MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	CG	3	6	1665	1670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009479	GC	4	8	2119	2126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009479	CT	3	6	2319	2324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009479	GC	3	6	3621	3626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009479	TA	3	6	3800	3805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009479	CG	3	6	7133	7138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009479	CG	3	6	7198	7203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009479	CG	3	6	16262	16267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009479	GC	3	6	27942	27947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009479	CG	3	6	29240	29245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009479	AC	3	6	29293	29298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009479	AC	3	6	31761	31766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009479	CT	3	6	33074	33079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009479	TC	5	10	33144	33153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009479	CG	3	6	33787	33792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009479	GA	3	6	33920	33925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009479	AT	3	6	37581	37586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009479	TG	3	6	37734	37739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009479	GC	3	6	37990	37995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009479	CG	4	8	38237	38244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009479	GC	3	6	38357	38362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009479	CG	3	6	38484	38489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009479	GC	4	8	38861	38868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009479	GC	3	6	42360	42365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009479	GC	3	6	43889	43894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009479	CG	4	8	44263	44270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009479	GC	3	6	45964	45969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009479	GC	3	6	47479	47484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009479	GC	3	6	49266	49271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009479	CG	3	6	49282	49287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009479	GC	3	6	49561	49566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009479	CA	3	6	51057	51062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009479	GC	3	6	51223	51228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009479	GC	3	6	51389	51394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009479	CG	3	6	51618	51623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009479	GA	3	6	53186	53191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009479	CG	3	6	53426	53431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009479	TG	3	6	54314	54319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009479	CG	3	6	56214	56219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009479	CG	3	6	57676	57681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009479	CG	3	6	58036	58041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009479	GC	3	6	58450	58455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009479	GC	3	6	58727	58732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009479	TC	3	6	59649	59654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009479	GC	3	6	59656	59661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009479	CG	4	8	60193	60200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009479	GC	3	6	60504	60509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009479	GC	3	6	62574	62579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009479	GC	4	8	62751	62758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009479	CG	3	6	64545	64550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009479	CG	3	6	64563	64568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009479	CT	3	6	65983	65988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009479	AC	4	8	66975	66982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009479	AG	3	6	69977	69982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009479	AC	3	6	69984	69989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.