MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	ACC	2	6	19	24	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271111
2	NC_009479	TCA	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
3	NC_009479	GAG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271111
4	NC_009479	CGC	2	6	160	165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
5	NC_009479	CGC	2	6	213	218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
6	NC_009479	CAT	2	6	252	257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
7	NC_009479	CGA	2	6	264	269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
8	NC_009479	CCG	2	6	275	280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
9	NC_009479	GCA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
10	NC_009479	TCG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271111
11	NC_009479	AGC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
12	NC_009479	GCG	3	9	382	390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271111
13	NC_009479	ACC	2	6	430	435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271111
14	NC_009479	GCC	2	6	502	507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
15	NC_009479	TCG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271111
16	NC_009479	CGA	4	12	522	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
17	NC_009479	TCA	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
18	NC_009479	CGA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
19	NC_009479	CCG	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
20	NC_009479	GGC	2	6	639	644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271111
21	NC_009479	TCG	2	6	677	682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271111
22	NC_009479	CCG	2	6	734	739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
23	NC_009479	GAG	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271111
24	NC_009479	ACT	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
25	NC_009479	CTA	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271111
26	NC_009479	CCG	2	6	867	872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
27	NC_009479	CGA	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
28	NC_009479	CAA	3	9	957	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271111
29	NC_009479	CCG	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
30	NC_009479	GAA	2	6	1035	1040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271111
31	NC_009479	CAC	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271111
32	NC_009479	AGG	2	6	1103	1108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271111
33	NC_009479	TTC	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271111
34	NC_009479	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
35	NC_009479	CGC	2	6	1182	1187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
36	NC_009479	GCA	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
37	NC_009479	CGG	2	6	1233	1238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271111
38	NC_009479	CGC	2	6	1311	1316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
39	NC_009479	AGC	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
40	NC_009479	CGA	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
41	NC_009479	GAC	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271111
42	NC_009479	GCC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
43	NC_009479	CCG	2	6	1499	1504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271111
44	NC_009479	GAA	2	6	1791	1796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271112
45	NC_009479	ACG	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271112
46	NC_009479	CGC	2	6	1841	1846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271112
47	NC_009479	CAC	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271112
48	NC_009479	CTC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271112
49	NC_009479	CGA	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271112
50	NC_009479	CCG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
51	NC_009479	CCA	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271113
52	NC_009479	CTG	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
53	NC_009479	TCA	2	6	2620	2625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271113
54	NC_009479	GCA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
55	NC_009479	GCC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
56	NC_009479	AGA	3	9	2734	2742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271113
57	NC_009479	GAG	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271113
58	NC_009479	GAG	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271113
59	NC_009479	GGA	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271113
60	NC_009479	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271113
61	NC_009479	CGT	3	9	2999	3007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
62	NC_009479	GTC	2	6	3066	3071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
63	NC_009479	CGA	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
64	NC_009479	CGT	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
65	NC_009479	GTC	2	6	3231	3236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271113
66	NC_009479	CCG	2	6	3244	3249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
67	NC_009479	CGC	3	9	3260	3268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
68	NC_009479	CGC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271113
69	NC_009479	GAC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
70	NC_009479	ACG	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271113
71	NC_009479	ACC	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271114
72	NC_009479	CGA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271114
73	NC_009479	CGT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271114
74	NC_009479	TCT	2	6	3939	3944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271114
75	NC_009479	CGC	2	6	4439	4444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271115
76	NC_009479	GAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271115
77	NC_009479	CCG	2	6	4497	4502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271115
78	NC_009479	TGG	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271115
79	NC_009479	GCG	2	6	4591	4596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271115
80	NC_009479	GCA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271115
81	NC_009479	TCG	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271115
82	NC_009479	CTT	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271115
83	NC_009479	GGA	3	9	4789	4797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271116
84	NC_009479	GCG	2	6	4845	4850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271116
85	NC_009479	CGC	3	9	4885	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271116
86	NC_009479	TGA	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271116
87	NC_009479	CGT	2	6	5017	5022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271116
88	NC_009479	CGG	2	6	5047	5052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271116
89	NC_009479	CCG	2	6	5082	5087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271116
90	NC_009479	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271116
91	NC_009479	TGG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271116
92	NC_009479	CCG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271116
93	NC_009479	CCT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271117
94	NC_009479	GCT	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271117
95	NC_009479	TGG	3	9	5300	5308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271117
96	NC_009479	TAC	2	6	5332	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271117
97	NC_009479	CGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
98	NC_009479	GAC	2	6	5376	5381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
99	NC_009479	AGC	2	6	5385	5390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
100	NC_009479	CGG	2	6	5402	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271117
101	NC_009479	TCG	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271117
102	NC_009479	CGT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271117
103	NC_009479	ACG	2	6	5603	5608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
104	NC_009479	CGG	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271117
105	NC_009479	GCA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
106	NC_009479	ACC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271117
107	NC_009479	GCA	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
108	NC_009479	AGC	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
109	NC_009479	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271117
110	NC_009479	CGA	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
111	NC_009479	GCC	2	6	5914	5919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271117
112	NC_009479	CGA	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271117
113	NC_009479	ACC	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271117
114	NC_009479	CAC	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271117
115	NC_009479	CAT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271118
116	NC_009479	ACG	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271118
117	NC_009479	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271118
118	NC_009479	GCC	2	6	6275	6280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271118
119	NC_009479	TCG	3	9	6295	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271118
120	NC_009479	ACG	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271118
121	NC_009479	TGC	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271118
122	NC_009479	GTC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271118
123	NC_009479	CGG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271118
124	NC_009479	AGC	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271118
125	NC_009479	GAC	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271118
126	NC_009479	CGT	2	6	6779	6784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271118
127	NC_009479	CGT	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271119
128	NC_009479	GAC	2	6	7322	7327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271119
129	NC_009479	GAC	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271119
130	NC_009479	GCG	2	6	7392	7397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271119
131	NC_009479	GAG	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271119
132	NC_009479	TCC	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271119
133	NC_009479	GCT	2	6	7468	7473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271119
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135	NC_009479	CCG	2	6	7605	7610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271119
136	NC_009479	CCG	2	6	7645	7650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271119
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152	NC_009479	ACT	2	6	8968	8973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271122
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156	NC_009479	CGT	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271122
157	NC_009479	TCG	2	6	9139	9144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271122
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161	NC_009479	CTA	2	6	9369	9374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271123
162	NC_009479	ACT	2	6	9425	9430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271123
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249	NC_009479	CGA	2	6	13689	13694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
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251	NC_009479	CGA	2	6	13764	13769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271123
252	NC_009479	GAT	2	6	13964	13969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271124
253	NC_009479	GTG	2	6	13976	13981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271124
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255	NC_009479	CCA	2	6	13997	14002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271124
256	NC_009479	GTC	2	6	14021	14026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271124
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