224	2232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
49	NC_009495	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
50	NC_009495	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378013
51	NC_009495	TTA	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378013
52	NC_009495	GAA	2	6	2351	2356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
53	NC_009495	ATA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
54	NC_009495	AAG	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
55	NC_009495	GAT	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378013
56	NC_009495	TAA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
57	NC_009495	GAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378013
58	NC_009495	AGT	2	6	2627	2632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378013
59	NC_009495	TAT	2	6	2644	2649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378013
60	NC_009495	AAT	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378013
61	NC_009495	ATA	2	6	2759	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378014
62	NC_009495	CAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148378014
63	NC_009495	GAC	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148378014
64	NC_009495	TAA	2	6	2911	2916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378014
65	NC_009495	ATT	2	6	2930	2935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378014
66	NC_009495	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009495	TAT	2	6	2976	2981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009495	TAA	2	6	3029	3034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
69	NC_009495	ATG	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378015
70	NC_009495	TAA	2	6	3096	3101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
71	NC_009495	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
72	NC_009495	TGT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148378015
73	NC_009495	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378015
74	NC_009495	AAT	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
75	NC_009495	TAT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378015
76	NC_009495	ATA	2	6	3467	3472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
77	NC_009495	ATG	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378015
78	NC_009495	ATT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378015
79	NC_009495	AAG	2	6	3634	3639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378015
80	NC_009495	AGA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378015
81	NC_009495	ATT	2	6	3714	3719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378015
82	NC_009495	GAT	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378015
83	NC_009495	ACA	2	6	3843	3848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148378015
84	NC_009495	CAT	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378015
85	NC_009495	ATA	2	6	3889	3894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
86	NC_009495	ATA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
87	NC_009495	GAT	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378015
88	NC_009495	TAA	2	6	4004	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
89	NC_009495	AGA	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378015
90	NC_009495	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378015
91	NC_009495	TTC	2	6	4126	4131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148378016
92	NC_009495	GTA	3	9	4146	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378016
93	NC_009495	TTG	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148378016
94	NC_009495	AGG	2	6	4391	4396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009495	ATG	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378017
96	NC_009495	TCA	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378017
97	NC_009495	ATA	2	6	4545	4550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378017
98	NC_009495	CTG	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148378017
99	NC_009495	TAA	2	6	4689	4694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378017
100	NC_009495	TGG	3	9	4723	4731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148378017
101	NC_009495	TGG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148378017
102	NC_009495	TGT	2	6	4774	4779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148378017
103	NC_009495	AGA	2	6	4814	4819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378017
104	NC_009495	TGA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378017
105	NC_009495	CAA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148378017
106	NC_009495	TGA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378017
107	NC_009495	GAT	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378017
108	NC_009495	CAG	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148378017
109	NC_009495	TAG	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378017
110	NC_009495	ATA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378017
111	NC_009495	AGA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378017
112	NC_009495	TTC	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148378017
113	NC_009495	CAT	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378017
114	NC_009495	GAA	2	6	5712	5717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378017
115	NC_009495	ATA	2	6	5874	5879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378017
116	NC_009495	AAT	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378017
117	NC_009495	ACC	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148378017
118	NC_009495	TGC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148378017
119	NC_009495	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378017
120	NC_009495	AAC	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148378017
121	NC_009495	ACT	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378017
122	NC_009495	TTA	2	6	6185	6190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378017
123	NC_009495	AAG	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378017
124	NC_009495	AGT	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378017
125	NC_009495	GAA	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378018
126	NC_009495	AGA	2	6	6474	6479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378018
127	NC_009495	ATA	2	6	6480	6485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148378018
128	NC_009495	ATC	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148378018
129	NC_009495	CAG	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148378018
130	NC_009495	TAG	2	6	6643	6648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378018
131	NC_009495	AGC	3	9	6686	6694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148378018
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133	NC_009495	TTC	2	6	6848	6853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148378018
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266	NC_009495	AAG	2	6	16689	16694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148378022
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269	NC_009495	TTA	2	6	16800	16805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148378022
270	NC_009495	GTA	2	6	16823	16828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148378022
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307	NC_009495	ATA	2	6	19363	19368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_009495	ATT	2	6	23690	23695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_009495	TAT	2	6	23716	23721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_009495	TAA	3	9	23769	23777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_009495	AAT	2	6	24246	24251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_009495	AAT	2	6	24322	24327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_009495	TTA	2	6	24370	24375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_009495	TAT	2	6	24639	24644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_009495	GAA	2	6	24906	24911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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