MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 68057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009484	CAG	2	6	273513	273518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259256
5002	NC_009484	GGT	2	6	273528	273533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259256
5003	NC_009484	GAT	2	6	273537	273542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259256
5004	NC_009484	AAT	2	6	273641	273646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259256
5005	NC_009484	CGC	2	6	273747	273752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259256
5006	NC_009484	CGG	2	6	273891	273896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259256
5007	NC_009484	TCA	2	6	274007	274012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_009484	TCA	2	6	274043	274048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_009484	CCG	2	6	274051	274056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_009484	GCG	2	6	274060	274065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_009484	TGC	2	6	274082	274087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259257
5012	NC_009484	TCG	2	6	274121	274126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259257
5013	NC_009484	GCC	2	6	274162	274167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259257
5014	NC_009484	CCA	2	6	274275	274280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259257
5015	NC_009484	GAA	2	6	274330	274335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259257
5016	NC_009484	CGG	2	6	274344	274349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259257
5017	NC_009484	CTG	2	6	274507	274512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259257
5018	NC_009484	GGC	2	6	274553	274558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259257
5019	NC_009484	GAT	2	6	274591	274596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259257
5020	NC_009484	TGT	2	6	274689	274694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259257
5021	NC_009484	CGC	2	6	274710	274715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259257
5022	NC_009484	ACC	2	6	274766	274771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259257
5023	NC_009484	AGA	2	6	274824	274829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259257
5024	NC_009484	GCG	2	6	274833	274838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259257
5025	NC_009484	GGC	2	6	274839	274844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259257
5026	NC_009484	GAC	2	6	274890	274895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259258
5027	NC_009484	GCG	4	12	274926	274937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259258
5028	NC_009484	AGC	2	6	274990	274995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259258
5029	NC_009484	CAG	2	6	275079	275084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259258
5030	NC_009484	CGC	2	6	275100	275105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259258
5031	NC_009484	GCG	2	6	275138	275143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259258
5032	NC_009484	GCA	3	9	275162	275170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259258
5033	NC_009484	CAC	2	6	275202	275207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259258
5034	NC_009484	GAT	2	6	275268	275273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259258
5035	NC_009484	GCG	2	6	275274	275279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259258
5036	NC_009484	GCG	2	6	275415	275420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_009484	CCT	2	6	275459	275464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_009484	GCC	2	6	275476	275481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_009484	TCG	2	6	275514	275519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259259
5040	NC_009484	CAT	2	6	275587	275592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259259
5041	NC_009484	CCG	2	6	275593	275598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259259
5042	NC_009484	GCT	2	6	275704	275709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259259
5043	NC_009484	GCG	2	6	275728	275733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259259
5044	NC_009484	CAT	2	6	275839	275844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259259
5045	NC_009484	TTC	2	6	275906	275911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259259
5046	NC_009484	CAT	2	6	275986	275991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259259
5047	NC_009484	GGT	2	6	275992	275997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259259
5048	NC_009484	CGG	2	6	276010	276015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259259
5049	NC_009484	GCC	2	6	276042	276047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259259
5050	NC_009484	ATC	2	6	276065	276070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259259
5051	NC_009484	GCC	2	6	276078	276083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259259
5052	NC_009484	TGA	2	6	276105	276110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259259
5053	NC_009484	CAT	2	6	276142	276147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259259
5054	NC_009484	CGA	2	6	276151	276156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259259
5055	NC_009484	CGG	2	6	276169	276174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259259
5056	NC_009484	CCG	2	6	276341	276346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259259
5057	NC_009484	GGA	2	6	276455	276460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_009484	GCA	2	6	276571	276576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259260
5059	NC_009484	CGA	2	6	276583	276588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259260
5060	NC_009484	CGA	2	6	276634	276639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259260
5061	NC_009484	CGG	2	6	276696	276701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259260
5062	NC_009484	TCC	2	6	276716	276721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259260
5063	NC_009484	TCG	2	6	276750	276755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259260
5064	NC_009484	AGG	2	6	276837	276842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259260
5065	NC_009484	GCT	2	6	276922	276927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259260
5066	NC_009484	GCG	2	6	276950	276955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259260
5067	NC_009484	GCC	2	6	277003	277008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259260
5068	NC_009484	CGG	2	6	277047	277052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259260
5069	NC_009484	TGA	2	6	277085	277090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259260
5070	NC_009484	TCC	2	6	277115	277120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259261
5071	NC_009484	CGC	2	6	277209	277214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259261
5072	NC_009484	TCG	2	6	277241	277246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259261
5073	NC_009484	TCG	2	6	277250	277255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259261
5074	NC_009484	CCG	2	6	277283	277288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259261
5075	NC_009484	GGT	2	6	277344	277349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259261
5076	NC_009484	CGG	2	6	277353	277358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259261
5077	NC_009484	CGC	2	6	277415	277420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259261
5078	NC_009484	GCA	2	6	277472	277477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259261
5079	NC_009484	GCT	3	9	277497	277505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259261
5080	NC_009484	CTT	2	6	277521	277526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259261
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5082	NC_009484	CGA	2	6	277641	277646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259261
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5084	NC_009484	GGC	3	9	277765	277773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5085	NC_009484	CCG	2	6	277858	277863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259262
5086	NC_009484	GTG	2	6	277940	277945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259262
5087	NC_009484	GCG	2	6	277971	277976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5088	NC_009484	CGG	3	9	277999	278007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5089	NC_009484	CGG	2	6	278049	278054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5090	NC_009484	CGC	2	6	278092	278097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259262
5091	NC_009484	CGG	2	6	278103	278108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5092	NC_009484	CGA	2	6	278130	278135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259262
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5099	NC_009484	CGG	2	6	278336	278341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5100	NC_009484	CGC	2	6	278418	278423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259262
5101	NC_009484	GAT	2	6	278446	278451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259262
5102	NC_009484	TGC	3	9	278568	278576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259262
5103	NC_009484	CGG	2	6	278577	278582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5104	NC_009484	GCT	2	6	278773	278778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259262
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5106	NC_009484	CGG	2	6	278829	278834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259262
5107	NC_009484	GAG	2	6	278867	278872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259262
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5109	NC_009484	GAT	2	6	279066	279071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259263
5110	NC_009484	CCG	2	6	279119	279124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259263
5111	NC_009484	CGG	2	6	279129	279134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259263
5112	NC_009484	CGC	2	6	279170	279175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259263
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5115	NC_009484	CGC	2	6	279261	279266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259263
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5117	NC_009484	GCC	2	6	279318	279323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259263
5118	NC_009484	GAC	2	6	279450	279455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259263
5119	NC_009484	GCG	2	6	279509	279514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259263
5120	NC_009484	GGC	2	6	279520	279525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259263
5121	NC_009484	GCG	2	6	279602	279607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259263
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5124	NC_009484	CGA	2	6	279753	279758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259263
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5236	NC_009484	GCC	2	6	285839	285844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259268
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5357	NC_009484	GCA	3	9	292053	292061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
5358	NC_009484	GCA	2	6	292125	292130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
5359	NC_009484	CGG	2	6	292156	292161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259274
5360	NC_009484	GAA	2	6	292180	292185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259274
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5362	NC_009484	GGT	2	6	292252	292257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259274
5363	NC_009484	GCC	2	6	292258	292263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259274
5364	NC_009484	GCA	2	6	292272	292277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259274
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5383	NC_009484	GCC	2	6	293224	293229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259275
5384	NC_009484	GTA	2	6	293295	293300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259275
5385	NC_009484	TCT	2	6	293312	293317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259275
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5417	NC_009484	GCA	2	6	294581	294586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259275
5418	NC_009484	CGC	2	6	294668	294673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259275
5419	NC_009484	GTG	2	6	294679	294684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259275
5420	NC_009484	GCG	2	6	294694	294699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259275
5421	NC_009484	GGC	2	6	294760	294765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259275
5422	NC_009484	TCC	2	6	294981	294986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5423	NC_009484	GGC	2	6	295133	295138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259276
5424	NC_009484	GCG	2	6	295167	295172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259276
5425	NC_009484	GGC	4	12	295188	295199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259276
5426	NC_009484	GTC	2	6	295235	295240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259276
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5428	NC_009484	CGC	2	6	295305	295310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259276
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5430	NC_009484	CGG	2	6	295423	295428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259276
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5433	NC_009484	TGG	2	6	295486	295491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259276
5434	NC_009484	GCC	2	6	295511	295516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259276
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5439	NC_009484	CGT	2	6	295598	295603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259276
5440	NC_009484	CGG	2	6	295629	295634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259276
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5472	NC_009484	CGT	2	6	297150	297155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259277
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