MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 5702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009482	GCCC	2	8	813	820	0 %	0 %	25 %	75 %	148241100
2	NC_009482	GCTG	2	8	1010	1017	0 %	25 %	50 %	25 %	148241100
3	NC_009482	CCAG	2	8	1053	1060	25 %	0 %	25 %	50 %	148241100
4	NC_009482	CGTC	2	8	1449	1456	0 %	25 %	25 %	50 %	148241101
5	NC_009482	TTGG	2	8	1505	1512	0 %	50 %	50 %	0 %	148241101
6	NC_009482	ATCA	2	8	1665	1672	50 %	25 %	0 %	25 %	148241101
7	NC_009482	GATC	2	8	1742	1749	25 %	25 %	25 %	25 %	148241101
8	NC_009482	CCCG	2	8	2275	2282	0 %	0 %	25 %	75 %	148241102
9	NC_009482	GCCC	2	8	2478	2485	0 %	0 %	25 %	75 %	148241102
10	NC_009482	GGTG	2	8	2831	2838	0 %	25 %	75 %	0 %	148241102
11	NC_009482	GCCT	2	8	2868	2875	0 %	25 %	25 %	50 %	148241102
12	NC_009482	TCCC	2	8	3203	3210	0 %	25 %	0 %	75 %	148241102
13	NC_009482	CGGG	2	8	3436	3443	0 %	0 %	75 %	25 %	148241102
14	NC_009482	CCAA	2	8	3797	3804	50 %	0 %	0 %	50 %	148241102
15	NC_009482	TTGG	2	8	3858	3865	0 %	50 %	50 %	0 %	148241102
16	NC_009482	TGGC	2	8	3964	3971	0 %	25 %	50 %	25 %	148241102
17	NC_009482	CGAT	2	8	4375	4382	25 %	25 %	25 %	25 %	148241102
18	NC_009482	AACC	2	8	4453	4460	50 %	0 %	0 %	50 %	148241102
19	NC_009482	TTCA	2	8	5493	5500	25 %	50 %	0 %	25 %	148241103
20	NC_009482	GCTT	2	8	6886	6893	0 %	50 %	25 %	25 %	148241104
21	NC_009482	GGCT	2	8	7196	7203	0 %	25 %	50 %	25 %	148241104
22	NC_009482	AGGT	2	8	7735	7742	25 %	25 %	50 %	0 %	148241104
23	NC_009482	TCCA	2	8	8124	8131	25 %	25 %	0 %	50 %	148241104
24	NC_009482	GCCC	2	8	8341	8348	0 %	0 %	25 %	75 %	148241104
25	NC_009482	GACA	2	8	9587	9594	50 %	0 %	25 %	25 %	148241106
26	NC_009482	CAGC	2	8	9951	9958	25 %	0 %	25 %	50 %	148241106
27	NC_009482	CAAC	2	8	10644	10651	50 %	0 %	0 %	50 %	148241107
28	NC_009482	TGAT	2	8	10826	10833	25 %	50 %	25 %	0 %	148241107
29	NC_009482	GTTG	2	8	11329	11336	0 %	50 %	50 %	0 %	148241108
30	NC_009482	GCTC	2	8	11729	11736	0 %	25 %	25 %	50 %	148241108
31	NC_009482	GCTG	2	8	12092	12099	0 %	25 %	50 %	25 %	148241109
32	NC_009482	TTGG	2	8	12728	12735	0 %	50 %	50 %	0 %	148241110
33	NC_009482	ATGA	2	8	13125	13132	50 %	25 %	25 %	0 %	148241110
34	NC_009482	GCCA	2	8	13638	13645	25 %	0 %	25 %	50 %	148241110
35	NC_009482	CCGC	2	8	13729	13736	0 %	0 %	25 %	75 %	148241110
36	NC_009482	GCCG	2	8	14590	14597	0 %	0 %	50 %	50 %	148241111
37	NC_009482	CTTG	2	8	15125	15132	0 %	50 %	25 %	25 %	148241111
38	NC_009482	CGGC	2	8	15209	15216	0 %	0 %	50 %	50 %	148241111
39	NC_009482	ACCC	2	8	15272	15279	25 %	0 %	0 %	75 %	148241111
40	NC_009482	GGCC	2	8	17017	17024	0 %	0 %	50 %	50 %	148241113
41	NC_009482	AGCG	2	8	17529	17536	25 %	0 %	50 %	25 %	148241114
42	NC_009482	GCGA	2	8	17569	17576	25 %	0 %	50 %	25 %	148241114
43	NC_009482	GCCG	2	8	17586	17593	0 %	0 %	50 %	50 %	148241114
44	NC_009482	CAGG	2	8	18088	18095	25 %	0 %	50 %	25 %	148241114
45	NC_009482	GATT	2	8	18144	18151	25 %	50 %	25 %	0 %	148241114
46	NC_009482	GCAG	2	8	18501	18508	25 %	0 %	50 %	25 %	148241115
47	NC_009482	CAGC	2	8	18554	18561	25 %	0 %	25 %	50 %	148241115
48	NC_009482	CCTG	2	8	18786	18793	0 %	25 %	25 %	50 %	148241115
49	NC_009482	GCGG	2	8	19479	19486	0 %	0 %	75 %	25 %	148241116
50	NC_009482	TGGC	2	8	19880	19887	0 %	25 %	50 %	25 %	148241116
51	NC_009482	GATC	2	8	20253	20260	25 %	25 %	25 %	25 %	148241117
52	NC_009482	CACG	2	8	20531	20538	25 %	0 %	25 %	50 %	148241117
53	NC_009482	CCAT	2	8	20659	20666	25 %	25 %	0 %	50 %	148241117
54	NC_009482	GTTG	2	8	22054	22061	0 %	50 %	50 %	0 %	148241118
55	NC_009482	CGCT	2	8	22140	22147	0 %	25 %	25 %	50 %	148241118
56	NC_009482	CAGG	2	8	22165	22172	25 %	0 %	50 %	25 %	148241118
57	NC_009482	GCAG	2	8	22213	22220	25 %	0 %	50 %	25 %	148241118
58	NC_009482	CATG	2	8	22387	22394	25 %	25 %	25 %	25 %	148241118
59	NC_009482	GCTC	2	8	22509	22516	0 %	25 %	25 %	50 %	148241118
60	NC_009482	TGGC	2	8	22925	22932	0 %	25 %	50 %	25 %	148241119
61	NC_009482	CCAG	2	8	23282	23289	25 %	0 %	25 %	50 %	148241119
62	NC_009482	GTCC	2	8	23736	23743	0 %	25 %	25 %	50 %	148241119
63	NC_009482	CTCC	2	8	24058	24065	0 %	25 %	0 %	75 %	148241120
64	NC_009482	CGGC	2	8	24936	24943	0 %	0 %	50 %	50 %	148241121
65	NC_009482	CGCA	2	8	25865	25872	25 %	0 %	25 %	50 %	148241122
66	NC_009482	CAGC	2	8	26331	26338	25 %	0 %	25 %	50 %	148241123
67	NC_009482	GCGG	2	8	26700	26707	0 %	0 %	75 %	25 %	148241123
68	NC_009482	TGCC	2	8	26746	26753	0 %	25 %	25 %	50 %	148241123
69	NC_009482	GTTG	2	8	27084	27091	0 %	50 %	50 %	0 %	148241124
70	NC_009482	GCTT	2	8	27347	27354	0 %	50 %	25 %	25 %	148241125
71	NC_009482	GCCT	2	8	28680	28687	0 %	25 %	25 %	50 %	148241126
72	NC_009482	AGTG	2	8	28702	28709	25 %	25 %	50 %	0 %	148241126
73	NC_009482	GGCA	2	8	28746	28753	25 %	0 %	50 %	25 %	148241126
74	NC_009482	CCTG	2	8	29673	29680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009482	GCCA	2	8	30360	30367	25 %	0 %	25 %	50 %	148241127
76	NC_009482	CAGC	2	8	30749	30756	25 %	0 %	25 %	50 %	148241127
77	NC_009482	CTTG	2	8	32142	32149	0 %	50 %	25 %	25 %	148241129
78	NC_009482	GCTC	2	8	32562	32569	0 %	25 %	25 %	50 %	148241129
79	NC_009482	AGCC	2	8	33372	33379	25 %	0 %	25 %	50 %	148241130
80	NC_009482	GCAA	2	8	34280	34287	50 %	0 %	25 %	25 %	148241132
81	NC_009482	CAGC	2	8	34559	34566	25 %	0 %	25 %	50 %	148241132
82	NC_009482	AGCC	2	8	34681	34688	25 %	0 %	25 %	50 %	148241132
83	NC_009482	CAGC	2	8	34778	34785	25 %	0 %	25 %	50 %	148241132
84	NC_009482	AGGC	2	8	35521	35528	25 %	0 %	50 %	25 %	148241134
85	NC_009482	TCCC	2	8	35535	35542	0 %	25 %	0 %	75 %	148241134
86	NC_009482	GCAG	2	8	35786	35793	25 %	0 %	50 %	25 %	148241134
87	NC_009482	GGCG	2	8	35861	35868	0 %	0 %	75 %	25 %	148241134
88	NC_009482	GCCA	2	8	35942	35949	25 %	0 %	25 %	50 %	148241134
89	NC_009482	GTTG	2	8	36044	36051	0 %	50 %	50 %	0 %	148241134
90	NC_009482	CAAG	2	8	36126	36133	50 %	0 %	25 %	25 %	148241134
91	NC_009482	TCAC	2	8	36403	36410	25 %	25 %	0 %	50 %	148241134
92	NC_009482	GTTG	2	8	36617	36624	0 %	50 %	50 %	0 %	148241136
93	NC_009482	GATT	2	8	36896	36903	25 %	50 %	25 %	0 %	148241136
94	NC_009482	CGGC	2	8	37859	37866	0 %	0 %	50 %	50 %	148241137
95	NC_009482	CTTG	2	8	38510	38517	0 %	50 %	25 %	25 %	148241137
96	NC_009482	ATCC	2	8	40216	40223	25 %	25 %	0 %	50 %	148241141
97	NC_009482	TGAT	2	8	40256	40263	25 %	50 %	25 %	0 %	148241142
98	NC_009482	GCCC	2	8	40566	40573	0 %	0 %	25 %	75 %	148241142
99	NC_009482	GCCC	2	8	40575	40582	0 %	0 %	25 %	75 %	148241142
100	NC_009482	AAAG	2	8	41595	41602	75 %	0 %	25 %	0 %	148241143
101	NC_009482	CAAG	2	8	42169	42176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009482	GGCA	2	8	42714	42721	25 %	0 %	50 %	25 %	148241145
103	NC_009482	TGGG	2	8	43991	43998	0 %	25 %	75 %	0 %	148241146
104	NC_009482	GGCG	2	8	44833	44840	0 %	0 %	75 %	25 %	148241147
105	NC_009482	CACC	2	8	44851	44858	25 %	0 %	0 %	75 %	148241147
106	NC_009482	GGAG	2	8	45224	45231	25 %	0 %	75 %	0 %	148241148
107	NC_009482	TGTT	2	8	45562	45569	0 %	75 %	25 %	0 %	148241148
108	NC_009482	ATTC	2	8	46142	46149	25 %	50 %	0 %	25 %	148241148
109	NC_009482	GTGG	2	8	46299	46306	0 %	25 %	75 %	0 %	148241148
110	NC_009482	CGTG	2	8	46508	46515	0 %	25 %	50 %	25 %	148241148
111	NC_009482	TTGA	2	8	46803	46810	25 %	50 %	25 %	0 %	148241149
112	NC_009482	ACCG	2	8	46941	46948	25 %	0 %	25 %	50 %	148241149
113	NC_009482	ACCG	2	8	47085	47092	25 %	0 %	25 %	50 %	148241149
114	NC_009482	TGGG	2	8	47334	47341	0 %	25 %	75 %	0 %	148241149
115	NC_009482	TTGG	2	8	47497	47504	0 %	50 %	50 %	0 %	148241149
116	NC_009482	CGGT	2	8	48019	48026	0 %	25 %	50 %	25 %	148241151
117	NC_009482	GGCC	2	8	48114	48121	0 %	0 %	50 %	50 %	148241151
118	NC_009482	TTGA	2	8	48386	48393	25 %	50 %	25 %	0 %	148241151
119	NC_009482	CGAT	2	8	48564	48571	25 %	25 %	25 %	25 %	148241151
120	NC_009482	GCGG	2	8	49728	49735	0 %	0 %	75 %	25 %	148241152
121	NC_009482	GGTG	2	8	50426	50433	0 %	25 %	75 %	0 %	148241152
122	NC_009482	GCCA	2	8	50470	50477	25 %	0 %	25 %	50 %	148241152
123	NC_009482	CTTC	2	8	50885	50892	0 %	50 %	0 %	50 %	148241153
124	NC_009482	CGGT	2	8	51286	51293	0 %	25 %	50 %	25 %	148241153
125	NC_009482	CCCA	2	8	52084	52091	25 %	0 %	0 %	75 %	148241154
126	NC_009482	GCCA	2	8	52780	52787	25 %	0 %	25 %	50 %	148241155
127	NC_009482	TGGC	2	8	53431	53438	0 %	25 %	50 %	25 %	148241156
128	NC_009482	TGGG	2	8	53667	53674	0 %	25 %	75 %	0 %	148241156
129	NC_009482	ACAA	2	8	54900	54907	75 %	0 %	0 %	25 %	148241160
130	NC_009482	CCCA	2	8	55056	55063	25 %	0 %	0 %	75 %	148241160
131	NC_009482	GTGA	2	8	55434	55441	25 %	25 %	50 %	0 %	148241160
132	NC_009482	TCTT	2	8	56456	56463	0 %	75 %	0 %	25 %	148241160
133	NC_009482	TTGT	2	8	56614	56621	0 %	75 %	25 %	0 %	148241161
134	NC_009482	CTGG	2	8	56641	56648	0 %	25 %	50 %	25 %	148241161
135	NC_009482	GATG	2	8	56890	56897	25 %	25 %	50 %	0 %	148241161
136	NC_009482	AGGC	2	8	58237	58244	25 %	0 %	50 %	25 %	148241162
137	NC_009482	CAGC	2	8	58593	58600	25 %	0 %	25 %	50 %	148241162
138	NC_009482	AGCC	2	8	58812	58819	25 %	0 %	25 %	50 %	148241162
139	NC_009482	CGGT	2	8	59463	59470	0 %	25 %	50 %	25 %	148241162
140	NC_009482	AGCG	2	8	59492	59499	25 %	0 %	50 %	25 %	148241162
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