MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009478	GACCA	2	10	1005	1014	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_009478	GCAGC	2	10	1115	1124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009478	TAGAA	2	10	1241	1250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009478	GCCGC	2	10	1606	1615	0 %	0 %	40 %	60 %	148245185
5	NC_009478	GGAAG	2	10	2047	2056	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009478	GACGA	2	10	2527	2536	40 %	0 %	40 %	20 %	148245186
7	NC_009478	GAAGG	2	10	2868	2877	40 %	0 %	60 %	0 %	148245187
8	NC_009478	CCGAC	2	10	4920	4929	20 %	0 %	20 %	60 %	148245188
9	NC_009478	GATCG	2	10	7761	7770	20 %	20 %	40 %	20 %	148245192
10	NC_009478	CGCTG	2	10	9921	9930	0 %	20 %	40 %	40 %	148245195
11	NC_009478	CTCGC	2	10	11886	11895	0 %	20 %	20 %	60 %	148245196
12	NC_009478	CGCTC	2	10	13341	13350	0 %	20 %	20 %	60 %	148245197
13	NC_009478	CTCCG	2	10	14015	14024	0 %	20 %	20 %	60 %	148245197
14	NC_009478	GGTCG	2	10	14220	14229	0 %	20 %	60 %	20 %	148245198
15	NC_009478	TGGTG	2	10	15786	15795	0 %	40 %	60 %	0 %	148245200
16	NC_009478	CCGCG	2	10	16884	16893	0 %	0 %	40 %	60 %	148245201
17	NC_009478	CGTGC	2	10	16992	17001	0 %	20 %	40 %	40 %	148245202
18	NC_009478	CGGGT	2	10	18886	18895	0 %	20 %	60 %	20 %	148245203
19	NC_009478	GCCCA	2	10	19259	19268	20 %	0 %	20 %	60 %	148245203
20	NC_009478	GTTCC	2	10	26237	26246	0 %	40 %	20 %	40 %	148245211
21	NC_009478	CGACG	2	10	26532	26541	20 %	0 %	40 %	40 %	148245211

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.