MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	G	6	6	13918	13923	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009480	G	6	6	17219	17224	0 %	0 %	100 %	0 %	148271193
3	NC_009480	C	6	6	25693	25698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_009480	G	6	6	26421	26426	0 %	0 %	100 %	0 %	148271200
5	NC_009480	C	6	6	34695	34700	0 %	0 %	0 %	100 %	148271208
6	NC_009480	A	6	6	39643	39648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009480	C	6	6	43311	43316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_009480	G	6	6	44543	44548	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009480	C	6	6	46445	46450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_009480	C	6	6	46857	46862	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_009480	G	6	6	51304	51309	0 %	0 %	100 %	0 %	148271219
12	NC_009480	G	7	7	56572	56578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009480	C	7	7	56807	56813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_009480	T	6	6	58842	58847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009480	G	6	6	59613	59618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009480	C	6	6	62082	62087	0 %	0 %	0 %	100 %	148271224
17	NC_009480	C	6	6	62279	62284	0 %	0 %	0 %	100 %	148271224
18	NC_009480	C	6	6	65037	65042	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_009480	G	6	6	70231	70236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009480	G	6	6	71316	71321	0 %	0 %	100 %	0 %	148271230
21	NC_009480	T	7	7	71452	71458	0 %	100 %	0 %	0 %	148271230
22	NC_009480	A	6	6	73355	73360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009480	C	6	6	79815	79820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_009480	G	6	6	85692	85697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009480	G	6	6	86594	86599	0 %	0 %	100 %	0 %	148271239
26	NC_009480	T	6	6	87097	87102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009480	A	7	7	87308	87314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009480	C	6	6	88976	88981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_009480	C	6	6	88992	88997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_009480	A	6	6	89827	89832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009480	C	8	8	90606	90613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_009480	C	6	6	93540	93545	0 %	0 %	0 %	100 %	148271242
33	NC_009480	A	6	6	93652	93657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009480	C	6	6	94050	94055	0 %	0 %	0 %	100 %	148271243
35	NC_009480	C	6	6	101242	101247	0 %	0 %	0 %	100 %	148271248
36	NC_009480	G	6	6	103719	103724	0 %	0 %	100 %	0 %	148271249
37	NC_009480	C	6	6	107240	107245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_009480	C	6	6	115099	115104	0 %	0 %	0 %	100 %	148271254
39	NC_009480	G	6	6	131993	131998	0 %	0 %	100 %	0 %	148271267
40	NC_009480	G	6	6	132145	132150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009480	G	6	6	133887	133892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009480	G	6	6	145797	145802	0 %	0 %	100 %	0 %	148271277
43	NC_009480	C	6	6	152841	152846	0 %	0 %	0 %	100 %	148271281
44	NC_009480	C	6	6	156593	156598	0 %	0 %	0 %	100 %	148271283
45	NC_009480	G	7	7	161654	161660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009480	G	6	6	163689	163694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009480	C	6	6	185691	185696	0 %	0 %	0 %	100 %	148271303
48	NC_009480	C	6	6	186284	186289	0 %	0 %	0 %	100 %	148271303
49	NC_009480	C	6	6	188933	188938	0 %	0 %	0 %	100 %	148271307
50	NC_009480	C	6	6	191478	191483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_009480	T	7	7	194398	194404	0 %	100 %	0 %	0 %	148271313
52	NC_009480	G	6	6	196040	196045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009480	C	6	6	196094	196099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_009480	C	6	6	199534	199539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55	NC_009480	G	6	6	199545	199550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009480	C	6	6	199712	199717	0 %	0 %	0 %	100 %	148271319
57	NC_009480	C	6	6	200345	200350	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_009480	C	7	7	203387	203393	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_009480	C	6	6	210950	210955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_009480	C	6	6	211053	211058	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_009480	C	6	6	212422	212427	0 %	0 %	0 %	100 %	148271329
62	NC_009480	C	6	6	218562	218567	0 %	0 %	0 %	100 %	148271337
63	NC_009480	G	6	6	218794	218799	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009480	G	6	6	218843	218848	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009480	G	6	6	219476	219481	0 %	0 %	100 %	0 %	148271338
66	NC_009480	C	6	6	223372	223377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_009480	C	6	6	223470	223475	0 %	0 %	0 %	100 %	148271342
68	NC_009480	G	6	6	245235	245240	0 %	0 %	100 %	0 %	148271360
69	NC_009480	C	6	6	253333	253338	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_009480	G	6	6	269092	269097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009480	G	6	6	272006	272011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009480	C	6	6	279165	279170	0 %	0 %	0 %	100 %	148271397
73	NC_009480	G	6	6	289411	289416	0 %	0 %	100 %	0 %	148271408
74	NC_009480	G	6	6	295078	295083	0 %	0 %	100 %	0 %	148271413
75	NC_009480	G	6	6	298660	298665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009480	C	6	6	299414	299419	0 %	0 %	0 %	100 %	148271417
77	NC_009480	C	6	6	303608	303613	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_009480	C	6	6	315118	315123	0 %	0 %	0 %	100 %	148271430
79	NC_009480	G	6	6	326693	326698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009480	C	6	6	345588	345593	0 %	0 %	0 %	100 %	148271462
81	NC_009480	G	6	6	350020	350025	0 %	0 %	100 %	0 %	148271468
82	NC_009480	C	10	10	355915	355924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_009480	G	6	6	372222	372227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009480	G	6	6	378053	378058	0 %	0 %	100 %	0 %	148271496
85	NC_009480	G	6	6	388406	388411	0 %	0 %	100 %	0 %	148271504
86	NC_009480	C	6	6	391531	391536	0 %	0 %	0 %	100 %	148271507
87	NC_009480	G	6	6	418889	418894	0 %	0 %	100 %	0 %	148271523
88	NC_009480	C	6	6	431728	431733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_009480	G	6	6	437657	437662	0 %	0 %	100 %	0 %	148271538
90	NC_009480	G	6	6	466210	466215	0 %	0 %	100 %	0 %	148271564
91	NC_009480	C	6	6	466738	466743	0 %	0 %	0 %	100 %	148271565
92	NC_009480	C	6	6	468231	468236	0 %	0 %	0 %	100 %	148271566
93	NC_009480	C	6	6	478759	478764	0 %	0 %	0 %	100 %	148271579
94	NC_009480	C	6	6	480111	480116	0 %	0 %	0 %	100 %	148271581
95	NC_009480	C	6	6	490868	490873	0 %	0 %	0 %	100 %	148271593
96	NC_009480	G	6	6	494917	494922	0 %	0 %	100 %	0 %	148271598
97	NC_009480	G	6	6	504389	504394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009480	G	6	6	525286	525291	0 %	0 %	100 %	0 %	148271623
99	NC_009480	C	6	6	534367	534372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_009480	G	6	6	544966	544971	0 %	0 %	100 %	0 %	148271647
101	NC_009480	G	6	6	546758	546763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009480	C	6	6	548734	548739	0 %	0 %	0 %	100 %	148271651
103	NC_009480	C	6	6	548843	548848	0 %	0 %	0 %	100 %	148271651
104	NC_009480	C	6	6	548925	548930	0 %	0 %	0 %	100 %	148271651
105	NC_009480	C	6	6	548997	549002	0 %	0 %	0 %	100 %	148271651
106	NC_009480	C	6	6	561423	561428	0 %	0 %	0 %	100 %	148271661
107	NC_009480	G	6	6	588475	588480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009480	G	6	6	594647	594652	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009480	G	6	6	603787	603792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009480	G	6	6	603900	603905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009480	C	6	6	603980	603985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_009480	G	6	6	609837	609842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009480	G	6	6	616965	616970	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009480	G	6	6	617680	617685	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009480	G	6	6	623388	623393	0 %	0 %	100 %	0 %	148271716
116	NC_009480	C	11	11	623821	623831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_009480	G	6	6	645532	645537	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009480	G	6	6	657944	657949	0 %	0 %	100 %	0 %	148271754
119	NC_009480	C	6	6	672910	672915	0 %	0 %	0 %	100 %	148271773
120	NC_009480	C	6	6	673688	673693	0 %	0 %	0 %	100 %	148271774
121	NC_009480	C	6	6	686790	686795	0 %	0 %	0 %	100 %	148271788
122	NC_009480	G	6	6	708434	708439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009480	C	7	7	708800	708806	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_009480	C	6	6	709596	709601	0 %	0 %	0 %	100 %	148271806
125	NC_009480	G	8	8	716400	716407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009480	C	6	6	719782	719787	0 %	0 %	0 %	100 %	148271810
127	NC_009480	C	6	6	725953	725958	0 %	0 %	0 %	100 %	148271817
128	NC_009480	G	6	6	726427	726432	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009480	G	6	6	742610	742615	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009480	T	6	6	747131	747136	0 %	100 %	0 %	0 %	148271840
131	NC_009480	T	6	6	747920	747925	0 %	100 %	0 %	0 %	148271840
132	NC_009480	C	6	6	759740	759745	0 %	0 %	0 %	100 %	148271851
133	NC_009480	G	6	6	761887	761892	0 %	0 %	100 %	0 %	148271853
134	NC_009480	G	6	6	773498	773503	0 %	0 %	100 %	0 %	148271860
135	NC_009480	G	6	6	783765	783770	0 %	0 %	100 %	0 %	148271872
136	NC_009480	C	6	6	797756	797761	0 %	0 %	0 %	100 %	148271888
137	NC_009480	C	6	6	799561	799566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
138	NC_009480	G	6	6	800990	800995	0 %	0 %	100 %	0 %	148271892
139	NC_009480	G	6	6	810974	810979	0 %	0 %	100 %	0 %	148271900
140	NC_009480	G	7	7	811523	811529	0 %	0 %	100 %	0 %	148271900
141	NC_009480	G	6	6	818557	818562	0 %	0 %	100 %	0 %	148271905
142	NC_009480	T	6	6	830849	830854	0 %	100 %	0 %	0 %	148271917
143	NC_009480	C	6	6	849472	849477	0 %	0 %	0 %	100 %	148271934
144	NC_009480	C	6	6	849812	849817	0 %	0 %	0 %	100 %	148271935
145	NC_009480	C	6	6	859347	859352	0 %	0 %	0 %	100 %	148271943
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.