MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 8486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	GCTC	2	8	215	222	0 %	25 %	25 %	50 %	148271179
2	NC_009480	GCCG	2	8	303	310	0 %	0 %	50 %	50 %	148271179
3	NC_009480	CTGC	2	8	367	374	0 %	25 %	25 %	50 %	148271179
4	NC_009480	GGAC	2	8	2094	2101	25 %	0 %	50 %	25 %	148271180
5	NC_009480	CCGC	2	8	2132	2139	0 %	0 %	25 %	75 %	148271180
6	NC_009480	GCCG	2	8	2358	2365	0 %	0 %	50 %	50 %	148271180
7	NC_009480	CGAC	2	8	2537	2544	25 %	0 %	25 %	50 %	148271180
8	NC_009480	GCCC	2	8	2568	2575	0 %	0 %	25 %	75 %	148271180
9	NC_009480	GGCA	2	8	3326	3333	25 %	0 %	50 %	25 %	148271181
10	NC_009480	CGTC	2	8	4050	4057	0 %	25 %	25 %	50 %	148271182
11	NC_009480	GCCT	2	8	5217	5224	0 %	25 %	25 %	50 %	148271182
12	NC_009480	CGTC	2	8	5344	5351	0 %	25 %	25 %	50 %	148271183
13	NC_009480	GCAC	2	8	6916	6923	25 %	0 %	25 %	50 %	148271184
14	NC_009480	CGGC	2	8	7360	7367	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
15	NC_009480	CAGC	2	8	9840	9847	25 %	0 %	25 %	50 %	148271185
16	NC_009480	TGCT	2	8	11912	11919	0 %	50 %	25 %	25 %	148271187
17	NC_009480	ACCC	2	8	12497	12504	25 %	0 %	0 %	75 %	148271188
18	NC_009480	CGAC	2	8	12522	12529	25 %	0 %	25 %	50 %	148271188
19	NC_009480	CGAC	2	8	12840	12847	25 %	0 %	25 %	50 %	148271188
20	NC_009480	GCGG	2	8	12986	12993	0 %	0 %	75 %	25 %	148271189
21	NC_009480	GCCG	2	8	13017	13024	0 %	0 %	50 %	50 %	148271189
22	NC_009480	CGGC	2	8	14555	14562	0 %	0 %	50 %	50 %	148271191
23	NC_009480	CGGC	2	8	14614	14621	0 %	0 %	50 %	50 %	148271191
24	NC_009480	CTCG	2	8	15792	15799	0 %	25 %	25 %	50 %	148271192
25	NC_009480	CTCG	2	8	15864	15871	0 %	25 %	25 %	50 %	148271192
26	NC_009480	CTGG	2	8	16029	16036	0 %	25 %	50 %	25 %	148271192
27	NC_009480	CGAC	2	8	16334	16341	25 %	0 %	25 %	50 %	148271193
28	NC_009480	GAGC	2	8	17108	17115	25 %	0 %	50 %	25 %	148271193
29	NC_009480	CGCC	2	8	17153	17160	0 %	0 %	25 %	75 %	148271193
30	NC_009480	GCGG	2	8	17412	17419	0 %	0 %	75 %	25 %	148271193
31	NC_009480	GAGC	2	8	18128	18135	25 %	0 %	50 %	25 %	148271194
32	NC_009480	CGTC	2	8	18529	18536	0 %	25 %	25 %	50 %	148271194
33	NC_009480	CTGG	2	8	18881	18888	0 %	25 %	50 %	25 %	148271194
34	NC_009480	CGGT	2	8	19241	19248	0 %	25 %	50 %	25 %	148271194
35	NC_009480	CGGC	2	8	19249	19256	0 %	0 %	50 %	50 %	148271194
36	NC_009480	GTCG	2	8	19427	19434	0 %	25 %	50 %	25 %	148271194
37	NC_009480	GCTC	2	8	20337	20344	0 %	25 %	25 %	50 %	148271195
38	NC_009480	TCGA	2	8	20534	20541	25 %	25 %	25 %	25 %	148271195
39	NC_009480	CGGG	2	8	20811	20818	0 %	0 %	75 %	25 %	148271195
40	NC_009480	CGAC	2	8	21054	21061	25 %	0 %	25 %	50 %	148271195
41	NC_009480	CCGC	2	8	21547	21554	0 %	0 %	25 %	75 %	148271196
42	NC_009480	ACGA	2	8	21637	21644	50 %	0 %	25 %	25 %	148271196
43	NC_009480	GCCA	2	8	22597	22604	25 %	0 %	25 %	50 %	148271196
44	NC_009480	CGAG	2	8	22893	22900	25 %	0 %	50 %	25 %	148271197
45	NC_009480	ACGC	2	8	23090	23097	25 %	0 %	25 %	50 %	148271197
46	NC_009480	CCAG	2	8	23133	23140	25 %	0 %	25 %	50 %	148271197
47	NC_009480	GCCC	2	8	23988	23995	0 %	0 %	25 %	75 %	148271197
48	NC_009480	CTCG	2	8	24308	24315	0 %	25 %	25 %	50 %	148271198
49	NC_009480	GGCG	2	8	24391	24398	0 %	0 %	75 %	25 %	148271198
50	NC_009480	CGGG	2	8	24816	24823	0 %	0 %	75 %	25 %	148271199
51	NC_009480	CTCC	2	8	26232	26239	0 %	25 %	0 %	75 %	148271200
52	NC_009480	CCGT	2	8	26308	26315	0 %	25 %	25 %	50 %	148271200
53	NC_009480	CCTG	2	8	26509	26516	0 %	25 %	25 %	50 %	148271200
54	NC_009480	GCTG	2	8	27578	27585	0 %	25 %	50 %	25 %	148271200
55	NC_009480	CGGC	3	12	27763	27774	0 %	0 %	50 %	50 %	148271200
56	NC_009480	GCGG	2	8	27996	28003	0 %	0 %	75 %	25 %	148271200
57	NC_009480	CGGG	2	8	28047	28054	0 %	0 %	75 %	25 %	148271200
58	NC_009480	CGCT	2	8	28593	28600	0 %	25 %	25 %	50 %	148271201
59	NC_009480	GTCC	2	8	29157	29164	0 %	25 %	25 %	50 %	148271202
60	NC_009480	GCGG	2	8	29557	29564	0 %	0 %	75 %	25 %	148271202
61	NC_009480	GCGG	2	8	29840	29847	0 %	0 %	75 %	25 %	148271202
62	NC_009480	GCGA	2	8	29867	29874	25 %	0 %	50 %	25 %	148271202
63	NC_009480	GCCC	2	8	30164	30171	0 %	0 %	25 %	75 %	148271204
64	NC_009480	CGTC	2	8	30680	30687	0 %	25 %	25 %	50 %	148271204
65	NC_009480	GGGC	2	8	30848	30855	0 %	0 %	75 %	25 %	148271204
66	NC_009480	TCGC	2	8	30978	30985	0 %	25 %	25 %	50 %	148271204
67	NC_009480	CGGC	2	8	31116	31123	0 %	0 %	50 %	50 %	148271204
68	NC_009480	GGCG	2	8	31132	31139	0 %	0 %	75 %	25 %	148271204
69	NC_009480	CGGG	2	8	31142	31149	0 %	0 %	75 %	25 %	148271204
70	NC_009480	CGCC	2	8	31752	31759	0 %	0 %	25 %	75 %	148271205
71	NC_009480	GCCG	2	8	32497	32504	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
72	NC_009480	CGGC	2	8	32570	32577	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
73	NC_009480	GGCG	2	8	32611	32618	0 %	0 %	75 %	25 %	148271205
74	NC_009480	CGGC	2	8	32633	32640	0 %	0 %	50 %	50 %	148271205
75	NC_009480	CACG	2	8	33043	33050	25 %	0 %	25 %	50 %	148271205
76	NC_009480	TCCT	2	8	33214	33221	0 %	50 %	0 %	50 %	148271206
77	NC_009480	TCGC	2	8	33821	33828	0 %	25 %	25 %	50 %	148271207
78	NC_009480	CGCA	2	8	33857	33864	25 %	0 %	25 %	50 %	148271207
79	NC_009480	TCCA	2	8	33893	33900	25 %	25 %	0 %	50 %	148271207
80	NC_009480	GCCG	2	8	34139	34146	0 %	0 %	50 %	50 %	148271207
81	NC_009480	CCGG	2	8	34440	34447	0 %	0 %	50 %	50 %	148271207
82	NC_009480	CGGG	2	8	34632	34639	0 %	0 %	75 %	25 %	148271207
83	NC_009480	CGGC	2	8	34955	34962	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
84	NC_009480	GGCG	2	8	34988	34995	0 %	0 %	75 %	25 %	148271208
85	NC_009480	GCCC	2	8	35488	35495	0 %	0 %	25 %	75 %	148271208
86	NC_009480	CCCA	2	8	35855	35862	25 %	0 %	0 %	75 %	148271209
87	NC_009480	GCCG	2	8	36348	36355	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
88	NC_009480	GCCG	2	8	36463	36470	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
89	NC_009480	CTCG	2	8	36760	36767	0 %	25 %	25 %	50 %	148271210
90	NC_009480	CTCG	2	8	37039	37046	0 %	25 %	25 %	50 %	148271210
91	NC_009480	CCCG	2	8	37584	37591	0 %	0 %	25 %	75 %	148271211
92	NC_009480	CGCC	2	8	40562	40569	0 %	0 %	25 %	75 %	148271212
93	NC_009480	TCGC	2	8	40828	40835	0 %	25 %	25 %	50 %	148271212
94	NC_009480	CACG	2	8	41093	41100	25 %	0 %	25 %	50 %	148271213
95	NC_009480	CGGC	2	8	41108	41115	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
96	NC_009480	CGGC	2	8	41125	41132	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
97	NC_009480	CGGG	2	8	41569	41576	0 %	0 %	75 %	25 %	148271213
98	NC_009480	CAGC	2	8	41693	41700	25 %	0 %	25 %	50 %	148271213
99	NC_009480	CCAT	2	8	42276	42283	25 %	25 %	0 %	50 %	148271214
100	NC_009480	CCCG	2	8	43196	43203	0 %	0 %	25 %	75 %	148271214
101	NC_009480	CGTC	2	8	45586	45593	0 %	25 %	25 %	50 %	148271215
102	NC_009480	GCGG	2	8	48960	48967	0 %	0 %	75 %	25 %	148271217
103	NC_009480	CGGC	2	8	52053	52060	0 %	0 %	50 %	50 %	148271220
104	NC_009480	GGGT	2	8	52268	52275	0 %	25 %	75 %	0 %	148271220
105	NC_009480	GCTC	2	8	53048	53055	0 %	25 %	25 %	50 %	148271221
106	NC_009480	GATG	2	8	53217	53224	25 %	25 %	50 %	0 %	148271221
107	NC_009480	GCCC	2	8	54494	54501	0 %	0 %	25 %	75 %	148271222
108	NC_009480	GACC	2	8	57124	57131	25 %	0 %	25 %	50 %	148271223
109	NC_009480	GGCG	2	8	61950	61957	0 %	0 %	75 %	25 %	148271224
110	NC_009480	GTTC	2	8	62373	62380	0 %	50 %	25 %	25 %	148271224
111	NC_009480	CCGG	2	8	63552	63559	0 %	0 %	50 %	50 %	148271225
112	NC_009480	CGGC	2	8	63648	63655	0 %	0 %	50 %	50 %	148271225
113	NC_009480	GTCC	2	8	63680	63687	0 %	25 %	25 %	50 %	148271225
114	NC_009480	ACGG	2	8	64915	64922	25 %	0 %	50 %	25 %	148271226
115	NC_009480	CCGG	2	8	64981	64988	0 %	0 %	50 %	50 %	148271226
116	NC_009480	GCGT	2	8	66040	66047	0 %	25 %	50 %	25 %	148271227
117	NC_009480	ACGC	2	8	67297	67304	25 %	0 %	25 %	50 %	148271227
118	NC_009480	CGGC	2	8	68432	68439	0 %	0 %	50 %	50 %	148271228
119	NC_009480	GGGT	2	8	68647	68654	0 %	25 %	75 %	0 %	148271228
120	NC_009480	GATG	2	8	69594	69601	25 %	25 %	50 %	0 %	148271229
121	NC_009480	CGCC	2	8	69845	69852	0 %	0 %	25 %	75 %	148271229
122	NC_009480	GGAG	2	8	69865	69872	25 %	0 %	75 %	0 %	148271229
123	NC_009480	TTCA	2	8	71085	71092	25 %	50 %	0 %	25 %	148271230
124	NC_009480	TTAA	2	8	71266	71273	50 %	50 %	0 %	0 %	148271230
125	NC_009480	GCAG	2	8	74904	74911	25 %	0 %	50 %	25 %	148271231
126	NC_009480	CGTT	2	8	76535	76542	0 %	50 %	25 %	25 %	148271232
127	NC_009480	GGCC	2	8	76941	76948	0 %	0 %	50 %	50 %	148271232
128	NC_009480	TCCC	2	8	77362	77369	0 %	25 %	0 %	75 %	148271232
129	NC_009480	CGAC	2	8	77684	77691	25 %	0 %	25 %	50 %	148271233
130	NC_009480	TCCG	2	8	77717	77724	0 %	25 %	25 %	50 %	148271233
131	NC_009480	GGCC	2	8	77950	77957	0 %	0 %	50 %	50 %	148271233
132	NC_009480	CGGC	2	8	77969	77976	0 %	0 %	50 %	50 %	148271233
133	NC_009480	TGCG	2	8	80871	80878	0 %	25 %	50 %	25 %	148271235
134	NC_009480	TCGC	2	8	82507	82514	0 %	25 %	25 %	50 %	148271236
135	NC_009480	GCCT	2	8	83546	83553	0 %	25 %	25 %	50 %	148271237
136	NC_009480	CGGC	2	8	85244	85251	0 %	0 %	50 %	50 %	148271238
137	NC_009480	GCCG	2	8	86154	86161	0 %	0 %	50 %	50 %	148271239
138	NC_009480	GGCT	2	8	86308	86315	0 %	25 %	50 %	25 %	148271239
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