MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 149824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009485	CAT	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009485	TCC	2	6	353	358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009485	CCT	2	6	359	364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009485	CGC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009485	ACC	2	6	539	544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009485	CTG	2	6	765	770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
7	NC_009485	AGG	2	6	845	850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251627
8	NC_009485	TGA	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251627
9	NC_009485	GGC	2	6	955	960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
10	NC_009485	CGC	2	6	962	967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
11	NC_009485	GCC	3	9	1027	1035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
12	NC_009485	GCC	2	6	1052	1057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
13	NC_009485	GCG	2	6	1058	1063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
14	NC_009485	CTG	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
15	NC_009485	CGG	2	6	1155	1160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
16	NC_009485	CCG	2	6	1184	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
17	NC_009485	GCG	2	6	1213	1218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
18	NC_009485	AGG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251627
19	NC_009485	CGA	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
20	NC_009485	GGT	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251627
21	NC_009485	CGA	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
22	NC_009485	CGG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
23	NC_009485	GTC	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
24	NC_009485	CGG	2	6	1508	1513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
25	NC_009485	CAT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251627
26	NC_009485	CTG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
27	NC_009485	CAA	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251627
28	NC_009485	CGT	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
29	NC_009485	TGT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251627
30	NC_009485	CGT	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
31	NC_009485	GCC	2	6	1871	1876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251627
32	NC_009485	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251627
33	NC_009485	TGC	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251627
34	NC_009485	ACG	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
35	NC_009485	ACG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251627
36	NC_009485	GCT	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009485	CCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009485	GGT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251628
39	NC_009485	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251628
40	NC_009485	GGC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251628
41	NC_009485	ACC	2	6	2492	2497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251628
42	NC_009485	CGC	2	6	2653	2658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
43	NC_009485	GAG	2	6	2741	2746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251628
44	NC_009485	CGG	2	6	2782	2787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251628
45	NC_009485	AGC	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251628
46	NC_009485	GCC	2	6	2870	2875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
47	NC_009485	AAC	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251628
48	NC_009485	TCG	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251628
49	NC_009485	CGC	2	6	3100	3105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
50	NC_009485	CCA	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251628
51	NC_009485	CGC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
52	NC_009485	CGC	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251628
53	NC_009485	CAA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009485	CGG	2	6	3519	3524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251629
55	NC_009485	CCA	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251629
56	NC_009485	GCG	2	6	3621	3626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251629
57	NC_009485	CGC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251629
58	NC_009485	GAA	2	6	3675	3680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251629
59	NC_009485	TCG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251629
60	NC_009485	ATG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251629
61	NC_009485	CTT	2	6	3826	3831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009485	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251630
63	NC_009485	TTC	2	6	3976	3981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251630
64	NC_009485	CGG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251630
65	NC_009485	GCC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
66	NC_009485	ACG	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251630
67	NC_009485	GCC	2	6	4256	4261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
68	NC_009485	CTT	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251630
69	NC_009485	GCT	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
70	NC_009485	CGA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251630
71	NC_009485	CGG	2	6	4406	4411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251630
72	NC_009485	CGC	2	6	4428	4433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
73	NC_009485	CGC	2	6	4461	4466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
74	NC_009485	TGC	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
75	NC_009485	CCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
76	NC_009485	GCT	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
77	NC_009485	CTG	2	6	4588	4593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
78	NC_009485	CGG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251630
79	NC_009485	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
80	NC_009485	TGC	3	9	4787	4795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
81	NC_009485	CGA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251630
82	NC_009485	TCG	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251630
83	NC_009485	GCC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251630
84	NC_009485	GTT	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251630
85	NC_009485	AGG	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009485	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251631
87	NC_009485	AAG	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251631
88	NC_009485	TCT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251631
89	NC_009485	ACA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251631
90	NC_009485	AAG	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251631
91	NC_009485	CTC	2	6	5368	5373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148251631
92	NC_009485	ATC	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251631
93	NC_009485	CGC	2	6	5395	5400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251631
94	NC_009485	GGT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251631
95	NC_009485	GGA	2	6	5446	5451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251631
96	NC_009485	TCG	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009485	GCC	2	6	5544	5549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251632
98	NC_009485	CTT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251632
99	NC_009485	CAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251632
100	NC_009485	CCG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251632
101	NC_009485	CCG	2	6	5801	5806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251632
102	NC_009485	CCG	2	6	5881	5886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
103	NC_009485	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251633
104	NC_009485	GGC	2	6	5955	5960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251633
105	NC_009485	TGC	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
106	NC_009485	TCG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
107	NC_009485	CGT	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
108	NC_009485	CAG	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
109	NC_009485	CGC	2	6	6321	6326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
110	NC_009485	CGA	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
111	NC_009485	CGT	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
112	NC_009485	GCC	2	6	6491	6496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
113	NC_009485	GCG	2	6	6537	6542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251633
114	NC_009485	GAC	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
115	NC_009485	ACG	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
116	NC_009485	CGC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
117	NC_009485	CGA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
118	NC_009485	CCG	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
119	NC_009485	GAG	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251633
120	NC_009485	CGA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
121	NC_009485	CGG	2	6	6742	6747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251633
122	NC_009485	GCC	2	6	6762	6767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
123	NC_009485	GGC	2	6	6853	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251633
124	NC_009485	ACG	2	6	6876	6881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
125	NC_009485	GAG	2	6	6905	6910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251633
126	NC_009485	GGC	2	6	6979	6984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251633
127	NC_009485	AAG	2	6	7007	7012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251633
128	NC_009485	CGA	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
129	NC_009485	GCC	2	6	7040	7045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
130	NC_009485	CGC	2	6	7066	7071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
131	NC_009485	CGA	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251633
132	NC_009485	CGC	2	6	7116	7121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
133	NC_009485	CCG	2	6	7167	7172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
134	NC_009485	AGG	2	6	7281	7286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251633
135	NC_009485	TCG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
136	NC_009485	GCC	2	6	7418	7423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
137	NC_009485	GCC	2	6	7433	7438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
138	NC_009485	CGT	2	6	7603	7608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
139	NC_009485	CGC	2	6	7653	7658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
140	NC_009485	CGC	2	6	7704	7709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
141	NC_009485	AGA	2	6	7770	7775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251633
142	NC_009485	CGC	2	6	7783	7788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
143	NC_009485	CAA	2	6	7873	7878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251633
144	NC_009485	GCT	2	6	7933	7938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251633
145	NC_009485	GCC	2	6	7945	7950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251633
146	NC_009485	CAC	2	6	8095	8100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_009485	ACC	2	6	8120	8125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_009485	GCC	2	6	8145	8150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_009485	GGC	2	6	8156	8161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009485	AGC	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_009485	GGC	2	6	8267	8272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_009485	TTC	2	6	8298	8303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_009485	CTC	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_009485	CAC	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148251634
155	NC_009485	GTC	2	6	8589	8594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
156	NC_009485	CGA	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251634
157	NC_009485	GGT	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251634
158	NC_009485	TCA	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148251634
159	NC_009485	CGG	2	6	8762	8767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251634
160	NC_009485	CGG	2	6	8798	8803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251634
161	NC_009485	CGT	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
162	NC_009485	GGT	2	6	8927	8932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251634
163	NC_009485	GAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251634
164	NC_009485	CGG	2	6	9125	9130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251634
165	NC_009485	GAG	2	6	9135	9140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251634
166	NC_009485	CAA	2	6	9161	9166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251634
167	NC_009485	GGC	2	6	9227	9232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251634
168	NC_009485	TGG	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148251634
169	NC_009485	CAA	2	6	9278	9283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251634
170	NC_009485	CGG	2	6	9299	9304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251634
171	NC_009485	AAG	2	6	9372	9377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148251634
172	NC_009485	CGA	2	6	9398	9403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251634
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174	NC_009485	TCG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
175	NC_009485	GTC	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
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180	NC_009485	GGC	2	6	9611	9616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251634
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182	NC_009485	TCG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
183	NC_009485	TGC	2	6	9790	9795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
184	NC_009485	TGT	2	6	9844	9849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148251634
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188	NC_009485	TGC	2	6	9985	9990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251634
189	NC_009485	TTC	2	6	9996	10001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251634
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229	NC_009485	GAC	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251636
230	NC_009485	GTC	2	6	12135	12140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_009485	TCG	2	6	12198	12203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251637
232	NC_009485	CAA	2	6	12244	12249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148251637
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236	NC_009485	CTG	2	6	12473	12478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251637
237	NC_009485	GCG	2	6	12501	12506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251637
238	NC_009485	GCC	3	9	12517	12525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251637
239	NC_009485	CGG	2	6	12526	12531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251637
240	NC_009485	GCG	2	6	12544	12549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251637
241	NC_009485	AGC	2	6	12579	12584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251637
242	NC_009485	CGA	2	6	12658	12663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251637
243	NC_009485	CGC	2	6	12706	12711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251637
244	NC_009485	CGC	2	6	12907	12912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148251637
245	NC_009485	CGA	2	6	13015	13020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251637
246	NC_009485	CGG	2	6	13066	13071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251637
247	NC_009485	GGA	2	6	13087	13092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148251637
248	NC_009485	TTC	2	6	13202	13207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148251637
249	NC_009485	GCG	2	6	13290	13295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251637
250	NC_009485	CGT	2	6	13300	13305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251637
251	NC_009485	TGC	2	6	13335	13340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251637
252	NC_009485	CGA	2	6	13414	13419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251637
253	NC_009485	CAT	2	6	13502	13507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_009485	CGC	2	6	13546	13551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_009485	CGA	2	6	13584	13589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_009485	GGC	2	6	13728	13733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148251638
257	NC_009485	CTG	2	6	13792	13797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251638
258	NC_009485	GAT	2	6	13851	13856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148251638
259	NC_009485	GTC	2	6	13870	13875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148251638
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261	NC_009485	CGA	2	6	13908	13913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148251638
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274	NC_009485	GCC	2	6	14978	14983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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