MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacter uraniireducens Rf4 chromosome

Total Repeats: 2874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009483	CCGAT	2	10	124	133	20 %	20 %	20 %	40 %	148262086
2	NC_009483	AGGGA	2	10	5222	5231	40 %	0 %	60 %	0 %	148262089
3	NC_009483	CAGAA	2	10	5956	5965	60 %	0 %	20 %	20 %	148262089
4	NC_009483	ACGGA	2	10	8587	8596	40 %	0 %	40 %	20 %	148262090
5	NC_009483	TCCCC	2	10	9674	9683	0 %	20 %	0 %	80 %	148262091
6	NC_009483	CCCTT	2	10	10867	10876	0 %	40 %	0 %	60 %	148262092
7	NC_009483	CGTTC	2	10	13029	13038	0 %	40 %	20 %	40 %	148262093
8	NC_009483	TGGAG	2	10	14065	14074	20 %	20 %	60 %	0 %	148262094
9	NC_009483	GGGGA	2	10	16770	16779	20 %	0 %	80 %	0 %	148262095
10	NC_009483	ACGGC	2	10	20150	20159	20 %	0 %	40 %	40 %	148262097
11	NC_009483	ACCCT	2	10	20248	20257	20 %	20 %	0 %	60 %	148262097
12	NC_009483	GGAGC	2	10	20271	20280	20 %	0 %	60 %	20 %	148262097
13	NC_009483	GGGAC	2	10	20534	20543	20 %	0 %	60 %	20 %	148262098
14	NC_009483	CACCG	2	10	22233	22242	20 %	0 %	20 %	60 %	148262099
15	NC_009483	CGGTC	2	10	22872	22881	0 %	20 %	40 %	40 %	148262100
16	NC_009483	CGATG	2	10	24185	24194	20 %	20 %	40 %	20 %	148262101
17	NC_009483	GGAAG	2	10	27982	27991	40 %	0 %	60 %	0 %	148262104
18	NC_009483	GACTA	2	10	28470	28479	40 %	20 %	20 %	20 %	148262104
19	NC_009483	TCCGC	2	10	29594	29603	0 %	20 %	20 %	60 %	148262105
20	NC_009483	TTCCT	2	10	32952	32961	0 %	60 %	0 %	40 %	148262109
21	NC_009483	AGGGA	2	10	34702	34711	40 %	0 %	60 %	0 %	148262110
22	NC_009483	CAGGG	2	10	35225	35234	20 %	0 %	60 %	20 %	148262111
23	NC_009483	GGAAG	2	10	37136	37145	40 %	0 %	60 %	0 %	148262113
24	NC_009483	CGGCG	2	10	41517	41526	0 %	0 %	60 %	40 %	148262118
25	NC_009483	GCGCA	2	10	41749	41758	20 %	0 %	40 %	40 %	148262119
26	NC_009483	GAAAA	2	10	44236	44245	80 %	0 %	20 %	0 %	148262121
27	NC_009483	GCGGA	2	10	44500	44509	20 %	0 %	60 %	20 %	148262121
28	NC_009483	TAACT	2	10	46628	46637	40 %	40 %	0 %	20 %	148262124
29	NC_009483	CGGCT	2	10	52222	52231	0 %	20 %	40 %	40 %	148262128
30	NC_009483	TGCTC	2	10	56312	56321	0 %	40 %	20 %	40 %	148262133
31	NC_009483	TCTCT	2	10	56537	56546	0 %	60 %	0 %	40 %	148262133
32	NC_009483	GGACG	2	10	58521	58530	20 %	0 %	60 %	20 %	148262135
33	NC_009483	TCGTT	2	10	59640	59649	0 %	60 %	20 %	20 %	148262136
34	NC_009483	GAACA	2	10	59747	59756	60 %	0 %	20 %	20 %	148262136
35	NC_009483	GGATA	2	10	60583	60592	40 %	20 %	40 %	0 %	148262136
36	NC_009483	GGTAA	2	10	60785	60794	40 %	20 %	40 %	0 %	148262136
37	NC_009483	GGACC	2	10	60829	60838	20 %	0 %	40 %	40 %	148262136
38	NC_009483	TTTGA	2	10	64831	64840	20 %	60 %	20 %	0 %	148262139
39	NC_009483	CGCGG	2	10	67477	67486	0 %	0 %	60 %	40 %	148262141
40	NC_009483	ACGGA	2	10	68104	68113	40 %	0 %	40 %	20 %	148262141
41	NC_009483	ACCGC	2	10	69707	69716	20 %	0 %	20 %	60 %	148262141
42	NC_009483	TCGCT	2	10	70822	70831	0 %	40 %	20 %	40 %	148262141
43	NC_009483	ATCGT	2	10	71177	71186	20 %	40 %	20 %	20 %	148262141
44	NC_009483	CTGGT	2	10	71304	71313	0 %	40 %	40 %	20 %	148262141
45	NC_009483	CCTGG	2	10	73464	73473	0 %	20 %	40 %	40 %	148262144
46	NC_009483	TAAGA	2	10	73706	73715	60 %	20 %	20 %	0 %	148262144
47	NC_009483	TGATT	2	10	74464	74473	20 %	60 %	20 %	0 %	148262145
48	NC_009483	AAAGA	2	10	74702	74711	80 %	0 %	20 %	0 %	148262145
49	NC_009483	TGAAG	2	10	74776	74785	40 %	20 %	40 %	0 %	148262145
50	NC_009483	TTGTT	2	10	75200	75209	0 %	80 %	20 %	0 %	148262146
51	NC_009483	AAGTC	2	10	76099	76108	40 %	20 %	20 %	20 %	148262147
52	NC_009483	TGCTC	2	10	78594	78603	0 %	40 %	20 %	40 %	148262150
53	NC_009483	TTGAC	2	10	82707	82716	20 %	40 %	20 %	20 %	148262151
54	NC_009483	TCCTG	2	10	83070	83079	0 %	40 %	20 %	40 %	148262151
55	NC_009483	CTCCG	2	10	83983	83992	0 %	20 %	20 %	60 %	148262151
56	NC_009483	TGGGT	2	10	84864	84873	0 %	40 %	60 %	0 %	148262151
57	NC_009483	TCAGT	2	10	87510	87519	20 %	40 %	20 %	20 %	148262153
58	NC_009483	CAAGT	2	10	87543	87552	40 %	20 %	20 %	20 %	148262153
59	NC_009483	ACCAC	2	10	89397	89406	40 %	0 %	0 %	60 %	148262153
60	NC_009483	GAGAA	2	10	89669	89678	60 %	0 %	40 %	0 %	148262153
61	NC_009483	ACACC	2	10	90495	90504	40 %	0 %	0 %	60 %	148262153
62	NC_009483	AGTGA	2	10	90707	90716	40 %	20 %	40 %	0 %	148262153
63	NC_009483	CAACG	2	10	91505	91514	40 %	0 %	20 %	40 %	148262153
64	NC_009483	TATCG	2	10	91759	91768	20 %	40 %	20 %	20 %	148262153
65	NC_009483	GGGGC	2	10	93384	93393	0 %	0 %	80 %	20 %	148262155
66	NC_009483	TCGGC	2	10	94004	94013	0 %	20 %	40 %	40 %	148262155
67	NC_009483	GAAGG	2	10	94838	94847	40 %	0 %	60 %	0 %	148262156
68	NC_009483	CGAAC	2	10	101118	101127	40 %	0 %	20 %	40 %	148262158
69	NC_009483	CATGC	2	10	101516	101525	20 %	20 %	20 %	40 %	148262158
70	NC_009483	TCTTT	2	10	103871	103880	0 %	80 %	0 %	20 %	148262159
71	NC_009483	CTGGT	2	10	105395	105404	0 %	40 %	40 %	20 %	148262159
72	NC_009483	ACGCC	2	10	109435	109444	20 %	0 %	20 %	60 %	148262160
73	NC_009483	GCCAC	2	10	113087	113096	20 %	0 %	20 %	60 %	148262160
74	NC_009483	GCCAT	2	10	113660	113669	20 %	20 %	20 %	40 %	148262160
75	NC_009483	GCAGC	2	10	114149	114158	20 %	0 %	40 %	40 %	148262160
76	NC_009483	CGCCT	2	10	118093	118102	0 %	20 %	20 %	60 %	148262163
77	NC_009483	TGAAC	2	10	120509	120518	40 %	20 %	20 %	20 %	148262166
78	NC_009483	TGCTC	2	10	120877	120886	0 %	40 %	20 %	40 %	148262167
79	NC_009483	GGCAC	2	10	121759	121768	20 %	0 %	40 %	40 %	148262167
80	NC_009483	CCGTG	2	10	128160	128169	0 %	20 %	40 %	40 %	148262172
81	NC_009483	CATCA	2	10	131395	131404	40 %	20 %	0 %	40 %	148262173
82	NC_009483	AGGGA	2	10	134933	134942	40 %	0 %	60 %	0 %	148262177
83	NC_009483	GGGGC	2	10	135138	135147	0 %	0 %	80 %	20 %	148262178
84	NC_009483	AGGAA	2	10	135959	135968	60 %	0 %	40 %	0 %	148262178
85	NC_009483	AGGGA	2	10	137519	137528	40 %	0 %	60 %	0 %	148262180
86	NC_009483	AAAGT	2	10	137909	137918	60 %	20 %	20 %	0 %	148262181
87	NC_009483	ATCTT	2	10	138002	138011	20 %	60 %	0 %	20 %	148262181
88	NC_009483	GGACG	2	10	140050	140059	20 %	0 %	60 %	20 %	148262183
89	NC_009483	TCGAA	2	10	141977	141986	40 %	20 %	20 %	20 %	148262186
90	NC_009483	TTCGT	2	10	144841	144850	0 %	60 %	20 %	20 %	148262189
91	NC_009483	GACTT	2	10	146344	146353	20 %	40 %	20 %	20 %	148262190
92	NC_009483	TTCGT	2	10	147535	147544	0 %	60 %	20 %	20 %	148262191
93	NC_009483	CGGTG	2	10	150827	150836	0 %	20 %	60 %	20 %	148262194
94	NC_009483	GGTCG	2	10	150876	150885	0 %	20 %	60 %	20 %	148262194
95	NC_009483	CGTGC	2	10	151327	151336	0 %	20 %	40 %	40 %	148262194
96	NC_009483	CCGTC	2	10	152699	152708	0 %	20 %	20 %	60 %	148262194
97	NC_009483	TGGTC	2	10	154629	154638	0 %	40 %	40 %	20 %	148262196
98	NC_009483	CCCCG	2	10	161151	161160	0 %	0 %	20 %	80 %	148262201
99	NC_009483	TGTCG	2	10	163527	163536	0 %	40 %	40 %	20 %	148262203
100	NC_009483	TGGCA	2	10	164993	165002	20 %	20 %	40 %	20 %	148262203
101	NC_009483	AACCG	2	10	165270	165279	40 %	0 %	20 %	40 %	148262203
102	NC_009483	CACCC	2	10	165924	165933	20 %	0 %	0 %	80 %	148262203
103	NC_009483	TGGCA	2	10	166067	166076	20 %	20 %	40 %	20 %	148262203
104	NC_009483	CCCCA	2	10	167558	167567	20 %	0 %	0 %	80 %	148262203
105	NC_009483	GTAGA	2	10	168823	168832	40 %	20 %	40 %	0 %	148262203
106	NC_009483	CCCGC	2	10	170625	170634	0 %	0 %	20 %	80 %	148262204
107	NC_009483	GCAGG	2	10	172891	172900	20 %	0 %	60 %	20 %	148262205
108	NC_009483	GCGAA	2	10	174759	174768	40 %	0 %	40 %	20 %	148262207
109	NC_009483	TGATC	2	10	174939	174948	20 %	40 %	20 %	20 %	148262207
110	NC_009483	GAAAA	2	10	175384	175393	80 %	0 %	20 %	0 %	148262207
111	NC_009483	GAATC	2	10	183809	183818	40 %	20 %	20 %	20 %	148262213
112	NC_009483	GATAC	2	10	184495	184504	40 %	20 %	20 %	20 %	148262214
113	NC_009483	GACAA	2	10	189092	189101	60 %	0 %	20 %	20 %	148262218
114	NC_009483	GAGCA	2	10	190071	190080	40 %	0 %	40 %	20 %	148262219
115	NC_009483	CAGAG	2	10	193742	193751	40 %	0 %	40 %	20 %	148262223
116	NC_009483	CGAAC	2	10	195900	195909	40 %	0 %	20 %	40 %	148262223
117	NC_009483	AGGCT	2	10	196267	196276	20 %	20 %	40 %	20 %	148262223
118	NC_009483	GCCCC	2	10	198935	198944	0 %	0 %	20 %	80 %	148262226
119	NC_009483	CCTGG	2	10	199795	199804	0 %	20 %	40 %	40 %	148262227
120	NC_009483	AGCCG	2	10	201068	201077	20 %	0 %	40 %	40 %	148262228
121	NC_009483	CCCGT	2	10	201512	201521	0 %	20 %	20 %	60 %	148262228
122	NC_009483	GCCTT	2	10	205165	205174	0 %	40 %	20 %	40 %	148262232
123	NC_009483	TTCTT	2	10	206855	206864	0 %	80 %	0 %	20 %	148262233
124	NC_009483	CGAGG	2	10	207076	207085	20 %	0 %	60 %	20 %	148262233
125	NC_009483	GCGCA	2	10	208147	208156	20 %	0 %	40 %	40 %	148262234
126	NC_009483	GGCCT	2	10	213464	213473	0 %	20 %	40 %	40 %	148262237
127	NC_009483	ACCGT	2	10	219056	219065	20 %	20 %	20 %	40 %	148262242
128	NC_009483	GTTGA	2	10	222776	222785	20 %	40 %	40 %	0 %	148262245
129	NC_009483	TCAAG	2	10	222920	222929	40 %	20 %	20 %	20 %	148262245
130	NC_009483	TTGCT	2	10	223125	223134	0 %	60 %	20 %	20 %	148262245
131	NC_009483	CGGAA	2	10	223173	223182	40 %	0 %	40 %	20 %	148262245
132	NC_009483	TTGTT	2	10	225515	225524	0 %	80 %	20 %	0 %	148262246
133	NC_009483	GAGCA	2	10	229270	229279	40 %	0 %	40 %	20 %	148262248
134	NC_009483	GCTCT	2	10	230699	230708	0 %	40 %	20 %	40 %	148262250
135	NC_009483	CGGGT	2	10	231634	231643	0 %	20 %	60 %	20 %	148262250
136	NC_009483	TGGAC	2	10	232044	232053	20 %	20 %	40 %	20 %	148262250
137	NC_009483	GTTCT	2	10	232408	232417	0 %	60 %	20 %	20 %	148262251
138	NC_009483	GAAGC	2	10	233319	233328	40 %	0 %	40 %	20 %	148262252
139	NC_009483	CCGCT	2	10	233592	233601	0 %	20 %	20 %	60 %	148262253
140	NC_009483	CCGTC	2	10	238179	238188	0 %	20 %	20 %	60 %	148262259
141	NC_009483	GGCAG	2	10	239222	239231	20 %	0 %	60 %	20 %	148262261
142	NC_009483	CGCGG	2	10	246121	246130	0 %	0 %	60 %	40 %	148262268
143	NC_009483	GATGG	2	10	246668	246677	20 %	20 %	60 %	0 %	148262268
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147	NC_009483	CGAAG	2	10	252649	252658	40 %	0 %	40 %	20 %	148262272
148	NC_009483	GGGTG	2	10	252859	252868	0 %	20 %	80 %	0 %	148262272
149	NC_009483	TCCCG	2	10	254597	254606	0 %	20 %	20 %	60 %	148262274
150	NC_009483	GCCGA	2	10	254773	254782	20 %	0 %	40 %	40 %	148262274
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247	NC_009483	ATGGG	2	10	448062	448071	20 %	20 %	60 %	0 %	148262463
248	NC_009483	ACCTG	2	10	449320	449329	20 %	20 %	20 %	40 %	148262464
249	NC_009483	AGGCG	2	10	450565	450574	20 %	0 %	60 %	20 %	148262465
250	NC_009483	CCGGC	2	10	450925	450934	0 %	0 %	40 %	60 %	148262465
251	NC_009483	CCCGG	2	10	455538	455547	0 %	0 %	40 %	60 %	148262466
252	NC_009483	GTCGT	2	10	455886	455895	0 %	40 %	40 %	20 %	148262466
253	NC_009483	GATCC	2	10	459404	459413	20 %	20 %	20 %	40 %	148262469
254	NC_009483	GAACG	3	15	460003	460017	40 %	0 %	40 %	20 %	148262469
255	NC_009483	TCAGT	2	10	460820	460829	20 %	40 %	20 %	20 %	148262470
256	NC_009483	CAGCA	2	10	461138	461147	40 %	0 %	20 %	40 %	148262470
257	NC_009483	CGGGT	2	10	463110	463119	0 %	20 %	60 %	20 %	148262472
258	NC_009483	GATGT	2	10	463193	463202	20 %	40 %	40 %	0 %	148262472
259	NC_009483	CCCGG	2	10	466231	466240	0 %	0 %	40 %	60 %	148262476
260	NC_009483	CCTGG	2	10	467208	467217	0 %	20 %	40 %	40 %	148262476
261	NC_009483	GGGTC	2	10	467510	467519	0 %	20 %	60 %	20 %	148262476
262	NC_009483	CGCGG	2	10	467673	467682	0 %	0 %	60 %	40 %	148262476
263	NC_009483	CGCCA	2	10	468706	468715	20 %	0 %	20 %	60 %	148262476
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272	NC_009483	CGGCA	2	10	477458	477467	20 %	0 %	40 %	40 %	148262483
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332	NC_009483	GCAAG	2	10	578883	578892	40 %	0 %	40 %	20 %	148262581
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389	NC_009483	GCCAG	2	10	680534	680543	20 %	0 %	40 %	40 %	148262653
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