MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 6349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009481	CTGC	2	8	348	355	0 %	25 %	25 %	50 %	148238337
2	NC_009481	CCCT	2	8	802	809	0 %	25 %	0 %	75 %	148238337
3	NC_009481	TGGC	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	148238337
4	NC_009481	CAAC	2	8	1499	1506	50 %	0 %	0 %	50 %	148238338
5	NC_009481	GACC	2	8	1580	1587	25 %	0 %	25 %	50 %	148238338
6	NC_009481	GCGA	2	8	1645	1652	25 %	0 %	50 %	25 %	148238338
7	NC_009481	CGTC	2	8	1847	1854	0 %	25 %	25 %	50 %	148238338
8	NC_009481	GATC	2	8	2055	2062	25 %	25 %	25 %	25 %	148238338
9	NC_009481	GGGA	2	8	2495	2502	25 %	0 %	75 %	0 %	148238339
10	NC_009481	GATT	2	8	2908	2915	25 %	50 %	25 %	0 %	148238339
11	NC_009481	GCAG	2	8	3176	3183	25 %	0 %	50 %	25 %	148238339
12	NC_009481	ATCA	2	8	3285	3292	50 %	25 %	0 %	25 %	148238339
13	NC_009481	GGGT	2	8	3910	3917	0 %	25 %	75 %	0 %	148238339
14	NC_009481	GGTT	2	8	3992	3999	0 %	50 %	50 %	0 %	148238339
15	NC_009481	GCGG	2	8	4283	4290	0 %	0 %	75 %	25 %	148238339
16	NC_009481	GAAA	2	8	4496	4503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009481	GTCA	2	8	4718	4725	25 %	25 %	25 %	25 %	148238340
18	NC_009481	GCTC	2	8	4744	4751	0 %	25 %	25 %	50 %	148238340
19	NC_009481	CCAG	2	8	4822	4829	25 %	0 %	25 %	50 %	148238340
20	NC_009481	GTCG	2	8	5513	5520	0 %	25 %	50 %	25 %	148238340
21	NC_009481	TTCA	2	8	5525	5532	25 %	50 %	0 %	25 %	148238340
22	NC_009481	CCCA	2	8	5534	5541	25 %	0 %	0 %	75 %	148238340
23	NC_009481	AAGG	2	8	5840	5847	50 %	0 %	50 %	0 %	148238340
24	NC_009481	GATG	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	148238340
25	NC_009481	GGCA	2	8	6201	6208	25 %	0 %	50 %	25 %	148238341
26	NC_009481	CAGC	2	8	6735	6742	25 %	0 %	25 %	50 %	148238341
27	NC_009481	GGGA	2	8	6892	6899	25 %	0 %	75 %	0 %	148238341
28	NC_009481	CAGC	2	8	7614	7621	25 %	0 %	25 %	50 %	148238341
29	NC_009481	AGGT	2	8	7760	7767	25 %	25 %	50 %	0 %	148238341
30	NC_009481	ATCC	2	8	7881	7888	25 %	25 %	0 %	50 %	148238341
31	NC_009481	GCAG	2	8	7979	7986	25 %	0 %	50 %	25 %	148238341
32	NC_009481	ATTC	2	8	8545	8552	25 %	50 %	0 %	25 %	148238342
33	NC_009481	TCGA	2	8	8722	8729	25 %	25 %	25 %	25 %	148238342
34	NC_009481	ACCA	2	8	9372	9379	50 %	0 %	0 %	50 %	148238342
35	NC_009481	TTGA	2	8	9660	9667	25 %	50 %	25 %	0 %	148238343
36	NC_009481	AGGG	2	8	10326	10333	25 %	0 %	75 %	0 %	148238343
37	NC_009481	GGTT	2	8	11133	11140	0 %	50 %	50 %	0 %	148238345
38	NC_009481	CTGG	2	8	11285	11292	0 %	25 %	50 %	25 %	148238345
39	NC_009481	GTTG	2	8	11467	11474	0 %	50 %	50 %	0 %	148238345
40	NC_009481	AGGG	2	8	11610	11617	25 %	0 %	75 %	0 %	148238345
41	NC_009481	GCCG	2	8	11844	11851	0 %	0 %	50 %	50 %	148238345
42	NC_009481	TCGT	2	8	11911	11918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009481	TCGA	2	8	12073	12080	25 %	25 %	25 %	25 %	148238346
44	NC_009481	TTGC	2	8	12445	12452	0 %	50 %	25 %	25 %	148238346
45	NC_009481	GCCA	2	8	13802	13809	25 %	0 %	25 %	50 %	148238347
46	NC_009481	TGGT	2	8	14324	14331	0 %	50 %	50 %	0 %	148238348
47	NC_009481	GCGT	2	8	14405	14412	0 %	25 %	50 %	25 %	148238348
48	NC_009481	CGGC	2	8	14812	14819	0 %	0 %	50 %	50 %	148238348
49	NC_009481	CTGC	2	8	15353	15360	0 %	25 %	25 %	50 %	148238348
50	NC_009481	TGGC	2	8	15552	15559	0 %	25 %	50 %	25 %	148238349
51	NC_009481	CCAG	2	8	15799	15806	25 %	0 %	25 %	50 %	148238349
52	NC_009481	CGGT	2	8	18653	18660	0 %	25 %	50 %	25 %	148238351
53	NC_009481	ATCC	2	8	18724	18731	25 %	25 %	0 %	50 %	148238351
54	NC_009481	GTTT	2	8	18863	18870	0 %	75 %	25 %	0 %	148238352
55	NC_009481	GACG	2	8	18936	18943	25 %	0 %	50 %	25 %	148238352
56	NC_009481	GCCA	2	8	19484	19491	25 %	0 %	25 %	50 %	148238353
57	NC_009481	GACG	2	8	19598	19605	25 %	0 %	50 %	25 %	148238353
58	NC_009481	CTGC	2	8	19645	19652	0 %	25 %	25 %	50 %	148238353
59	NC_009481	CCGG	2	8	19971	19978	0 %	0 %	50 %	50 %	148238353
60	NC_009481	CACC	2	8	19987	19994	25 %	0 %	0 %	75 %	148238353
61	NC_009481	CTGG	2	8	20423	20430	0 %	25 %	50 %	25 %	148238353
62	NC_009481	TGGA	2	8	20445	20452	25 %	25 %	50 %	0 %	148238353
63	NC_009481	GCTG	3	12	20493	20504	0 %	25 %	50 %	25 %	148238353
64	NC_009481	TGAG	2	8	20533	20540	25 %	25 %	50 %	0 %	148238353
65	NC_009481	ATTG	2	8	20856	20863	25 %	50 %	25 %	0 %	148238354
66	NC_009481	ATCA	2	8	22492	22499	50 %	25 %	0 %	25 %	148238354
67	NC_009481	GAGG	2	8	22813	22820	25 %	0 %	75 %	0 %	148238354
68	NC_009481	GAGG	2	8	23227	23234	25 %	0 %	75 %	0 %	148238354
69	NC_009481	CCAG	2	8	23945	23952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009481	TGAT	2	8	24066	24073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009481	AAAT	2	8	24184	24191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009481	TGAT	2	8	24244	24251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009481	GTGA	2	8	24737	24744	25 %	25 %	50 %	0 %	148238355
74	NC_009481	ATCA	2	8	24823	24830	50 %	25 %	0 %	25 %	148238355
75	NC_009481	GATT	2	8	25504	25511	25 %	50 %	25 %	0 %	148238355
76	NC_009481	TGCT	2	8	25743	25750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009481	TTTG	2	8	25868	25875	0 %	75 %	25 %	0 %	148238356
78	NC_009481	CCGA	2	8	26025	26032	25 %	0 %	25 %	50 %	148238356
79	NC_009481	TGAT	2	8	26422	26429	25 %	50 %	25 %	0 %	148238356
80	NC_009481	GCTG	2	8	26690	26697	0 %	25 %	50 %	25 %	148238356
81	NC_009481	CCGC	2	8	26824	26831	0 %	0 %	25 %	75 %	148238356
82	NC_009481	TTCA	2	8	27160	27167	25 %	50 %	0 %	25 %	148238357
83	NC_009481	AGTG	2	8	27493	27500	25 %	25 %	50 %	0 %	148238357
84	NC_009481	GGCA	2	8	27899	27906	25 %	0 %	50 %	25 %	148238357
85	NC_009481	AGCC	2	8	28095	28102	25 %	0 %	25 %	50 %	148238357
86	NC_009481	TGCT	2	8	28327	28334	0 %	50 %	25 %	25 %	148238357
87	NC_009481	TCAC	2	8	28562	28569	25 %	25 %	0 %	50 %	148238357
88	NC_009481	TCGG	2	8	29577	29584	0 %	25 %	50 %	25 %	148238359
89	NC_009481	GTGA	2	8	30806	30813	25 %	25 %	50 %	0 %	148238360
90	NC_009481	CGAT	2	8	30981	30988	25 %	25 %	25 %	25 %	148238361
91	NC_009481	GGGT	2	8	31344	31351	0 %	25 %	75 %	0 %	148238361
92	NC_009481	ACCG	2	8	31503	31510	25 %	0 %	25 %	50 %	148238361
93	NC_009481	CCTG	2	8	31513	31520	0 %	25 %	25 %	50 %	148238361
94	NC_009481	AGTC	2	8	31627	31634	25 %	25 %	25 %	25 %	148238361
95	NC_009481	GCAC	2	8	32686	32693	25 %	0 %	25 %	50 %	148238363
96	NC_009481	TGGT	2	8	32861	32868	0 %	50 %	50 %	0 %	148238363
97	NC_009481	CAGC	2	8	32870	32877	25 %	0 %	25 %	50 %	148238363
98	NC_009481	CATC	2	8	33109	33116	25 %	25 %	0 %	50 %	148238364
99	NC_009481	GACC	2	8	33695	33702	25 %	0 %	25 %	50 %	148238364
100	NC_009481	GCAA	2	8	33753	33760	50 %	0 %	25 %	25 %	148238364
101	NC_009481	CGAT	2	8	34060	34067	25 %	25 %	25 %	25 %	148238364
102	NC_009481	CCGC	2	8	34362	34369	0 %	0 %	25 %	75 %	148238364
103	NC_009481	ATCG	2	8	34754	34761	25 %	25 %	25 %	25 %	148238365
104	NC_009481	GTCC	2	8	35343	35350	0 %	25 %	25 %	50 %	148238365
105	NC_009481	CAGC	2	8	35560	35567	25 %	0 %	25 %	50 %	148238365
106	NC_009481	TCCA	2	8	36695	36702	25 %	25 %	0 %	50 %	148238367
107	NC_009481	TCCA	2	8	36791	36798	25 %	25 %	0 %	50 %	148238367
108	NC_009481	TGCT	2	8	37023	37030	0 %	50 %	25 %	25 %	148238367
109	NC_009481	ATCC	2	8	37177	37184	25 %	25 %	0 %	50 %	148238367
110	NC_009481	CAAG	2	8	37681	37688	50 %	0 %	25 %	25 %	148238367
111	NC_009481	AAGG	2	8	38134	38141	50 %	0 %	50 %	0 %	148238368
112	NC_009481	TTTC	2	8	38311	38318	0 %	75 %	0 %	25 %	148238368
113	NC_009481	GCAA	2	8	39005	39012	50 %	0 %	25 %	25 %	148238370
114	NC_009481	CAGC	2	8	39103	39110	25 %	0 %	25 %	50 %	148238370
115	NC_009481	GCCC	2	8	39530	39537	0 %	0 %	25 %	75 %	148238370
116	NC_009481	CCTG	2	8	39542	39549	0 %	25 %	25 %	50 %	148238370
117	NC_009481	GGCT	2	8	39723	39730	0 %	25 %	50 %	25 %	148238370
118	NC_009481	GCTG	2	8	39885	39892	0 %	25 %	50 %	25 %	148238371
119	NC_009481	CGCT	2	8	40286	40293	0 %	25 %	25 %	50 %	148238372
120	NC_009481	CCCA	2	8	40642	40649	25 %	0 %	0 %	75 %	148238372
121	NC_009481	CGGG	2	8	40715	40722	0 %	0 %	75 %	25 %	148238372
122	NC_009481	GCCG	2	8	40874	40881	0 %	0 %	50 %	50 %	148238372
123	NC_009481	TGCC	2	8	41210	41217	0 %	25 %	25 %	50 %	148238373
124	NC_009481	CATC	2	8	41366	41373	25 %	25 %	0 %	50 %	148238374
125	NC_009481	GATT	2	8	41535	41542	25 %	50 %	25 %	0 %	148238374
126	NC_009481	AATA	2	8	41558	41565	75 %	25 %	0 %	0 %	148238374
127	NC_009481	GCTG	2	8	42043	42050	0 %	25 %	50 %	25 %	148238375
128	NC_009481	TGCG	2	8	42493	42500	0 %	25 %	50 %	25 %	148238375
129	NC_009481	CCGA	2	8	42536	42543	25 %	0 %	25 %	50 %	148238375
130	NC_009481	TGGA	2	8	42664	42671	25 %	25 %	50 %	0 %	148238375
131	NC_009481	GCCT	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	148238375
132	NC_009481	CCAA	2	8	42790	42797	50 %	0 %	0 %	50 %	148238375
133	NC_009481	GCCG	2	8	42935	42942	0 %	0 %	50 %	50 %	148238375
134	NC_009481	ATGG	2	8	43251	43258	25 %	25 %	50 %	0 %	148238375
135	NC_009481	ACGC	2	8	43424	43431	25 %	0 %	25 %	50 %	148238375
136	NC_009481	TTGG	2	8	43462	43469	0 %	50 %	50 %	0 %	148238376
137	NC_009481	GAGG	2	8	44524	44531	25 %	0 %	75 %	0 %	148238378
138	NC_009481	TGCC	2	8	44712	44719	0 %	25 %	25 %	50 %	148238378
139	NC_009481	AAAG	2	8	45181	45188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_009481	GCCA	2	8	46110	46117	25 %	0 %	25 %	50 %	148238382
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