MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 2528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	CCGAC	2	10	14	23	20 %	0 %	20 %	60 %	148271179
2	NC_009480	ACCAC	2	10	1307	1316	40 %	0 %	0 %	60 %	148271179
3	NC_009480	GGGCA	2	10	4141	4150	20 %	0 %	60 %	20 %	148271182
4	NC_009480	GATCG	2	10	4611	4620	20 %	20 %	40 %	20 %	148271182
5	NC_009480	GCGAC	2	10	5010	5019	20 %	0 %	40 %	40 %	148271182
6	NC_009480	CAGGC	2	10	5074	5083	20 %	0 %	40 %	40 %	148271182
7	NC_009480	GCACC	2	10	6698	6707	20 %	0 %	20 %	60 %	148271184
8	NC_009480	ACCCG	2	10	14750	14759	20 %	0 %	20 %	60 %	148271191
9	NC_009480	CCGTC	2	10	15887	15896	0 %	20 %	20 %	60 %	148271192
10	NC_009480	CGGCG	2	10	18671	18680	0 %	0 %	60 %	40 %	148271194
11	NC_009480	GCGCG	2	10	19210	19219	0 %	0 %	60 %	40 %	148271194
12	NC_009480	GCGAT	2	10	19950	19959	20 %	20 %	40 %	20 %	148271194
13	NC_009480	CGACG	2	10	20233	20242	20 %	0 %	40 %	40 %	148271195
14	NC_009480	GCGGG	2	10	23351	23360	0 %	0 %	80 %	20 %	148271197
15	NC_009480	GAGCA	2	10	23537	23546	40 %	0 %	40 %	20 %	148271197
16	NC_009480	CCCGC	2	10	24021	24030	0 %	0 %	20 %	80 %	148271197
17	NC_009480	GTCGA	2	10	24213	24222	20 %	20 %	40 %	20 %	148271198
18	NC_009480	GGACG	2	10	24422	24431	20 %	0 %	60 %	20 %	148271198
19	NC_009480	AGCGC	2	10	24607	24616	20 %	0 %	40 %	40 %	148271198
20	NC_009480	CACCG	2	10	25974	25983	20 %	0 %	20 %	60 %	148271200
21	NC_009480	GCTCG	2	10	26202	26211	0 %	20 %	40 %	40 %	148271200
22	NC_009480	TCGGC	2	10	26715	26724	0 %	20 %	40 %	40 %	148271200
23	NC_009480	GCCGG	2	10	28028	28037	0 %	0 %	60 %	40 %	148271200
24	NC_009480	CCGGC	2	10	28574	28583	0 %	0 %	40 %	60 %	148271201
25	NC_009480	CGGGC	2	10	29804	29813	0 %	0 %	60 %	40 %	148271202
26	NC_009480	GCGTC	2	10	30814	30823	0 %	20 %	40 %	40 %	148271204
27	NC_009480	GCACG	2	10	31079	31088	20 %	0 %	40 %	40 %	148271204
28	NC_009480	GCGTC	2	10	31944	31953	0 %	20 %	40 %	40 %	148271205
29	NC_009480	GCGCG	2	10	34570	34579	0 %	0 %	60 %	40 %	148271207
30	NC_009480	GTGCC	2	10	35542	35551	0 %	20 %	40 %	40 %	148271208
31	NC_009480	GGCGC	2	10	35558	35567	0 %	0 %	60 %	40 %	148271208
32	NC_009480	GGCGG	2	10	35700	35709	0 %	0 %	80 %	20 %	148271208
33	NC_009480	GCCGT	2	10	36617	36626	0 %	20 %	40 %	40 %	148271210
34	NC_009480	GCGAC	2	10	37116	37125	20 %	0 %	40 %	40 %	148271210
35	NC_009480	CAGGT	2	10	37914	37923	20 %	20 %	40 %	20 %	148271211
36	NC_009480	CGGCG	2	10	41438	41447	0 %	0 %	60 %	40 %	148271213
37	NC_009480	CCCGA	2	10	41667	41676	20 %	0 %	20 %	60 %	148271213
38	NC_009480	GGCGG	2	10	42499	42508	0 %	0 %	80 %	20 %	148271214
39	NC_009480	CCACG	2	10	48038	48047	20 %	0 %	20 %	60 %	148271216
40	NC_009480	ACCGC	2	10	49005	49014	20 %	0 %	20 %	60 %	148271217
41	NC_009480	CTCCG	2	10	49464	49473	0 %	20 %	20 %	60 %	148271217
42	NC_009480	CGAAC	2	10	54826	54835	40 %	0 %	20 %	40 %	148271222
43	NC_009480	AGCGA	2	10	62429	62438	40 %	0 %	40 %	20 %	148271224
44	NC_009480	TTGCT	2	10	66321	66330	0 %	60 %	20 %	20 %	148271227
45	NC_009480	TGCTC	2	10	70853	70862	0 %	40 %	20 %	40 %	148271230
46	NC_009480	GGTGA	2	10	76808	76817	20 %	20 %	60 %	0 %	148271232
47	NC_009480	CTCTG	2	10	77573	77582	0 %	40 %	20 %	40 %	148271233
48	NC_009480	TGCGT	2	10	77600	77609	0 %	40 %	40 %	20 %	148271233
49	NC_009480	CGTCA	2	10	78126	78135	20 %	20 %	20 %	40 %	148271233
50	NC_009480	CCACG	2	10	79253	79262	20 %	0 %	20 %	60 %	148271234
51	NC_009480	ACCGC	2	10	83422	83431	20 %	0 %	20 %	60 %	148271237
52	NC_009480	GCGCG	2	10	86566	86575	0 %	0 %	60 %	40 %	148271239
53	NC_009480	CCGCG	2	10	92836	92845	0 %	0 %	40 %	60 %	148271241
54	NC_009480	ACCAA	2	10	93278	93287	60 %	0 %	0 %	40 %	148271242
55	NC_009480	CGAAG	2	10	96743	96752	40 %	0 %	40 %	20 %	148271245
56	NC_009480	TGAGG	2	10	98030	98039	20 %	20 %	60 %	0 %	148271247
57	NC_009480	AGGCA	2	10	98951	98960	40 %	0 %	40 %	20 %	148271247
58	NC_009480	GCCGG	2	10	100485	100494	0 %	0 %	60 %	40 %	148271248
59	NC_009480	CGACC	2	10	100597	100606	20 %	0 %	20 %	60 %	148271248
60	NC_009480	CCCGT	2	10	102074	102083	0 %	20 %	20 %	60 %	148271248
61	NC_009480	AGGCG	2	10	107804	107813	20 %	0 %	60 %	20 %	148271251
62	NC_009480	CAGCC	2	10	112300	112309	20 %	0 %	20 %	60 %	148271252
63	NC_009480	GCGTC	2	10	113121	113130	0 %	20 %	40 %	40 %	148271253
64	NC_009480	GCGCG	2	10	117308	117317	0 %	0 %	60 %	40 %	148271256
65	NC_009480	CGAGT	2	10	121804	121813	20 %	20 %	40 %	20 %	148271260
66	NC_009480	GCCGT	2	10	122030	122039	0 %	20 %	40 %	40 %	148271260
67	NC_009480	GGGAT	2	10	125672	125681	20 %	20 %	60 %	0 %	148271262
68	NC_009480	GTCGC	2	10	126007	126016	0 %	20 %	40 %	40 %	148271263
69	NC_009480	GTCGT	2	10	127602	127611	0 %	40 %	40 %	20 %	148271264
70	NC_009480	GAGAG	2	10	127975	127984	40 %	0 %	60 %	0 %	148271264
71	NC_009480	TGGCT	2	10	132824	132833	0 %	40 %	40 %	20 %	148271268
72	NC_009480	TGCTC	2	10	134147	134156	0 %	40 %	20 %	40 %	148271269
73	NC_009480	CGAGT	2	10	136616	136625	20 %	20 %	40 %	20 %	148271271
74	NC_009480	GCAGG	2	10	138913	138922	20 %	0 %	60 %	20 %	148271272
75	NC_009480	CACGA	2	10	139063	139072	40 %	0 %	20 %	40 %	148271272
76	NC_009480	CGGCT	2	10	139976	139985	0 %	20 %	40 %	40 %	148271274
77	NC_009480	GGCTG	2	10	141764	141773	0 %	20 %	60 %	20 %	148271275
78	NC_009480	CGACG	2	10	141867	141876	20 %	0 %	40 %	40 %	148271275
79	NC_009480	ACCCC	2	10	143475	143484	20 %	0 %	0 %	80 %	148271275
80	NC_009480	TCGGC	2	10	144047	144056	0 %	20 %	40 %	40 %	148271276
81	NC_009480	GCGAC	2	10	145230	145239	20 %	0 %	40 %	40 %	148271277
82	NC_009480	CGCAC	2	10	147267	147276	20 %	0 %	20 %	60 %	148271277
83	NC_009480	CTCTC	2	10	147566	147575	0 %	40 %	0 %	60 %	148271278
84	NC_009480	GAGCT	2	10	150166	150175	20 %	20 %	40 %	20 %	148271279
85	NC_009480	CGAAC	2	10	150374	150383	40 %	0 %	20 %	40 %	148271279
86	NC_009480	GATGG	2	10	150734	150743	20 %	20 %	60 %	0 %	148271279
87	NC_009480	GCGAC	2	10	151496	151505	20 %	0 %	40 %	40 %	148271280
88	NC_009480	CGCGT	2	10	153229	153238	0 %	20 %	40 %	40 %	148271281
89	NC_009480	CTCCA	2	10	154042	154051	20 %	20 %	0 %	60 %	148271281
90	NC_009480	CGGTG	2	10	154476	154485	0 %	20 %	60 %	20 %	148271281
91	NC_009480	CCTCG	2	10	155663	155672	0 %	20 %	20 %	60 %	148271282
92	NC_009480	AGGAG	2	10	157531	157540	40 %	0 %	60 %	0 %	148271283
93	NC_009480	CTCGG	2	10	157958	157967	0 %	20 %	40 %	40 %	148271283
94	NC_009480	CCGGG	2	10	159545	159554	0 %	0 %	60 %	40 %	148271284
95	NC_009480	CATGT	2	10	160092	160101	20 %	40 %	20 %	20 %	148271284
96	NC_009480	GTCGC	2	10	161341	161350	0 %	20 %	40 %	40 %	148271284
97	NC_009480	GTGAG	2	10	161447	161456	20 %	20 %	60 %	0 %	148271284
98	NC_009480	GCGCA	2	10	162935	162944	20 %	0 %	40 %	40 %	148271286
99	NC_009480	GCCCG	2	10	168161	168170	0 %	0 %	40 %	60 %	148271290
100	NC_009480	CGGCG	2	10	168269	168278	0 %	0 %	60 %	40 %	148271290
101	NC_009480	CCCGA	2	10	168498	168507	20 %	0 %	20 %	60 %	148271290
102	NC_009480	ACGGC	2	10	169523	169532	20 %	0 %	40 %	40 %	148271291
103	NC_009480	CCGCC	2	10	169642	169651	0 %	0 %	20 %	80 %	148271292
104	NC_009480	CAGGC	2	10	172496	172505	20 %	0 %	40 %	40 %	148271295
105	NC_009480	GAGGT	2	10	172958	172967	20 %	20 %	60 %	0 %	148271295
106	NC_009480	TCGGC	2	10	173827	173836	0 %	20 %	40 %	40 %	148271296
107	NC_009480	ATCGC	2	10	174535	174544	20 %	20 %	20 %	40 %	148271297
108	NC_009480	GCCGG	2	10	175202	175211	0 %	0 %	60 %	40 %	148271298
109	NC_009480	GCCCG	2	10	176982	176991	0 %	0 %	40 %	60 %	148271298
110	NC_009480	GCCCG	2	10	181505	181514	0 %	0 %	40 %	60 %	148271301
111	NC_009480	GGCGA	2	10	182373	182382	20 %	0 %	60 %	20 %	148271302
112	NC_009480	GGTGC	2	10	182570	182579	0 %	20 %	60 %	20 %	148271302
113	NC_009480	GCGCC	2	10	182590	182599	0 %	0 %	40 %	60 %	148271302
114	NC_009480	GGTCG	2	10	183617	183626	0 %	20 %	60 %	20 %	148271302
115	NC_009480	CCGGT	2	10	184269	184278	0 %	20 %	40 %	40 %	148271302
116	NC_009480	CGCGG	2	10	186944	186953	0 %	0 %	60 %	40 %	148271304
117	NC_009480	CTGCC	2	10	188704	188713	0 %	20 %	20 %	60 %	148271306
118	NC_009480	GACCA	2	10	189697	189706	40 %	0 %	20 %	40 %	148271308
119	NC_009480	GATCG	2	10	189775	189784	20 %	20 %	40 %	20 %	148271309
120	NC_009480	AGCGG	2	10	190646	190655	20 %	0 %	60 %	20 %	148271310
121	NC_009480	CCCGT	2	10	191108	191117	0 %	20 %	20 %	60 %	148271310
122	NC_009480	GGTCT	2	10	192966	192975	0 %	40 %	40 %	20 %	148271312
123	NC_009480	CCCGC	2	10	198559	198568	0 %	0 %	20 %	80 %	148271317
124	NC_009480	ACGCG	2	10	198637	198646	20 %	0 %	40 %	40 %	148271317
125	NC_009480	CCGCC	2	10	198902	198911	0 %	0 %	20 %	80 %	148271317
126	NC_009480	GCGCG	2	10	200535	200544	0 %	0 %	60 %	40 %	148271320
127	NC_009480	CGCGC	2	10	200551	200560	0 %	0 %	40 %	60 %	148271320
128	NC_009480	GGAGC	2	10	203180	203189	20 %	0 %	60 %	20 %	148271322
129	NC_009480	TCCGC	2	10	204867	204876	0 %	20 %	20 %	60 %	148271324
130	NC_009480	GCGCG	2	10	205078	205087	0 %	0 %	60 %	40 %	148271324
131	NC_009480	GCGGG	2	10	207875	207884	0 %	0 %	80 %	20 %	148271328
132	NC_009480	AGCTC	2	10	212050	212059	20 %	20 %	20 %	40 %	148271329
133	NC_009480	CGGCC	2	10	212108	212117	0 %	0 %	40 %	60 %	148271329
134	NC_009480	CGCGA	2	10	214974	214983	20 %	0 %	40 %	40 %	148271332
135	NC_009480	CGGCC	2	10	215280	215289	0 %	0 %	40 %	60 %	148271332
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138	NC_009480	CGCGC	2	10	216475	216484	0 %	0 %	40 %	60 %	148271333
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260	NC_009480	TGGAC	2	10	355741	355750	20 %	20 %	40 %	20 %	148271474
261	NC_009480	CGCCC	2	10	357036	357045	0 %	0 %	20 %	80 %	148271475
262	NC_009480	CCACG	2	10	359807	359816	20 %	0 %	20 %	60 %	148271478
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