MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 9973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_009484	CCGG	2	8	532895	532902	0 %	0 %	50 %	50 %	148259495
1503	NC_009484	GTTC	2	8	532955	532962	0 %	50 %	25 %	25 %	148259495
1504	NC_009484	GCGA	2	8	532993	533000	25 %	0 %	50 %	25 %	148259495
1505	NC_009484	CTCC	2	8	533070	533077	0 %	25 %	0 %	75 %	148259496
1506	NC_009484	CGAG	2	8	533119	533126	25 %	0 %	50 %	25 %	148259496
1507	NC_009484	CGCC	2	8	533371	533378	0 %	0 %	25 %	75 %	148259496
1508	NC_009484	GCCG	2	8	534602	534609	0 %	0 %	50 %	50 %	148259497
1509	NC_009484	CGGC	2	8	534720	534727	0 %	0 %	50 %	50 %	148259497
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1511	NC_009484	CGGC	2	8	535323	535330	0 %	0 %	50 %	50 %	148259498
1512	NC_009484	TGCC	2	8	535733	535740	0 %	25 %	25 %	50 %	148259498
1513	NC_009484	CAAC	2	8	535959	535966	50 %	0 %	0 %	50 %	148259498
1514	NC_009484	GCCG	2	8	536402	536409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_009484	ATCT	2	8	537040	537047	25 %	50 %	0 %	25 %	148259499
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1517	NC_009484	CCCG	2	8	538527	538534	0 %	0 %	25 %	75 %	148259501
1518	NC_009484	CGAT	2	8	538617	538624	25 %	25 %	25 %	25 %	148259501
1519	NC_009484	GTCG	2	8	539308	539315	0 %	25 %	50 %	25 %	148259501
1520	NC_009484	CGCT	2	8	539471	539478	0 %	25 %	25 %	50 %	148259501
1521	NC_009484	TCCT	2	8	540215	540222	0 %	50 %	0 %	50 %	148259502
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1525	NC_009484	GCCG	2	8	541536	541543	0 %	0 %	50 %	50 %	148259503
1526	NC_009484	GACC	2	8	542158	542165	25 %	0 %	25 %	50 %	148259504
1527	NC_009484	CGAC	2	8	542379	542386	25 %	0 %	25 %	50 %	148259504
1528	NC_009484	GCAT	2	8	543527	543534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_009484	CGCC	2	8	544258	544265	0 %	0 %	25 %	75 %	148259506
1530	NC_009484	CGCT	2	8	544499	544506	0 %	25 %	25 %	50 %	148259506
1531	NC_009484	GCGA	2	8	544517	544524	25 %	0 %	50 %	25 %	148259506
1532	NC_009484	GTCC	2	8	544855	544862	0 %	25 %	25 %	50 %	148259506
1533	NC_009484	GGCC	2	8	546415	546422	0 %	0 %	50 %	50 %	148259507
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1535	NC_009484	CGGG	2	8	546621	546628	0 %	0 %	75 %	25 %	148259507
1536	NC_009484	CCGC	2	8	546832	546839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1537	NC_009484	CAGC	2	8	547130	547137	25 %	0 %	25 %	50 %	148259508
1538	NC_009484	CGAG	2	8	547138	547145	25 %	0 %	50 %	25 %	148259508
1539	NC_009484	GGCG	2	8	547595	547602	0 %	0 %	75 %	25 %	148259508
1540	NC_009484	GACG	2	8	548227	548234	25 %	0 %	50 %	25 %	148259509
1541	NC_009484	GCCG	2	8	548419	548426	0 %	0 %	50 %	50 %	148259509
1542	NC_009484	GACG	2	8	548472	548479	25 %	0 %	50 %	25 %	148259509
1543	NC_009484	CGGT	2	8	548592	548599	0 %	25 %	50 %	25 %	148259509
1544	NC_009484	CAGG	2	8	549305	549312	25 %	0 %	50 %	25 %	148259510
1545	NC_009484	TGCG	2	8	549550	549557	0 %	25 %	50 %	25 %	148259510
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1547	NC_009484	ATTG	2	8	551432	551439	25 %	50 %	25 %	0 %	148259512
1548	NC_009484	GATC	2	8	551714	551721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1549	NC_009484	GGCG	2	8	552302	552309	0 %	0 %	75 %	25 %	148259513
1550	NC_009484	CCGG	2	8	552459	552466	0 %	0 %	50 %	50 %	148259513
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1552	NC_009484	CGAT	2	8	553387	553394	25 %	25 %	25 %	25 %	148259513
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1554	NC_009484	GCGG	2	8	553854	553861	0 %	0 %	75 %	25 %	148259513
1555	NC_009484	CGGC	2	8	553991	553998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_009484	CCCG	2	8	554174	554181	0 %	0 %	25 %	75 %	148259514
1557	NC_009484	TGAC	2	8	554767	554774	25 %	25 %	25 %	25 %	148259514
1558	NC_009484	GCTG	2	8	554857	554864	0 %	25 %	50 %	25 %	148259514
1559	NC_009484	CATT	2	8	555046	555053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_009484	CGGC	2	8	555194	555201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_009484	GGCG	2	8	555253	555260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1563	NC_009484	TGGC	2	8	555525	555532	0 %	25 %	50 %	25 %	148259515
1564	NC_009484	GCGG	2	8	556524	556531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_009484	GTCA	2	8	556582	556589	25 %	25 %	25 %	25 %	148259516
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1577	NC_009484	CGAT	2	8	560916	560923	25 %	25 %	25 %	25 %	148259519
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1595	NC_009484	CTTG	2	8	565085	565092	0 %	50 %	25 %	25 %	148259523
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1597	NC_009484	CCGG	2	8	565327	565334	0 %	0 %	50 %	50 %	148259523
1598	NC_009484	CGTG	2	8	566016	566023	0 %	25 %	50 %	25 %	148259524
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1602	NC_009484	GATC	2	8	567175	567182	25 %	25 %	25 %	25 %	148259525
1603	NC_009484	CGGG	3	12	567238	567249	0 %	0 %	75 %	25 %	148259525
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1613	NC_009484	CATC	2	8	571548	571555	25 %	25 %	0 %	50 %	148259529
1614	NC_009484	GAAC	2	8	572175	572182	50 %	0 %	25 %	25 %	148259530
1615	NC_009484	GGGC	2	8	572209	572216	0 %	0 %	75 %	25 %	148259530
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1617	NC_009484	CCCG	2	8	572512	572519	0 %	0 %	25 %	75 %	148259530
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1619	NC_009484	GCCG	2	8	573491	573498	0 %	0 %	50 %	50 %	148259531
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1621	NC_009484	GGGC	2	8	573866	573873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_009484	TGGC	2	8	573967	573974	0 %	25 %	50 %	25 %	148259532
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1628	NC_009484	CGAA	2	8	576052	576059	50 %	0 %	25 %	25 %	148259535
1629	NC_009484	TCGT	2	8	576765	576772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_009484	TGGC	2	8	576970	576977	0 %	25 %	50 %	25 %	148259536
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