MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 1596

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009482	TTA	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009482	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009482	GGC	2	6	163	168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009482	GCG	2	6	8433	8438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009482	GTC	2	6	16702	16707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009482	TTA	2	6	35324	35329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009482	CTC	2	6	35402	35407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_009482	TGC	2	6	37078	37083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009482	TGA	2	6	39484	39489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009482	TGT	2	6	39568	39573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009482	ATT	2	6	41842	41847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009482	CAT	2	6	41865	41870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009482	TGG	2	6	42306	42311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009482	CTA	2	6	52018	52023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009482	GCT	2	6	54675	54680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009482	GCC	2	6	61692	61697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009482	CAG	2	6	61714	61719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009482	GCA	2	6	63905	63910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009482	TGT	2	6	64026	64031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009482	GCA	2	6	78707	78712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009482	CAC	2	6	78745	78750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009482	GCC	2	6	81884	81889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009482	CCG	2	6	83001	83006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009482	ATC	2	6	83025	83030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009482	GGT	2	6	90658	90663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009482	CTG	2	6	94304	94309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009482	TGC	2	6	94347	94352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009482	CTT	2	6	95780	95785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009482	GAA	2	6	97697	97702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009482	ATA	2	6	97802	97807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009482	CAG	2	6	98841	98846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009482	TCC	2	6	103486	103491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009482	ATG	2	6	106096	106101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009482	GTT	2	6	106151	106156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009482	TGC	2	6	109813	109818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009482	AGA	2	6	117225	117230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009482	GCG	2	6	123576	123581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009482	AGG	2	6	125076	125081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009482	CAA	2	6	128381	128386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009482	CTT	2	6	128649	128654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009482	AAC	2	6	128692	128697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009482	GAT	2	6	132447	132452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009482	ACC	2	6	132465	132470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009482	GCG	2	6	132488	132493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009482	TGT	2	6	132497	132502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009482	TGC	2	6	132578	132583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009482	CGG	2	6	132638	132643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009482	CTC	2	6	132661	132666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009482	CCA	2	6	132731	132736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009482	AGC	2	6	132742	132747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009482	TGC	2	6	132898	132903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009482	GGT	2	6	132914	132919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009482	ATG	2	6	133296	133301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009482	GGC	2	6	136346	136351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009482	CTG	2	6	155150	155155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009482	GCG	2	6	167378	167383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009482	CGC	2	6	176787	176792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009482	CAG	2	6	176813	176818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009482	AGG	2	6	176852	176857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009482	GAT	2	6	176882	176887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009482	AGG	2	6	181021	181026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009482	CGG	2	6	181113	181118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009482	ATC	2	6	181153	181158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009482	ATG	2	6	181223	181228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009482	CGT	2	6	181329	181334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009482	TGA	2	6	181355	181360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009482	TGT	2	6	181416	181421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009482	AAT	2	6	181441	181446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009482	TCA	2	6	190525	190530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009482	TGG	2	6	190551	190556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009482	TGG	2	6	190599	190604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009482	AGG	2	6	190745	190750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009482	TGC	2	6	190791	190796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009482	GCG	2	6	190804	190809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009482	CAG	2	6	190813	190818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009482	GCC	2	6	190829	190834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009482	CAG	2	6	190916	190921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009482	GCT	2	6	191030	191035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009482	TGC	2	6	191164	191169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009482	TGG	2	6	191176	191181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009482	GGA	2	6	191626	191631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009482	GTA	2	6	192256	192261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009482	AAC	2	6	192282	192287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009482	ATT	2	6	192366	192371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009482	TAG	2	6	192393	192398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009482	CCT	2	6	192409	192414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009482	CCT	2	6	194276	194281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009482	TAT	2	6	194321	194326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009482	ATC	2	6	195503	195508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009482	CTA	2	6	195590	195595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009482	TTA	2	6	195635	195640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009482	ATG	2	6	195812	195817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009482	CAT	2	6	195887	195892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009482	TAA	2	6	195921	195926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009482	TAA	2	6	195936	195941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009482	ATT	2	6	196075	196080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009482	TTA	2	6	196119	196124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009482	ACT	2	6	199291	199296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009482	AAC	2	6	199476	199481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009482	AAG	2	6	199501	199506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009482	CAA	2	6	199528	199533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009482	TGA	2	6	199656	199661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009482	TCG	2	6	199796	199801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009482	CTG	2	6	199811	199816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009482	GAA	2	6	199827	199832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009482	GGA	2	6	199843	199848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009482	TAA	2	6	199922	199927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009482	TCT	2	6	199962	199967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009482	TGT	2	6	200052	200057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009482	AAT	2	6	200083	200088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009482	TAT	2	6	200196	200201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009482	ATT	2	6	200220	200225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009482	TAA	2	6	200339	200344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009482	ATA	2	6	201998	202003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009482	CTT	2	6	202043	202048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009482	CTC	2	6	202083	202088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009482	AAG	2	6	202105	202110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009482	TCT	2	6	202162	202167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009482	CTT	2	6	202409	202414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009482	AGA	2	6	202578	202583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009482	TAT	2	6	202606	202611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009482	TCT	2	6	206754	206759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009482	TGA	2	6	206766	206771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009482	CTG	2	6	206879	206884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009482	TCT	2	6	206885	206890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009482	TGT	2	6	206970	206975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009482	TTC	2	6	207159	207164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009482	TCC	2	6	207187	207192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009482	ATT	2	6	207276	207281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009482	CTT	2	6	208586	208591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009482	AGC	2	6	212746	212751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009482	GCG	2	6	218085	218090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009482	GCA	2	6	218100	218105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009482	AGC	2	6	224745	224750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136	NC_009482	AGC	2	6	235872	235877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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