MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 68057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_009484	TCG	2	6	3385772	3385777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262080
68002	NC_009484	GGC	2	6	3385851	3385856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262080
68003	NC_009484	CCG	2	6	3385903	3385908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262081
68004	NC_009484	GGC	2	6	3385916	3385921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262081
68005	NC_009484	GAG	3	9	3386004	3386012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148262081
68006	NC_009484	CGG	2	6	3386039	3386044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262081
68007	NC_009484	CAG	2	6	3386172	3386177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262081
68008	NC_009484	CGC	2	6	3386241	3386246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262081
68009	NC_009484	CGG	2	6	3386261	3386266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262081
68010	NC_009484	AAG	2	6	3386277	3386282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148262081
68011	NC_009484	CAT	2	6	3386289	3386294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148262081
68012	NC_009484	GCG	2	6	3386317	3386322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262081
68013	NC_009484	GAT	2	6	3386351	3386356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148262081
68014	NC_009484	ATC	2	6	3386511	3386516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148262081
68015	NC_009484	CCA	2	6	3386519	3386524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148262081
68016	NC_009484	AAC	2	6	3386550	3386555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68017	NC_009484	ATG	2	6	3386588	3386593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148262082
68018	NC_009484	GCC	2	6	3386753	3386758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262082
68019	NC_009484	TGG	3	9	3386877	3386885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148262082
68020	NC_009484	CGC	2	6	3386891	3386896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262082
68021	NC_009484	CGC	2	6	3386923	3386928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262082
68022	NC_009484	GCA	2	6	3386993	3386998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262082
68023	NC_009484	CGA	2	6	3387043	3387048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262082
68024	NC_009484	CAG	2	6	3387086	3387091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262082
68025	NC_009484	GCC	3	9	3387233	3387241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262082
68026	NC_009484	GGC	2	6	3387258	3387263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68027	NC_009484	GCC	2	6	3387270	3387275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68028	NC_009484	GCC	2	6	3387620	3387625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262083
68029	NC_009484	GCT	2	6	3387706	3387711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262083
68030	NC_009484	TCG	2	6	3387738	3387743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262083
68031	NC_009484	GGC	2	6	3387746	3387751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68032	NC_009484	GCG	2	6	3387758	3387763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68033	NC_009484	GCG	2	6	3387788	3387793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68034	NC_009484	TGC	2	6	3387798	3387803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262083
68035	NC_009484	ATC	2	6	3387833	3387838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148262083
68036	NC_009484	GTG	2	6	3387884	3387889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148262083
68037	NC_009484	GCT	2	6	3387913	3387918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148262083
68038	NC_009484	TGG	2	6	3387948	3387953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148262083
68039	NC_009484	CGA	2	6	3387963	3387968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262083
68040	NC_009484	CGG	2	6	3387997	3388002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68041	NC_009484	GGC	2	6	3388013	3388018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68042	NC_009484	ACA	2	6	3388032	3388037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148262083
68043	NC_009484	GCC	3	9	3388151	3388159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148262083
68044	NC_009484	ATC	2	6	3388221	3388226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148262083
68045	NC_009484	GCA	2	6	3388246	3388251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148262083
68046	NC_009484	CGG	2	6	3388261	3388266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68047	NC_009484	CGG	2	6	3388291	3388296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68048	NC_009484	CAA	2	6	3388348	3388353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148262083
68049	NC_009484	ACC	3	9	3388391	3388399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148262083
68050	NC_009484	GGC	2	6	3388445	3388450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68051	NC_009484	GGC	2	6	3388516	3388521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148262083
68052	NC_009484	CGG	2	6	3388537	3388542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68053	NC_009484	GCC	2	6	3388571	3388576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68054	NC_009484	CAA	2	6	3388808	3388813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148262084
68055	NC_009484	GGA	2	6	3388853	3388858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148262084
68056	NC_009484	GGC	2	6	3389077	3389082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68057	NC_009484	GCC	2	6	3389094	3389099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.