MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	CAC	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009479	GCC	2	6	1591	1596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009479	GCC	2	6	2025	2030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009479	CCG	2	6	2035	2040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009479	GCC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009479	GTC	2	6	2050	2055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009479	GGT	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009479	GGC	2	6	2115	2120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009479	GCC	2	6	2258	2263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009479	CTC	2	6	2266	2271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009479	GAG	3	9	2400	2408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009479	CGA	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009479	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009479	CGA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009479	GCA	2	6	3478	3483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009479	ACA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009479	TGT	2	6	3787	3792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009479	ACG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009479	TCT	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009479	ATC	2	6	4056	4061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009479	GCC	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009479	GGA	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009479	TAC	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009479	CGC	2	6	4106	4111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009479	CGA	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009479	GAG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009479	GGA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009479	CGA	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009479	ACG	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009479	CGG	2	6	4288	4293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009479	CAC	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009479	GTC	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009479	CTA	2	6	6076	6081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009479	CGT	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009479	CGT	2	6	7109	7114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009479	CGA	3	9	7146	7154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009479	CGG	2	6	7184	7189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009479	GGC	2	6	7248	7253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009479	GGC	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009479	CGT	2	6	8222	8227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009479	CGC	2	6	8230	8235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009479	TCG	2	6	13830	13835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009479	CGT	2	6	14314	14319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009479	GGC	2	6	14331	14336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009479	TCG	2	6	14340	14345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009479	GGT	2	6	16048	16053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009479	GTC	2	6	16064	16069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009479	TCG	2	6	16071	16076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009479	GCC	3	9	16081	16089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_009479	CGA	2	6	16180	16185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009479	TCG	2	6	16191	16196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009479	CCT	2	6	16211	16216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009479	CAC	2	6	16286	16291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009479	CGA	2	6	16309	16314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009479	CCA	2	6	16339	16344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009479	GAG	2	6	16378	16383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009479	CTG	2	6	16434	16439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009479	GAC	2	6	16462	16467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009479	CAG	2	6	16489	16494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009479	CAC	2	6	16510	16515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009479	GAG	2	6	16519	16524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009479	CCG	2	6	16561	16566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009479	GTC	2	6	16599	16604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009479	GGT	2	6	16636	16641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009479	ACA	2	6	25651	25656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009479	GTG	2	6	27755	27760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009479	ACC	2	6	27809	27814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009479	TTC	2	6	27817	27822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009479	CAT	2	6	27837	27842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009479	GAA	2	6	27873	27878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009479	GAT	2	6	27952	27957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009479	TGG	2	6	28062	28067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009479	GCG	4	12	28231	28242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009479	ACA	2	6	29009	29014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009479	CCA	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009479	GGC	2	6	29082	29087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009479	CGA	2	6	29131	29136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009479	GCG	2	6	29188	29193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009479	CCA	2	6	29660	29665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009479	ACG	2	6	31667	31672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009479	GTT	2	6	31677	31682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009479	CAA	2	6	31688	31693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009479	CTG	2	6	31813	31818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009479	CAG	2	6	31837	31842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009479	CCG	2	6	32732	32737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009479	GGC	2	6	32750	32755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009479	CGA	2	6	32769	32774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009479	CGA	2	6	32837	32842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009479	GGC	3	9	32989	32997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009479	CGT	2	6	33009	33014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009479	GAC	2	6	33193	33198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009479	GCG	2	6	33231	33236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009479	CCG	2	6	33249	33254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009479	CGA	2	6	33261	33266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009479	GGC	2	6	33271	33276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009479	AGC	2	6	33282	33287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009479	GGT	2	6	33684	33689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009479	TCG	2	6	33695	33700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009479	AAC	2	6	33771	33776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009479	GCC	3	9	33876	33884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009479	GGC	3	9	33927	33935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009479	GGC	2	6	33951	33956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009479	CTT	2	6	37420	37425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009479	GTG	2	6	37457	37462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009479	CGT	2	6	37760	37765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009479	GTG	2	6	37791	37796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009479	GGC	2	6	37863	37868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009479	ACG	2	6	37880	37885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009479	CGT	2	6	38017	38022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009479	CGG	2	6	38037	38042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009479	CGC	2	6	38076	38081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009479	TCG	2	6	38117	38122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009479	CGT	2	6	38142	38147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009479	CCG	2	6	38210	38215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009479	GAG	2	6	38266	38271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009479	GTC	2	6	38284	38289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009479	CTC	2	6	38308	38313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009479	GCC	2	6	38317	38322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009479	CGC	2	6	38340	38345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009479	TCG	2	6	38363	38368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009479	CTC	2	6	38377	38382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009479	GGC	2	6	38419	38424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009479	CGC	2	6	38430	38435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009479	CGG	2	6	38460	38465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009479	CGT	2	6	38469	38474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009479	GTG	2	6	38512	38517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009479	GCT	2	6	38550	38555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009479	TGC	2	6	38561	38566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009479	TCG	2	6	38695	38700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009479	CGG	2	6	38711	38716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009479	CGG	2	6	38729	38734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009479	GCC	2	6	38823	38828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009479	GCC	2	6	38838	38843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009479	CCA	2	6	38884	38889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009479	CTC	2	6	38892	38897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009479	CGC	2	6	38918	38923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009479	ACG	2	6	38935	38940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009479	GGC	2	6	38951	38956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009479	TCG	2	6	38986	38991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009479	CCG	2	6	39017	39022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.