MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 2648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009484	CGGCGA	2	12	3186867	3186878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148261903
2502	NC_009484	TCGGCG	2	12	3187163	3187174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261903
2503	NC_009484	GCGCTC	2	12	3187516	3187527	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148261903
2504	NC_009484	TCGAGA	2	12	3189544	3189555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148261906
2505	NC_009484	TCGGGC	2	12	3195769	3195780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261913
2506	NC_009484	GAGAAC	2	12	3196976	3196987	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148261914
2507	NC_009484	CCTCGC	2	12	3199737	3199748	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148261916
2508	NC_009484	ACGGCC	2	12	3200231	3200242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261916
2509	NC_009484	CCGTTC	2	12	3201262	3201273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261916
2510	NC_009484	CCGAAA	2	12	3204370	3204381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148261917
2511	NC_009484	GTCGCT	2	12	3207474	3207485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261918
2512	NC_009484	CCTCGG	2	12	3208873	3208884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148261919
2513	NC_009484	CCGGCA	2	12	3209218	3209229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261919
2514	NC_009484	GCCTCG	2	12	3209757	3209768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148261920
2515	NC_009484	GGCCGC	2	12	3211365	3211376	0 %	0 %	50 %	50 %	148261920
2516	NC_009484	ACAGGG	2	12	3213032	3213043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148261921
2517	NC_009484	GCGAAC	2	12	3213608	3213619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261922
2518	NC_009484	CGATAT	2	12	3219646	3219657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148261924
2519	NC_009484	GGGCGG	2	12	3223102	3223113	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	148261926
2520	NC_009484	CGGCTT	2	12	3224734	3224745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261928
2521	NC_009484	CCGCGC	2	12	3226104	3226115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261929
2522	NC_009484	CATCGT	2	12	3227857	3227868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148261931
2523	NC_009484	CTCGAC	2	12	3229449	3229460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261933
2524	NC_009484	GCCAAG	2	12	3230456	3230467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261935
2525	NC_009484	TGGCGG	2	12	3230928	3230939	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148261935
2526	NC_009484	ACGCCA	2	12	3231332	3231343	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148261936
2527	NC_009484	TCGCCT	2	12	3231380	3231391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261936
2528	NC_009484	GGGGCA	2	12	3231483	3231494	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148261936
2529	NC_009484	GTCCTC	2	12	3231646	3231657	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261936
2530	NC_009484	ACCCTG	2	12	3231796	3231807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261936
2531	NC_009484	GCCATC	2	12	3231967	3231978	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261936
2532	NC_009484	GCCCCG	2	12	3232598	3232609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261937
2533	NC_009484	TTACGT	2	12	3232814	3232825	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2534	NC_009484	TCGCCA	2	12	3233366	3233377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261938
2535	NC_009484	TGACGC	2	12	3234252	3234263	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261939
2536	NC_009484	GCCATC	2	12	3234290	3234301	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261939
2537	NC_009484	TCGCCA	2	12	3234318	3234329	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261939
2538	NC_009484	GCGACC	2	12	3236041	3236052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261940
2539	NC_009484	CCCGAT	2	12	3236768	3236779	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261940
2540	NC_009484	CGTCAG	2	12	3236873	3236884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261940
2541	NC_009484	CGACCT	2	12	3237101	3237112	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261940
2542	NC_009484	TCGACG	2	12	3238254	3238265	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261941
2543	NC_009484	TCCTGC	2	12	3239265	3239276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261941
2544	NC_009484	CGGCGC	2	12	3239506	3239517	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
2545	NC_009484	GCGATC	2	12	3240134	3240145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261941
2546	NC_009484	CGCGGG	2	12	3241710	3241721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261943
2547	NC_009484	CGCCGG	2	12	3242734	3242745	0 %	0 %	50 %	50 %	148261944
2548	NC_009484	GCAGAC	2	12	3245116	3245127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261946
2549	NC_009484	TCGGCG	2	12	3245442	3245453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261946
2550	NC_009484	GCATCG	2	12	3245577	3245588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261946
2551	NC_009484	ACCGGC	2	12	3247457	3247468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261948
2552	NC_009484	CTGCAT	2	12	3247622	3247633	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148261948
2553	NC_009484	CCCAGG	2	12	3247764	3247775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261948
2554	NC_009484	GTCGGC	2	12	3248026	3248037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261948
2555	NC_009484	CGTCAT	2	12	3248694	3248705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148261949
2556	NC_009484	CGCCCG	2	12	3249545	3249556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261950
2557	NC_009484	CTCGAC	2	12	3250456	3250467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261951
2558	NC_009484	CGCGCC	2	12	3250971	3250982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261951
2559	NC_009484	GCCATG	2	12	3252097	3252108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261952
2560	NC_009484	GAGGCC	2	12	3252399	3252410	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148261953
2561	NC_009484	TCGTGG	2	12	3253654	3253665	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148261953
2562	NC_009484	AATGCA	2	12	3255157	3255168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148261956
2563	NC_009484	ATCGCC	2	12	3255957	3255968	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148261957
2564	NC_009484	ACCGGC	2	12	3256836	3256847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261957
2565	NC_009484	GCTGGC	2	12	3258140	3258151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261958
2566	NC_009484	CATGTG	2	12	3261423	3261434	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148261960
2567	NC_009484	ACGTTG	2	12	3261691	3261702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148261961
2568	NC_009484	CGGCAG	2	12	3262203	3262214	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148261962
2569	NC_009484	CGTCCT	2	12	3262310	3262321	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261962
2570	NC_009484	TCAGGG	2	12	3263234	3263245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148261962
2571	NC_009484	CCGCTG	2	12	3263330	3263341	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2572	NC_009484	CGAGGC	2	12	3268285	3268296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148261967
2573	NC_009484	ATCGGC	2	12	3269655	3269666	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148261969
2574	NC_009484	CGGACA	2	12	3270226	3270237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261969
2575	NC_009484	TCTCGC	2	12	3271128	3271139	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261970
2576	NC_009484	GCCGGA	2	12	3274207	3274218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148261972
2577	NC_009484	CGGCCT	2	12	3275186	3275197	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148261972
2578	NC_009484	TGCGGA	2	12	3277497	3277508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148261974
2579	NC_009484	GCGCGG	2	12	3277546	3277557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261974
2580	NC_009484	GACGGA	2	12	3277696	3277707	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148261974
2581	NC_009484	GCAGGC	2	12	3279073	3279084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148261977
2582	NC_009484	CCTCGC	2	12	3281714	3281725	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148261981
2583	NC_009484	CGCTGG	2	12	3282833	3282844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261982
2584	NC_009484	CGTCGC	2	12	3283620	3283631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148261983
2585	NC_009484	GAAGAT	2	12	3284025	3284036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148261983
2586	NC_009484	GGCGAT	2	12	3287107	3287118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148261986
2587	NC_009484	CGGTGC	2	12	3289755	3289766	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148261987
2588	NC_009484	AGGGCG	2	12	3292535	3292546	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148261991
2589	NC_009484	TGTCGA	2	12	3294142	3294153	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148261993
2590	NC_009484	CGGCCA	2	12	3294964	3294975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148261994
2591	NC_009484	CAACGC	2	12	3295687	3295698	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148261994
2592	NC_009484	CGCGGC	2	12	3297361	3297372	0 %	0 %	50 %	50 %	148261995
2593	NC_009484	CATCTG	2	12	3300092	3300103	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148261999
2594	NC_009484	CGAGGG	2	12	3300181	3300192	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148261999
2595	NC_009484	ACAGCG	2	12	3300376	3300387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261999
2596	NC_009484	CGGCGC	2	12	3303837	3303848	0 %	0 %	50 %	50 %	148262003
2597	NC_009484	CGCCAC	2	12	3305191	3305202	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148262003
2598	NC_009484	GCGTTC	2	12	3312138	3312149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262009
2599	NC_009484	GTCGCC	2	12	3312199	3312210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148262009
2600	NC_009484	GACGGT	2	12	3316201	3316212	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148262013
2601	NC_009484	CAGCGC	2	12	3320754	3320765	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_009484	AACCGT	2	12	3321364	3321375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_009484	AATGAC	2	12	3321795	3321806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2604	NC_009484	CCGCTC	2	12	3322688	3322699	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148262020
2605	NC_009484	GATGCG	2	12	3324161	3324172	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148262022
2606	NC_009484	CCTGAA	2	12	3325706	3325717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148262023
2607	NC_009484	GGCGCT	2	12	3326423	3326434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262025
2608	NC_009484	GACCTC	2	12	3327679	3327690	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148262027
2609	NC_009484	ACGCCT	2	12	3328655	3328666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148262029
2610	NC_009484	CGCCGG	2	12	3328755	3328766	0 %	0 %	50 %	50 %	148262029
2611	NC_009484	GGTGCT	2	12	3332099	3332110	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148262032
2612	NC_009484	CCTATC	2	12	3332632	3332643	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148262032
2613	NC_009484	GCCGAG	2	12	3333459	3333470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262033
2614	NC_009484	CTGTTC	2	12	3336630	3336641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148262036
2615	NC_009484	GCCATC	2	12	3338804	3338815	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148262038
2616	NC_009484	TGCGGA	2	12	3340072	3340083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148262039
2617	NC_009484	CCACGA	2	12	3343848	3343859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2618	NC_009484	CATGCC	2	12	3347901	3347912	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_009484	CAGCGA	2	12	3348450	3348461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262048
2620	NC_009484	TGGTGA	2	12	3348653	3348664	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148262048
2621	NC_009484	TGCCGG	2	12	3349633	3349644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262049
2622	NC_009484	TGTCGG	2	12	3351352	3351363	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148262049
2623	NC_009484	CGGCGC	2	12	3352542	3352553	0 %	0 %	50 %	50 %	148262050
2624	NC_009484	CTTGAG	2	12	3355468	3355479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148262052
2625	NC_009484	GCCGAG	2	12	3355825	3355836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262053
2626	NC_009484	CTTCAG	2	12	3356074	3356085	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148262053
2627	NC_009484	CGATCG	2	12	3357554	3357565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262055
2628	NC_009484	ATGCGC	2	12	3359198	3359209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262056
2629	NC_009484	CCGGCG	2	12	3359813	3359824	0 %	0 %	50 %	50 %	148262057
2630	NC_009484	GATCAG	2	12	3363614	3363625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148262060
2631	NC_009484	CTGCGG	2	12	3366452	3366463	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262063
2632	NC_009484	GCCAGC	2	12	3366556	3366567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148262063
2633	NC_009484	TCGGCA	2	12	3368825	3368836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262066
2634	NC_009484	ATGCCG	2	12	3370668	3370679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148262067
2635	NC_009484	CGCGGC	2	12	3371495	3371506	0 %	0 %	50 %	50 %	148262068
2636	NC_009484	CGGCCT	2	12	3373377	3373388	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148262068
2637	NC_009484	GCCGAA	2	12	3374631	3374642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262071
2638	NC_009484	CCGAGG	2	12	3378380	3378391	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262074
2639	NC_009484	CATAGG	2	12	3379172	3379183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148262074
2640	NC_009484	CTGGCG	2	12	3379365	3379376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262074
2641	NC_009484	AGGATC	2	12	3379468	3379479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148262075
2642	NC_009484	GTCGCG	2	12	3381335	3381346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148262076
2643	NC_009484	CGGGCG	2	12	3382315	3382326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262077
2644	NC_009484	GGGCGC	2	12	3383816	3383827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262077
2645	NC_009484	GCAGCC	2	12	3384122	3384133	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2646	NC_009484	GCCGAG	2	12	3384241	3384252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148262078
2647	NC_009484	GCTCGT	2	12	3387681	3387692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262083
2648	NC_009484	TTCGGC	2	12	3389006	3389017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262084

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