MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter uraniireducens Rf4 chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009483	GCAAAA	2	12	46638	46649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009483	ACAAAA	2	12	75040	75051	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009483	CCCTAC	2	12	131117	131128	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009483	AGGGAA	2	12	190674	190685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009483	AAAAAC	2	12	213975	213986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009483	TTTGAT	2	12	214114	214125	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009483	ATTAAT	2	12	229539	229550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009483	TTCCAA	2	12	254445	254456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009483	TGCAGA	2	12	308177	308188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_009483	TTTTTA	2	12	323827	323838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009483	ATTCCA	2	12	338235	338246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009483	GTATCA	2	12	350191	350202	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_009483	GTTGCA	2	12	350203	350214	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009483	GACCGG	2	12	378349	378360	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009483	ATATTC	2	12	478953	478964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009483	TCTTTA	2	12	479090	479101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009483	AGACGC	2	12	531480	531491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009483	TGCGCC	2	12	531529	531540	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009483	TTGCAC	2	12	540041	540052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009483	ATGACG	2	12	540890	540901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009483	CCGTTT	2	12	544579	544590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009483	GTGGTT	2	12	658152	658163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009483	TCATAA	2	12	666074	666085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_009483	AAATTG	2	12	723388	723399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009483	ACGACT	2	12	743897	743908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009483	TTTCAT	2	12	746215	746226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_009483	GCAAAT	2	12	762179	762190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_009483	AGGCCA	2	12	774170	774181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009483	GCTGTT	2	12	776290	776301	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009483	TTTCCC	2	12	792373	792384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009483	ATTCCA	2	12	835466	835477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009483	GACTAT	2	12	845458	845469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009483	GGCAGC	2	12	885234	885245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009483	AGCCCG	2	12	886040	886051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009483	TGAACA	2	12	945548	945559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009483	AATGCA	2	12	953302	953313	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009483	GATTCA	2	12	965239	965250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009483	GTTCAT	2	12	965256	965267	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009483	TAAAAT	2	12	971423	971434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009483	GACAAA	2	12	1000085	1000096	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009483	TCGGCA	2	12	1003329	1003340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009483	ACAATA	2	12	1005820	1005831	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009483	TGGAAT	2	12	1029638	1029649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009483	GGAGGC	2	12	1052443	1052454	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_009483	GCGGTT	2	12	1096497	1096508	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009483	ATTCCA	2	12	1141905	1141916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009483	ATTCCA	2	12	1174918	1174929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009483	GGAGCT	2	12	1237853	1237864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_009483	TTCGGC	2	12	1319370	1319381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009483	GCTCCG	2	12	1319815	1319826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009483	TACGCC	2	12	1320347	1320358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009483	AACGGC	2	12	1357461	1357472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009483	TTGTCG	2	12	1377868	1377879	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009483	CCGGTC	2	12	1466585	1466596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009483	GGAGAG	2	12	1480163	1480174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009483	ATTTTG	2	12	1503800	1503811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009483	TTCATT	2	12	1503890	1503901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_009483	CTGCGC	2	12	1535581	1535592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009483	ATTCCA	2	12	1566835	1566846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009483	AGTCAT	2	12	1602126	1602137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009483	TGAAAT	2	12	1604703	1604714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009483	TCCATA	2	12	1641164	1641175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009483	TAAGCC	2	12	1650706	1650717	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009483	TCCGGT	2	12	1682804	1682815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009483	TCCCGA	2	12	1704848	1704859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009483	AATAAA	2	12	1796387	1796398	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009483	GTCAAA	2	12	1813342	1813353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009483	GCCTCC	2	12	1842914	1842925	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009483	TACTTG	2	12	1861627	1861638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009483	TGGAAT	2	12	1865549	1865560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009483	CACCCC	2	12	1870966	1870977	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
72	NC_009483	TTAGAT	2	12	1906312	1906323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009483	GAGGGG	2	12	1917154	1917165	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009483	GCCTCC	2	12	1934548	1934559	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009483	TGTATG	2	12	1972249	1972260	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009483	TCCATT	2	12	2048369	2048380	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009483	CACTAT	2	12	2150727	2150738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009483	TTAGAT	2	12	2290456	2290467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009483	GCTCTT	2	12	2328524	2328535	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009483	AAAAAG	2	12	2363682	2363693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009483	ATTGCA	2	12	2372178	2372189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_009483	GAGTGC	2	12	2383476	2383487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009483	ATTTTG	2	12	2390739	2390750	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009483	GTTAAG	2	12	2428776	2428787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009483	ATAATT	2	12	2440869	2440880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009483	TTTTCA	2	12	2441620	2441631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009483	GGATAA	2	12	2442383	2442394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009483	GACACC	2	12	2451231	2451242	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009483	AACCAC	2	12	2454326	2454337	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009483	AAGGGA	2	12	2455116	2455127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009483	CCAATC	2	12	2559166	2559177	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009483	GACCGG	2	12	2564120	2564131	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009483	TCCTCA	2	12	2577873	2577884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009483	TCAGGA	2	12	2577891	2577902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009483	CCCGAC	2	12	2586798	2586809	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_009483	ATTCCA	2	12	2604506	2604517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009483	TATCCA	2	12	2638001	2638012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009483	AAATTC	2	12	2692235	2692246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009483	CACTTA	2	12	2785828	2785839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009483	GTACCA	2	12	2788908	2788919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009483	GCCGCT	2	12	2789068	2789079	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009483	CGTGTA	2	12	2790431	2790442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009483	AAAATG	2	12	2802479	2802490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009483	TAAAAA	2	12	2841557	2841568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009483	TAAAGT	2	12	2879656	2879667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009483	CATCTC	2	12	2903920	2903931	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009483	TGGCAG	2	12	3014228	3014239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_009483	TGGAAT	2	12	3046597	3046608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009483	TGGTTT	2	12	3074630	3074641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009483	TTCACA	2	12	3096324	3096335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009483	AACACT	2	12	3103391	3103402	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009483	TCAACC	2	12	3145142	3145153	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009483	TTAAGA	2	12	3153507	3153518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009483	GGATGG	2	12	3156771	3156782	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009483	GATTCT	2	12	3157823	3157834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_009483	GATTCT	2	12	3157853	3157864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_009483	GGAGGC	2	12	3241669	3241680	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009483	TGCCGC	2	12	3244197	3244208	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009483	TCCCGC	2	12	3255286	3255297	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009483	ATGGAG	2	12	3298158	3298169	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009483	TGAAAA	2	12	3341854	3341865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009483	ATTTCC	2	12	3415481	3415492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009483	TGGAAT	2	12	3429856	3429867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009483	TCAATA	2	12	3498103	3498114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.