MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009481	GA	3	6	23765	23770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009481	AG	3	6	24025	24030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009481	GA	3	6	24124	24129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009481	CG	3	6	24204	24209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009481	AT	4	8	24250	24257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009481	TC	3	6	41779	41784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009481	GC	3	6	41876	41881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009481	CT	3	6	45208	45213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009481	CA	4	8	80697	80704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009481	TG	3	6	85641	85646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009481	AG	3	6	96184	96189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009481	AT	3	6	96204	96209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009481	AT	3	6	96273	96278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009481	GT	3	6	98451	98456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009481	AT	3	6	99302	99307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009481	TC	3	6	99560	99565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009481	GT	3	6	99795	99800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009481	AG	3	6	100761	100766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009481	AG	4	8	110040	110047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009481	AG	4	8	117269	117276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009481	CG	3	6	117689	117694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009481	CG	3	6	126316	126321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009481	GC	3	6	157486	157491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009481	GA	3	6	163737	163742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009481	CG	3	6	178660	178665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009481	TC	3	6	189984	189989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009481	TC	3	6	206308	206313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009481	GC	3	6	219914	219919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009481	GC	3	6	229207	229212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009481	GC	3	6	234219	234224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009481	CG	3	6	278983	278988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009481	GC	4	8	292883	292890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009481	GA	3	6	294438	294443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009481	GC	3	6	316897	316902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009481	TC	3	6	317097	317102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009481	GA	4	8	327321	327328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009481	TC	3	6	327473	327478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009481	TC	3	6	340610	340615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009481	CT	3	6	350608	350613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009481	GA	4	8	376224	376231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009481	TG	3	6	380445	380450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009481	GC	3	6	414680	414685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009481	AG	3	6	435444	435449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009481	GT	3	6	437101	437106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009481	CG	3	6	447312	447317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009481	CT	3	6	448141	448146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009481	CA	3	6	463027	463032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009481	CA	3	6	475395	475400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009481	TC	3	6	475439	475444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009481	GT	3	6	483185	483190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009481	CG	3	6	484517	484522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009481	GA	3	6	500675	500680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009481	TC	3	6	503932	503937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009481	GT	3	6	512894	512899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009481	AG	3	6	535635	535640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009481	AC	3	6	535709	535714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009481	AC	3	6	535878	535883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009481	CA	3	6	536844	536849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009481	TG	3	6	537264	537269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009481	TG	3	6	537751	537756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009481	CT	4	8	538459	538466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009481	GA	3	6	538772	538777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009481	GC	3	6	539054	539059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009481	CA	3	6	542468	542473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009481	AC	3	6	543601	543606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009481	GT	3	6	543615	543620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009481	AG	3	6	555507	555512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009481	GA	3	6	555681	555686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009481	GC	3	6	555764	555769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009481	TG	3	6	585453	585458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009481	CT	3	6	585994	585999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009481	GA	3	6	601396	601401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009481	TG	3	6	609338	609343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009481	CG	3	6	611553	611558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009481	TC	3	6	622680	622685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009481	GT	3	6	644370	644375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009481	CA	3	6	655908	655913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009481	CT	3	6	656976	656981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009481	GT	3	6	664617	664622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009481	TG	3	6	673912	673917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009481	CT	3	6	681182	681187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009481	AG	3	6	697080	697085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009481	TG	3	6	699120	699125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009481	GC	3	6	701600	701605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009481	TC	3	6	715503	715508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009481	TC	3	6	718013	718018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009481	GA	3	6	727987	727992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009481	GC	3	6	776645	776650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009481	CT	3	6	786427	786432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009481	GT	3	6	791641	791646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009481	GA	3	6	792166	792171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009481	GC	3	6	795121	795126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009481	TC	3	6	801991	801996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009481	TC	3	6	804537	804542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009481	GC	4	8	807509	807516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009481	TG	3	6	810292	810297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009481	TA	3	6	827432	827437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009481	GC	3	6	832143	832148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009481	AC	3	6	832165	832170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009481	TG	3	6	852771	852776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009481	TC	3	6	856471	856476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009481	AG	3	6	857507	857512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009481	GT	3	6	863000	863005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009481	CT	3	6	868499	868504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009481	CA	3	6	868605	868610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009481	TC	3	6	868733	868738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009481	TC	3	6	871017	871022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009481	TC	3	6	873903	873908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009481	CA	4	8	874202	874209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009481	CG	3	6	874285	874290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009481	AG	3	6	875372	875377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009481	CT	4	8	887660	887667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009481	GC	3	6	887668	887673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009481	CG	3	6	888298	888303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009481	CG	3	6	894759	894764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009481	AG	3	6	901622	901627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009481	CA	3	6	901900	901905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009481	CT	3	6	913594	913599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009481	CG	3	6	916593	916598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009481	CG	3	6	917294	917299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009481	TC	3	6	927732	927737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009481	TG	3	6	927760	927765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009481	GT	3	6	931302	931307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009481	GA	3	6	959155	959160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009481	TC	3	6	960057	960062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009481	TC	3	6	976985	976990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009481	GT	3	6	978515	978520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009481	CT	3	6	990601	990606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009481	CT	3	6	999427	999432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009481	GA	3	6	1012749	1012754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009481	GA	3	6	1017419	1017424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009481	GC	3	6	1025129	1025134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009481	TC	3	6	1025615	1025620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009481	GC	3	6	1026689	1026694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009481	CT	3	6	1041794	1041799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009481	GC	3	6	1060224	1060229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009481	CT	3	6	1071760	1071765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009481	GC	3	6	1077402	1077407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009481	GT	3	6	1093939	1093944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009481	CT	3	6	1100253	1100258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009481	GA	3	6	1102978	1102983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009481	GA	3	6	1139424	1139429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009481	AG	3	6	1149518	1149523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009481	TC	3	6	1164179	1164184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009481	GA	3	6	1181837	1181842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009481	CA	3	6	1192450	1192455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009481	GT	3	6	1198686	1198691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009481	AC	3	6	1198857	1198862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009481	GA	3	6	1204374	1204379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009481	CT	3	6	1222299	1222304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009481	CG	3	6	1253709	1253714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009481	AG	3	6	1270685	1270690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.