MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM1

Total Repeats: 490

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009478	CGG	2	6	122	127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009478	CCG	2	6	128	133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009478	GCC	2	6	134	139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009478	CGG	2	6	228	233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009478	GGT	2	6	237	242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009478	GAC	2	6	294	299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009478	TCG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009478	GCC	2	6	343	348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009478	GCA	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009478	GGC	2	6	556	561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009478	GTG	2	6	625	630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009478	CGC	2	6	778	783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009478	CGG	2	6	853	858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009478	CGA	2	6	863	868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009478	CCG	2	6	957	962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009478	CGA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245184
17	NC_009478	AGG	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245184
18	NC_009478	TGA	2	6	1460	1465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245184
19	NC_009478	ACG	2	6	1478	1483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245185
20	NC_009478	TGG	2	6	1507	1512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245185
21	NC_009478	GAG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245185
22	NC_009478	CAT	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245185
23	NC_009478	CGC	2	6	1725	1730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245185
24	NC_009478	AGC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245185
25	NC_009478	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245185
26	NC_009478	GAC	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009478	TCG	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245186
28	NC_009478	GCA	2	6	2079	2084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
29	NC_009478	ACC	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245186
30	NC_009478	CGA	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
31	NC_009478	GCA	2	6	2287	2292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
32	NC_009478	ATC	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245186
33	NC_009478	CTG	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245186
34	NC_009478	GCA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
35	NC_009478	CGA	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245186
36	NC_009478	CGT	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245186
37	NC_009478	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245186
38	NC_009478	TCC	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245186
39	NC_009478	CAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245187
40	NC_009478	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245187
41	NC_009478	CTG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245187
42	NC_009478	ATC	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245187
43	NC_009478	GTC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
44	NC_009478	TCG	2	6	3173	3178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
45	NC_009478	AGT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245188
46	NC_009478	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245188
47	NC_009478	GTG	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
48	NC_009478	TCG	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
49	NC_009478	CTG	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
50	NC_009478	GCT	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
51	NC_009478	CGC	2	6	3435	3440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
52	NC_009478	CGA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
53	NC_009478	GCC	2	6	3476	3481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
54	NC_009478	AGG	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245188
55	NC_009478	CGG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
56	NC_009478	TCG	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
57	NC_009478	GCC	2	6	3616	3621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
58	NC_009478	CCG	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
59	NC_009478	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245188
60	NC_009478	TGC	3	9	3869	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
61	NC_009478	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
62	NC_009478	TGA	3	9	3935	3943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245188
63	NC_009478	GGT	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
64	NC_009478	CGG	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
65	NC_009478	CGG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
66	NC_009478	CGA	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
67	NC_009478	CCT	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245188
68	NC_009478	GGT	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
69	NC_009478	GCG	3	9	4303	4311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
70	NC_009478	CGA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
71	NC_009478	TGT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245188
72	NC_009478	CGA	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
73	NC_009478	ACC	3	9	4537	4545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245188
74	NC_009478	CGC	2	6	4560	4565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
75	NC_009478	CGC	2	6	4611	4616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245188
76	NC_009478	CAG	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
77	NC_009478	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
78	NC_009478	GGC	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245188
79	NC_009478	CGA	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
80	NC_009478	AGC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
81	NC_009478	CGA	3	9	5091	5099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
82	NC_009478	ACG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245188
83	NC_009478	GTG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245188
84	NC_009478	TCC	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245188
85	NC_009478	CGT	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245188
86	NC_009478	TCC	2	6	5330	5335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009478	TCG	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009478	ATG	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009478	GCG	2	6	5468	5473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009478	GGT	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009478	ATG	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009478	GGT	2	6	5942	5947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245189
93	NC_009478	AGC	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245189
94	NC_009478	CAA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148245190
95	NC_009478	TTG	2	6	6219	6224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245190
96	NC_009478	ATC	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245190
97	NC_009478	GCA	2	6	6502	6507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245191
98	NC_009478	GCG	2	6	6549	6554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245191
99	NC_009478	ACG	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245191
100	NC_009478	CGT	2	6	6569	6574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245191
101	NC_009478	CAG	2	6	6648	6653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245191
102	NC_009478	TCG	2	6	6655	6660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245191
103	NC_009478	GCA	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245191
104	NC_009478	TCC	2	6	6772	6777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009478	GTG	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009478	GCA	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009478	CGA	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245192
108	NC_009478	CGG	2	6	7120	7125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245192
109	NC_009478	CCG	2	6	7127	7132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
110	NC_009478	CGT	2	6	7136	7141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245192
111	NC_009478	AGC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245192
112	NC_009478	GCC	2	6	7239	7244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
113	NC_009478	GCG	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245192
114	NC_009478	CGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
115	NC_009478	CGG	3	9	7527	7535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245192
116	NC_009478	ACC	2	6	7546	7551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245192
117	NC_009478	GCT	3	9	7557	7565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245192
118	NC_009478	CGG	2	6	7590	7595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148245192
119	NC_009478	TCG	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245192
120	NC_009478	ACG	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245192
121	NC_009478	CCG	2	6	7877	7882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
122	NC_009478	GCC	2	6	7903	7908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
123	NC_009478	GCC	2	6	7936	7941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
124	NC_009478	TCG	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245192
125	NC_009478	TCG	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245192
126	NC_009478	CGA	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245192
127	NC_009478	GCC	2	6	8108	8113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
128	NC_009478	GCC	2	6	8168	8173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
129	NC_009478	GCC	2	6	8209	8214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245192
130	NC_009478	CGT	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245192
131	NC_009478	CAC	2	6	8273	8278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009478	CCG	2	6	8341	8346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245193
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381	NC_009478	TGG	2	6	20223	20228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
382	NC_009478	CTA	2	6	20243	20248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_009478	TGC	2	6	20430	20435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245204
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389	NC_009478	GCA	2	6	21023	21028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245205
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401	NC_009478	GGA	2	6	22100	22105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
402	NC_009478	ACG	2	6	22152	22157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_009478	GCG	2	6	22319	22324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
404	NC_009478	TGG	2	6	22560	22565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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