MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 75162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	CGC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271179
2	NC_009480	TCA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
3	NC_009480	TGG	2	6	104	109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271179
4	NC_009480	AGC	2	6	179	184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
5	NC_009480	GCC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271179
6	NC_009480	AGC	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
7	NC_009480	CGG	2	6	435	440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271179
8	NC_009480	CTG	2	6	547	552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271179
9	NC_009480	GGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271179
10	NC_009480	TCA	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
11	NC_009480	AAC	2	6	652	657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
12	NC_009480	CTG	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271179
13	NC_009480	CGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
14	NC_009480	TCC	2	6	722	727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271179
15	NC_009480	AGG	2	6	746	751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271179
16	NC_009480	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271179
17	NC_009480	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
18	NC_009480	GTC	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271179
19	NC_009480	GCC	2	6	816	821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271179
20	NC_009480	TCA	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
21	NC_009480	TCC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271179
22	NC_009480	GAA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271179
23	NC_009480	GAC	2	6	961	966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
24	NC_009480	CCA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271179
25	NC_009480	CAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
26	NC_009480	CAT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
27	NC_009480	CGA	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
28	NC_009480	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
29	NC_009480	ACC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271179
30	NC_009480	GCA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009480	ACC	2	6	1494	1499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009480	ACG	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009480	TCC	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009480	CCG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009480	CCG	2	6	1668	1673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009480	CGT	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009480	CGC	2	6	1721	1726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009480	CCG	2	6	1734	1739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009480	GTC	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
40	NC_009480	GAG	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271180
41	NC_009480	GCC	2	6	2189	2194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
42	NC_009480	CAC	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271180
43	NC_009480	GCT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
44	NC_009480	GAG	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271180
45	NC_009480	CCT	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271180
46	NC_009480	CGC	2	6	2373	2378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
47	NC_009480	GAC	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271180
48	NC_009480	TCA	2	6	2429	2434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271180
49	NC_009480	CGG	2	6	2523	2528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271180
50	NC_009480	CGA	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271180
51	NC_009480	GCT	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
52	NC_009480	CCG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
53	NC_009480	TCA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271180
54	NC_009480	CGC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
55	NC_009480	GGC	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271180
56	NC_009480	CCT	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271180
57	NC_009480	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271180
58	NC_009480	CTG	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
59	NC_009480	CAA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271180
60	NC_009480	TCC	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271180
61	NC_009480	CTG	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
62	NC_009480	CTG	3	9	3115	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
63	NC_009480	TCG	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
64	NC_009480	CGA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271181
65	NC_009480	CGC	3	9	3281	3289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271181
66	NC_009480	CGT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
67	NC_009480	CGG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
68	NC_009480	CGA	2	6	3419	3424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271181
69	NC_009480	TCG	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
70	NC_009480	GCG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
71	NC_009480	CGG	2	6	3527	3532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
72	NC_009480	GAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
73	NC_009480	ATG	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271181
74	NC_009480	CTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271181
75	NC_009480	CAT	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271181
76	NC_009480	GTC	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
77	NC_009480	GCT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
78	NC_009480	AGG	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
79	NC_009480	GAG	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
80	NC_009480	TCC	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271181
81	NC_009480	AGG	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
82	NC_009480	CGG	2	6	4007	4012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
83	NC_009480	AGA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271181
84	NC_009480	ACC	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271181
85	NC_009480	GAT	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271182
86	NC_009480	TGG	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271182
87	NC_009480	CCG	2	6	4244	4249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271182
88	NC_009480	CTG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
89	NC_009480	GGA	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271182
90	NC_009480	GCT	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
91	NC_009480	GCT	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
92	NC_009480	TGC	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
93	NC_009480	CGC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271182
94	NC_009480	AGC	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
95	NC_009480	CTG	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
96	NC_009480	ATC	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271182
97	NC_009480	GAC	2	6	4744	4749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
98	NC_009480	GAC	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
99	NC_009480	CGG	2	6	4791	4796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
100	NC_009480	CGA	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
101	NC_009480	GCT	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
102	NC_009480	CGA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
103	NC_009480	GGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
104	NC_009480	GCG	2	6	5251	5256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
105	NC_009480	CGG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271183
106	NC_009480	CCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271183
107	NC_009480	GAC	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271183
108	NC_009480	GAG	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271183
109	NC_009480	TCG	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271183
110	NC_009480	CCT	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271183
111	NC_009480	ACG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271183
112	NC_009480	CTA	2	6	5834	5839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009480	GAC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009480	ATC	2	6	5889	5894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009480	CCG	2	6	5912	5917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009480	CCA	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009480	CGA	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
118	NC_009480	CGA	2	6	6002	6007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
119	NC_009480	GAG	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271184
120	NC_009480	CAG	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
121	NC_009480	CAC	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271184
122	NC_009480	TCG	2	6	6184	6189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
123	NC_009480	CGA	2	6	6200	6205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
124	NC_009480	CGG	2	6	6254	6259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271184
125	NC_009480	CGT	2	6	6266	6271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
126	NC_009480	CGA	2	6	6272	6277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
127	NC_009480	CGG	2	6	6356	6361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271184
128	NC_009480	CGG	4	12	6368	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271184
129	NC_009480	CGG	2	6	6392	6397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271184
130	NC_009480	CGT	2	6	6419	6424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
131	NC_009480	CCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271184
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250	NC_009480	AGG	2	6	10983	10988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271186
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253	NC_009480	GCT	2	6	11110	11115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271186
254	NC_009480	GCG	2	6	11142	11147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271186
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257	NC_009480	AGG	2	6	11419	11424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009480	CGT	2	6	11461	11466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_009480	CGA	2	6	11530	11535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_009480	ACG	2	6	11562	11567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009480	TCG	2	6	11599	11604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_009480	GCC	2	6	21951	21956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271196

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