MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Geobacter uraniireducens Rf4 chromosome

Total Repeats: 3476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009483	CCGAT	2	10	124	133	20 %	20 %	20 %	40 %	148262086
2	NC_009483	AGGGA	2	10	5222	5231	40 %	0 %	60 %	0 %	148262089
3	NC_009483	CAGAA	2	10	5956	5965	60 %	0 %	20 %	20 %	148262089
4	NC_009483	ACGGA	2	10	8587	8596	40 %	0 %	40 %	20 %	148262090
5	NC_009483	TCCCC	2	10	9674	9683	0 %	20 %	0 %	80 %	148262091
6	NC_009483	CCCTT	2	10	10867	10876	0 %	40 %	0 %	60 %	148262092
7	NC_009483	CGTTC	2	10	13029	13038	0 %	40 %	20 %	40 %	148262093
8	NC_009483	TGGAG	2	10	14065	14074	20 %	20 %	60 %	0 %	148262094
9	NC_009483	GGGGA	2	10	16770	16779	20 %	0 %	80 %	0 %	148262095
10	NC_009483	ACGGC	2	10	20150	20159	20 %	0 %	40 %	40 %	148262097
11	NC_009483	ACCCT	2	10	20248	20257	20 %	20 %	0 %	60 %	148262097
12	NC_009483	GGAGC	2	10	20271	20280	20 %	0 %	60 %	20 %	148262097
13	NC_009483	GGGAC	2	10	20534	20543	20 %	0 %	60 %	20 %	148262098
14	NC_009483	CACCG	2	10	22233	22242	20 %	0 %	20 %	60 %	148262099
15	NC_009483	CGGTC	2	10	22872	22881	0 %	20 %	40 %	40 %	148262100
16	NC_009483	CGATG	2	10	24185	24194	20 %	20 %	40 %	20 %	148262101
17	NC_009483	GGAAG	2	10	27982	27991	40 %	0 %	60 %	0 %	148262104
18	NC_009483	GACTA	2	10	28470	28479	40 %	20 %	20 %	20 %	148262104
19	NC_009483	TCCGC	2	10	29594	29603	0 %	20 %	20 %	60 %	148262105
20	NC_009483	TTCCT	2	10	32952	32961	0 %	60 %	0 %	40 %	148262109
21	NC_009483	AGGGA	2	10	34702	34711	40 %	0 %	60 %	0 %	148262110
22	NC_009483	CAGGG	2	10	35225	35234	20 %	0 %	60 %	20 %	148262111
23	NC_009483	AGTTA	2	10	36685	36694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009483	TAAAA	2	10	36737	36746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009483	GGAAG	2	10	37136	37145	40 %	0 %	60 %	0 %	148262113
26	NC_009483	CGGCG	2	10	41517	41526	0 %	0 %	60 %	40 %	148262118
27	NC_009483	GCGCA	2	10	41749	41758	20 %	0 %	40 %	40 %	148262119
28	NC_009483	GAAAA	2	10	44236	44245	80 %	0 %	20 %	0 %	148262121
29	NC_009483	GCGGA	2	10	44500	44509	20 %	0 %	60 %	20 %	148262121
30	NC_009483	TAACT	2	10	46628	46637	40 %	40 %	0 %	20 %	148262124
31	NC_009483	CGGCT	2	10	52222	52231	0 %	20 %	40 %	40 %	148262128
32	NC_009483	TGCTC	2	10	56312	56321	0 %	40 %	20 %	40 %	148262133
33	NC_009483	TCTCT	2	10	56537	56546	0 %	60 %	0 %	40 %	148262133
34	NC_009483	GGACG	2	10	58521	58530	20 %	0 %	60 %	20 %	148262135
35	NC_009483	TCGTT	2	10	59640	59649	0 %	60 %	20 %	20 %	148262136
36	NC_009483	GAACA	2	10	59747	59756	60 %	0 %	20 %	20 %	148262136
37	NC_009483	GGATA	2	10	60583	60592	40 %	20 %	40 %	0 %	148262136
38	NC_009483	GGTAA	2	10	60785	60794	40 %	20 %	40 %	0 %	148262136
39	NC_009483	GGACC	2	10	60829	60838	20 %	0 %	40 %	40 %	148262136
40	NC_009483	TTTGA	2	10	64831	64840	20 %	60 %	20 %	0 %	148262139
41	NC_009483	CATGT	2	10	66466	66475	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009483	CGCGG	2	10	67477	67486	0 %	0 %	60 %	40 %	148262141
43	NC_009483	ACGGA	2	10	68104	68113	40 %	0 %	40 %	20 %	148262141
44	NC_009483	ACCGC	2	10	69707	69716	20 %	0 %	20 %	60 %	148262141
45	NC_009483	TCGCT	2	10	70822	70831	0 %	40 %	20 %	40 %	148262141
46	NC_009483	ATCGT	2	10	71177	71186	20 %	40 %	20 %	20 %	148262141
47	NC_009483	CTGGT	2	10	71304	71313	0 %	40 %	40 %	20 %	148262141
48	NC_009483	CCTGG	2	10	73464	73473	0 %	20 %	40 %	40 %	148262144
49	NC_009483	TAAGA	2	10	73706	73715	60 %	20 %	20 %	0 %	148262144
50	NC_009483	TGATT	2	10	74464	74473	20 %	60 %	20 %	0 %	148262145
51	NC_009483	AAAGA	2	10	74702	74711	80 %	0 %	20 %	0 %	148262145
52	NC_009483	TGAAG	2	10	74776	74785	40 %	20 %	40 %	0 %	148262145
53	NC_009483	TTGTT	2	10	75200	75209	0 %	80 %	20 %	0 %	148262146
54	NC_009483	AAGTC	2	10	76099	76108	40 %	20 %	20 %	20 %	148262147
55	NC_009483	TGCTC	2	10	78594	78603	0 %	40 %	20 %	40 %	148262150
56	NC_009483	TTGAC	2	10	82707	82716	20 %	40 %	20 %	20 %	148262151
57	NC_009483	TCCTG	2	10	83070	83079	0 %	40 %	20 %	40 %	148262151
58	NC_009483	CTCCG	2	10	83983	83992	0 %	20 %	20 %	60 %	148262151
59	NC_009483	TGGGT	2	10	84864	84873	0 %	40 %	60 %	0 %	148262151
60	NC_009483	TCAGT	2	10	87510	87519	20 %	40 %	20 %	20 %	148262153
61	NC_009483	CAAGT	2	10	87543	87552	40 %	20 %	20 %	20 %	148262153
62	NC_009483	ACCAC	2	10	89397	89406	40 %	0 %	0 %	60 %	148262153
63	NC_009483	GAGAA	2	10	89669	89678	60 %	0 %	40 %	0 %	148262153
64	NC_009483	ACACC	2	10	90495	90504	40 %	0 %	0 %	60 %	148262153
65	NC_009483	AGTGA	2	10	90707	90716	40 %	20 %	40 %	0 %	148262153
66	NC_009483	CAACG	2	10	91505	91514	40 %	0 %	20 %	40 %	148262153
67	NC_009483	TATCG	2	10	91759	91768	20 %	40 %	20 %	20 %	148262153
68	NC_009483	GGGGC	2	10	93384	93393	0 %	0 %	80 %	20 %	148262155
69	NC_009483	TCGGC	2	10	94004	94013	0 %	20 %	40 %	40 %	148262155
70	NC_009483	GAAGG	2	10	94838	94847	40 %	0 %	60 %	0 %	148262156
71	NC_009483	CGCTC	2	10	96668	96677	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_009483	CGAAC	2	10	101118	101127	40 %	0 %	20 %	40 %	148262158
73	NC_009483	CATGC	2	10	101516	101525	20 %	20 %	20 %	40 %	148262158
74	NC_009483	TCTTT	2	10	103871	103880	0 %	80 %	0 %	20 %	148262159
75	NC_009483	CTGGT	2	10	105395	105404	0 %	40 %	40 %	20 %	148262159
76	NC_009483	ACGCC	2	10	109435	109444	20 %	0 %	20 %	60 %	148262160
77	NC_009483	GCCAC	2	10	113087	113096	20 %	0 %	20 %	60 %	148262160
78	NC_009483	GCCAT	2	10	113660	113669	20 %	20 %	20 %	40 %	148262160
79	NC_009483	GCAGC	2	10	114149	114158	20 %	0 %	40 %	40 %	148262160
80	NC_009483	CCCCA	2	10	117568	117577	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_009483	CGCCT	2	10	118093	118102	0 %	20 %	20 %	60 %	148262163
82	NC_009483	TGAAC	2	10	120509	120518	40 %	20 %	20 %	20 %	148262166
83	NC_009483	TGCTC	2	10	120877	120886	0 %	40 %	20 %	40 %	148262167
84	NC_009483	GGCAC	2	10	121759	121768	20 %	0 %	40 %	40 %	148262167
85	NC_009483	GAACA	2	10	124516	124525	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_009483	TTAAG	2	10	127835	127844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009483	CCGTG	2	10	128160	128169	0 %	20 %	40 %	40 %	148262172
88	NC_009483	AGGGT	2	10	131104	131113	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009483	GAGAA	2	10	131147	131156	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009483	CATCA	2	10	131395	131404	40 %	20 %	0 %	40 %	148262173
91	NC_009483	AGGGA	2	10	134933	134942	40 %	0 %	60 %	0 %	148262177
92	NC_009483	GGGGC	2	10	135138	135147	0 %	0 %	80 %	20 %	148262178
93	NC_009483	AGGAA	2	10	135959	135968	60 %	0 %	40 %	0 %	148262178
94	NC_009483	AGGGA	2	10	137519	137528	40 %	0 %	60 %	0 %	148262180
95	NC_009483	AAAGT	2	10	137909	137918	60 %	20 %	20 %	0 %	148262181
96	NC_009483	ATCTT	2	10	138002	138011	20 %	60 %	0 %	20 %	148262181
97	NC_009483	GGTTT	2	10	138404	138413	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009483	CACGT	2	10	138497	138506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_009483	ACGTG	2	10	138507	138516	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009483	AAACC	2	10	138591	138600	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009483	GGACG	2	10	140050	140059	20 %	0 %	60 %	20 %	148262183
102	NC_009483	TCGAA	2	10	141977	141986	40 %	20 %	20 %	20 %	148262186
103	NC_009483	AGAAA	2	10	143047	143056	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009483	GGGGA	2	10	143950	143959	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009483	TTCGT	2	10	144841	144850	0 %	60 %	20 %	20 %	148262189
106	NC_009483	GACTT	2	10	146344	146353	20 %	40 %	20 %	20 %	148262190
107	NC_009483	TTCGT	2	10	147535	147544	0 %	60 %	20 %	20 %	148262191
108	NC_009483	CGGTG	2	10	150827	150836	0 %	20 %	60 %	20 %	148262194
109	NC_009483	GGTCG	2	10	150876	150885	0 %	20 %	60 %	20 %	148262194
110	NC_009483	CGTGC	2	10	151327	151336	0 %	20 %	40 %	40 %	148262194
111	NC_009483	CCGTC	2	10	152699	152708	0 %	20 %	20 %	60 %	148262194
112	NC_009483	CATGC	2	10	154589	154598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009483	TGGTC	2	10	154629	154638	0 %	40 %	40 %	20 %	148262196
114	NC_009483	CCCCG	2	10	161151	161160	0 %	0 %	20 %	80 %	148262201
115	NC_009483	TGTCG	2	10	163527	163536	0 %	40 %	40 %	20 %	148262203
116	NC_009483	TGGCA	2	10	164993	165002	20 %	20 %	40 %	20 %	148262203
117	NC_009483	AACCG	2	10	165270	165279	40 %	0 %	20 %	40 %	148262203
118	NC_009483	CACCC	2	10	165924	165933	20 %	0 %	0 %	80 %	148262203
119	NC_009483	TGGCA	2	10	166067	166076	20 %	20 %	40 %	20 %	148262203
120	NC_009483	CCCCA	2	10	167558	167567	20 %	0 %	0 %	80 %	148262203
121	NC_009483	GTAGA	2	10	168823	168832	40 %	20 %	40 %	0 %	148262203
122	NC_009483	CCCGC	2	10	170625	170634	0 %	0 %	20 %	80 %	148262204
123	NC_009483	GCAGG	2	10	172891	172900	20 %	0 %	60 %	20 %	148262205
124	NC_009483	GCGAA	2	10	174759	174768	40 %	0 %	40 %	20 %	148262207
125	NC_009483	TGATC	2	10	174939	174948	20 %	40 %	20 %	20 %	148262207
126	NC_009483	GAAAA	2	10	175384	175393	80 %	0 %	20 %	0 %	148262207
127	NC_009483	TTTAT	2	10	179964	179973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009483	AGTAA	2	10	182932	182941	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009483	GAATC	2	10	183809	183818	40 %	20 %	20 %	20 %	148262213
130	NC_009483	GATAC	2	10	184495	184504	40 %	20 %	20 %	20 %	148262214
131	NC_009483	GACAA	2	10	189092	189101	60 %	0 %	20 %	20 %	148262218
132	NC_009483	GAGCA	2	10	190071	190080	40 %	0 %	40 %	20 %	148262219
133	NC_009483	AAGGA	2	10	192612	192621	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009483	CAGAG	2	10	193742	193751	40 %	0 %	40 %	20 %	148262223
135	NC_009483	CGAAC	2	10	195900	195909	40 %	0 %	20 %	40 %	148262223
136	NC_009483	AGGCT	2	10	196267	196276	20 %	20 %	40 %	20 %	148262223
137	NC_009483	GCCCC	2	10	198935	198944	0 %	0 %	20 %	80 %	148262226
138	NC_009483	CCTGG	2	10	199795	199804	0 %	20 %	40 %	40 %	148262227
139	NC_009483	AGCCG	2	10	201068	201077	20 %	0 %	40 %	40 %	148262228
140	NC_009483	CCCGT	2	10	201512	201521	0 %	20 %	20 %	60 %	148262228
141	NC_009483	GGTTC	2	10	204649	204658	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_009483	ATTTT	2	10	211825	211834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_009483	GTTGA	2	10	222776	222785	20 %	40 %	40 %	0 %	148262245
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158	NC_009483	TGGAC	2	10	232044	232053	20 %	20 %	40 %	20 %	148262250
159	NC_009483	GTTCT	2	10	232408	232417	0 %	60 %	20 %	20 %	148262251
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165	NC_009483	TAACA	2	10	239880	239889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_009483	CGCGG	2	10	246121	246130	0 %	0 %	60 %	40 %	148262268
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263	NC_009483	TAAAA	2	10	402801	402810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009483	CGGTG	2	10	403195	403204	0 %	20 %	60 %	20 %	148262424
265	NC_009483	GCATG	2	10	404934	404943	20 %	20 %	40 %	20 %	148262427
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267	NC_009483	TCCGT	2	10	407357	407366	0 %	40 %	20 %	40 %	148262428
268	NC_009483	AACGG	2	10	407864	407873	40 %	0 %	40 %	20 %	148262428
269	NC_009483	GAACC	2	10	408030	408039	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_009483	AGGCG	2	10	410223	410232	20 %	0 %	60 %	20 %	148262431
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366	NC_009483	CGGGG	2	10	547801	547810	0 %	0 %	80 %	20 %	148262559
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372	NC_009483	GGGAA	2	10	551216	551225	40 %	0 %	60 %	0 %	148262562
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379	NC_009483	GCATG	2	10	560984	560993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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381	NC_009483	TGCGC	2	10	564340	564349	0 %	20 %	40 %	40 %	148262577
382	NC_009483	TCATT	2	10	565207	565216	20 %	60 %	0 %	20 %	148262577
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385	NC_009483	GTATG	2	10	566785	566794	20 %	40 %	40 %	0 %	148262578
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392	NC_009483	GCAAG	2	10	574926	574935	40 %	0 %	40 %	20 %	148262580
393	NC_009483	GCAAG	2	10	577689	577698	40 %	0 %	40 %	20 %	148262581
394	NC_009483	GCAAG	2	10	578286	578295	40 %	0 %	40 %	20 %	148262581
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396	NC_009483	GCAAG	2	10	579480	579489	40 %	0 %	40 %	20 %	148262581
397	NC_009483	GTCAT	2	10	584215	584224	20 %	40 %	20 %	20 %	148262582
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