MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009484	TGGA	2	8	2634	2641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009484	GTCT	2	8	2875	2882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009484	GGCC	2	8	3430	3437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009484	GCCG	2	8	12290	12297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009484	CCGG	2	8	12324	12331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009484	CGCC	2	8	12917	12924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009484	GCAT	2	8	13634	13641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009484	AGGA	2	8	14473	14480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009484	CGGG	2	8	28303	28310	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009484	GCCA	2	8	30316	30323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009484	GCCC	2	8	30376	30383	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_009484	GCCA	2	8	34122	34129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009484	TGAT	2	8	42887	42894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009484	TCAT	2	8	43206	43213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009484	CCGG	2	8	46108	46115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009484	GAAA	2	8	46295	46302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009484	CCCG	2	8	49439	49446	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009484	CCGG	2	8	53877	53884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009484	CGCC	2	8	74027	74034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_009484	CGGC	2	8	75633	75640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009484	GGAT	2	8	89571	89578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009484	ATCA	2	8	89654	89661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009484	TGCC	2	8	108508	108515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009484	ATGC	2	8	109610	109617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009484	CCAT	2	8	109783	109790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009484	TGGT	2	8	117821	117828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009484	ATTG	2	8	117919	117926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009484	CGGC	2	8	124283	124290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009484	AAGA	2	8	127747	127754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009484	CGGC	2	8	127795	127802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009484	GCAG	2	8	129135	129142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009484	ACGA	2	8	135753	135760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009484	GAGG	2	8	144887	144894	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009484	GCCG	2	8	156602	156609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009484	GGGC	2	8	157258	157265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009484	TTCC	2	8	167233	167240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009484	TCCA	2	8	193647	193654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009484	AAAG	2	8	202741	202748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009484	CCGA	2	8	205056	205063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009484	TGCC	2	8	213385	213392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009484	GCCC	2	8	224615	224622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_009484	GGAT	2	8	226173	226180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009484	GCCC	2	8	226241	226248	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009484	TACC	2	8	228834	228841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009484	GCCG	2	8	229584	229591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009484	CATG	2	8	229697	229704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009484	GCCG	2	8	229723	229730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009484	GGCG	2	8	230963	230970	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009484	CGAG	2	8	230974	230981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009484	GCTT	2	8	234969	234976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009484	GACA	2	8	244359	244366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009484	TCCG	2	8	254909	254916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009484	AGCC	2	8	266852	266859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009484	GAAA	2	8	267052	267059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009484	GAGG	2	8	268247	268254	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009484	CCGC	2	8	269366	269373	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_009484	GGCC	2	8	270031	270038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009484	CGGG	2	8	275368	275375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009484	CGCC	2	8	282079	282086	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009484	ATGA	2	8	282207	282214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009484	CGGC	2	8	291105	291112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009484	CCGC	2	8	291146	291153	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009484	AAAT	2	8	299394	299401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009484	GGCC	2	8	308180	308187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009484	GGGA	2	8	308429	308436	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009484	ATTG	2	8	318652	318659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009484	AATC	2	8	323078	323085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009484	CCGC	2	8	323255	323262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009484	ATTT	2	8	323282	323289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009484	AGGG	2	8	325800	325807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009484	CCAG	2	8	325816	325823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009484	CGCC	2	8	325853	325860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_009484	AGAC	2	8	326407	326414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009484	ATGG	2	8	328947	328954	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009484	CGGC	2	8	331017	331024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009484	GGAG	2	8	331296	331303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009484	GCCA	2	8	338195	338202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009484	TTTA	2	8	338442	338449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009484	AGGA	2	8	338713	338720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009484	CGAA	2	8	338776	338783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009484	CCTG	2	8	341827	341834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009484	CGCA	2	8	350725	350732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009484	CCGG	2	8	350736	350743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009484	GCCG	2	8	353067	353074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009484	GCCC	2	8	353093	353100	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_009484	GGCC	2	8	353167	353174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009484	CTTC	2	8	356562	356569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009484	GGCC	2	8	367738	367745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009484	TTTG	2	8	369981	369988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009484	GACC	2	8	372070	372077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009484	GCCG	2	8	375460	375467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009484	CCGC	3	12	375470	375481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_009484	AGCC	2	8	375483	375490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009484	CCCG	2	8	376970	376977	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_009484	CCCG	2	8	377004	377011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_009484	CCCG	2	8	377038	377045	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_009484	CGGC	2	8	388766	388773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009484	AGGA	2	8	396007	396014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009484	GCCG	2	8	397519	397526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009484	GGGC	2	8	397554	397561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009484	CGCC	2	8	398136	398143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_009484	CTCG	2	8	398161	398168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009484	CCGC	2	8	398232	398239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_009484	CGCC	2	8	398341	398348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_009484	GATT	2	8	409398	409405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009484	CGAA	2	8	409758	409765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009484	GCGG	2	8	413670	413677	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009484	GGTT	2	8	414356	414363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009484	CGGC	2	8	414411	414418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009484	ATCG	2	8	415048	415055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009484	GAAA	2	8	425735	425742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009484	ATCC	2	8	429151	429158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009484	CCTG	2	8	429218	429225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009484	AGGA	2	8	429252	429259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009484	GCCT	2	8	433524	433531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009484	GGGC	2	8	440658	440665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009484	GATC	2	8	441399	441406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009484	GCAG	2	8	444850	444857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009484	CGAC	2	8	448641	448648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009484	CGCC	2	8	450077	450084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_009484	GTCC	2	8	459773	459780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009484	CGAG	2	8	464859	464866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009484	GCCC	2	8	467326	467333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_009484	ATCG	2	8	473589	473596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009484	TTCG	2	8	473641	473648	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009484	GTCA	2	8	473804	473811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009484	GCCC	2	8	490545	490552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009484	GCGG	2	8	490571	490578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009484	GATC	2	8	498659	498666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009484	CTGT	2	8	498871	498878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009484	GGGC	2	8	505547	505554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009484	ATAA	2	8	505701	505708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009484	ACCT	2	8	505974	505981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009484	CTAC	2	8	511094	511101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009484	CATC	2	8	511150	511157	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009484	CTTG	2	8	511275	511282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009484	GCCG	2	8	536402	536409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009484	GCAT	2	8	543527	543534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009484	CCGC	2	8	546832	546839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_009484	GATC	2	8	551714	551721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009484	CGGC	2	8	553991	553998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009484	CATT	2	8	555046	555053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009484	CGGC	2	8	555194	555201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009484	GGCG	2	8	555253	555260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009484	GCGG	2	8	556524	556531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009484	TTTG	2	8	564163	564170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009484	CCGG	2	8	564535	564542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009484	GCCG	2	8	571305	571312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009484	GGGC	2	8	573866	573873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009484	TCGT	2	8	576765	576772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009484	AAGA	2	8	578739	578746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_009484	TCAG	2	8	1004824	1004831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_009484	CCGG	2	8	1137035	1137042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_009484	GCCG	2	8	1595325	1595332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
442	NC_009484	AACC	2	8	1603850	1603857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_009484	GTCT	2	8	1610758	1610765	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
444	NC_009484	GACC	2	8	1610823	1610830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_009484	ACCG	2	8	1611727	1611734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_009484	CGGA	2	8	1651889	1651896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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455	NC_009484	TGGT	2	8	1673591	1673598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_009484	GACG	2	8	1710357	1710364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_009484	CGCC	2	8	1710789	1710796	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
464	NC_009484	GCCG	2	8	1710811	1710818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
465	NC_009484	CCGC	2	8	1711872	1711879	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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469	NC_009484	CGGG	2	8	1725844	1725851	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
470	NC_009484	CCCG	2	8	1729829	1729836	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
471	NC_009484	GCCG	2	8	1732255	1732262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
472	NC_009484	GCCG	2	8	1734273	1734280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
473	NC_009484	CGCA	2	8	1734289	1734296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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475	NC_009484	CGCC	2	8	1740292	1740299	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
476	NC_009484	CGCC	2	8	1743095	1743102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
477	NC_009484	ACGG	2	8	1744035	1744042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
478	NC_009484	TCCC	2	8	1753746	1753753	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
479	NC_009484	CACC	2	8	1765205	1765212	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
480	NC_009484	CCCG	2	8	1765248	1765255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
481	NC_009484	CGAA	2	8	1772385	1772392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_009484	ATTT	2	8	1772505	1772512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_009484	CCGG	2	8	1773601	1773608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_009484	CGTC	2	8	1797016	1797023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_009484	CCGC	2	8	1801930	1801937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
486	NC_009484	CGAT	2	8	1806672	1806679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_009484	AATC	2	8	1810333	1810340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
488	NC_009484	GGCC	2	8	1810367	1810374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
489	NC_009484	CCGG	2	8	1810417	1810424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
490	NC_009484	GATC	2	8	1811791	1811798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
491	NC_009484	GTTG	2	8	1816923	1816930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_009484	AGGC	2	8	1816988	1816995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_009484	GCCG	2	8	1816997	1817004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NC_009484	CGGC	3	12	1820270	1820281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_009484	CCGC	2	8	1824850	1824857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_009484	GATT	2	8	1833625	1833632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_009484	CCGG	2	8	1836700	1836707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
498	NC_009484	CGCC	2	8	1848396	1848403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
499	NC_009484	GCGA	2	8	1864381	1864388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_009484	ATCC	2	8	1873012	1873019	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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