MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009478	GC	3	6	34	39	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009478	CG	3	6	330	335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009478	CG	3	6	735	740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009478	CA	3	6	1469	1474	50 %	0 %	0 %	50 %	148245185
5	NC_009478	CG	3	6	1704	1709	0 %	0 %	50 %	50 %	148245185
6	NC_009478	AC	4	8	2003	2010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009478	CG	3	6	2256	2261	0 %	0 %	50 %	50 %	148245186
8	NC_009478	CG	3	6	2489	2494	0 %	0 %	50 %	50 %	148245186
9	NC_009478	CG	3	6	2538	2543	0 %	0 %	50 %	50 %	148245186
10	NC_009478	GC	3	6	3525	3530	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
11	NC_009478	GC	3	6	4144	4149	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
12	NC_009478	GC	3	6	4475	4480	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
13	NC_009478	CG	3	6	4891	4896	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
14	NC_009478	GC	3	6	5110	5115	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
15	NC_009478	GC	3	6	5266	5271	0 %	0 %	50 %	50 %	148245188
16	NC_009478	CT	3	6	6043	6048	0 %	50 %	0 %	50 %	148245189
17	NC_009478	CG	3	6	6701	6706	0 %	0 %	50 %	50 %	148245191
18	NC_009478	TC	3	6	6754	6759	0 %	50 %	0 %	50 %	148245191
19	NC_009478	CG	3	6	7308	7313	0 %	0 %	50 %	50 %	148245192
20	NC_009478	GC	4	8	7357	7364	0 %	0 %	50 %	50 %	148245192
21	NC_009478	GC	3	6	7806	7811	0 %	0 %	50 %	50 %	148245192
22	NC_009478	GC	3	6	8263	8268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009478	GC	3	6	10136	10141	0 %	0 %	50 %	50 %	148245195
24	NC_009478	CT	3	6	10542	10547	0 %	50 %	0 %	50 %	148245195
25	NC_009478	CG	3	6	11096	11101	0 %	0 %	50 %	50 %	148245196
26	NC_009478	CG	3	6	11282	11287	0 %	0 %	50 %	50 %	148245196
27	NC_009478	CG	4	8	12170	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	148245196
28	NC_009478	CG	3	6	12377	12382	0 %	0 %	50 %	50 %	148245196
29	NC_009478	CG	3	6	13064	13069	0 %	0 %	50 %	50 %	148245197
30	NC_009478	GC	3	6	13164	13169	0 %	0 %	50 %	50 %	148245197
31	NC_009478	CG	3	6	13212	13217	0 %	0 %	50 %	50 %	148245197
32	NC_009478	CG	3	6	15085	15090	0 %	0 %	50 %	50 %	148245198
33	NC_009478	CG	3	6	17146	17151	0 %	0 %	50 %	50 %	148245202
34	NC_009478	GC	3	6	17232	17237	0 %	0 %	50 %	50 %	148245202
35	NC_009478	GC	3	6	17395	17400	0 %	0 %	50 %	50 %	148245202
36	NC_009478	GC	3	6	17955	17960	0 %	0 %	50 %	50 %	148245203
37	NC_009478	GC	3	6	18483	18488	0 %	0 %	50 %	50 %	148245203
38	NC_009478	CG	3	6	19811	19816	0 %	0 %	50 %	50 %	148245203
39	NC_009478	AG	3	6	19952	19957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009478	TC	3	6	19985	19990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009478	TC	3	6	20374	20379	0 %	50 %	0 %	50 %	148245204
42	NC_009478	CA	3	6	20640	20645	50 %	0 %	0 %	50 %	148245204
43	NC_009478	GC	3	6	21417	21422	0 %	0 %	50 %	50 %	148245206
44	NC_009478	GT	3	6	21599	21604	0 %	50 %	50 %	0 %	148245206
45	NC_009478	TG	3	6	21869	21874	0 %	50 %	50 %	0 %	148245206
46	NC_009478	CT	3	6	24188	24193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009478	CG	4	8	24314	24321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009478	GC	3	6	25347	25352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009478	CT	3	6	25469	25474	0 %	50 %	0 %	50 %	148245211
50	NC_009478	GC	4	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
51	NC_009478	CG	3	6	25678	25683	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
52	NC_009478	GC	3	6	25939	25944	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
53	NC_009478	CG	3	6	25948	25953	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
54	NC_009478	CG	3	6	26021	26026	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
55	NC_009478	GC	3	6	26368	26373	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
56	NC_009478	CG	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
57	NC_009478	CG	3	6	26668	26673	0 %	0 %	50 %	50 %	148245211
58	NC_009478	CT	3	6	26962	26967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009478	AG	3	6	27062	27067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009478	AG	4	8	27079	27086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.