MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 2547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009484	CGGCGC	2	12	3303837	3303848	0 %	0 %	50 %	50 %	148262003
2502	NC_009484	CGCCAC	2	12	3305191	3305202	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148262003
2503	NC_009484	GCGTTC	2	12	3312138	3312149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262009
2504	NC_009484	GTCGCC	2	12	3312199	3312210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148262009
2505	NC_009484	GACGGT	2	12	3316201	3316212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148262013
2506	NC_009484	CCGCTC	2	12	3322688	3322699	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148262020
2507	NC_009484	GATGCG	2	12	3324161	3324172	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148262022
2508	NC_009484	CCTGAA	2	12	3325706	3325717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148262023
2509	NC_009484	GGCGCT	2	12	3326423	3326434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262025
2510	NC_009484	GACCTC	2	12	3327679	3327690	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148262027
2511	NC_009484	ACGCCT	2	12	3328655	3328666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148262029
2512	NC_009484	CGCCGG	2	12	3328755	3328766	0 %	0 %	50 %	50 %	148262029
2513	NC_009484	GGTGCT	2	12	3332099	3332110	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148262032
2514	NC_009484	CCTATC	2	12	3332632	3332643	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148262032
2515	NC_009484	GCCGAG	2	12	3333459	3333470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262033
2516	NC_009484	CTGTTC	2	12	3336630	3336641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148262036
2517	NC_009484	GCCATC	2	12	3338804	3338815	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148262038
2518	NC_009484	TGCGGA	2	12	3340072	3340083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148262039
2519	NC_009484	CAGCGA	2	12	3348450	3348461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262048
2520	NC_009484	TGGTGA	2	12	3348653	3348664	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148262048
2521	NC_009484	TGCCGG	2	12	3349633	3349644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262049
2522	NC_009484	TGTCGG	2	12	3351352	3351363	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148262049
2523	NC_009484	CGGCGC	2	12	3352542	3352553	0 %	0 %	50 %	50 %	148262050
2524	NC_009484	CTTGAG	2	12	3355468	3355479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148262052
2525	NC_009484	GCCGAG	2	12	3355825	3355836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262053
2526	NC_009484	CTTCAG	2	12	3356074	3356085	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148262053
2527	NC_009484	CGATCG	2	12	3357554	3357565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262055
2528	NC_009484	ATGCGC	2	12	3359198	3359209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262056
2529	NC_009484	CCGGCG	2	12	3359813	3359824	0 %	0 %	50 %	50 %	148262057
2530	NC_009484	GATCAG	2	12	3363614	3363625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148262060
2531	NC_009484	CTGCGG	2	12	3366452	3366463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262063
2532	NC_009484	GCCAGC	2	12	3366556	3366567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148262063
2533	NC_009484	TCGGCA	2	12	3368825	3368836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262066
2534	NC_009484	ATGCCG	2	12	3370668	3370679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262067
2535	NC_009484	CGCGGC	2	12	3371495	3371506	0 %	0 %	50 %	50 %	148262068
2536	NC_009484	CGGCCT	2	12	3373377	3373388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148262068
2537	NC_009484	GCCGAA	2	12	3374631	3374642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262071
2538	NC_009484	CCGAGG	2	12	3378380	3378391	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262074
2539	NC_009484	CATAGG	2	12	3379172	3379183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148262074
2540	NC_009484	CTGGCG	2	12	3379365	3379376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262074
2541	NC_009484	AGGATC	2	12	3379468	3379479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148262075
2542	NC_009484	GTCGCG	2	12	3381335	3381346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262076
2543	NC_009484	CGGGCG	2	12	3382315	3382326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262077
2544	NC_009484	GGGCGC	2	12	3383816	3383827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262077
2545	NC_009484	GCCGAG	2	12	3384241	3384252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262078
2546	NC_009484	GCTCGT	2	12	3387681	3387692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262083
2547	NC_009484	TTCGGC	2	12	3389006	3389017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262084

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.