MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 5913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009485	GCATC	2	10	792	801	20 %	20 %	20 %	40 %	148251627
2	NC_009485	TGCGC	2	10	824	833	0 %	20 %	40 %	40 %	148251627
3	NC_009485	ACCAC	2	10	1892	1901	40 %	0 %	0 %	60 %	148251627
4	NC_009485	GCGCC	2	10	3999	4008	0 %	0 %	40 %	60 %	148251630
5	NC_009485	TCGGC	2	10	4166	4175	0 %	20 %	40 %	40 %	148251630
6	NC_009485	AGCGC	2	10	6222	6231	20 %	0 %	40 %	40 %	148251633
7	NC_009485	AAGGC	2	10	7338	7347	40 %	0 %	40 %	20 %	148251633
8	NC_009485	GCCGC	2	10	7457	7466	0 %	0 %	40 %	60 %	148251633
9	NC_009485	AGCGC	2	10	7506	7515	20 %	0 %	40 %	40 %	148251633
10	NC_009485	CCTCG	2	10	8972	8981	0 %	20 %	20 %	60 %	148251634
11	NC_009485	GTGCT	2	10	9264	9273	0 %	40 %	40 %	20 %	148251634
12	NC_009485	GCCGC	2	10	10802	10811	0 %	0 %	40 %	60 %	148251634
13	NC_009485	TTCCG	2	10	11953	11962	0 %	40 %	20 %	40 %	148251636
14	NC_009485	GCACG	2	10	12712	12721	20 %	0 %	40 %	40 %	148251637
15	NC_009485	CAGAC	2	10	13035	13044	40 %	0 %	20 %	40 %	148251637
16	NC_009485	GCCGC	2	10	17390	17399	0 %	0 %	40 %	60 %	148251641
17	NC_009485	GCGCC	2	10	17444	17453	0 %	0 %	40 %	60 %	148251641
18	NC_009485	TGGCG	2	10	20290	20299	0 %	20 %	60 %	20 %	148251643
19	NC_009485	TCGTC	2	10	23153	23162	0 %	40 %	20 %	40 %	148251645
20	NC_009485	GGCGA	2	10	24715	24724	20 %	0 %	60 %	20 %	148251647
21	NC_009485	GGATC	2	10	27440	27449	20 %	20 %	40 %	20 %	148251651
22	NC_009485	CGCGA	2	10	28485	28494	20 %	0 %	40 %	40 %	148251652
23	NC_009485	CGTTG	2	10	28827	28836	0 %	40 %	40 %	20 %	148251652
24	NC_009485	GGCGC	2	10	29552	29561	0 %	0 %	60 %	40 %	148251653
25	NC_009485	GCCGC	2	10	30759	30768	0 %	0 %	40 %	60 %	148251654
26	NC_009485	CGCGG	2	10	30901	30910	0 %	0 %	60 %	40 %	148251654
27	NC_009485	ACCTG	2	10	31813	31822	20 %	20 %	20 %	40 %	148251655
28	NC_009485	CTGGC	2	10	31968	31977	0 %	20 %	40 %	40 %	148251655
29	NC_009485	GCGCG	2	10	32515	32524	0 %	0 %	60 %	40 %	148251655
30	NC_009485	GCCGC	2	10	35925	35934	0 %	0 %	40 %	60 %	148251658
31	NC_009485	GGCCG	2	10	36196	36205	0 %	0 %	60 %	40 %	148251658
32	NC_009485	CGCTC	2	10	37185	37194	0 %	20 %	20 %	60 %	148251659
33	NC_009485	GGCGC	2	10	39619	39628	0 %	0 %	60 %	40 %	148251661
34	NC_009485	TCGCC	2	10	39645	39654	0 %	20 %	20 %	60 %	148251661
35	NC_009485	CGATC	2	10	39988	39997	20 %	20 %	20 %	40 %	148251661
36	NC_009485	ACCGG	2	10	42074	42083	20 %	0 %	40 %	40 %	148251663
37	NC_009485	GCCGC	2	10	44071	44080	0 %	0 %	40 %	60 %	148251666
38	NC_009485	GCGTC	2	10	44486	44495	0 %	20 %	40 %	40 %	148251667
39	NC_009485	CCGCG	2	10	47561	47570	0 %	0 %	40 %	60 %	148251671
40	NC_009485	ATCAC	2	10	47650	47659	40 %	20 %	0 %	40 %	148251671
41	NC_009485	CGGCC	2	10	47933	47942	0 %	0 %	40 %	60 %	148251671
42	NC_009485	CGGCT	2	10	48048	48057	0 %	20 %	40 %	40 %	148251671
43	NC_009485	CAGGT	2	10	48405	48414	20 %	20 %	40 %	20 %	148251671
44	NC_009485	CGCGC	2	10	50055	50064	0 %	0 %	40 %	60 %	148251673
45	NC_009485	GATCA	2	10	53082	53091	40 %	20 %	20 %	20 %	148251676
46	NC_009485	CGGGC	2	10	53306	53315	0 %	0 %	60 %	40 %	148251676
47	NC_009485	TCGCC	2	10	56174	56183	0 %	20 %	20 %	60 %	148251678
48	NC_009485	GGCGA	2	10	56720	56729	20 %	0 %	60 %	20 %	148251679
49	NC_009485	AGGCG	2	10	59246	59255	20 %	0 %	60 %	20 %	148251681
50	NC_009485	CGGTC	2	10	60533	60542	0 %	20 %	40 %	40 %	148251681
51	NC_009485	GCCGC	2	10	62197	62206	0 %	0 %	40 %	60 %	148251683
52	NC_009485	CTGGC	2	10	65007	65016	0 %	20 %	40 %	40 %	148251685
53	NC_009485	CGCGC	2	10	65444	65453	0 %	0 %	40 %	60 %	148251685
54	NC_009485	GGCGA	2	10	65595	65604	20 %	0 %	60 %	20 %	148251685
55	NC_009485	GACCA	2	10	65868	65877	40 %	0 %	20 %	40 %	148251685
56	NC_009485	GCTGC	2	10	66485	66494	0 %	20 %	40 %	40 %	148251686
57	NC_009485	CATCG	2	10	70154	70163	20 %	20 %	20 %	40 %	148251691
58	NC_009485	CGGCA	2	10	70361	70370	20 %	0 %	40 %	40 %	148251691
59	NC_009485	TGGCG	2	10	70842	70851	0 %	20 %	60 %	20 %	148251692
60	NC_009485	CATCG	2	10	71097	71106	20 %	20 %	20 %	40 %	148251692
61	NC_009485	GCTGG	2	10	71951	71960	0 %	20 %	60 %	20 %	148251693
62	NC_009485	CATCG	2	10	73742	73751	20 %	20 %	20 %	40 %	148251695
63	NC_009485	CCGGC	2	10	75605	75614	0 %	0 %	40 %	60 %	148251697
64	NC_009485	CAATG	2	10	75638	75647	40 %	20 %	20 %	20 %	148251697
65	NC_009485	GCGCC	2	10	76897	76906	0 %	0 %	40 %	60 %	148251698
66	NC_009485	CGCGG	2	10	77171	77180	0 %	0 %	60 %	40 %	148251698
67	NC_009485	CGCGC	2	10	78555	78564	0 %	0 %	40 %	60 %	148251699
68	NC_009485	CTGAG	2	10	81256	81265	20 %	20 %	40 %	20 %	148251702
69	NC_009485	GACCA	2	10	81572	81581	40 %	0 %	20 %	40 %	148251703
70	NC_009485	ACCGC	2	10	83018	83027	20 %	0 %	20 %	60 %	148251704
71	NC_009485	GGCCG	2	10	84876	84885	0 %	0 %	60 %	40 %	148251705
72	NC_009485	CCGGT	2	10	84998	85007	0 %	20 %	40 %	40 %	148251705
73	NC_009485	TGCGC	2	10	86656	86665	0 %	20 %	40 %	40 %	148251707
74	NC_009485	GCCAT	2	10	86709	86718	20 %	20 %	20 %	40 %	148251707
75	NC_009485	TGCCC	2	10	86860	86869	0 %	20 %	20 %	60 %	148251707
76	NC_009485	CGCAA	2	10	88644	88653	40 %	0 %	20 %	40 %	148251707
77	NC_009485	GCGTG	2	10	90182	90191	0 %	20 %	60 %	20 %	148251708
78	NC_009485	CCGCG	2	10	91155	91164	0 %	0 %	40 %	60 %	148251710
79	NC_009485	GGCCG	2	10	93186	93195	0 %	0 %	60 %	40 %	148251711
80	NC_009485	CGCGG	2	10	93479	93488	0 %	0 %	60 %	40 %	148251711
81	NC_009485	CGGCG	2	10	93557	93566	0 %	0 %	60 %	40 %	148251711
82	NC_009485	GTCGC	2	10	93954	93963	0 %	20 %	40 %	40 %	148251711
83	NC_009485	GCGCC	2	10	94550	94559	0 %	0 %	40 %	60 %	148251711
84	NC_009485	CCGCG	2	10	95815	95824	0 %	0 %	40 %	60 %	148251712
85	NC_009485	GCGCC	2	10	95992	96001	0 %	0 %	40 %	60 %	148251712
86	NC_009485	ACCGA	2	10	96015	96024	40 %	0 %	20 %	40 %	148251712
87	NC_009485	GGCGC	2	10	96676	96685	0 %	0 %	60 %	40 %	148251712
88	NC_009485	GCGCC	2	10	97102	97111	0 %	0 %	40 %	60 %	148251712
89	NC_009485	CGGTC	2	10	98613	98622	0 %	20 %	40 %	40 %	148251713
90	NC_009485	TGACG	2	10	99119	99128	20 %	20 %	40 %	20 %	148251714
91	NC_009485	GCGTG	2	10	100438	100447	0 %	20 %	60 %	20 %	148251715
92	NC_009485	ACGCC	2	10	100906	100915	20 %	0 %	20 %	60 %	148251716
93	NC_009485	GCCGA	2	10	101846	101855	20 %	0 %	40 %	40 %	148251716
94	NC_009485	ATCGG	2	10	103824	103833	20 %	20 %	40 %	20 %	161763536
95	NC_009485	CGCGC	2	10	105244	105253	0 %	0 %	40 %	60 %	148251720
96	NC_009485	GCCGG	2	10	105998	106007	0 %	0 %	60 %	40 %	148251721
97	NC_009485	GCGCG	2	10	107310	107319	0 %	0 %	60 %	40 %	148251723
98	NC_009485	TCGCG	2	10	108122	108131	0 %	20 %	40 %	40 %	148251724
99	NC_009485	CCTCG	2	10	114703	114712	0 %	20 %	20 %	60 %	148251731
100	NC_009485	TGCGC	2	10	114814	114823	0 %	20 %	40 %	40 %	148251731
101	NC_009485	GACAC	2	10	116414	116423	40 %	0 %	20 %	40 %	148251732
102	NC_009485	CGCGC	2	10	120139	120148	0 %	0 %	40 %	60 %	148251735
103	NC_009485	GGCCA	2	10	120701	120710	20 %	0 %	40 %	40 %	148251736
104	NC_009485	CGGCG	2	10	121369	121378	0 %	0 %	60 %	40 %	148251738
105	NC_009485	TCCTG	2	10	122547	122556	0 %	40 %	20 %	40 %	148251739
106	NC_009485	CGGCG	2	10	123678	123687	0 %	0 %	60 %	40 %	148251741
107	NC_009485	GCCGA	2	10	125302	125311	20 %	0 %	40 %	40 %	148251742
108	NC_009485	GCACG	2	10	126574	126583	20 %	0 %	40 %	40 %	148251743
109	NC_009485	TCCGC	2	10	130330	130339	0 %	20 %	20 %	60 %	148251747
110	NC_009485	GCGCC	2	10	134653	134662	0 %	0 %	40 %	60 %	148251750
111	NC_009485	GGTCG	2	10	134747	134756	0 %	20 %	60 %	20 %	148251750
112	NC_009485	GCGCT	2	10	139112	139121	0 %	20 %	40 %	40 %	148251752
113	NC_009485	CGGCT	2	10	139439	139448	0 %	20 %	40 %	40 %	148251752
114	NC_009485	GAGCC	2	10	139565	139574	20 %	0 %	40 %	40 %	148251752
115	NC_009485	ACGAC	2	10	142108	142117	40 %	0 %	20 %	40 %	148251753
116	NC_009485	CGGCG	2	10	143692	143701	0 %	0 %	60 %	40 %	148251755
117	NC_009485	CGTCG	2	10	145562	145571	0 %	20 %	40 %	40 %	148251756
118	NC_009485	CGCGC	2	10	150179	150188	0 %	0 %	40 %	60 %	148251760
119	NC_009485	GGAGC	2	10	150989	150998	20 %	0 %	60 %	20 %	148251762
120	NC_009485	GCGCG	2	10	152553	152562	0 %	0 %	60 %	40 %	148251764
121	NC_009485	GGCAC	2	10	153988	153997	20 %	0 %	40 %	40 %	148251767
122	NC_009485	TCGCT	2	10	158088	158097	0 %	40 %	20 %	40 %	148251771
123	NC_009485	GGCCT	2	10	158976	158985	0 %	20 %	40 %	40 %	148251773
124	NC_009485	GCGTC	2	10	164402	164411	0 %	20 %	40 %	40 %	148251779
125	NC_009485	GTCGT	2	10	166932	166941	0 %	40 %	40 %	20 %	148251781
126	NC_009485	CCGGC	2	10	168007	168016	0 %	0 %	40 %	60 %	148251782
127	NC_009485	CGATC	2	10	168089	168098	20 %	20 %	20 %	40 %	148251782
128	NC_009485	GGCGC	2	10	168632	168641	0 %	0 %	60 %	40 %	148251782
129	NC_009485	GTTGC	2	10	171512	171521	0 %	40 %	40 %	20 %	148251784
130	NC_009485	GCGAT	2	10	172478	172487	20 %	20 %	40 %	20 %	148251785
131	NC_009485	CATGA	2	10	174734	174743	40 %	20 %	20 %	20 %	148251787
132	NC_009485	CCAGG	2	10	176238	176247	20 %	0 %	40 %	40 %	148251789
133	NC_009485	CGGCT	2	10	178488	178497	0 %	20 %	40 %	40 %	148251789
134	NC_009485	TGCCA	2	10	179597	179606	20 %	20 %	20 %	40 %	148251790
135	NC_009485	TCGGC	2	10	182316	182325	0 %	20 %	40 %	40 %	148251792
136	NC_009485	TGCCC	2	10	182497	182506	0 %	20 %	20 %	60 %	148251793
137	NC_009485	TGCCG	2	10	182901	182910	0 %	20 %	40 %	40 %	148251793
138	NC_009485	AGCCG	2	10	185959	185968	20 %	0 %	40 %	40 %	148251797
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141	NC_009485	GTCCG	2	10	191610	191619	0 %	20 %	40 %	40 %	148251803
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143	NC_009485	TGCCG	2	10	194371	194380	0 %	20 %	40 %	40 %	148251806
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179	NC_009485	CCCAG	2	10	253463	253472	20 %	0 %	20 %	60 %	148251861
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249	NC_009485	ATCGA	2	10	366906	366915	40 %	20 %	20 %	20 %	148251976
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253	NC_009485	CGTGA	2	10	371158	371167	20 %	20 %	40 %	20 %	148251980
254	NC_009485	GGCCA	2	10	371359	371368	20 %	0 %	40 %	40 %	148251980
255	NC_009485	ATCAC	2	10	371708	371717	40 %	20 %	0 %	40 %	148251980
256	NC_009485	GCGCG	2	10	371733	371742	0 %	0 %	60 %	40 %	148251980
257	NC_009485	GCAGG	2	10	373112	373121	20 %	0 %	60 %	20 %	148251981
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259	NC_009485	AGTCC	2	10	373214	373223	20 %	20 %	20 %	40 %	148251981
260	NC_009485	AGCGC	2	10	374073	374082	20 %	0 %	40 %	40 %	148251982
261	NC_009485	CCGCG	2	10	374736	374745	0 %	0 %	40 %	60 %	148251983
262	NC_009485	ACGGC	2	10	375086	375095	20 %	0 %	40 %	40 %	148251983
263	NC_009485	ATGGA	2	10	375316	375325	40 %	20 %	40 %	0 %	148251984
264	NC_009485	GGCAC	2	10	376338	376347	20 %	0 %	40 %	40 %	148251985
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