MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila str. Corby chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009494	CTTTTC	2	12	431	442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009494	AATGCA	2	12	4258	4269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009494	TCGAAT	2	12	11104	11115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009494	TCCGTG	2	12	30453	30464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009494	GTTTAT	2	12	31711	31722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009494	ATTCAT	2	12	84520	84531	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009494	CTTATT	2	12	100443	100454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009494	TTAATA	2	12	144086	144097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009494	TTGCTT	2	12	233854	233865	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009494	TGGAAA	2	12	236511	236522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009494	TCAACA	2	12	245894	245905	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009494	TAATTT	2	12	259318	259329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009494	ATAATT	2	12	327019	327030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009494	TGTCCA	2	12	368116	368127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009494	CATTTG	2	12	415763	415774	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009494	TGAAAT	2	12	417633	417644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009494	ATTTAA	2	12	421621	421632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009494	TCTTAT	2	12	467228	467239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_009494	TTATTT	2	12	529110	529121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009494	CTTGGT	2	12	563708	563719	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009494	GATTAA	2	12	564877	564888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009494	TTAAAT	2	12	566003	566014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009494	TAAAAT	2	12	580276	580287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009494	TAATTA	2	12	635264	635275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009494	AGGGCA	2	12	671909	671920	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009494	AATCAA	2	12	681466	681477	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009494	TTTAAA	2	12	687169	687180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009494	CATTTG	2	12	701623	701634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009494	TGAAAT	2	12	703493	703504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009494	TAAAAT	2	12	713570	713581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009494	ATTTAT	2	12	716618	716629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009494	TGGACT	2	12	722936	722947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009494	CATGCT	2	12	723234	723245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009494	GCCTTG	2	12	841680	841691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009494	AAATGG	2	12	969492	969503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009494	TTTGTT	2	12	975737	975748	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009494	TTTTTA	2	12	1007521	1007532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009494	AATAAC	2	12	1010542	1010553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009494	GCCTTG	2	12	1018251	1018262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009494	AAAGAG	2	12	1090657	1090668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009494	TTTCGT	2	12	1107770	1107781	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_009494	AAGTGC	2	12	1109011	1109022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009494	TTTTAT	2	12	1132533	1132544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009494	TTAAAA	2	12	1163259	1163270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009494	ATTTTT	2	12	1173482	1173493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009494	ATGCAA	2	12	1217758	1217769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009494	TATTCT	2	12	1273471	1273482	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_009494	ATTAAC	2	12	1287723	1287734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009494	AAGTCC	2	12	1288266	1288277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009494	TTACTG	2	12	1289349	1289360	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_009494	TAATTT	2	12	1301434	1301445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009494	AAGTCC	2	12	1302319	1302330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009494	CTGACC	2	12	1310819	1310830	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009494	TGTTTT	2	12	1354349	1354360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009494	AATTTT	2	12	1411978	1411989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009494	TTTTAT	2	12	1456440	1456451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009494	GACTTT	2	12	1480460	1480471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009494	AATGAT	2	12	1530594	1530605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009494	ATCATT	2	12	1531800	1531811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009494	AAATTG	2	12	1541241	1541252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009494	TAAAAA	2	12	1569863	1569874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009494	TTAAAA	2	12	1574097	1574108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009494	TAAAAA	2	12	1578027	1578038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009494	TTTTTA	2	12	1581826	1581837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009494	AGTTTT	2	12	1589264	1589275	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009494	CAGTAC	2	12	1600952	1600963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009494	AATCAT	2	12	1602092	1602103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009494	CAAAAT	2	12	1644444	1644455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009494	GATATT	2	12	1722426	1722437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009494	TGGACT	2	12	1755165	1755176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_009494	CATGCT	2	12	1755463	1755474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009494	AAAATT	2	12	1762313	1762324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009494	TATTTT	2	12	1819995	1820006	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009494	AGTTAA	2	12	1899029	1899040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009494	AAAAAT	2	12	1909437	1909448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009494	AGACTT	2	12	1926936	1926947	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009494	ATCAAC	2	12	1942395	1942406	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009494	AACCTC	2	12	1998218	1998229	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009494	AAGTCC	2	12	1999432	1999443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009494	AAAAAT	2	12	2112363	2112374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009494	TCAAAA	2	12	2149192	2149203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009494	CTTTTT	2	12	2154141	2154152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009494	ATTTAG	2	12	2157791	2157802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009494	ACTTTT	2	12	2178216	2178227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009494	TGTTAT	2	12	2194261	2194272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009494	TTACAT	2	12	2246206	2246217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009494	TTAATT	2	12	2259406	2259417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009494	TGACAA	2	12	2296608	2296619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_009494	CTGAAT	2	12	2316604	2316615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009494	AAATTA	2	12	2327902	2327913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009494	ACAAAA	2	12	2328523	2328534	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_009494	TGTAAT	2	12	2345055	2345066	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009494	AGTTAT	2	12	2378180	2378191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009494	TTTTTA	2	12	2415769	2415780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009494	TAAATA	2	12	2456689	2456700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009494	AAGTCC	2	12	2460646	2460657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009494	ATTCTG	2	12	2473799	2473810	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009494	AATTTA	2	12	2481832	2481843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009494	ACTTTG	2	12	2532552	2532563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009494	TATTAA	2	12	2547265	2547276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009494	AAGTCC	2	12	2585973	2585984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009494	CCAAGG	2	12	2609420	2609431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009494	ATTTTA	2	12	2614729	2614740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009494	TCAAAG	2	12	2649137	2649148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_009494	ATTTTT	2	12	2652936	2652947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009494	TAAAAA	2	12	2711910	2711921	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009494	GCGGGA	2	12	2717357	2717368	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009494	AAAGAA	2	12	2888100	2888111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009494	CATAAA	2	12	2972081	2972092	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_009494	TGAATT	2	12	3023914	3023925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009494	TTGATT	2	12	3024499	3024510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009494	GACAGG	2	12	3025592	3025603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_009494	GCTTAT	2	12	3047685	3047696	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_009494	AGAAAC	2	12	3064136	3064147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_009494	GAATAA	2	12	3139637	3139648	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009494	TATTTG	2	12	3171990	3172001	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009494	AAAATC	2	12	3223754	3223765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009494	TTCTGA	2	12	3232580	3232591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009494	ATAAAA	2	12	3239854	3239865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009494	AAGTCC	2	12	3261788	3261799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009494	TCCTTA	2	12	3263273	3263284	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009494	ATTTCA	2	12	3276796	3276807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009494	CAAATG	2	12	3278666	3278677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009494	TTATTT	2	12	3319513	3319524	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009494	TCATTT	2	12	3353305	3353316	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_009494	CAAGGT	2	12	3370795	3370806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_009494	CTTATT	2	12	3397086	3397097	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009494	CAAGGT	2	12	3431983	3431994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009494	ACATCC	2	12	3445806	3445817	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009494	CCAAGC	2	12	3448779	3448790	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009494	TATGAA	2	12	3448803	3448814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009494	TATACC	2	12	3449813	3449824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009494	TATTTT	2	12	3469959	3469970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009494	GCTCTT	2	12	3502457	3502468	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009494	CTTATT	2	12	3538606	3538617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.