MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 chromosome

Total Repeats: 1567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009487	GTTGAA	2	12	3246	3257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266449
2	NC_009487	ATAAAT	2	12	3347	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009487	TTTAAA	2	12	3524	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009487	GTTATC	2	12	7352	7363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266453
5	NC_009487	CAGATA	2	12	8261	8272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266453
6	NC_009487	CAAGCT	2	12	8320	8331	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266453
7	NC_009487	GTAATG	2	12	9308	9319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266453
8	NC_009487	AGATGA	2	12	9711	9722	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266453
9	NC_009487	ACAATT	2	12	11314	11325	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266455
10	NC_009487	TAGCAT	2	12	11409	11420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266455
11	NC_009487	TAAATC	2	12	17227	17238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009487	GCTTTA	2	12	17505	17516	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266460
13	NC_009487	TTTGAA	2	12	18326	18337	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266460
14	NC_009487	TTGGTG	2	12	19170	19181	0 %	50 %	50 %	0 %	148266461
15	NC_009487	TAAAGG	2	12	20373	20384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266462
16	NC_009487	TTGAAG	2	12	20570	20581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266462
17	NC_009487	TGATTG	2	12	21774	21785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266463
18	NC_009487	TGAAAT	2	12	22105	22116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266463
19	NC_009487	AAGGAA	2	12	22543	22554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148266464
20	NC_009487	TGAATT	2	12	25471	25482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266465
21	NC_009487	ATTTCA	2	12	27955	27966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266467
22	NC_009487	ATCAGC	2	12	31270	31281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266470
23	NC_009487	AAAAGA	2	12	33911	33922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148266471
24	NC_009487	ACATCT	2	12	35565	35576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148266472
25	NC_009487	GTTTAA	2	12	36708	36719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266473
26	NC_009487	AAAAAT	2	12	37402	37413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009487	AATGAA	2	12	38638	38649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266475
28	NC_009487	ACAACT	2	12	40703	40714	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148266476
29	NC_009487	TTTTCT	2	12	51524	51535	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148266486
30	NC_009487	AATTAA	2	12	51714	51725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148266486
31	NC_009487	GGCATG	2	12	52345	52356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148266487
32	NC_009487	TAAAAA	2	12	53507	53518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266487
33	NC_009487	CATTAA	2	12	54143	54154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266488
34	NC_009487	ATTTTT	2	12	63793	63804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009487	ATAAGA	2	12	66249	66260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266501
36	NC_009487	AAATAA	2	12	67914	67925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266503
37	NC_009487	TTTAAT	2	12	78981	78992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148266509
38	NC_009487	ACAAAT	2	12	81396	81407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148266512
39	NC_009487	AATTAA	2	12	81487	81498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148266512
40	NC_009487	ATTTAT	2	12	83908	83919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009487	TTAATG	2	12	84432	84443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266513
42	NC_009487	AAGTCA	2	12	85637	85648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266515
43	NC_009487	AAAAAG	2	12	85751	85762	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148266515
44	NC_009487	GAAAAA	2	12	86064	86075	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148266515
45	NC_009487	AATTAT	2	12	88303	88314	50 %	50 %	0 %	0 %	148266517
46	NC_009487	ACCCTT	2	12	90142	90153	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148266519
47	NC_009487	TTTAGC	2	12	92051	92062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266521
48	NC_009487	AAATAA	2	12	92102	92113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148266521
49	NC_009487	GTTAGA	2	12	94220	94231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009487	AAAAGA	2	12	94274	94285	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009487	GCTAAA	2	12	97062	97073	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266523
52	NC_009487	AACAAA	2	12	97483	97494	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009487	TAAAGA	2	12	101210	101221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266528
54	NC_009487	AACCAC	2	12	105082	105093	50 %	0 %	0 %	50 %	148266530
55	NC_009487	AATATA	2	12	106784	106795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009487	AACCGA	2	12	108393	108404	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148266532
57	NC_009487	ATAGAT	2	12	113293	113304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266535
58	NC_009487	TATCAT	2	12	114060	114071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266536
59	NC_009487	TTTATT	2	12	114468	114479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148266537
60	NC_009487	TATTTG	2	12	114554	114565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148266537
61	NC_009487	TAAATA	2	12	115987	115998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148266537
62	NC_009487	TTTTTC	2	12	117831	117842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148266538
63	NC_009487	TTAAAT	2	12	117926	117937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009487	TAACAA	2	12	119283	119294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009487	TAAGCC	2	12	119692	119703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266540
66	NC_009487	ATCGCA	2	12	120907	120918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148266541
67	NC_009487	TTTGAA	2	12	121938	121949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266542
68	NC_009487	CAATGG	2	12	130896	130907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148266548
69	NC_009487	TGAAGA	2	12	131730	131741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266549
70	NC_009487	TTTCAT	2	12	132411	132422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148266550
71	NC_009487	TGTATA	2	12	136631	136642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266554
72	NC_009487	TCGAAA	2	12	138132	138143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148266556
73	NC_009487	CTATTG	2	12	140718	140729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266558
74	NC_009487	CATATG	2	12	141921	141932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266559
75	NC_009487	AATGTA	2	12	142822	142833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009487	CTGTAA	2	12	144643	144654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_009487	GGTATG	2	12	144964	144975	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148266562
78	NC_009487	CAGATT	2	12	147562	147573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266564
79	NC_009487	AGATAT	2	12	154940	154951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266571
80	NC_009487	GTTTTT	2	12	155849	155860	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009487	ATGCCT	2	12	156079	156090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148266572
82	NC_009487	TGAAAG	2	12	156719	156730	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148266572
83	NC_009487	GATATG	2	12	164219	164230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148266578
84	NC_009487	ATTTGA	2	12	168125	168136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266581
85	NC_009487	GATTTT	2	12	172636	172647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148266586
86	NC_009487	ACAAAG	2	12	177156	177167	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148266590
87	NC_009487	TGTAAT	2	12	178180	178191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266591
88	NC_009487	AAAGAT	2	12	179169	179180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266593
89	NC_009487	ATTAAT	2	12	181075	181086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009487	CAATAT	2	12	181641	181652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266594
91	NC_009487	TCCCAC	2	12	182333	182344	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009487	TTGGTA	2	12	185667	185678	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266599
93	NC_009487	GCGATT	2	12	185687	185698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148266599
94	NC_009487	AAATTT	2	12	185785	185796	50 %	50 %	0 %	0 %	148266599
95	NC_009487	ACCTGC	2	12	188687	188698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148266602
96	NC_009487	AAGATA	2	12	188833	188844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266602
97	NC_009487	CGTTAA	2	12	191767	191778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148266604
98	NC_009487	CTATTA	2	12	193618	193629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266604
99	NC_009487	TATGAT	2	12	195152	195163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148266604
100	NC_009487	TTGAAA	2	12	195604	195615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266604
101	NC_009487	AACATT	2	12	198044	198055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266604
102	NC_009487	AGCAAC	2	12	201533	201544	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148266608
103	NC_009487	TGTTTG	2	12	201581	201592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148266608
104	NC_009487	CACCTT	2	12	203585	203596	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148266610
105	NC_009487	ACCTTT	2	12	204090	204101	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148266610
106	NC_009487	TTTATA	2	12	204186	204197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009487	ATTAAT	2	12	204209	204220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009487	GTAAAT	2	12	207829	207840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266613
109	NC_009487	ATTTTA	2	12	209424	209435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148266614
110	NC_009487	TATCTT	2	12	214038	214049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148266617
111	NC_009487	ATTTGG	2	12	215051	215062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266618
112	NC_009487	GAGTTT	2	12	218394	218405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148266620
113	NC_009487	TATACA	2	12	222394	222405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148266624
114	NC_009487	TTATTT	2	12	224426	224437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148266626
115	NC_009487	ATTTAT	2	12	225005	225016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148266626
116	NC_009487	TTTTTA	2	12	225036	225047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009487	CCCTGA	2	12	227763	227774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148266630
118	NC_009487	TCCTGA	2	12	228582	228593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148266630
119	NC_009487	TCAATT	2	12	230733	230744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148266632
120	NC_009487	AATATG	2	12	232033	232044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148266633
121	NC_009487	GATTTT	2	12	235189	235200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_009487	GGACTT	2	12	493416	493427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148266898
231	NC_009487	ATTTAT	2	12	495545	495556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_009487	CAAATA	2	12	500050	500061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148266905
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235	NC_009487	TTTTTA	2	12	506130	506141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_009487	CGATTT	2	12	507751	507762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148266912
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239	NC_009487	TAAAGA	2	12	510002	510013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148266912
240	NC_009487	AAAATG	2	12	511563	511574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_009487	GACTCA	2	12	656475	656486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148267023
352	NC_009487	GACTCA	2	12	656493	656504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148267023
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