MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 36093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009481	TAG	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009481	TGC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238337
3	NC_009481	CCG	2	6	280	285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238337
4	NC_009481	ACC	2	6	447	452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238337
5	NC_009481	GCG	2	6	460	465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238337
6	NC_009481	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238337
7	NC_009481	TGG	2	6	544	549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238337
8	NC_009481	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238337
9	NC_009481	GCA	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238337
10	NC_009481	TGA	2	6	626	631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238337
11	NC_009481	GAT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238337
12	NC_009481	GAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238337
13	NC_009481	CTT	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238337
14	NC_009481	GGT	3	9	893	901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238337
15	NC_009481	GCC	2	6	906	911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238337
16	NC_009481	CAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238337
17	NC_009481	TGT	2	6	1064	1069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238337
18	NC_009481	ATC	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238337
19	NC_009481	GAG	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238337
20	NC_009481	ACC	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238337
21	NC_009481	CGG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238337
22	NC_009481	ATG	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238337
23	NC_009481	TCT	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238338
24	NC_009481	TCC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238338
25	NC_009481	CTG	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238338
26	NC_009481	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238338
27	NC_009481	CAG	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
28	NC_009481	CGG	2	6	1573	1578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238338
29	NC_009481	CTA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238338
30	NC_009481	AGC	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
31	NC_009481	TCG	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238338
32	NC_009481	TGA	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238338
33	NC_009481	AGC	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
34	NC_009481	CAG	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
35	NC_009481	GGA	2	6	1940	1945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238338
36	NC_009481	GGA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238338
37	NC_009481	ACG	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238338
38	NC_009481	CAG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009481	AGG	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238339
40	NC_009481	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238339
41	NC_009481	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
42	NC_009481	TGG	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
43	NC_009481	GTG	2	6	2397	2402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
44	NC_009481	CGG	2	6	2458	2463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
45	NC_009481	GCC	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238339
46	NC_009481	TCC	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238339
47	NC_009481	CTG	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
48	NC_009481	TGA	2	6	2573	2578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
49	NC_009481	GTG	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
50	NC_009481	GCA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
51	NC_009481	GAT	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
52	NC_009481	TGG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
53	NC_009481	GCT	2	6	2992	2997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
54	NC_009481	GGC	2	6	3005	3010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
55	NC_009481	CTG	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
56	NC_009481	GTG	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
57	NC_009481	GAG	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238339
58	NC_009481	CCG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238339
59	NC_009481	TGT	2	6	3185	3190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238339
60	NC_009481	GAA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238339
61	NC_009481	TGC	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
62	NC_009481	GCT	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
63	NC_009481	CTG	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
64	NC_009481	CTG	2	6	3405	3410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
65	NC_009481	GAT	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
66	NC_009481	CCA	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238339
67	NC_009481	CAG	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
68	NC_009481	GGT	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
69	NC_009481	CGG	2	6	3491	3496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
70	NC_009481	TGC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
71	NC_009481	GGC	2	6	3569	3574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238339
72	NC_009481	GAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
73	NC_009481	TGG	2	6	3874	3879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
74	NC_009481	TGG	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238339
75	NC_009481	CTT	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238339
76	NC_009481	CGA	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
77	NC_009481	GAT	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
78	NC_009481	GCA	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
79	NC_009481	CTG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
80	NC_009481	AGC	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
81	NC_009481	CTG	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238339
82	NC_009481	CAG	2	6	4139	4144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238339
83	NC_009481	TTG	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238339
84	NC_009481	TGA	2	6	4322	4327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238339
85	NC_009481	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238340
86	NC_009481	GCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
87	NC_009481	GCA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
88	NC_009481	GCA	3	9	4800	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
89	NC_009481	TGA	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
90	NC_009481	TGA	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
91	NC_009481	CCA	2	6	4938	4943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238340
92	NC_009481	CAG	2	6	4973	4978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
93	NC_009481	CGG	2	6	5019	5024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
94	NC_009481	GAG	2	6	5132	5137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238340
95	NC_009481	CAG	2	6	5158	5163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238340
96	NC_009481	CAT	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238340
97	NC_009481	GCC	2	6	5192	5197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238340
98	NC_009481	TGA	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
99	NC_009481	CAC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238340
100	NC_009481	GAT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
101	NC_009481	CGG	2	6	5397	5402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
102	NC_009481	GAT	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238340
103	NC_009481	CAC	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238340
104	NC_009481	GGA	2	6	5791	5796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238340
105	NC_009481	TGG	2	6	5850	5855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238340
106	NC_009481	GGC	2	6	5857	5862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238340
107	NC_009481	AGC	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
108	NC_009481	GAC	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
109	NC_009481	TCC	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
110	NC_009481	TTC	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238341
111	NC_009481	GGC	2	6	6246	6251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
112	NC_009481	CAG	3	9	6256	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
113	NC_009481	CTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
114	NC_009481	CTC	2	6	6429	6434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
115	NC_009481	CCT	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
116	NC_009481	CGG	2	6	6450	6455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
117	NC_009481	CCT	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
118	NC_009481	CAC	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
119	NC_009481	GCT	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
120	NC_009481	CAG	2	6	6559	6564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
121	NC_009481	ACC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
122	NC_009481	TGC	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
123	NC_009481	GAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238341
124	NC_009481	TGA	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238341
125	NC_009481	CGT	2	6	6864	6869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
126	NC_009481	GGC	2	6	6915	6920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
127	NC_009481	AGG	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238341
128	NC_009481	CCA	2	6	6984	6989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
129	NC_009481	GCG	2	6	6997	7002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
130	NC_009481	CTT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238341
131	NC_009481	CAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
132	NC_009481	AGC	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
133	NC_009481	CTC	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
134	NC_009481	CCG	2	6	7156	7161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238341
135	NC_009481	CCT	2	6	7251	7256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
136	NC_009481	CCA	2	6	7308	7313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238341
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155	NC_009481	GTC	2	6	8119	8124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238341
156	NC_009481	CAG	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
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158	NC_009481	GGT	2	6	8229	8234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238341
159	NC_009481	CGA	2	6	8253	8258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238341
160	NC_009481	GCG	2	6	8323	8328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238341
161	NC_009481	CTC	2	6	8446	8451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238341
162	NC_009481	AAG	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009481	TCT	2	6	8501	8506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_009481	TGA	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238342
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168	NC_009481	TTG	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238342
169	NC_009481	TGG	3	9	8903	8911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238342
170	NC_009481	GTC	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238342
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173	NC_009481	TCC	2	6	9241	9246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238342
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242	NC_009481	CGG	2	6	13742	13747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238347
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245	NC_009481	AGC	2	6	14110	14115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238348
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247	NC_009481	CAG	2	6	14161	14166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238348
248	NC_009481	GTG	2	6	14308	14313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238348
249	NC_009481	GCT	2	6	14421	14426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238348
250	NC_009481	CTC	2	6	14526	14531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238348
251	NC_009481	TGG	2	6	14552	14557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238348
252	NC_009481	GTC	2	6	14576	14581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238348
253	NC_009481	TGC	2	6	14687	14692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238348
254	NC_009481	GGC	2	6	14799	14804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238348
255	NC_009481	ACT	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238348
256	NC_009481	CGC	2	6	14878	14883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238348
257	NC_009481	TGA	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238348
258	NC_009481	TGC	2	6	14960	14965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238348
259	NC_009481	GCC	2	6	15000	15005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238348
260	NC_009481	TTC	2	6	15014	15019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238348
261	NC_009481	GTT	2	6	15195	15200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238348
262	NC_009481	TGC	2	6	15263	15268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238348
263	NC_009481	TGA	2	6	15321	15326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238348
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270	NC_009481	GCG	2	6	15937	15942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238349
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280	NC_009481	ACA	2	6	16524	16529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238349
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282	NC_009481	GGA	2	6	16633	16638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238349
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284	NC_009481	TGG	2	6	16698	16703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238349
285	NC_009481	GTG	2	6	16748	16753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238349
286	NC_009481	GTT	2	6	16777	16782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238349
287	NC_009481	GGC	2	6	16870	16875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238349
288	NC_009481	GGA	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238349
289	NC_009481	TCA	2	6	17072	17077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_009481	TGA	2	6	17232	17237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238350
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313	NC_009481	CCA	2	6	18024	18029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238351
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333	NC_009481	GTT	2	6	19316	19321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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335	NC_009481	CTG	2	6	19462	19467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238353
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359	NC_009481	TCA	2	6	20547	20552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
360	NC_009481	GGA	3	9	20565	20573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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